Flow diagram showing the different

Flow diagram showing the different steps in the analysis of microbial
community structure by PCR-DGGE. DNA is extracted from an
environmental sample and used as template in the polymerase chain
reaction (PCR) to amplify the 16s rRNA encoding genes of bacteria.
Thereafter, the PCR products are separated by denaturing gradient gel
electrophoresis (DGGE) (lane 1). The phylogenetic affiliation of the
predominant community members, as represented in the DGGE band
pattern, can be inferred by comparative analysis of sequences from
excised and re-amplified DNA fragments (lanes 2-7) and sequences
stored in nucleotide databases. Moreover, the sequence information
can be used to design an oligonucleotide probe for the detection of a
specific bacterial population by fluorescence in situ hybridisation
(FISH). (a) A photograph of a microbial community stained with the
DNA-binding fluorochrome DAPI resulting in blue light emission from
all bacteria after UV illumination. (b) The same microbial community
after incubation with a red fluorochrome-labelled oligonucleotide probe
specific for the bacterial population represented by the sequence
obtained from band 3 in the denaturing gradient gel.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

แผนภาพการไหลของการแสดงขั้นตอนที่แตกต่างกันในการวิเคราะห์จุลินทรีย์โครงสร้างชุมชนโดย PCR-DGGE ดีเอ็นเอแยกจากตัวอย่างด้านสิ่งแวดล้อมและใช้เป็นแม่แบบในห่วงโซ่โพลิเมอร์ปฏิกิริยา(PCR) เพื่อขยายการเข้ารหัส 16s rRNA ยีนของแบคทีเรีย. หลังจากนั้นผลิตภัณฑ์ PCR จะถูกคั่นด้วยการไล่ระดับสี denaturing เจลอิเล็ก(DGGE) (ช่องทางที่ 1) สังกัดสายวิวัฒนาการของสมาชิกในชุมชนที่โดดเด่นเป็นตัวแทนใน DGGE วงดนตรีรูปแบบสามารถสรุปจากการวิเคราะห์เปรียบเทียบลำดับจากพอร์ทอีกครั้งและขยายดีเอ็นเอ(เลน 2-7) และลำดับที่เก็บไว้ในฐานข้อมูลเบื่อหน่าย นอกจากนี้ยังมีข้อมูลลำดับที่สามารถนำมาใช้ในการออกแบบการสอบสวน oligonucleotide สำหรับการตรวจสอบของประชากรโดยเฉพาะแบคทีเรียเรืองแสงในhybridisation แหล่งกำเนิด(ปลา) (ก) การถ่ายภาพของชุมชนจุลินทรีย์เปื้อนกับDAPI fluorochrome ดีเอ็นเอผูกพันที่เกิดขึ้นในการปล่อยแสงสีฟ้าจากเชื้อแบคทีเรียทั้งหมดหลังจากยูวีส่องสว่าง (ข) กลุ่มจุลินทรีย์เดียวกันหลังจากการบ่มด้วยสีแดงที่มีข้อความoligonucleotide-fluorochrome สอบสวนเฉพาะสำหรับประชากรแบคทีเรียที่แสดงโดยลำดับที่ได้รับจากวงเจลที่3 ในการไล่ระดับสี denaturing

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

แผนผังแสดงขั้นตอนต่าง ๆ ในการวิเคราะห์โครงสร้างชุมชนจุลินทรีย์
โดยดีเอ็นเอ 9 แถบบ่งชี้ . ดีเอ็นเอที่สกัดจาก
ตัวอย่างสิ่งแวดล้อมและใช้เป็นแม่แบบในปฏิกิริยาลูกโซ่
reaction ( PCR ) เพื่อขยายการเข้ารหัสยีน 16S rRNA ของแบคทีเรีย .
หลังจากนั้นผลิตภัณฑ์ PCR จะแยกจากกันโดยี่ลาดเจล
electrophoresis ( การทดลอง ) ( ช่องที่ 1 )ความร่วมมือของสมาชิกในชุมชน ซึ่ง
) ตามที่แสดงในการทดลองวงดนตรี
แบบแผน สามารถสรุปโดยการวิเคราะห์เปรียบเทียบลำดับจาก
ตัดและชิ้นส่วนของดีเอ็นเออีกครั้ง ( เลน 2-7 ) และลำดับ
เก็บไว้ในฐานข้อมูลลำดับเบส . นอกจากนี้ การเรียงลำดับข้อมูล
สามารถใช้ในการออกแบบ ซึ่งการสอบสวนเพื่อตรวจหาของ
โดยเฉพาะประชากรแบคทีเรียเรืองแสงใน situ ไฮบริไดเซชัน
( ปลา ) ( 1 ) รูปถ่ายของชุมชนของจุลินทรีย์ที่เปื้อน
ดีเอ็นเอมัดฟลู โรโครม dapi เป็นผลในการเปล่งแสงสีฟ้าจาก
แบคทีเรียทั้งหมดหลังจากแสงยูวี ( ข ) เดียวกันจุลินทรีย์ชุมชน
หลังจากบ่มด้วยสีแดง ซึ่งสอบสวน
ชื่อฟลู โรโครมที่เฉพาะเจาะจงสำหรับประชากรแบคทีเรียแทนด้วยลำดับ
ได้รับจากวงดนตรี 3 ในสี่ลาดเจล