To generate a geographical picture of V. parahaemolyticus genotype
distribution, 105 V. parahaemolyticus strains isolated from
seafood at retail, originating from different geographical origins
as well as V. parahaemolyticus isolated at Sri Lankan and Ecuadorian
shrimp farms were subjected to MLST analysis. A total of 64
distinct sequence types (ST) were detected, confirming the high
genetic diversity of seafood associated V. parahaemolyticus (Ellis
et al., 2012; Theethakaew et al., 2013; Urmersbach et al., 2014).
Based on the allelic profiles a minimum spanning tree (MSTree) was
generated to visualize the genetic relationship of V. parahaemolyticus
strains originating from different geographical regions. STs of
Asian and South-American strains were spread across the entire
tree, but European STs were located in two clusters. Most of the
Southeast-Asian STs grouped together, and only one ST showed
an intercontinental distribution (ST424). Most of the identified STs
were recovered only once, but some STs (e.g. ST394, ST395 and
ST397) were more frequently found (Urmersbach et al., 2014).
เพื่อสร้างภาพทางภูมิศาสตร์ของ V. parahaemolyticus จีโนไทป์
กระจาย 105 V. parahaemolyticus สายพันธุ์ที่แยกได้จาก
อาหารทะเลที่ร้านค้าปลีกที่มีต้นกำเนิดจากต้นกำเนิดทางภูมิศาสตร์ที่แตกต่างกัน
เช่นเดียวกับ V. parahaemolyticus แยกที่ศรีลังกาและเอกวาดอร์
ฟาร์มกุ้งถูกยัดเยียดให้วิเคราะห์ MLST รวมเป็น 64
ประเภทที่แตกต่างกันตามลำดับ (ST) ถูกตรวจพบว่ายืนยันสูง
ความหลากหลายทางพันธุกรรมของอาหารทะเลที่เกี่ยวข้อง V. parahaemolyticus (เอลลิส
, et al, 2012;. Theethakaew et al, 2013;.. Urmersbach et al, 2014).
อยู่บนพื้นฐานของ โปรไฟล์ allelic ต้นไม้ทอดต่ำสุด (MSTree) ถูก
สร้างขึ้นเพื่อให้มองเห็นความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของ V. parahaemolyticus
สายพันธุ์ที่มาจากพื้นที่ทางภูมิศาสตร์ที่แตกต่างกัน STs ของ
สายพันธุ์เอเชียและอเมริกาใต้กระจายอยู่ทั่วทั้ง
ต้นไม้ แต่ STs ยุโรปตั้งอยู่ในสองกลุ่ม ส่วนใหญ่ของ
STs เอเชียตะวันออกเฉียงใต้รวมกลุ่มกันและเพียงหนึ่ง ST แสดงให้เห็น
การกระจายข้ามทวีป (ST424) ส่วนใหญ่เอสทีระบุ
ถูกกู้คืนได้เพียงครั้งเดียว แต่บาง STs (เช่น ST394, ST395 และ
ST397) พบบ่อยมากขึ้น (Urmersbach et al., 2014)
การแปล กรุณารอสักครู่..

เพื่อสร้างภาพทางภูมิศาสตร์ของ tdh พันธุกรรมจำหน่าย , 105 tdh สายพันธุ์ที่แยกได้จากอาหารทะเลที่ขายปลีก , ที่มาจากต้นกำเนิดทางภูมิศาสตร์ที่แตกต่างกันเช่นเดียวกับ tdh แยกเอกวาดอร์และศรีลังกากุ้งถูก mlst การวิเคราะห์ ทั้งหมด 64ลำดับประเภทที่แตกต่างกัน ( ST ) ถูกตรวจพบว่าสูงความหลากหลายทางพันธุกรรมของอาหารทะเลที่ tdh ( เอลลิสet al . , 2012 ; theethakaew et al . , 2013 ; urmersbach et al . , 2010 )บนพื้นฐานของ allelic โปรไฟล์ขั้นต่ำต้นไม้ทอดข้าม ( mstree ) คือสร้างขึ้นเพื่อแสดงความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของ V . parahaemolyticusสายพันธุ์ที่มาจากภูมิภาคทางภูมิศาสตร์ที่แตกต่างกัน ระบบของเอเชียใต้และสายพันธุ์อเมริกันได้กระจายทั่วทั้งต้นไม้ แต่ STS ยุโรปมีอยู่สองกลุ่ม มากที่สุดของเอเชียตะวันออกเฉียงใต้ STS เข้าด้วยกัน และมีเพียงหนึ่งเซนต์การกระจายของทวีป ( st424 ) ที่สุดของระบบ ระบุพบเพียงครั้งเดียว แต่บางระบบ ( เช่น st394 st395 , และst397 ) พบบ่อยพบ ( urmersbach et al . , 2010 )
การแปล กรุณารอสักครู่..
