Rice is a staple food for half of t

Rice is a staple food for half of the world’s population and is extensively grown by more than half of the world’s farmers on every continent in more than 100 countries.
However, rice is susceptible to cold stress. Cold stress affects growth and distribution of rice plants (Cruz et al, 2013, Sanghera et al, 2011).
Importantly, cold stress at reproductive stage causes pollen sterility resulting in reduce grain yield, possibly due to decreased assimilate supply to seeds as a result of reduced photosynthetic rates (Thakur et al 2010).
Yield loss due to cold stress is an important problem on rice cultivation not only in areas at high latitudes or high altitudes but also in tropical countries such as Thailand and the other Lower Mekong countries including Cambodia, Laos, Burma, and Vietnam.
Regarding the expected higher frequencies and intensity of extreme temperature events in the near future, cold temperature could even increase the loss of rice yield.
Asia cultivated rice (Oryza sativa) consists of two subspecies, indica and japonica.
During human selection, cultivated rice has undergone significant chances in agriculture traits such as grain yield and environmental tolerance.
Japonica rice plants generally show better cold tolerance than do indica cultivars. japonica rice plants and rice germplasm harboring cold resistant genes can be used as sources for development of cold resistant indica varieties (Ma et al 2015; Kim et al 2014; Kim et al 2011).
Cold tolerance is a very complex traits controlled by multiple genes.
At present, a number of QTL and genes respond to cold stress have been identified (Zhang, et al, 2014; Sanghera, et al 2011).
The cold tolerant gene and QTL are useful for the development of molecular markers used for facilitating breeding of cold tolerance in rice (Kim et al 2014; Xiao, et al 2014; Ma et al 2015; Shirasawa et al. 2012).
Because it is difficult to identify plants having genes responsible for cold tolerance using phenotypes, marker-assisted selection is a valuable method for developing cold-tolerant cultivars.
Cold stress caused differential expression or modification of various transcription factors, genes, and other molecular factors including epigenetic mechanisms such as DNA methylation, non-coding RNA, and microRNA (Mittal et al, 2012; Kim et al, 2015).
Transcriptome analyses using microarray technologies have been used to provide our understanding of cold response in rice (Maruyama et al, 2014; Yun et al, 2010).
However, these studies have some limitation including the material and the techniques used (Shen et al 2014). RNA sequencing (RNA-seq) technology is a good choice for transcriptomic analysis.
This technique overcomes the limitations of microarray technology.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ข้าวเป็นอาหารหลักของประชากรโลกครึ่งหนึ่ง และจะเติบโตขึ้นอย่างกว้างขวาง โดยมากกว่าครึ่งหนึ่งของเกษตรกรของโลกในทุกทวีปในกว่า 100 ประเทศ อย่างไรก็ตาม ข้าวจึงไวต่อความเครียดเย็น เย็นความเครียดมีผลต่อการเจริญเติบโตและการกระจายของพืชข้าว (ครัซ et al, 2013, Sanghera et al, 2011) สำคัญ เย็นความเครียดในระยะสืบพันธุ์สาเหตุในละอองเกสร sterility เกิดลดผลผลิตข้าว ครบกำหนดอาจจะลดลงอย่างอุปทานการเมล็ดจาก photosynthetic ลดราคา (Thakur et al 2010) สูญเสียผลผลิตเนื่องจากความเครียดที่เย็นจะมีปัญหาที่สำคัญในการเพาะปลูกข้าวไม่เพียงแต่ ในพื้นที่ latitudes สูงหรือระดับสูง แต่ยังอยู่ ในประเทศเขตร้อนเช่นประเทศไทยและแม่น้ำโขงต่ำกว่าประเทศอื่น ๆ เช่นกัมพูชา ลาว พม่า เวียดนาม และ เกี่ยวกับความถี่สูงกว่าที่คาดไว้และความเข้มของอุณหภูมิมากเหตุการณ์ในอนาคต อุณหภูมิเย็นแม้สามารถเพิ่มการสูญเสียของผลผลิตข้าว ข้าวเอเชีย cultivated (Oryza ซา) ประกอบด้วย ของชนิดย่อยสอง indica, japonica ระหว่างเลือกมนุษย์ ปลูกข้าวได้เปลี่ยนโอกาสสำคัญในลักษณะเกษตรเช่นผลผลิตข้าวและการยอมรับด้านสิ่งแวดล้อม Japonica ข้าวพืชโดยทั่วไปแสดงยอมรับดีกว่าเย็นกว่าทำพันธุ์ indica japonica ข้าวพืช และข้าว germplasm harboring เย็นทนยีนสามารถใช้เป็นแหล่งพัฒนาพันธุ์ indica ทนเย็น (Ma et al 2015 คิม et al 2014 คิม et al 2011) ยอมรับเย็นมีลักษณะซับซ้อนมากที่ควบคุม โดยยีนหลาย ปัจจุบัน การระบุจำนวน QTL และยีนที่ตอบสนองกับความเครียดเย็น (เตียว et al, 2014 Sanghera, et al 2011) เย็นทนกับยีนและ QTL มีประโยชน์สำหรับการพัฒนาเครื่องหมายโมเลกุลที่ใช้สำหรับอำนวยความสะดวกพันธุ์เผื่อเย็นข้าว (Kim et al 2014 เสี่ยว et al; 2014 Ma et al 2015 Shirasawa et al. 2012) เนื่องจากเป็นการระบุพืชยีนเย็นเผื่อใช้ฟี เครื่องช่วยเลือกเป็นวิธีการมีคุณค่าในการพัฒนาพันธุ์เย็นป้องกัน เกิดจากความเครียดเย็นส่วนนิพจน์หรือการปรับเปลี่ยนปัจจัยต่าง ๆ transcription ยีน และปัจจัยอื่น ๆ โมเลกุลรวมทั้งกลไก epigenetic DNA ปรับ ไม่ใช่รหัสอาร์เอ็นเอ และ microRNA (Mittal et al, 2012 คิม et al, 2015) ใช้วิเคราะห์ Transcriptome ใช้เทคโนโลยี microarray เพื่อให้เราเข้าใจตอบเย็นข้าว (มารุยามะ et al, 2014 ยุน et al, 2010) อย่างไรก็ตาม การศึกษานี้มีข้อจำกัดบางอย่างรวมทั้งวัสดุ และเทคนิคการใช้ (Shen et al 2014) เทคโนโลยีการจัดลำดับ (อาร์เอ็นเอลำดับ) อาร์เอ็นเอเป็นทางเลือกที่ดีสำหรับการวิเคราะห์ transcriptomic เทคนิคนี้ overcomes ข้อจำกัดของเทคโนโลยี microarray

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ข้าวเป็นอาหารหลักสำหรับครึ่งหนึ่งของประชากรโลกและเป็นที่ปลูกอย่างกว้างขวางโดยมากกว่าครึ่งหนึ่งของเกษตรกรของโลกในทุกทวีปในกว่า 100 ประเทศทั่วโลก.
แต่ข้าวไวต่อความเครียดเย็น ความเครียดเย็นส่งผลกระทบต่อการเจริญเติบโตและการแพร่กระจายของต้นข้าว (ครูซ et al, 2013 Sanghera et al, 2011).
ที่สำคัญความเครียดเย็นในขั้นตอนการสืบพันธุ์ที่ทำให้เกิดความแห้งแล้งเกสรผลในการลดผลผลิตข้าวอาจจะเป็นเพราะลดลงดูดซึมอุปทานเมล็ดเป็นผล ของอัตราการสังเคราะห์แสงลดลง (Thakur et al, 2010).
ผลผลิตสูญเสียเนื่องจากความเครียดเย็นเป็นปัญหาที่สำคัญในการเพาะปลูกข้าวไม่เพียง แต่ในพื้นที่ที่ละติจูดสูงหรือระดับสูง แต่ยังอยู่ในประเทศเขตร้อนเช่นประเทศไทยและประเทศอื่น ๆ โขงตอนล่างรวมทั้งกัมพูชา ลาวพม่าและเวียดนาม.
เกี่ยวกับความถี่สูงที่คาดหวังและความรุนแรงของเหตุการณ์ที่อุณหภูมิมากในอนาคตอันใกล้อุณหภูมิเย็นยังสามารถเพิ่มการสูญเสียของผลผลิตข้าว.
เอเชียเพาะปลูกข้าว (Oryza sativa) ประกอบด้วยสองจำพวก indica และ japonica .
ในระหว่างการเลือกมนุษย์ที่เพาะปลูกข้าวได้รับโอกาสที่สำคัญในลักษณะการเกษตรเช่นผลผลิตและความทนทานต่อสิ่งแวดล้อม.
Japonica ต้นข้าวโดยทั่วไปแสดงความอดทนเย็นดีกว่าทำพันธุ์ indica japonica พืชข้าวและพันธุ์ข้าวเก็บงำยีนทนความหนาวเย็นสามารถใช้เป็นแหล่งข้อมูลสำหรับการพัฒนาพันธุ์ indica ทนเย็น (Ma et al, 2015; คิม et al, 2014; คิม et al, 2011).
ความอดทนเย็นเป็นลักษณะที่ซับซ้อนมากควบคุมโดยยีนหลาย .
ในปัจจุบันจำนวนของ QTL และยีนที่ตอบสนองต่อความเครียดเย็นได้รับการระบุ (Zhang, et al, 2014; Sanghera, et al 2011).
ยีนทนหนาวเย็นและ QTL มีประโยชน์สำหรับการพัฒนาเครื่องหมายโมเลกุลที่ใช้ในการอำนวยความสะดวกในการปรับปรุงพันธุ์ ของความอดทนหนาวเย็นในข้าว (คิม et al, 2014; เสี่ยว, et al 2014; Ma et al, 2015;. Shirasawa et al, 2012).
เพราะมันเป็นเรื่องยากที่จะระบุพืชที่มียีนที่รับผิดชอบในการทนทานต่อความหนาวเย็นโดยใช้ phenotypes เลือกเครื่องหมายช่วยเป็น .
เป็นวิธีที่มีคุณค่าในการพัฒนาสายพันธุ์ที่ทนความเย็นความเครียดเย็นที่เกิดจากการแสดงออกที่แตกต่างกันหรือเปลี่ยนแปลงถอดความปัจจัยต่างๆยีนและปัจจัยโมเลกุลอื่นๆ รวมทั้งกลไก epigenetic เช่น methylation ดีเอ็นเออาร์เอ็นเอที่ไม่ได้เข้ารหัสและ microRNA (Mittal et al, 2012; คิม et al, 2015).
ยีนวิเคราะห์โดยใช้เทคโนโลยี microarray ได้ถูกนำมาใช้เพื่อให้ความเข้าใจของเราตอบสนองต่อความหนาวเย็นในข้าว (Maruyama et al, 2014;. Yun et al, 2010)
อย่างไรก็ตามการศึกษาเหล่านี้มีข้อ จำกัด รวมทั้งวัสดุและบาง เทคนิคที่ใช้ (Shen et al, 2014) ลำดับอาร์เอ็นเอ (RNA-seq) เทคโนโลยีเป็นทางเลือกที่ดีสำหรับการวิเคราะห์ transcriptomic.
เทคนิคนี้เอาชนะข้อ จำกัด ของเทคโนโลยี microarray

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ข้าวเป็นอาหารหลักสำหรับครึ่งหนึ่งของประชากรโลกและอย่างกว้างขวางปลูกโดยมากกว่าครึ่งหนึ่งของโลก เกษตรกรในทุกทวีปทั่วโลกในกว่า 100 ประเทศ
แต่ข้าวที่ไวต่อความเย็น ความเย็นที่มีผลต่อการเจริญเติบโตและการแพร่กระจายของพืชข้าว ( ครูซ et al , 2013 , sanghera et al , 2011 )
ที่สำคัญความเย็นที่ระยะเจริญพันธุ์ทำให้เป็นหมันเกสรส่งผลลดผลผลิตอาจลดลงเนื่องจากดูดซึมจัดหาเมล็ดพันธุ์ เป็นผลจากการลดอัตราการสังเคราะห์แสง ( Thakur et al , 2010 )
การสูญเสียผลผลิตจากความเย็น เป็นปัญหาสำคัญในการปลูกข้าว ไม่เพียง แต่ในพื้นที่ที่ละติจูดสูง หรือที่สูง แต่ยังอยู่ในประเทศเขตร้อน เช่น ประเทศไทย และประเทศแม่น้ำโขงอื่นๆ ได้แก่ กัมพูชา ลาว พม่า และเวียดนาม
เกี่ยวกับความถี่และความรุนแรงของเหตุการณ์ที่คาดว่าจะสูงกว่าอุณหภูมิที่รุนแรงในอนาคตอุณหภูมิเย็นจะเพิ่มการสูญเสียของผลผลิตข้าว
เอเชียปลูกข้าว ( Oryza sativa ) แบ่งออกเป็น 2 ชนิดย่อยจากญี่ปุ่น , และ .
ในระหว่างการเลือกของมนุษย์ปลูกข้าวได้รับโอกาสสำคัญในภาคการเกษตร ผลผลิตและลักษณะ เช่น ความอดทน สิ่งแวดล้อม
พืชข้าวญี่ปุ่นมักแสดงความอดทนหนาวได้ดีกว่าทำจากพันธุ์ข้าวและข้าวพันธุกรรมยีนพืชที่ทนความหนาวเย็น สามารถใช้เป็นแหล่งข้อมูลสำหรับการพัฒนาของเย็นทน 3 สายพันธุ์ ( ma et al 2015 ; Kim et al 2014 ; Kim et al 2011 )
เย็นความอดทนมันซับซ้อนหลายลักษณะควบคุมโดยยีน
ปัจจุบันจำนวนของยีนที่ตอบสนองต่อความเครียด และความเย็นที่ได้รับการระบุ ( Zhang et al , 2014 ; sanghera et al 2011 )
เย็นใจกว้างยีน และ ความเป็นประโยชน์ต่อการพัฒนาเครื่องหมายโมเลกุลที่ใช้สำหรับการเพาะพันธุ์ข้าวเย็นความอดทน ( Kim et al 2014 ; เสี่ยว , et al 2014 ; ma et al 2015 ; shirasawa et al . 2012 )
เพราะมันเป็นเรื่องยากที่จะระบุพืชที่มียีนที่รับผิดชอบในการเกิดทนเย็น ,เครื่องหมายช่วยเลือกเป็นวิธีที่มีคุณค่าเพื่อพัฒนาเย็นใจกว้างพันธุ์
ความเย็นทำให้แสดงออกที่แตกต่างกันหรือการเปลี่ยนแปลงของปัจจัยการถอดความยีนต่างๆ และปัจจัยอื่น ๆรวมถึงกลไกระดับโมเลกุล Epigenetic เช่น methylation ดีเอ็นเอ อาร์เอ็นเอ นะครับ ไม่ใช่ และ MIC ( Mittal et al , 2012 ; Kim et al , 2015 )
ทราน ริปโตมวิเคราะห์การใช้เทคโนโลยีไมโคร เรย์ได้ถูกใช้เพื่อให้เราเข้าใจการเย็นในข้าว ( มารุยาม่า et al , 2014 ; ยุน et al , 2010 )
แต่การศึกษาเหล่านี้มีข้อ จำกัด รวมทั้งวัสดุและเทคนิคที่ใช้ ( Shen et al 2014 ) อาร์เอ็นเอ ( RNA sequencing seq ) เทคโนโลยีเป็นทางเลือกที่ดีสำหรับการวิเคราะห์ transcriptomic .
เทคนิคนี้เอาชนะข้อจำกัดของ microarray เทคโนโลยี