In the current study, we have used

In the current study, we have used HT-TREBS to individually analyze the DNA methylation pattern of 4799 IAP
LTR retrotransposons in embryonic stem, somatic and Neuro2A cells. According to the results, half of the loci
within this family show constant methylation patterns between the three cell types whereas the remaining
half display variable levels of methylation. About half of the variably methylated IAP LTRs tend to be
hypomethylated in ES cells, and nearly all in this group are hypomethylated in Neuro2A cells. The observed hypomethylation
in both cell types occur in a non-uniform, locus-specific manner and to various degrees of
severity, with some of them being easily detectible by COBRA. Overall, this study demonstrates the feasibility
of HT-TREBS to study DNA methylation changes at retrotransposons in a locus-specific manner in multiple cell
types and further suggests the potential utility of this technique in developing epigenetic biomarkers for tracking
disease progression.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ในการศึกษาปัจจุบัน เราใช้เอชที TREBS แยกวิเคราะห์ DNA ปรับรูปแบบให้ 4799Retrotransposons LTR ในต้นกำเนิดตัวอ่อน somatic และเซลล์ Neuro2A ตามผลลัพธ์ loci ครึ่งหนึ่งภายในครอบครัวนี้แสดงรูปแบบการปรับค่าคงที่ระหว่างเซลล์สามชนิดในขณะเหลือครึ่งแสดงปรับระดับตัวแปร ประมาณครึ่งหนึ่งของ LTRs ให้ variably methylated มีแนวโน้มที่จะhypomethylated ในเซลล์ ES และเกือบทั้งหมดในกลุ่มนี้เป็น hypomethylated ในเซลล์ Neuro2A Hypomethylation สังเกตในเซลล์ทั้งสองชนิดเกิดขึ้น ในลักษณะที่ไม่สม่ำเสมอ เฉพาะโลกัสโพล และมุมองศาต่าง ๆ ของความรุนแรง มีบางส่วนของพวกเขากำลัง detectible ได้ โดยงูเห่า โดยรวม การศึกษานี้แสดงให้เห็นถึงความเป็นไปได้ที่ของ TREBS เอชทีเพื่อศึกษาดีเอ็นเอเปลี่ยนแปลงปรับที่ retrotransposons อย่างเฉพาะโลกัสโพลในหลายเซลล์ชนิด และการแนะนำเพิ่มเติม อรรถประโยชน์ศักยภาพของเทคนิคนี้ในการพัฒนา epigenetic biomarkers สำหรับการติดตามความก้าวหน้าของโรค

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ในการศึกษาในปัจจุบันเราได้ใช้ HT-TREBS เป็นรายบุคคลเพื่อวิเคราะห์รูปแบบดีเอ็นเอ methylation ของ IAP 4799
LTR retrotransposons ในต้นกำเนิดตัวอ่อน, ร่างกายและเซลล์ Neuro2A ตามผลการครึ่งหนึ่งของตำแหน่งภายในครอบครัวนี้แสดงให้เห็นรูปแบบ methylation คงที่ระหว่างสามเซลล์ชนิดในขณะที่ส่วนที่เหลืออีกครึ่งหนึ่งของการแสดงผลระดับตัวแปรmethylation ประมาณครึ่งหนึ่งของ LTRs IAP methylated แตกมีแนวโน้มที่จะhypomethylated ในเซลล์ ES และเกือบทั้งหมดในกลุ่มนี้ hypomethylated ในเซลล์ Neuro2A hypomethylation สังเกตทั้งในเซลล์ชนิดเกิดขึ้นในไม่สม่ำเสมอลักษณะสถานที่ที่เฉพาะเจาะจงและองศาต่างๆของความรุนแรงกับบางส่วนของพวกเขาเป็นได้อย่างง่ายดายโดยdetectible COBRA โดยรวม, การศึกษาแสดงให้เห็นถึงความเป็นไปได้นี้ของHT-TREBS เพื่อศึกษาการเปลี่ยนแปลงดีเอ็นเอ methylation ที่ retrotransposons ในลักษณะที่เป็นสถานที่เฉพาะในเซลล์หลายชนิดและยังแสดงให้เห็นยูทิลิตี้ที่มีศักยภาพของเทคนิคนี้ในการพัฒนาbiomarkers epigenetic สำหรับการติดตามความก้าวหน้าของโรค