A sugary mutant with low total star

A sugary mutant with low total starch and high sugar contents was compared with its wild type Sindongjin for
grain-filling caryopses. In the present study, developing seeds of Sindongjin and sugary mutant from the 11th
day after flowering (DAF) were subjected to RNA sequencing (RNA-Seq). A total of 30,385 and 32,243 genes
were identified in Sindongjin and sugary mutant. Transcriptomic change analysis showed that 7713 differentially
expressed genes (DEGs) (log2 fold change ≥1, false discovery rate (FDR) ≤ 0.001) were identified based on our
RNA-Seq data, with 7239 genes up-regulated and 474 down-regulated in the sugary mutant. A large number of
DEGs were found related to metabolic, biosynthesis of secondary metabolites, plant-pathogen interaction,
plant hormone signal transduction and starch/sugar metabolism. Detailed pathway dissection and quantitative
real time PCR (qRT-PCR) demonstrated that most genes involved in sucrose to starch synthesis are upregulated, whereas the expression of the ADP-glucose pyrophosphorylase small subunit (OsAGPS2b) catalyzing
the first committed step of starch biosynthesis was specifically inhibited during the grain-filling stage in sugary
mutant. Further analysis suggested that the OsAGPS2b is a considerable candidate gene responsible for phenotype
of sugary mutant.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Mutant ไพเราะต่ำรวมแป้งและน้ำตาลสูงเนื้อหาถูกเปรียบเทียบกับป่าชนิด Sindongjin สำหรับธัญ filling caryopses ในปัจจุบันการศึกษา พัฒนาเมล็ด Sindongjin และ mutant ไพเราะจาก 11 แบบวันหลังจาก flowering (เยอรมัน) ถูกต้องลำดับเบส (อาร์เอ็นเอลำดับ) อาร์เอ็นเอ ผลรวมของยีน 30,385 และ 32,243identified Sindongjin และ mutant ไพเราะได้ วิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงของ Transcriptomic พบว่า 7713 differentiallyแสดงยีน (DEGs) (log2 พับเปลี่ยน ≥1 ค้นหาเท็จอัตรา (FDR) ≤ 0.001) ได้ตาม identified ของเราอาร์เอ็นเอลำดับข้อมูล ยีน 7239 ขึ้นระเบียบ และ 474 ลงระเบียบใน mutant ไพเราะ เป็นจำนวนมากDEGs พบที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญ การสังเคราะห์ของ metabolites รอง การโต้ตอบ โรงงานการศึกษาฮอร์โมนพืชสัญญาณ transduction และแป้ง/น้ำตาลเผาผลาญ รายละเอียดทางเดินชำแหละ และเชิงปริมาณเวลาจริง PCR (qRT-PCR) แสดงว่า ยีนเกี่ยวข้องกับซูโครสแป้งสังเคราะห์ส่วนใหญ่เป็น upregulated ในขณะที่ค่าของการ ADP กลูโคส pyrophosphorylase ย่อยขนาดเล็ก (OsAGPS2b) catalyzingขั้นตอนการกำหนดให้ first ของชีวสังเคราะห์แป้งถูกห้ามในช่วงระยะเมล็ด filling ในไพเราะ specificallymutant วิเคราะห์เพิ่มเติมแนะนำว่า OsAGPS2b ยีนผู้สมัครจำนวนมากชอบ phenotypeของ mutant ไพเราะ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

กลายพันธุ์หวานที่มีแป้งต่ำและปริมาณน้ำตาลสูงเมื่อเทียบกับประเภทป่า Sindongjin สำหรับ
Fi grain- caryopses lling ในการศึกษาการพัฒนาเมล็ดพันธุ์ของ Sindongjin และกลายพันธุ์หวานจาก 11
วันหลังจากที่ชั้น owering (DAF) ถูกยัดเยียดให้ลำดับอาร์เอ็นเอ (RNA-Seq) รวมของ 30385 และ 32243 ยีน
เป็นเอ็ดสายการระบุใน Sindongjin และกลายพันธุ์หวาน การวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลง transcriptomic แสดงให้เห็นว่า 7713 แตกต่าง
ของยีนที่แสดงออก (degs) (log2 พับเปลี่ยนแปลง≥1อัตราการค้นพบที่ผิดพลาด (FDR) ≤ 0.001) เป็นเอ็ดสายการระบุขึ้นอยู่กับเรา
ข้อมูล RNA-Seq กับ 7239 ยีนขึ้นควบคุมและ 474 ควบคุมลงใน กลายพันธุ์หวาน จำนวนมากของ
degs ถูกค้นพบที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญอาหาร, การสังเคราะห์ของสารทุติยภูมิปฏิสัมพันธ์พืชเชื้อโรค,
ฮอร์โมนพืชสัญญาณและแป้ง / การเผาผลาญน้ำตาล ผ่าทางเดินรายละเอียดและปริมาณ
time PCR จริง (qRT-PCR) แสดงให้เห็นว่ายีนที่สุดที่เกี่ยวข้องในซูโครสในการสังเคราะห์แป้งจะ upregulated ขณะที่การแสดงออกของ ADP กลูโคส pyrophosphorylase subunit ขนาดเล็ก (OsAGPS2b) เร่ง
ขั้นตอนความมุ่งมั่นที่แรก Fi ของการสังเคราะห์แป้งที่ถูกระบุไว้ถอนรากถอนโคน ยับยั้งในช่วงสาย grain- เวที lling ในหวาน
กลายพันธุ์ การวิเคราะห์เพิ่มเติมชี้ให้เห็นว่า OsAGPS2b เป็นยีนผู้สมัครมากความรับผิดชอบในการฟีโนไทป์
ของมนุษย์กลายพันธุ์หวาน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ไพเราะกลายพันธุ์ที่มีแป้งและน้ำตาลสูง เนื้อหารวมต่ำเมื่อเทียบกับ sindongjin ชนิดของป่า
เม็ดจึงบอก caryopses . ในการศึกษาการพัฒนาของเมล็ดและหวาน sindongjin กลายพันธุ์จากวันที่ 11
หลังจากfl owering ( DAF ) ถูกลำดับ RNA ( RNA seq ) รวม 30385 และ 32243 ยีน
ถูก identi จึงเอ็ดใน sindongjin และหวานที่กลายพันธุ์การวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลง transcriptomic ต่างกัน พบว่า 7713
แสดงออกยีน ( degs ) ( LOG พับเปลี่ยน≥ 1 อัตราการค้นพบเท็จ ( FDR ) ≤ 0.001 ) identi จึงเอ็ดขึ้นอยู่กับข้อมูล seq อาร์เอ็นเอของเรา
, กับ 7239 ยีนกระตุ้นแล้วลงและระเบียบในหวานที่กลายพันธุ์ จํานวนมาก
degs พบเกี่ยวข้องกับการเผาผลาญ การสังเคราะห์สาร secondary metabolites )
เชื้อโรคพืชฮอร์โมนพืชสัญญาณพลังงานและแป้ง / น้ำตาล การเผาผลาญ ชำแหละเส้นทางรายละเอียดและปริมาณ
เวลา PCR จริง ( ข้าพเจ้า PCR ) พบว่า ยีนที่เกี่ยวข้องในการสังเคราะห์ส่วนใหญ่ซูโครส แป้ง upregulated ในขณะที่การแสดงออกของ ADP กลูโคส pyrophosphorylase เล็ก subunit ( osagps2b ) และ
จึงมุ่งมั่นก้าวแรกของวิถีการสังเคราะห์แป้งเป็น speci จึง CALLY ยับยั้งระหว่างเม็ดจึงบอกขั้นตอนในหวาน
กลายพันธุ์ การวิเคราะห์เพิ่มเติม พบว่ามีผู้สมัครมาก osagps2b ยีนที่รับผิดชอบ
หวานฟีโนไทป์ที่กลายพันธุ์