P < 0.03%,
Mn < 1%, C < 0.02%, Fe balance) immersed in a tank filled with
continuously renewed seawater from Genoa harbour (Italy).
Biocathodes were formed under constant polarization
at 0.20 V/SCE for several days and collected when a stable
current density in the 200e400 mA m2 range was obtained
(Bergel et al., 2005). The biocathodes were stored at 4 C in
seawater before being used. The multispecies biocathodes were
placed in a Petri dish and the biofilm was removed from the
electrode by scraping in 5 ml of sterile synthetic seawater. The
biofilm samples were then used to isolate heterotrophic aerobic
bacteria.
Isolation and identification of heterotrophic bacteria
Two different recovery media were used to grow the bacteria
using the initial biofilm as inoculum: either plates of Marine Agar
(MA, Difco Laboratories, Detroit, Mich.) or plates of synthetic
seawater (standard ASTM D1141-90) (agar 7%) supplemented with
1 g L1 of glucose as a carbon source. Cultures were performed at
30 C. Microorganisms collected from the plates were then cultured
in liquid medium (marine broth (Difco) diluted 3 times) and finally
stored at 20 C in the same medium supplemented with 20% (v/v)
glycerol.
DNA was extracted from four microbial colonies collected on
Marine Agar plates using the MOBIO PowerSoil ® DNA Isolation
kit, according to the manufacturer's instructions. DNA concentrations were checked by reading the absorbance at 260 nm. As
these concentrations were too low, DNA amplification was performed by PCR with 16S universal primers p8fpl (50 AGA GTT TGA
TCC TGG CTC AG 30) and p806R (50 GGA CTA CCA GGG TAT CTA AT
30) (Invitrogen TM) (McCabe et al., 1999). PCR reaction was performed in a final volume of 50 mL with 0.25 mL of GoTaq® DNA
polymerase (Promega), 5 mL of forward and reverse primers, 10 mL
of GoTaq Reaction buffer (Promega), 1 mL of nucleotide mix
(Promega), 10 mL of DNA template, and 18.75 mL of nuclease free
water. The PCR protocol was: initial denaturation (95 C for
4 min), denaturation (94 C for 1 min), annealing (55 C (McCabe
et al., 1999) for 2 min, 30 cycles), extension (72 C for 2 min) and
final extension (72 C for 10 min) (Recommended Thermal Cycling
Conditions for GoTaq® DNA Polymerase). The samples were sent
to Eurofins Company where 16S rDNA gene sequencing (Sanger
technique) was performed. Once sequencing was completed, data
were analysed using BLASTn (NCBI website) for the genus
identification.
< 0.03% PMn < 1%, < 0.02% C ดุล Fe) แช่ในถังเต็มไปด้วยอย่างต่อเนื่องต่อน้ำทะเลจากท่าเรือของเจนัว (อิตาลี)Biocathodes เกิดขึ้นภายใต้คงโพลาไรซ์ที่ 0.20 V/SCE หลายวัน และรวบรวมเมื่อมั่นคงความหนาแน่นของกระแสในช่วง m2 mA 200e400 ได้รับ(Bergel et al. 2005) Biocathodes ถูกเก็บไว้ที่ 4 C ในน้ำทะเลก่อนที่จะถูกใช้ Multispecies biocathodes ได้วางในจานเพาะ และ biofilm ถูกเอาออกจากการอิเล็กโทรด โดยขูดใน 5 มล.น้ำทะเลสังเคราะห์ที่ผ่านการฆ่าเชื้อ การตัวอย่าง biofilm จากนั้นใช้ในการแยก heterotrophic แอโรบิกเชื้อแบคทีเรียแยกการ heterotrophic แบคทีเรียและใช้สื่อการกู้คืนที่แตกต่างกันสองเติบโตแบคทีเรียใช้ biofilm เริ่มต้นเป็น inoculum: จานทั้งอาหารทะเล(MA ห้องปฏิบัติการ Difco ดีทรอยต์ Mich.) หรือเป็นแผ่นสังเคราะห์น้ำทะเล (มาตรฐาน ASTM D1141-90) (อาหาร 7%) เสริมด้วยg 1 L1 ของกลูโคสเป็นแหล่งคาร์บอน วัฒนธรรมดำเนินการที่รวบรวมจากแผ่น 30 เซลเซียสจุลินทรีย์ได้แล้วอ่างในสื่อของเหลว (น้ำซุป (Difco) เจือจาง 3 ครั้ง) และในที่สุดเก็บที่ 20 C ในตัวกลางเดียวกันเสริม ด้วย 20% (v/v)กลีเซอรอลดีเอ็นเอที่ถูกแยกจากอาณานิคมจุลินทรีย์สี่ที่รวบรวมไว้ในจานอาหารทะเลที่ใช้แยกดีเอ็นเอของ® MOBIO PowerSoilชุด ตามคำแนะนำของผู้ผลิต ความเข้มข้นของดีเอ็นเอได้ถูกตรวจสอบ โดยการอ่าน absorbance ที่ 260 nm เป็นความเข้มข้นเหล่านี้ได้ต่ำเกินไป ทำขยายดีเอ็นเอ โดย PCR ด้วย 16S ไพรเมอร์สากล p8fpl (50 เอ GTT TGAไทยคันทรีคลับ TGG CTC AG 30) และ p806R (50 GGA CTA CCA GGG ททท. CTA AT30 (Invitrogen TM) (McCabe et al. 1999) ทำปฏิกิริยา PCR ใน 50 มล.ด้วย GoTaq ® DNA 0.25 มิลลิลิตรระดับสุดท้ายพอลิเมอเรส (Promega), 5 มล.ของไปข้างหน้า และย้อนกลับไพรเมอร์ 10 มล.บัฟเฟอร์ปฏิกิริยา GoTaq (Promega), นิวคลีโอไทด์ 1 มิลลิลิตรผสมมล. (Promega), 10 mL ของดีเอ็นเอต้นแบบ และ 18.75 nuclease ฟรีน้ำ โพรโทคอล PCR ถูก: denaturation เริ่มต้น (95 C สำหรับ4 นาที), denaturation (C 94 1 นาที), หลอม (55 C (McCabeet al. 1999) 2 นาที 30 รอบ), นามสกุล (72 C สำหรับ 2 นาที) และนามสกุลสุดท้าย (72 C 10 นาที) (แนะนำความร้อนขี่จักรยานเงื่อนไขสำหรับพอลิเมอเรส DNA GoTaq ®) ส่งตัวอย่างบริษัท Eurofins ที่ลำดับเบสของยีน rDNA (Sanger 16Sเทคนิค) ได้ดำเนินการ เมื่อเสร็จสิ้นการจัดลำดับ ข้อมูลได้วิเคราะห์โดยใช้ BLASTn (เว็บไซต์ NCBI) สำหรับสกุลรหัส
การแปล กรุณารอสักครู่..

P <0.03%
Mn <1%, C <0.02% สมดุลเฟ) แช่ในถังที่เต็มไปด้วย
น้ำทะเลต่ออายุอย่างต่อเนื่องมาจากเจนัวฮาร์เบอร์ (อิตาลี).
Biocathodes ถูกจัดตั้งขึ้นภายใต้โพลาไรซ์คงที่
ที่ 0.20 V / SCE เป็นเวลาหลายวันและเก็บรวบรวม เมื่อมีเสถียรภาพ
ความหนาแน่นกระแสในช่วง m2 200e400 mA ที่ได้รับ
(Bergel et al., 2005) biocathodes ถูกเก็บไว้ที่ 4 ซีใน
น้ำทะเลก่อนที่จะถูกนำมาใช้ biocathodes multispecies ถูก
วางไว้ในจานเลี้ยงเชื้อและไบโอฟิล์มจะถูกลบออกจาก
ขั้วไฟฟ้าโดยขูดใน 5 มิลลิลิตรของน้ำทะเลสังเคราะห์ผ่านการฆ่าเชื้อ
ตัวอย่างฟิล์มถูกนำมาใช้แล้วจะแยกแอโรบิก heterotrophic
แบคทีเรีย.
การแยกและจำแนกชนิดของเชื้อแบคทีเรีย heterotrophic
สองสื่อการกู้คืนที่แตกต่างกันถูกนำมาใช้ในการเจริญเติบโตแบคทีเรีย
ใช้ไบโอฟิล์มครั้งแรกเป็นเชื้อ: ทั้งแผ่นทางทะเลวุ้น
(MA, Difco ห้องปฏิบัติการ, ดีทรอยต์, มิชิแกน ) หรือแผ่นสังเคราะห์
น้ำทะเล (มาตรฐาน ASTM D1141-90) (agar 7%) เสริมด้วย
1 กรัม L1 ของน้ำตาลกลูโคสเป็นแหล่งคาร์บอน วัฒนธรรมที่ได้รับการดำเนินการใน
วันที่ 30 องศาเซลเซียสจุลินทรีย์ที่เก็บรวบรวมจากแผ่นแล้วเพาะเลี้ยง
ในอาหารเหลว (ทะเลน้ำซุป (Difco) ปรับลดครั้งที่ 3) และในที่สุดก็
เก็บไว้ที่ 20 องศาเซลเซียสในสื่อเดียวกันเสริมด้วย 20% (v / v)
กลีเซอรอล.
ดีเอ็นเอ ถูกสกัดจากสี่อาณานิคมของจุลินทรีย์ที่รวบรวมไว้ใน
แผ่นวุ้นทางทะเลโดยใช้ Mobio PowerSoil ®ดีเอ็นเอแยก
ชุดตามคำแนะนำของผู้ผลิต ความเข้มข้นของดีเอ็นเอถูกตรวจสอบโดยการอ่านการดูดกลืนแสงที่ 260 นาโนเมตร ในฐานะที่เป็น
ความเข้มข้นเหล่านี้ต่ำเกินไปดีเอ็นเอได้ดำเนินการโดยวิธี PCR กับ 16S สากลไพรเมอร์ p8fpl (50 AGA GTT TGA
TCC TGG CTC เอจี 30) และ p806R (50 GGA CTA CCA GGG ททท CTA AT
30) (Invitrogen TM) (McCabe, et al ., 1999) ปฏิกิริยา PCR ที่ได้ดำเนินการในปริมาณสุดท้ายของ 50 มล 0.25 มลGoTaq®ดีเอ็นเอ
โพลิเมอร์ (Promega) 5 มิลลิลิตรไปข้างหน้าและไพรเมอร์ 10 มลย้อนกลับ
ของ GoTaq บัฟเฟอร์ปฏิกิริยา (Promega) 1 มิลลิลิตรผสมเบื่อหน่าย
(Promega) 10 มิลลิลิตรของแม่แบบดีเอ็นเอและ 18.75 มล Nuclease ฟรี
น้ำ โปรโตคอล PCR คือ: denaturation ครั้งแรก (95 องศาเซลเซียสเป็นเวลา
4 นาที), denaturation (94 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 1 นาที) การหลอม (55 C (McCabe
นามสกุล (72 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 2, et al, 1999) เป็นเวลา 2 นาที 30 รอบ.) นาที) และ
ขยายสุดท้าย (72 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 10 นาที) (แนะนำความร้อน
เงื่อนไขในการGoTaq® DNA Polymerase) กลุ่มตัวอย่างที่ถูกส่ง
ไปยัง บริษัท ที่ Eurofins 16S rDNA ยีนลำดับ (Sanger
เทคนิค) ได้ดำเนินการ เมื่อเสร็จสมบูรณ์ลำดับข้อมูล
ที่ได้มาวิเคราะห์โดยใช้ดังกล่าวหา (เว็บไซต์ NCBI) สำหรับพืชและสัตว์
ประจำตัวประชาชน
การแปล กรุณารอสักครู่..

P < 0.03 %และ < 1% , C < 0.02 % Fe สมดุล ) แช่ในถัง เต็ม ไป ด้วยอย่างต่อเนื่องต่ออายุน้ำทะเลจากอ่าวเจนัว ( อิตาลี )biocathodes ถูกสร้างขึ้นภายใต้ขนาดคงที่ที่ 0.20 v / สวยหลายๆ วัน และรวบรวมเมื่อมั่นคงความหนาแน่นของกระแสในช่วง 200e400 M2 ได้มา( เบอร์เจล et al . , 2005 ) การ biocathodes เก็บรักษาที่อุณหภูมิ 4 องศาเซลเซียสในน้ำทะเล ก่อนการใช้ การ multispecies biocathodes คือวางในจาน Petri และฟิล์มถูกลบออกจากขั้วไฟฟ้าโดยขูด 5 ml ของน้ำทะเลสังเคราะห์ที่เป็นหมัน ที่ตัวอย่างฟิล์มแล้วใช้เพื่อแยกแบบแอโรบิกแบคทีเรียการแยกและจำแนกแบบแบคทีเรียสองสื่อการกู้คืนที่แตกต่างกันถูกนำมาใช้เพื่อขยายเชื้อแบคทีเรียใช้ฟิล์มเป็นเชื้อเริ่มต้นอย่างใดอย่างหนึ่งจานวุ้น มารีน( แม่ difco ห้องปฏิบัติการ , ดีทรอยต์ , ลอนดอน ) หรือแผ่นสังเคราะห์น้ำทะเล ( d1141-90 ASTM มาตรฐาน ) ( วุ้น 7 % ) เสริมด้วย1 g l1 กลูโคสเป็นแหล่งคาร์บอน . วัฒนธรรม มีการปฏิบัติที่30 องศาเซลเซียส จุลินทรีย์ที่เก็บจากจาน แล้วเพาะเลี้ยงในอาหารเหลว ( มารีนซุป ( difco ) จำนวน 3 ครั้ง ) และสุดท้ายเก็บไว้ที่อุณหภูมิ 20 องศาเซลเซียส ในตัวกลางเดียวกันเสริม 20 เปอร์เซ็นต์ ( v / v )กลีเซอรอล .ดีเอ็นเอจากสี่จุลินทรีย์ที่เก็บในอาณานิคมแผ่นวุ้นทางทะเลโดยใช้ mobio powersoil ®การสกัดดีเอ็นเอชุด ตามคำแนะนำของผู้ผลิต ปริมาณดีเอ็นเอตรวจสอบ โดยอ่านค่าการดูดกลืนแสงที่ 260 นาโนเมตร เป็นความเข้มข้นเหล่านี้ต่ำเกินไป การเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอด้วยวิธี PCR กับการใช้ไพรเมอร์ p8fpl สากล ( 50 gtt ด้วยสTCC tgg CTC AG 30 ) และ p806r ( 50 ก๊ะ CTA CCA GGG CTA ที่ททท.30 ) ( Invitrogen TM ) ( แมคเคบ et al . , 1999 ) ปฏิกิริยา PCR แสดงในหมวดสุดท้าย 50 ml 0.25 มล. gotaq ®ดีเอ็นเอการ ( promega ) 5 มิลลิลิตร ไปข้างหน้าและย้อนกลับ ไพรเมอร์ 10 มล.ปฏิกิริยาของบัฟเฟอร์ gotaq ( promega ) 1 ml เบสผสม( promega ) 10 ml ของแม่แบบดีเอ็นเอ และ 18.75 มิลลิลิตรของนิวเคลียสฟรีน้ำ pcr โปรโตคอล : เริ่มต้น ( ( 95 C สำหรับ4 นาที ) ( ( 94 องศาเซลเซียสนาน 1 นาที ) อบ 55 C ( แมคเคบet al . , 1999 ) สำหรับ 2 นาที 30 รอบ ) , นามสกุล ( 72 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 2 นาที ) และส่วนขยายสุดท้าย ( 72 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 10 นาที ) ( แนะนำให้ใช้ความร้อนจักรยานเงื่อนไขสำหรับ gotaq ® DNA polymerase ) จำนวนส่งไปยัง บริษัท ที่ยีน 16S rDNA ( ลำดับ eurofins แซงเกอร์เทคนิค ) กำหนด เมื่อหาข้อมูลเสร็จวิเคราะห์ข้อมูลโดยใช้ blastn ( เว็บไซต์ ncbi ) สกุลรหัส
การแปล กรุณารอสักครู่..
