3.4. DNA barcoding of edible plants

3.4. DNA barcoding of edible plants
Plants are an essential element in human diet, both directly (cereals are the base of the food pyramid, followed by fruits and vegetables) and indirectly (plant products are used to feed cattle).Furthermore, several plants are used as food additives (e.g. soy). A reliable identification of crop species, as well as their origin and traceability,are key elements in the field of food safety. In the last 20 years
several PCR-methods have been tested on several crop cultivars, such as rice, corn, sorghum, barley, rye (Pasqualone et al., 1999; Ren, Zhu,Warndorff, Bucheli, & Shu, 2006; Salem et al., 2007; Terzi et al., 2005).Thesemethods are useful for both the producers, who are interested in protecting and certifying their crops (DeMattia, Imazio, Grassi, & Labra,2008; Labra et al., 2003; Ren et al., 2006), and consumers, who are interested in the quality and origin of their food. The increasing diffusion of genetically modified (GM) crops has further increased the demand for molecular techniques to track transgenes (Auer, 2003). In recent years, a multiplex DNA microarray chip for simultaneous identification of GMOs, based on regulations of different countries, has been developed (Leimanis et al., 2006; Nikolic, Taski-Ajdukovic, Jevtic, &Marinkovic, 2009), as well as similar systems devoted to the identification of plant species and cultivars (Agrimonti, Vietina, Pafundo, & Marmiroli, 2011; Xie,McNally, Li, Leung, & Zhu, 2006). However, as previously discussed, these molecular methods have a common limitation in their high species-specificity. Due to globalization, an increasing number of plants originating from different areas of the world are now offered to consumers, but there are not reliable, universal tools for their identification. DNA barcoding could be a reliable alternative to DNA fingerprinting approaches in plants identification,with a higher effectiveness/cost ratio. In fact, DNA barcoding does not require an
extensive knowledge of the genome of each organism, being based on the use of one or few universal markers (Hollingsworth et al., 2011).Nowadays, the research on DNA barcoding in the field of botany is
shifting from the analysis of the performance of different markers towards more practical applications. Among edible plants, this approach has been used to track spices (De Mattia et al., 2011). Species
of the genus Mentha, Ocimum, Origanum, Salvia, Thymus and Rosmarinus were analyzed by using the core-barcode region (matK+rbcL), and the trnH-psbA intergenic spacer. With DNA barcoding, most common spices can be identified, with the exclusion of marjoram and oregano, which, belonging to the same genus Oregano, have an intraspecific diversity which is higher than interspecific,because of several cases of hybridization.DNA barcoding has shown high performances in discriminating basil species: matK and trnH-psbA were able to distinguish commercial basil (Ocimum basilicum L) from other Ocimum species, as well as different basil cultivars.DNA barcoding was also used to investigate the genetic relationships between wild and cultivated plants, as well as their origin. Nicolè et al. (2011) used DNA barcoding on bean germplasm (Phaseolus vulgaris L.) observing distinct haplotypes for bean accessions
corresponding to Mesoamerican or Andean areas. However,this study also highlighted the limits of approach in resolving genetic relationships between races and strictly related varieties.Bruni et al. (2010) evaluated the effectiveness of DNA barcoding in separating toxic from edible species, evidencing a clear molecular distinction between cultivated species of the genera Solanum (Solanum tuberosum L., Solanum lycopersicum L. group) and Prunus (Prunus armeniaca L., Prunus avium L., Prunus cerasus L., Prunus domestica L.) and their toxic congenerics. This study suggested that DNA barcoding could be used to distinguish edible species from their non-edible or toxic congenerics (Jaakola, Suokas, & Häggman, 2010).The limits of adopting universal barcode markers are evident at the cultivar level, where genetic variability is limited, and there are complications due to breeding events. To overcome these limits,
Kane and Cronk (2008) proposed the ultra-barcoding methodology,which is based on the sequence of the whole plastidial genome, together with large portions of the nuclear genome. This combination
provides enough information to evidence genetic diversity below the level of species, distinguishing hybrids from pure lines, hence it is far more sensitive than traditional DNA barcoding (Nock et al.,
2011; Parks, Cronn, & Liston, 2009; Steele & Pires, 2011). Kane and Cronk (2008) evaluated the effectiveness of ultra-barcoding on cocoa (Theobroma cacao L.), and found several plastidial and nuclear
SNPs, which were useful to identify different cultivars. This technique is promising, but it is difficult to apply on a large scale due to its high costs, and its excessive species-specificity.Nowadays, there are no technical limitations to the application of DNA barcoding for the traceability of plant raw materials. However,the reduced genetic diversity at cultivar level often requires the analysis of large portions of the genome, which currently have a too high cost/effectiveness ratio to be widely used. Furthermore, this approach is contrary to the basic DNA barcoding methodology, which requires the analysis of short and universal DNA regions only.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.4 การซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอของพืชใช้เป็นอาหารพืชมีองค์ประกอบสำคัญในอาหารมนุษย์ ทั้งโดยตรง (ธัญญาหารเป็นฐานของปิรามิดอาหาร ตาม ด้วยผักและผลไม้) และทางอ้อม (ผลิตภัณฑ์พืชใช้เลี้ยงวัว) นอกจากนี้ พืชต่าง ๆ ใช้เป็นวัตถุเจือปนอาหาร (เช่นถั่วเหลือง) รหัสที่น่าเชื่อถือของสปีชีส์พืช เป็นจุดเริ่มต้นของพวกเขา และ ติดตาม มีองค์ประกอบสำคัญด้านความปลอดภัยของอาหาร ใน 20 ปีหลายวิธี PCR ได้ทดสอบบนพืชพันธุ์ต่าง ๆ ข้าว ข้าวโพด ข้าวฟ่าง ข้าว บาร์เลย์ ข้าวไรย์ (Pasqualone et al., 1999 เร็น ซู Warndorff, Bucheli และ ชู 2006 -Salem et al., 2007 Terzi et al., 2005) Thesemethods มีประโยชน์สำหรับทั้งผู้ผลิต ผู้มีความสนใจในการปกป้อง และได้รับการรับรองของพืช (DeMattia, Imazio, Grassi, & Labra, 2008 Labra และ al., 2003 เร็นและ al., 2006), และ ผู้ บริโภคมีความสนใจในคุณภาพและจุดกำเนิดของอาหาร แพร่เพิ่มพืชผลดัดแปลงพันธุกรรม (จีเอ็ม) ได้เพิ่มเติมเพิ่มความต้องการเทคนิคโมเลกุลเพื่อติดตาม transgenes (Auer, 2003) ในปีที่ผ่านมา multiplex DNA microarray ปซึ่งสำหรับการดัดแปลงพันธุกรรม ตามกฎระเบียบของประเทศต่าง ๆ พร้อมระบุได้รับการพัฒนา (Leimanis และ al., 2006 Nikolic, Taski Ajdukovic, Jevtic, & Marinkovic, 2009), ระบบคล้ายเป็นเช่นทุ่มเทเพื่อการระบุของชนิดพืชและพันธุ์ (Agrimonti, Vietina, Pafundo, & Marmiroli, 2011 เจีย McNally, Li เหลียง และ ซู 2006) อย่างไรก็ตาม discussed ก่อนหน้านี้ วิธีการระดับโมเลกุลเหล่านี้มีข้อจำกัดทั่วไปใน species-specificity ของพวกเขาสูง เนื่องจากโลกาภิวัตน์ การเพิ่มจำนวนพืชที่มาจากพื้นที่ต่าง ๆ ของโลกจะนำเสนอให้ผู้บริโภคขณะนี้ แต่ไม่มีเครื่องมือที่เชื่อถือได้ สากลสำหรับรหัสของพวกเขา ซอฟต์แวร์ดีเอ็นเออาจเป็นทางเลือกที่น่าเชื่อถือกับดีเอ็นเอลายพิมพ์ที่ใช้ในการระบุพืช มีอัตราส่วนต้นทุน/ประสิทธิผลที่สูงขึ้น ในความเป็นจริง โค้ดีเอ็นเอไม่ต้องการความรู้ที่กว้างขวางของกลุ่มของสิ่งมีชีวิตแต่ละ เป็นไปตามการใช้หนึ่ง หรือสองสามสากลเครื่องหมาย (Hollingsworth et al., 2011) ปัจจุบัน การวิจัยในซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอในด้านพฤกษศาสตร์จะขยับจากการวิเคราะห์ประสิทธิภาพของเครื่องหมายต่าง ๆ ไปประยุกต์ใช้งานจริงมากขึ้น ผู้ที่กินพืช วิธีการนี้มีการใช้เพื่อติดตามเครื่องเทศ (เด Mattia et al., 2011) สปีชีส์ของพืชสกุล Mentha สกุลกะเพรา-โหระพา Origanum, Salvia ต่อมไทมัส และ Rosmarinus ได้วิเคราะห์ โดยใช้บาร์โค้ดหลักภูมิภาค (matK + rbcL), และเป็นตัวเว้นวรรค intergenic trnH-psbA กับซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอ เครื่องเทศทั่วสามารถระบุ มีข้อยกเว้นที่ marjoram และออริกาโน ที่ เป็นสมาชิกสกุลเดียวกับออริกาโน มีความหลากหลายเป็น intraspecific ซึ่งจะสูงกว่า interspecific มีหลายกรณีที่ hybridization ซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอได้แสดงสมรรถนะสูงในรับการจำแนกชนิดโหระพา: matK และ trnH psbA ถูกต้องแยกพาณิชย์โหระพา (สกุลกะเพรา-โหระพา basilicum L) จากอื่น ๆ พันธุ์สกุลกะเพรา-โหระพา ตลอดจนพันธุ์โหระพาต่างกัน นอกจากนี้ยังใช้ซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอเพื่อตรวจสอบความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างป่า และการปลูกพืช เป็นจุดกำเนิดของ Nicolè et al. (2011) ใช้ซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอในถั่ว germplasm (เขียว vulgaris L.) สังเกตว่า haplotypes สำหรับถั่ว accessionsที่สอดคล้องกับพื้นที่ในอเมริกากลางหรือ Andean อย่างไรก็ตาม การศึกษานี้ยังถูกเน้นขีดจำกัดของวิธีการในการแก้ไขความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างเชื้อชาติและสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างเคร่งครัด บรูนี et al. (2010) ประเมินประสิทธิผลของซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอในการแยกสารพิษจากกินพันธุ์ การขอแบ่งแยกปลูกพันธุ์สกุล Solanum (Solanum tuberosum L. กลุ่ม Solanum lycopersicum L.) และนาง (นาง armeniaca L. นาง avium L. นาง cerasus L. พลัม L.) เป็นโมเลกุลชัดเจน และ congenerics ความเป็นพิษ การศึกษานี้แนะนำว่า สามารถใช้ซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอเพื่อแยกชนิดกินจากพวกเขาไม่กิน หรือพิษ congenerics (Jaakola, Suokas, & Häggman, 2010) ขีดจำกัดของการใช้เครื่องหมายบาร์โค้ดสากลจะเห็นได้ชัดระดับ cultivar ที่ความแปรผันทางพันธุกรรมจำกัด และมีภาวะแทรกซ้อนเนื่องจากเหตุการณ์การปรับปรุงพันธุ์ เพื่อเอาชนะข้อจำกัดเหล่านี้เคนและ Cronk (2008) เสนอวิธีอัลตร้าโค้ ซึ่งขึ้นอยู่กับลำดับของจีโนมทั้ง plastidial กับส่วนใหญ่ของกลุ่มนิวเคลียร์ ชุดนี้ให้ข้อมูลเพียงพอหลักฐานความหลากหลายทางพันธุกรรมต่ำกว่าระดับชนิด แยกลูกผสมจากบรรทัดบริสุทธิ์ จึงสำคัญมากกว่าโค้ดีเอ็นเอแบบดั้งเดิม (หมุนนก et al.,2011 สวน Cronn, & สตัน 2009 Steele และ Pires, 2011) เคน Cronk (2008) ประเมินประสิทธิผลของอัลตร้าซอฟต์แวร์ในโกโก้ (Theobroma cacao L.), และพบหลาย plastidial และนิวเคลียร์SNPs ซึ่งมีประโยชน์ในการระบุพันธุ์แตกต่างกัน เทคนิคนี้แจ่ม แต่ก็ยากที่จะใช้ในพื้นที่ขนาดใหญ่เป็นต้นทุนที่สูง และ species-specificity ของมากเกินไป ในปัจจุบัน มีไม่จำกัดเทคนิคการใช้ซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอสำหรับการติดตามผลของโรงงานวัตถุดิบ อย่างไรก็ตาม ความหลากหลายทางพันธุกรรมลดลงระดับ cultivar มักต้องการวิเคราะห์จีโนม ใหญ่บางส่วนซึ่งขณะนี้มีอัตราต้นทุนประสิทธิภาพสูงเกินไปที่จะใช้กันอย่างแพร่หลาย นอกจากนี้ วิธีการนี้จะขัดกับพื้นฐานดีเอ็นเอซอฟต์แวร์วิธี ซึ่งต้องวิเคราะห์สั้น และสากลดีเอ็นเอภูมิภาคเท่านั้น

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3.4 บาร์โค้ดดีเอ็นเอของพืชที่กินพืชเป็นองค์ประกอบสำคัญในอาหารของมนุษย์ทั้งทางตรง (ธัญพืชเป็นฐานของพีระมิดอาหารตามด้วยผักและผลไม้) และทางอ้อม (ผลิตภัณฑ์จากพืชที่ใช้ในการเลี้ยงวัว) .Furthermore พืชหลายใช้ เป็นวัตถุเจือปนอาหาร (เช่นถั่วเหลือง)
ประจำตัวที่เชื่อถือได้ของสายพันธุ์พืชเช่นเดียวกับการกำเนิดและการตรวจสอบย้อนกลับของพวกเขาเป็นองค์ประกอบสำคัญในด้านความปลอดภัยของอาหาร ในช่วง 20
ปีที่ผ่านมาหลายPCR-วิธีการได้รับการทดสอบเกี่ยวกับพันธุ์พืชต่างๆเช่นข้าวข้าวโพดข้าวฟ่างข้าวบาร์เลย์ข้าวไรย์ (Pasqualone et al, 1999;. เรเนจู้ Warndorff, Bucheli & Shu 2006; ซาเลม et al, 2007;.. Terzi et al, 2005) .Thesemethods มีประโยชน์สำหรับทั้งผู้ผลิตที่มีความสนใจในการปกป้องและรับรองพืชของพวกเขา (DeMattia, Imazio, Grassi และ Labra 2008; Labra et al, 2003. Ren et al., 2006) และผู้บริโภคที่มีความสนใจในคุณภาพและที่มาของอาหารของพวกเขา แพร่ที่เพิ่มขึ้นของการดัดแปลงทางพันธุกรรม (GM) พืชได้เพิ่มขึ้นต่อความต้องการสำหรับเทคนิคโมเลกุลในการติดตาม transgenes (Auer, 2003) ในปีที่ผ่านดีเอ็นเอมัลติเพล็กชิป microarray สำหรับประชาชนพร้อมกันของ GMOs ขึ้นอยู่กับกฎระเบียบของประเทศต่าง ๆ ได้รับการพัฒนา (Leimanis et al, 2006;. Nikolic, Taski-Ajdukovic, Jevtic และ Marinkovic 2009) เช่นเดียวกับที่คล้ายกัน ระบบที่ทุ่มเทให้กับบัตรประจำตัวของพันธุ์พืชและพันธุ์ (Agrimonti, Vietina, Pafundo & Marmiroli 2011; Xie, เนลลี, หลี่เหลียงจู้และ 2006) อย่างไรก็ตามในขณะที่ก่อนหน้านี้กล่าวถึงวิธีการโมเลกุลเหล่านี้มีข้อ จำกัด ที่พบบ่อยในสูงของพวกเขาชนิดที่เฉพาะเจาะจง เนื่องจากโลกาภิวัตน์, การเพิ่มจำนวนของพืชที่มาจากพื้นที่ต่างๆของโลกที่มีการเสนอในขณะนี้ให้กับผู้บริโภค แต่มีไม่น่าเชื่อถือเครื่องมือสากลสำหรับการระบุของพวกเขา บาร์โค้ดดีเอ็นเออาจจะเป็นทางเลือกที่น่าเชื่อถือในการพิมพ์ลายนิ้วมือดีเอ็นเอแนวทางในการระบุพืชที่มีประสิทธิภาพสูง / อัตราส่วนค่าใช้จ่าย ในความเป็นจริงบาร์โค้ดดีเอ็นเอไม่จำเป็นต้องมีความรู้ที่กว้างขวางของจีโนมของแต่ละสิ่งมีชีวิตที่อยู่บนพื้นฐานของการใช้งานของหนึ่งหรือเครื่องหมายสากลไม่กี่ (Hollingsworth et al., 2011) .Nowadays งานวิจัยเกี่ยวกับดีเอ็นเอบาร์โค้ดในด้านพฤกษศาสตร์ที่ จะขยับจากการวิเคราะห์ผลการดำเนินงานของตัวบ่งชี้ที่แตกต่างกันที่มีต่อการใช้งานจริงมากขึ้น ในบรรดาพืชที่กินได้วิธีการนี้ถูกนำมาใช้ในการติดตามเครื่องเทศ (De Mattia et al., 2011) สายพันธุ์ของพืชและสัตว์ Mentha, แมงลัก, Origanum, ซัลเวีย, ไธมัสและ Rosmarinus วิเคราะห์โดยใช้หลักของภูมิภาคบาร์โค้ด (MATK + rbcL) และ trnH-psbA intergenic spacer ด้วยบาร์โค้ดดีเอ็นเอเครื่องเทศที่พบมากที่สุดสามารถระบุได้ด้วยการยกเว้นของมาจอแรมและออริกาโนซึ่งอยู่ในสกุลเดียวกันออริกาโน, มีความหลากหลายสำนวนซึ่งสูงกว่า interspecific เพราะหลายกรณีของ hybridization.DNA บาร์โค้ดได้แสดงให้เห็นสูง การแสดงในรูปแบบใบโหระพาแบ่งแยก: MATK และ trnH-psbA ก็สามารถที่จะแยกแยะความแตกต่างในเชิงพาณิชย์กะเพรา (Ocimum basilicum L) จากสายพันธุ์อื่น ๆ Ocimum เช่นเดียวกับใบโหระพาที่แตกต่างกัน cultivars.DNA บาร์โค้ดก็ยังใช้ในการตรวจสอบความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างพืชป่าและปลูก ตลอดจนเป็นที่มาของ นิโคล et al, (2011) ใช้บาร์โค้ดดีเอ็นเอพันธุ์ถั่ว (ถั่วแขก L. ) สังเกตพบ haplotype แตกต่างกันสำหรับสายถั่วที่สอดคล้องกับMesoamerican หรือพื้นที่ที่แอนเดียน อย่างไรก็ตามการศึกษานี้ยังเน้นข้อ จำกัด ของวิธีการในการแก้ปัญหาความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างเชื้อชาติและที่เกี่ยวข้องอย่างเคร่งครัด varieties.Bruni et al, (2010) การประเมินประสิทธิภาพของดีเอ็นเอบาร์โค้ดในการแยกจากสายพันธุ์ที่เป็นพิษกินหลักฐานแสดงความแตกต่างที่ชัดเจนระหว่างโมเลกุลชนิดที่ปลูกจำพวกมะเขือนี้ (Solanum tuberosum L. , มะเขือ lycopersicum กลุ่ม L. ) และ Prunus (Prunus armeniaca ลิตร, Prunus avium ลิตร, Prunus cerasus ลิตร, Prunus domestica L. ) และ congenerics พิษของพวกเขา การศึกษาครั้งนี้ชี้ให้เห็นว่าดีเอ็นเอบาร์โค้ดสามารถใช้ในการแยกความแตกต่างชนิดที่กินได้จาก congenerics ที่ไม่ได้กินหรือเป็นพิษของพวกเขา (Jaakola, Suokas และ HAGGMAN 2010) ข้อ จำกัด ได้โดยเริ่มต้นของการใช้เครื่องหมายบาร์โค้ดสากลจะเห็นได้ชัดในระดับพันธุ์ที่แปรปรวนทางพันธุกรรม จำกัด และมีภาวะแทรกซ้อนเนื่องจากเหตุการณ์การเพาะพันธุ์ เพื่อเอาชนะข้อ จำกัด เหล่านี้, เทอรีเคน Cronk (2008) ได้เสนอวิธีการพิเศษบาร์โค้ดซึ่งจะขึ้นอยู่กับลำดับของจีโนมทั้ง plastidial ร่วมกับส่วนใหญ่ของจีโนมนิวเคลียร์ ชุดนี้มีข้อมูลเพียงพอที่จะมีหลักฐานความหลากหลายทางพันธุกรรมต่ำกว่าระดับของสายพันธุ์แตกต่างลูกผสมจากสายบริสุทธิ์ด้วยเหตุนี้มันอยู่ไกลมากขึ้นมีความสำคัญกว่าดีเอ็นเอแบบดั้งเดิมบาร์โค้ด (Nock, et al. 2011; สวนสาธารณะ, Cronn และ Liston 2009; สตีลและ Pires 2011) เทอรีเคน Cronk (2008) การประเมินประสิทธิภาพของอัลตร้าบาร์โค้ดบนโกโก้ (ต้นโกโก้ L. ) และพบ plastidial หลายนิวเคลียร์SNPs ซึ่งเป็นประโยชน์ในการระบุสายพันธุ์ที่แตกต่างกัน เทคนิคนี้มีแนวโน้ม แต่มันเป็นเรื่องยากที่จะนำไปใช้ในขนาดใหญ่เนื่องจากค่าใช้จ่ายสูงและมากเกินไปของสายพันธุ์ specificity.Nowadays ไม่มีข้อ จำกัด ทางเทคนิคกับการประยุกต์ใช้บาร์โค้ดดีเอ็นเอตรวจสอบย้อนกลับของวัตถุดิบพืช อย่างไรก็ตามความหลากหลายทางพันธุกรรมที่ลดลงในระดับพันธุ์มักจะต้องใช้การวิเคราะห์ส่วนใหญ่มาจากจีโนมซึ่งในขณะนี้มีค่าใช้จ่ายสูงเกินไป / อัตราส่วนประสิทธิภาพที่จะใช้กันอย่างแพร่หลาย นอกจากนี้วิธีการนี้จะขัดกับดีเอ็นเอบาร์โค้ดพื้นฐานวิธีการซึ่งจะต้องมีการวิเคราะห์ดีเอ็นเอของภูมิภาคในระยะสั้นและสากลเท่านั้น

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3.4 . ดีเอ็นเอ barcoding พืช
กินพืชเป็นองค์ประกอบสำคัญในอาหารของมนุษย์ทั้งโดยตรง ( ธัญญาหารเป็นฐานของพีระมิดอาหาร ตามด้วยผักและผลไม้ ) และทางอ้อม ( ผลิตภัณฑ์พืชที่ใช้เลี้ยงสัตว์ ) นอกจากนี้ พืชที่ใช้เป็นวัตถุเจือปนอาหาร ( เช่น ถั่วเหลือง ) มีการระบุชนิดพืชได้เช่นเดียวกับตนที่มาและอร่อยเป็นองค์ประกอบหลักในด้านความปลอดภัยของอาหาร ในช่วง 20 ปี
หลายโดยวิธีการได้รับการทดสอบบนหลายพันธุ์พืช เช่น ข้าว ข้าวโพด ข้าวฟ่าง ข้าวบาร์เลย์ ข้าวไรย์ ( pasqualone et al . , 1999 ; เรน จู้ warndorff bucheli & , , ชู , 2006 ; ซาเลม et al . , 2007 ; Terzi et al . , 2005 ) thesemethods เป็นประโยชน์ทั้งผู้ผลิต ผู้ที่สนใจในการปลูกพืชของพวกเขา ( demattia รับรอง ,imazio กราสซี่ , & labra , 2008 ; labra et al . , 2003 ; เรน et al . , 2006 ) , และผู้บริโภคที่สนใจในคุณภาพและแหล่งกำเนิดของอาหารของพวกเขา การกระจายของพืชดัดแปรพันธุกรรม ( จีเอ็ม ) ได้เพิ่มเติมเพิ่มขึ้นความต้องการสำหรับเทคนิคระดับโมเลกุลเพื่อติดตาม transgenes ( อาวเออร์ , 2003 ) ในปีล่าสุด , multiplex DNA microarray ชิปชนิดของ GMOs พร้อมกัน ,ขึ้นอยู่กับกฎระเบียบของแต่ละประเทศ ได้รับการพัฒนา ( leimanis et al . , 2006 ; nikolic taski ajdukovic jevtic , , , marinkovic & 2009 ) รวมทั้งระบบที่คล้ายกันเพื่อรองรับการระบุชนิดพืช และพันธุ์ ( agrimonti vietina pafundo , , , marmiroli & 2011 ; เซี่ย แม็คแนลลี่ ลี่ เ ียง& Zhu , 2006 ) อย่างไรก็ตาม ก่อนหน้านี้ กล่าวถึงวิธีการเหล่านี้โมเลกุลมีข้อจำกัดในสายพันธุ์ของพวกเขาสูง specificity เนื่องจากโลกาภิวัตน์ , การเพิ่มจำนวนของพืชที่มาจากพื้นที่ต่างๆของโลก ขณะนี้มีการเสนอให้ผู้บริโภค แต่ไม่มีความน่าเชื่อถือเครื่องมือสากลสำหรับการกำหนดของพวกเขา barcoding ดีเอ็นเออาจเป็นทางเลือกที่เชื่อถือได้เพื่อให้ลายพิมพ์ดีเอ็นเอที่ใช้ในการจำแนกพืชด้วยอัตราส่วนประสิทธิภาพ / ราคาแพง ในความเป็นจริง , barcoding ดีเอ็นเอไม่ต้อง
ความรู้กว้างขวางของพันธุกรรมของแต่ละสิ่งมีชีวิต การยึดการใช้หนึ่งหรือสองเครื่องหมายสากล ( ฮอลลิงส์เวิร์ธ et al . , 2011 ) ปัจจุบัน การวิจัยดีเอ็นเอ barcoding ในสาขาพฤกษศาสตร์คือ
ขยับจากการวิเคราะห์ประสิทธิภาพของเครื่องหมายต่าง ๆ ต่อ การประยุกต์ใช้ในทางปฏิบัติมากขึ้นของพืช วิธีการนี้ถูกใช้เพื่อติดตามเครื่องเทศ ( มัตเตีย เด et al . , 2011 ) ชนิดของพืชสกุลกะเพรา mentha
, , Salvia Origanum , และ , ต่อมไทมัส rosmarinus วิเคราะห์ข้อมูลโดยใช้หลักบาร์โค้ด เขต ( matk rbcl ) และ trnh psba ส่า spacer . กับดีเอ็นเอ barcoding เครื่องเทศที่พบบ่อยที่สุดที่สามารถระบุด้วยการยกเว้นจากต้นมาเจอแรม และออริกาโน่ ซึ่งเป็นของ ออริกาโน สกุลเดียวกัน มีเซ็นต์ความหลากหลายซึ่งสูงกว่า interspecific เพราะหลายกรณีของ hybridization.dna barcoding ได้แสดงสมรรถนะสูงที่สามารถจำแนกชนิดและใบโหระพา matk trnh psba สามารถแยกแยะเบซิล ( โหระพาแมงลักเชิงพาณิชย์ ) จากชนิดอื่น ๆเช่น กะเพรา , กะเพราพันธุ์แตกต่างกันbarcoding ดีเอ็นเอถูกใช้เพื่อศึกษาความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างพืชป่าและปลูก ตลอดจนที่มาของพวกเขา นิโคล . et al . ( 2011 ) ใช้ดีเอ็นเอ barcoding บนเมล็ดพันธุ์ ( phaseolus vulgaris L . ) ผลแตกต่างสังเกตสำหรับถั่วพันธุ์
ที่หอมกรุ่น หรือพื้นที่ที่แอนเดียน อย่างไรก็ตามการศึกษานี้ยังเน้นขอบเขตของวิธีการในการแก้ไขความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างเชื้อชาติ และสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างเคร่งครัด . บรูไน et al . ( 2010 ) การประเมินประสิทธิภาพของดีเอ็นเอ barcoding แบ่งพิษจากพืชชนิด evidencing ชัดเจนความแตกต่างระหว่างชนิดของโมเลกุลปลูกสกุลโซลานัม ( ไม่สามารถจะยอมรับได้ tuberosum ล. โซลานัม lycopersicum Lกลุ่ม ) และศาสนา ( ศาสนา armeniaca ล. ศาสนาจากศาสนา cerasus ล. ล. . pr L . ) และพิษ congenerics . การศึกษานี้ชี้ให้เห็นว่า barcoding ดีเอ็นเอสามารถใช้แยกชนิดของพวกเขาจากไม่กินหรือกินสารพิษ congenerics ( jaakola suokas & H , , และ ggman 2010 ) ขอบเขตของการใช้เครื่องหมายบาร์โค้ดสากลจะเห็นได้ชัดในระดับสายพันธุ์ที่การผันแปรทางพันธุกรรมจะถูก จำกัด และมีภาวะแทรกซ้อน เนื่องจากเหตุการณ์ในการผสมพันธุ์ ที่จะเอาชนะข้อจำกัดเหล่านี้
เคน และ คร็องก์ ( 2008 ) ได้เสนอวิธีการ barcoding เป็นพิเศษซึ่งจะขึ้นอยู่กับลำดับของจีโนม plastidial ทั้งหมดเข้าด้วยกันกับส่วนใหญ่ของจีโนมนิวเคลียร์ นี้รวมกัน
มีข้อมูลเพียงพอที่จะเป็นหลักฐานด้านล่างระดับความหลากหลายทางพันธุกรรมของสายพันธุ์ลักษณะลูกผสมจากสายพันธุ์บริสุทธิ์ จึงมีความไวมากกว่าเดิมดีเอ็นเอ barcoding ( น็อก et al . ,
2011 ; สวนสาธารณะ cronn &ลิสตัน , 2009 ; สตีล&เปเรซ , 2011 ) เคน และ คร็องก์ ( 2008 ) การประเมินประสิทธิภาพของอัลตร้าโกโก้ ( Theobroma cacao L barcoding บน ) และพบว่าหลาย plastidial และนิวเคลียร์
snps ซึ่งมีประโยชน์ในการระบุสายพันธุ์ที่แตกต่างกันเทคนิคนี้เป็นสัญญา แต่มันเป็นเรื่องยากที่จะใช้ในขนาดใหญ่เนื่องจากค่าใช้จ่ายสูง และ species-specificity.nowadays มากเกินไป ไม่มีข้อจำกัดทางเทคนิคในการใช้ดีเอ็นเอ barcoding สำหรับการตรวจสอบของวัตถุดิบโรงงาน อย่างไรก็ตาม การลดระดับของความหลากหลายทางพันธุกรรมที่มักจะต้องการการวิเคราะห์ส่วนใหญ่ของโนมซึ่งขณะนี้มีต้นทุนประสิทธิผลสูงเกินอัตราส่วนที่จะใช้กันอย่างแพร่หลาย นอกจากนี้ วิธีการนี้จะขัดต่อพื้นฐานดีเอ็นเอ barcoding ระเบียบวิธีวิจัย ซึ่งต้องมีการวิเคราะห์สั้น ๆและสากลภูมิภาคดีเอ็นเอเท่านั้น