Predicting binding sitesUnderstandi

Predicting binding sites
Understanding the principles that govern where and when genes are expressed is essential for deciphering how genome information is turned into the molecular and cellular phenomena that underlie the biology of complex organisms. Gene expression programs are determined through the recognition of specific promoter and enhancer sequences within the DNA by regulatory transcription-factor proteins. Transcription-factor-binding sites (TFBSs; see the 'Background' box) are short sequences, many of which have been painstakingly elucidated over the years using experimental procedures such as DNAse footprinting and electrophoretic mobility shift assays (EMSA). TFBSs tend to be short, often less that 10 base-pairs long, and thus they are likely to occur within a genome quite often simply by chance. In addition, each transcription factor appears to tolerate a wide range of variations from its simple consensus sequence, making it extremely difficult to predict binding sites by simply searching a genome sequence for consensus motifs.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เว็บไซต์รวมการคาดการณ์เข้าใจหลักการควบคุม เมื่อยีนมีแสดงเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับ deciphering วิธีเปิดข้อมูลจีโนมเป็นปรากฏการณ์ระดับโมเลกุล และเซลล์ที่อยู่ภายใต้วิชาชีววิทยาของสิ่งมีชีวิตที่ซับซ้อน โปรแกรมนิพจน์ยีนถูกกำหนดผ่านการรู้เฉพาะโปรโมเตอร์และเพิ่มลำดับดีเอ็นเออยู่ภายใน โดยโปรตีน transcription ปัจจัยบังคับ ไซต์ผูกปัจจัย transcription (TFBSs ดูกล่อง 'เบื้องหลัง') เป็นลำดับโดยย่อ จำนวนมากที่ได้ถูกบรรจง elucidated ปีใช้วิธีทดลอง DNAse footprinting และเห็นด้วยกะ assays (EMSA) TFBSs มักจะ เป็นระยะสั้น มักน้อยฐานคู่ที่ 10 ยาว และดังนั้นจึง มีแนวโน้มที่จะเกิดขึ้นภายในกลุ่มค่อนข้างบ่อยก็ตามโอกาส นอกจากนี้ แต่ละปัจจัย transcription ปรากฏทนหลากหลายรูปแบบจากลำดับของมติง่าย ทำให้ยากมากที่จะทำนายรวมไซต์ โดยเพียงแค่ค้นหาจีโนมลำดับการลงมติ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ทำนายเว็บไซต์ผูกพัน
การทำความเข้าใจหลักการที่ควบคุมที่ไหนและเมื่อยีนที่จะแสดงเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับการถอดรหัสว่าข้อมูลจีโนมจะกลายเป็นปรากฏการณ์ระดับโมเลกุลและเซลล์ที่รองรับชีววิทยาของสิ่งมีชีวิตที่ซับซ้อน โปรแกรมการแสดงออกของยีนที่มีการพิจารณาผ่านการรับรู้ของผู้ก่อการที่เฉพาะเจาะจงและลำดับการเพิ่มภายในดีเอ็นเอโปรตีนถอดความปัจจัยด้านกฎระเบียบ ถอดความปัจจัยที่มีผลผูกพันเว็บไซต์ (TFBSs ดูกล่องพื้นหลัง ') เป็นลำดับสั้นหลายแห่งที่ได้รับการอธิบายอย่างระมัดระวังในช่วงหลายปีโดยใช้วิธีการทดลองเช่น footprinting DNase และการวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงความคล่องตัว electrophoretic (EMSA) TFBSs มีแนวโน้มที่จะสั้นมักจะน้อยกว่า 10 คู่ฐานยาวและทำให้พวกเขามีแนวโน้มที่จะเกิดขึ้นภายในจีโนมค่อนข้างบ่อยโดยเพียงแค่โอกาส นอกจากนี้ถอดความปัจจัยแต่ละดูเหมือนจะทนต่อความหลากหลายของรูปแบบจากลำดับฉันทามติที่เรียบง่ายทำให้มันยากมากที่จะทำนายเว็บไซต์ผูกพันโดยเพียงแค่การค้นหาลำดับจีโนมสำหรับลวดลายฉันทามติ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ทำนายเต็มเปี่ยม
เข้าใจหลักการที่ควบคุมที่ไหนและเมื่อเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับการถอดรหัสยีนจะแสดงออกอย่างไรข้อมูลจีโนมจะกลายเป็นปรากฏการณ์ที่โมเลกุลและเซลล์ต่างๆชีววิทยาของสิ่งมีชีวิตที่ซับซ้อนการแสดงออกของยีนที่โปรแกรมกำหนด ผ่านการส่งเสริมการขายที่เฉพาะเจาะจงและลำดับภาพภายในดีเอ็นเอด้วยโปรตีน ปัจจัยด้านการ transcription ถอดความปัจจัยรวมเว็บไซต์ ( tfbss ; เห็นกล่อง ' พื้นหลัง ' ) สั้น ลำดับหลายแห่งซึ่งได้รับการตรวจสอบอย่างระมัดระวังกว่าปีใช้วิธีการทดลอง เช่น footprinting และตรวจหา ADNase ยูไนเต็ดกะ ) ( emsa ) tfbss มีแนวโน้มที่จะสั้น มักจะน้อยกว่า 10 คู่เบสที่ยาวและดังนั้นจึงมีแนวโน้มที่จะเกิดขึ้นภายในจีโนมค่อนข้างบ่อยเพียงโดยบังเอิญ นอกจากนี้ถอดความปัจจัยแต่ละดูเหมือนจะทนหลากหลายรูปแบบ จากลำดับของ Consensus ง่ายทำให้มันยากมากที่จะทำนายการเว็บไซต์โดยการค้นหาเพียงจีโนมลำดับสำหรับฉันทามติลวดลาย