Description of Polynucleobacter cos

Description of Polynucleobacter cosmopolitanus sp. nov.
Polynucleobacter cosmopolitanus (cos.mo.po.li9ta.nus. Gr. adj. kosmopolites an inhabitant of the world, a cosmopolitan; N.L. masc. adj. cosmopolitanus cosmopolitan). Curved, non-motile rods, 0.5–1.4 mm in length and 0.3– 0.5 mm in width. Chemo-organotrophic, aerobic strains, at least some of the strains are able to grow anaerobically. Can be cultivated on NSY, R2A, and Bacto peptone media, and some other complex media at concentrations of ¡3gl21 .

Colonies grown on NSY agar are unpigmented, circular and convex with smooth surfaces and reach a diameter of 1 mm after 5–10 days at 20224 uC. Growth occurs at 10– 35 uC, four strains also grow at 5 uC and two strains are able to grow at 38 uC. Grows without NaCl. Maximum NaCl concentration tolerated is strain dependent and ranges from 0.3 to 0.5 % (w/v). Utilizes acetate, pyruvate, propionate, oxaloacetate, malate, succinate, fumarate, Dgalacturonic acid, D-galactose, L-cysteine and L-alanine when these substrates are provided in a medium containing low amounts of NSY.

None of the strains utilize formate, glycolate, oxalate, D-lyxose, D-fructose, D-fucose, D-sorbitol, L-aspartate, L-serine, L-asparagine or betaine. Major cellular fatty acids are C18 : 1v7c, C16 : 0 and C12 : 0 3-OH. No 2-hydroxylated compounds are detected. Fractions of natural populations pass through 0.2 mm filters. Can be distinguished from P. necessarius by using the P. necessarius-specific FISH probe PnecC-16S-445 (Hahn et al., 2009), as well as by differences in fatty acid profiles (Table 3).

In contrast to P. necessarius, exclusively free-living strains and no endosymbiotic strains are reported, however, the existence of endosymbiotic strains cannot be completely excluded at present. Tentatively, all strains possessing the oligonucleotide sequence 59-AA(T/G)CCCT(A/T)AGGGGGAAA-39 (E. coli positions 181–197) within the 16S rRNA gene shall be assigned to the proposed species. In almost all cases (with one known exception), the presence of this diagnostic sequence can be determined by FISH with a mixture of the two probes PnecD1-181 and PnecD2- 181 (Hahn et al., 2005).

The type strain, MWH-MoIso2T (5DSM 21490T 5CIP 109840T 5LMG 25212T ), was isolated from the water column (pelagic zone) of Lake Mondsee located in the Salzkammergut Lake District in Austria (Hahn, 2003). The DNA G+C content of the type strain is 44.9 %. Four other reference strains are available: MWH-CaK1 (5DSM 21494), MWH-VicM1 (5DSM 21486); MWH-TaW3 (5DSM 21487) and MWH-NZ8W13 (5DSM 21488)

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

คำอธิบายของ Polynucleobacter sp. cosmopolitanus พ.ย. Polynucleobacter cosmopolitanus (cos.mo.po.li9ta.nus กลุ่มปรับปรุง kosmopolites มีพลเมืองของโลก ความเป็นสากล N.L. ปรับปรุง masc. cosmopolitanus ความเป็นสากล โค้ง แท่ง-motile, 0.5-1.4 มม.ความยาวและ 0.3 – 0.5 มม.ความกว้าง สายพันธุ์มผล-organotrophic แอโรบิก น้อยบางสายพันธุ์จะสามารถเติบโต anaerobically สามารถจะเพาะปลูก NSY, R2A และ Bacto peptone สื่อ และบางสื่อที่ซับซ้อนอื่น ๆ ที่ความเข้มข้นของ ¡3gl21 อาณานิคมที่เติบโตบนวุ้น NSY unpigmented วงกลม และนูน ด้วยพื้นผิวที่เรียบ และถึงมีเส้นผ่าศูนย์กลาง 1 มม.หลังจาก 5-10 วันใน 20224 uC เจริญเติบโตที่เกิดขึ้นใน 10-35 uC สี่สายพันธุ์ยังเติบโตที่ 5 uC และสองสายพันธุ์สามารถที่จะเติบโตที่ 38 uC เติบโต โดย NaCl ความเข้มข้น NaCl สูงสุดที่ยอมรับได้ขึ้นอยู่กับสายพันธุ์และช่วงตั้งแต่ 0.3 ถึง 0.5% (w/v) ใช้อะซิเตท pyruvate, propionate, oxaloacetate มาลาเต succinate, fumarate กรด Dgalacturonic กาแล็กโทส D, L-cysteine และ L-อะลานีนเมื่อพื้นผิวเหล่านี้ไว้ในสื่อกลางที่ประกอบด้วยจำนวน NSY ต่ำ ไม่มีสายพันธุ์ที่ใช้รูปแบบเอกสาร glycolate ออกซา เลต D lyxose, D-ฟรักโทส D fucose, D-ซอร์บิ ทอ L-อัลคาไลน์ L-รอบเส้นใยประสาท L asparagine หรือเบทาอีน กรดไขมันสำคัญที่เซลลูลาร์ C18: 1v7c, C16: 0 และ C12: 0 3-โอ้ มีการตรวจพบสารที่ 2 ไม่มี-hydroxylated เศษส่วนของธรรมชาติประชากรผ่านตัวกรอง 0.2 mm สามารถแตกต่างจาก P. necessarius โดยใช้หัวปลาเฉพาะ necessarius P. PnecC 16S 445 (Hahn et al. 2009), เช่นเดียว กับความแตกต่างในส่วนกำหนดค่ากรดไขมัน (ตาราง 3) ตรงกันข้ามกับ P. necessarius เฉพาะ free-living สายพันธุ์และ endosymbiotic ไม่สายพันธุ์มีรายงาน อย่างไรก็ตาม การดำรงอยู่ของสายพันธุ์ไม่สามารถยกเว้นที่สมบูรณ์ endosymbiotic ปัจจุบัน ไม่แน่นอน ทุกสายพันธุ์มีลำดับ oligonucleotide 59 AA(T/G) CCCT (a/t) AGGGGGAAA-39 (E. coli ตำแหน่ง 181-197) ภายในยีน 16S rRNA จะถูกกำหนดให้นำเสนอสายพันธุ์ ในกรณีที่เกือบทั้งหมด (ด้วยข้อยกเว้นหนึ่งรู้จัก), สามารถถูกกำหนด โดยปลาของลำดับนี้วินิจฉัย ด้วยส่วนผสมของโพรบสอง PnecD1 181 และ PnecD2 - 181 (Hahn et al. 2005) สายพันธุ์ชนิด MWH MoIso2T (5DSM 21490T 5CIP 109840T 5LMG 25212T), ถูกแยกจากน้ำคอลัมน์ (โซนปล้อง) ของเลมอนด์ซีแลนด์อยู่ใน Salzkammergut Lake District ในออสเตรีย (Hahn, 2003) เนื้อหาดีเอ็นเอ G + C ของสายพันธุ์ชนิดเป็น 44.9% มีสี่สายพันธุ์อื่น ๆ อ้างอิง: MWH CaK1 (5DSM 21494), MWH VicM1 (5DSM 21486); MWH TaW3 (5DSM 21487) และ MWH NZ8W13 (5DSM 21488)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

คำอธิบายของ Polynucleobacter cosmopolitanus SP nov.
Polynucleobacter cosmopolitanus (... cos.mo.po.li9ta.nus Gr adj kosmopolites คนอาศัยอยู่ในโลกที่เป็นสากล.. NL masc adj cosmopolitanus สากล) โค้งแท่งไม่มีเคลื่อนไหว, 0.5-1.4 มิลลิเมตรยาวและ 0.3- 0.5 มมความกว้าง Chemo-organotrophic สายพันธุ์แอโรบิกอย่างน้อยบางส่วนของสายพันธุ์ที่มีความสามารถที่จะเติบโตแบบไม่ใช้อากาศ สามารถปลูกใน NSY, R2A และสื่อเปปโตน Bacto และบางสื่อที่ซับซ้อนอื่น ๆ ที่ความเข้มข้น¡ 3gl21.

อาณานิคมที่ปลูกใน NSY วุ้นเป็น unpigmented วงกลมนูนและมีพื้นผิวเรียบและเข้าถึงเส้นผ่าศูนย์กลาง 1 มิลลิเมตรหลังจาก 5-10 วัน ที่ 20,224 UC การเจริญเติบโตที่เกิดขึ้นใน 10- 35 UC สี่สายพันธุ์ที่ยังเติบโตที่ 5 UC และสองสายพันธุ์ที่มีความสามารถที่จะเติบโตที่ 38 UC เติบโตโดยไม่ต้องโซเดียมคลอไรด์ โซเดียมคลอไรด์ความเข้มข้นสูงสุดทนต่อความเครียดและขึ้นอยู่กับช่วง 0.3-0.5% (w / v) ใช้น้ำนมไพรู propionate, oxaloacetate, Malate, succinate, fumarate กรด Dgalacturonic D-กาแลคโต, L-cysteine และ L-อะลานีนเมื่อพื้นผิวเหล่านี้จะถูกจัดให้อยู่ในสื่อที่มีจำนวนต่ำของ NSY.

ไม่มีสายพันธุ์ใช้รูปแบบ, glycolate, ออกซาเลต D-lyxose D-ฟรุกโตส, D-fucose D-ซอร์บิทอ, L-aspartate, L-ซีรีน, L-asparagine หรือเบทาอีน กรดไขมันที่สำคัญคือโทรศัพท์มือถือ C18: 1v7c, C16: 0 และ C12: 0 3 OH ไม่มีสารประกอบ 2 hydroxylated มีการตรวจพบ เศษของประชากรธรรมชาติผ่านฟิลเตอร์ 0.2 มิลลิเมตร อาจจะแตกต่างจากพี necessarius โดยใช้พี necessarius เฉพาะปลาสอบสวน PnecC-16S-445 (Hahn et al., 2009) เช่นเดียวกับความแตกต่างในโปรไฟล์ของกรดไขมัน (ตารางที่ 3).

ในทางตรงกันข้ามกับพี necessarius เฉพาะฟรีชีวิตสายพันธุ์และสายพันธุ์ที่ไม่มี endosymbiotic จะมีการรายงาน แต่การดำรงอยู่ของสายพันธุ์ endosymbiotic ไม่สามารถได้รับการยกเว้นอย่างสมบูรณ์ในปัจจุบัน แน่นอนทุกสายพันธุ์ที่มีลำดับ oligonucleotide 59-AA (T / G) CCCT (A / T) AGGGGGAAA-39 ( E. coli ตำแหน่ง 181-197) ภายในยีน 16S rRNA จะได้รับมอบหมายให้สายพันธุ์ที่นำเสนอ ในเกือบทุกกรณี (มีข้อยกเว้นที่รู้จักกัน) การปรากฏตัวของลำดับการวินิจฉัยนี้จะถูกกำหนดโดยปลาที่มีส่วนผสมของทั้งสอง probes PnecD1-181 และ PnecD2- 181 (Hahn et al., 2005).

ประเภทความเครียด MWH -MoIso2T (5DSM 21490T 5CIP 109840T 5LMG 25212T) ถูกแยกออกจากน้ำคอลัมน์ (โซนทะเล) ของทะเลสาบ Mondsee ตั้งอยู่ใน Salzkammergut Lake District ในออสเตรีย (ฮาห์น, 2003) เนื้อหาดีเอ็นเอ G + C ของสายพันธุ์ชนิดเป็น 44.9% สี่สายพันธุ์อ้างอิงอื่น ๆ ที่มี: MWH-CaK1 (5DSM 21,494) MWH-VicM1 (5DSM 21486); MWH-TaW3 (5DSM 21,487) และ MWH-NZ8W13 (5DSM 21,488)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

รายละเอียดของ polynucleobacter cosmopolitanus sp .polynucleobacter cosmopolitanus ( cos.mo.po.li9ta.nus . กลุ่มที่ 1 . kosmopolites เป็นประชากรของโลก ทั่วโลก ; n.l. masc . 1 . cosmopolitanus สากล ) โค้งที่ไม่เคลื่อนที่ , แท่ง , 0.5 – 1.4 มม. และ 0.3 - 0.5 มม. ในความกว้าง คีโม organotrophic สายพันธุ์แอโรบิกอย่างน้อยบางส่วนของสายพันธุ์ที่สามารถปลูกพ . สามารถปลูกได้ใน nsy r2a Bacto extract , และสื่อ และบางอื่น ๆที่ซับซ้อนสื่อที่ความเข้มข้นของ¡ 3gl21 .อาณานิคมที่ปลูกใน nsy วุ้นเป็น unpigmented , กลมและนูนที่มีพื้นผิวเรียบถึงมีขนาดเส้นผ่าศูนย์กลาง 1 มม. หลังจาก 5 – 10 วัน 20224 ฯลฯ . การเจริญเติบโตเกิดขึ้นที่ 10 – 35 UC 4 สายพันธุ์ที่ยังเติบโตใน 5 UC และสองสายพันธุ์ที่สามารถเจริญเติบโตใน 38 เป็นต้น . เติบโตโดยปราศจากเกลือ สูงสุดที่ความเข้มข้นของเกลือนเป็นสายพันธุ์ และช่วงตั้งแต่ 0.3 ถึง 0.5 % ( w / v ) ใช้อะซิเตต , ไพรูเวท propionate ซาโลอะซิเตต , malate Succinate , กรร dgalacturonic , กรด d-galactose L-Cysteine และอะลานีน , เมื่อพื้นผิวเหล่านี้ไว้ในอาหารที่มีปริมาณ nsy .ไม่มีสายพันธุ์ที่ใช้รูปแบบเอกสาร , ไกโคเลต d-lyxose ต , , , d-fructose d-fucose d-sorbitol l-aspartate , , , , l-serine Name หรือ บี , . ที่สำคัญของเซลล์กรดไขมัน c18 : 1v7c c16 , : 0 : 0 c12 3-oh . ไม่ 2-hydroxylated สารประกอบจะตรวจพบ เศษส่วนของประชากรธรรมชาติผ่านการกรอง 0.2 มิลลิเมตร แตกต่างจากหน้า necessarius โดยใช้หน้า necessarius เฉพาะหัวปลา pnecc-16s-445 ( Hahn et al . , 2009 ) ตลอดจนความแตกต่างในโปรไฟล์ของกรดไขมัน ( ตารางที่ 3 )ในทางตรงกันข้ามกับหน้า necessarius เฉพาะสายพันธุ์และสายพันธุ์อิสระ endosymbiotic รายงาน อย่างไรก็ตาม การดำรงอยู่ของสายพันธุ์ endosymbiotic ไม่สามารถจะสมบูรณ์ไม่รวมในปัจจุบัน แน่นอน ทุกสายพันธุ์ ซึ่งมีลำดับ 59-aa ( T / g ) ccct ( A / T ) agggggaaa-39 ( E . coli ) 181 ( 197 ) ภายในเบส 16S rRNA ยีนจะมอบหมายให้เสนอชนิด ในเกือบทุกกรณี ( ยกเว้นคนรู้จัก ) มีลำดับการวินิจฉัยนี้สามารถหาได้โดยปลาที่มีส่วนผสมของทั้งสองวัด และ pnecd2 pnecd1-181 - 181 ( Hahn et al . , 2005 )ชนิดของความเครียด mwh-moiso2t ( 5dsm 21490t 5cip 109840t 5lmg 25212t ) ถูกแยกจากน้ำ ( ทะเลเขตทะเลสาบ Salzkammergut เขตทะเลสาบตั้งอยู่ใน Mondsee ออสเตรีย ( Hahn , 2003 ) ดีเอ็นเอ G + C เนื้อหาของประเภทเมื่อย 44.9 % สี่สายพันธุ์อ้างอิงอื่น ๆที่มีอยู่ : mwh-cak1 ( 5dsm 21494 ) mwh-vicm1 ( 5dsm 21486 ) ; mwh-taw3 ( 5dsm 21487 ) และ mwh-nz8w13 ( 5dsm 21488 )