The aim of this study was to test the hypothesis that M. alfredi
and M. birostris are separately evolving species, using nuclear DNA
(nDNA) and mitochondrial DNA (mtDNA) sequence data. Ancient
divergence might be accompanied by large net interspecific genetic
distance and reciprocal monophyly in both genetic markers (Avise,
2004). Alternatively, recent divergence might be characterised by a
smaller amount of net distance and possible polyphyly or paraphyly
(Funk and Omland, 2003). In this case, the challenge is to
determine whether or not the shared genetic variation between
species is due to post-divergence gene flow (i.e. isolation with
migration: IM) or is simply a remnant of variation in the common
ancestor (incomplete lineage sorting: ILS). Traditionally, interpretation
favouring one hypothesis over another has been made based
on qualitative evidence including (1) tree topology, (2) contrasting
patterns in nDNA and mtDNA, and (3) the geographic distribution
of paraphyletic or polyphyletic lineages (Avise, 2004). More recently,
advances in coalescent theory enabled model-based parameter
estimation and hypothesis testing for recent divergence (e.g.
‘Isolation-with-Migration model’) (Hey and Machado, 2003;
Knowles, 2004; Nielsen and Beaumont, 2009). Although both IM
The aim of this study was to test the hypothesis that M. alfredi
and M. birostris are separately evolving species, using nuclear DNA
(nDNA) and mitochondrial DNA (mtDNA) sequence data. Ancient
divergence might be accompanied by large net interspecific genetic
distance and reciprocal monophyly in both genetic markers (Avise,
2004). Alternatively, recent divergence might be characterised by a
smaller amount of net distance and possible polyphyly or paraphyly
(Funk and Omland, 2003). In this case, the challenge is to
determine whether or not the shared genetic variation between
species is due to post-divergence gene flow (i.e. isolation with
migration: IM) or is simply a remnant of variation in the common
ancestor (incomplete lineage sorting: ILS). Traditionally, interpretation
favouring one hypothesis over another has been made based
on qualitative evidence including (1) tree topology, (2) contrasting
patterns in nDNA and mtDNA, and (3) the geographic distribution
of paraphyletic or polyphyletic lineages (Avise, 2004). More recently,
advances in coalescent theory enabled model-based parameter
estimation and hypothesis testing for recent divergence (e.g.
‘Isolation-with-Migration model’) (Hey and Machado, 2003;
Knowles, 2004; Nielsen and Beaumont, 2009). Although both IM
การแปล กรุณารอสักครู่..
![](//thimg.ilovetranslation.com/pic/loading_3.gif?v=b9814dd30c1d7c59_8619)
จุดมุ่งหมายของการศึกษานี้คือ เพื่อทดสอบสมมติฐานที่ว่า ม. alfredi
. birostris จะแยกกันพัฒนาสายพันธุ์โดยใช้
ดีเอ็นเอนิวเคลียร์ ( ndna ) และไมโตคอนเดรียดีเอ็นเอ ( แสดง ) ข้อมูลลำดับ Divergence โบราณ
อาจจะมีขนาดใหญ่สุทธิ interspecific พันธุกรรม
ระยะทางและ monophyly ซึ่งกันและกันทั้งในเครื่องหมายพันธุกรรม ( วีเซ่
, 2004 ) หรือความแตกต่างล่าสุดอาจจะมีลักษณะโดย
เล็กน้อยของระยะทางสุทธิ และเป็นไปได้ polyphyly หรือ paraphyly
( คนขี้ขลาดและ omland , 2003 ) ในกรณีนี้ ความท้าทายคือการตรวจสอบว่า หรือไม่ใช้
ทางพันธุกรรมระหว่างสายพันธุ์เนื่องจากความแตกต่างของยีนการโพสต์ ( เช่นแยกกับ
การย้ายถิ่น : IM ) หรือเป็นเพียงเศษเสี้ยวของการเปลี่ยนแปลงในบรรพบุรุษ
( สมบูรณ์เชื้อสายการเรียงลำดับ : ILS ) ประเพณีการตีความ
สมมติฐานหนึ่งนิยมกันได้ตาม
หลักฐานเชิงคุณภาพประกอบด้วย ( 1 ) แบบต้นไม้ ( 2 ) ตัดกัน
รูปแบบและ ndna แสดง และ ( 3 ) การกระจายทางภูมิศาสตร์ของ paraphyletic
หรือ polyphyletic พันธุ์ ( วีเซ่ , 2004 ) เมื่อเร็วๆ นี้ เปิดใช้งานสำหรับการรวมตัว
ความก้าวหน้าในทฤษฎีการประมาณค่าพารามิเตอร์และการทดสอบสมมติฐานสำหรับความแตกต่างล่าสุด
( เช่น' ' การแยกรุ่น ) ( นี่ มาชาโด้ , 2003 ;
โนวส์ , 2004 ; Nielsen และบรูมอนท์ , 2009 ) แม้ว่าทั้งม
การแปล กรุณารอสักครู่..
![](//thimg.ilovetranslation.com/pic/loading_3.gif?v=b9814dd30c1d7c59_8619)