Advances in next generation sequenc

Advances in next generation sequencing technologies has
resulted in the generation of unprecedented levels of sequence
data. Therefore, modern biology now presents new challenges in
terms of data management, query and analysis. Human DNA is
comprised of approximately 3 billion base pairs with a personal
genome representing approximately 100 gigabytes (GB) of data,
the equivalent of 102,400 photos. By the end of 2011, the global
annual sequencing capacity was estimated to be 13 quadrillion
bases and counting, enough data to fill a stack of DVDs two miles
high.
Moore’s Law describes a trend coined by Intel co-founder Gordon Moore which states that ‘‘the number of transistors that can be placed on an integrated circuit board is increasing exponentially, with a doubling time of roughly 18 months’’ . Put more simply: computers double in speed and half in size every 18 months. Similar phenomena have been noted for the capacity of hard disks (Kryder’s Law) and network bandwidth (Nielsen’s Law and Butter’s Law) . This trend has remained true for approximately 40 years, until the completion of the Human Genome project in 2003. Since then, a deluge of biological sequence data has been generated; a phenomenon largely spurred by the falling cost of sequencing. Sequencing a human genome has decreased in cost from $1 million in 2007 to $1 thousand in 2012 . As further evidence of this, the 1,000 Genomes project [8], which involves sequencing and cataloguing human genetic variation, has deposited two times more raw data into NCBI’s GenBank during its first 6 months than all the previous sequences deposited in the last 30 years and with mobile sequencing thumb drives on the horizon, it shows no sign of slowing. Over the coming years, the National Cancer Institute will sequence a million genomes to understand biological pathways and the genomic variation. Given that the whole genome of a tumour and a matching normal tissue sample consumes 1 TB of uncompressed data (this could be reduced by a factor of 10 if compressed); one million genomes will require 1 million TB, equivalent to 1000 petabyte (PB) or 1 Exabyte (EB).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

มีความก้าวหน้าในเทคโนโลยีลำดับรุ่นถัดไปส่งผลให้เกิดการสร้างระดับประวัติการณ์ลำดับข้อมูล ดังนั้น ชีววิทยาสมัยใหม่ตอนนี้นำเสนอความท้าทายใหม่ในเงื่อนไขของการจัดการข้อมูล แบบสอบถาม และวิเคราะห์ เป็นดีเอ็นเอมนุษย์ประมาณ 3 ล้านฐานคู่กับบุคคลประกอบด้วยกลุ่มที่แสดงประมาณ 100 กิกะไบต์ (GB) ข้อมูลเทียบเท่ากับภาพถ่าย 102,400 สิ้นสุดของ 2011 โลกปีลำดับกำลังถูกประมาณ 13 quadrillionฐานและการตรวจนับ ข้อมูลเพียงพอในการกรอกข้อมูลกองซ้อนของดีวีดีสองไมล์สูงกฎของมัวร์อธิบายแนวโน้มจังหวะ โดย Intel ร่วมก่อตั้งมัวร์ Gordon ซึ่งระบุว่า ''จำนวน transistors ซึ่งสามารถวางบนกระดานเป็นวงจรรวมจะเพิ่มสร้าง เวลา doubling ประมาณ 18 เดือน '' ใส่กว่านั้น: คอมพิวเตอร์ทวีความเร็วและขนาดทุก 18 เดือนครึ่ง ปรากฏการณ์คล้ายตั้งข้อสังเกตสำหรับความจุของฮาร์ดดิสก์ (กฎหมายของ Kryder) และเครือข่ายแบนด์วิธ (นีลของกฎหมายและกฎหมายของเนย) แนวโน้มนี้มีอยู่จริงประมาณ 40 ปี จนเสร็จสิ้นโครงการมมนุษย์ใน 2003 หลังจากนั้น สถานการณ์น้ำท่วมข้อมูลชีวภาพลำดับสร้างแล้ว ปรากฏการณ์ส่วนใหญ่กระตุ้น โดยต้นทุนที่ลดลงของลำดับ ลำดับเบสเป็นมมนุษย์ลดต้นทุนจาก 1 ล้านเหรียญในปี 2007 จะ $1 พันใน 2012 เป็นหลักฐานต่อไปนี้ 1000 Genomes โครงการ [8], ซึ่งเกี่ยวข้องกับการจัดลำดับ และการ cataloguing ความผันแปรทางพันธุกรรมมนุษย์ ได้ฝากข้อมูลดิบมากกว่าสองครั้งใน GenBank ของ NCBI ในช่วง 6 เดือนแรกกว่าลำดับก่อนหน้านี้ทั้งหมดที่ฝาก ใน ปี 30 และ มีลำดับการเคลื่อนนิ้วหัวแม่มือ ไดรฟ์บนขอบฟ้า มันแสดงไม่มีสัญญาณของการชะลอตัว ปีมา สถาบันมะเร็งแห่งชาติจะลำดับ genomes ล้านเข้าใจหลักทางชีวภาพและการเปลี่ยนแปลง genomic กำหนดว่า กลุ่มทั้งหมดเป็นเนื้องอกและตัวอย่างเนื้อเยื่อปกติตรงใช้ 1 TB ข้อมูลบีบอัด (นี้อาจจะลดลง ด้วยตัวคูณ 10 ถ้าบีบ); genomes หนึ่งล้านจะต้องล้าน 1 TB เท่ากับ 1000 เพตะไบต์ (PB) หรือ 1 เอกซะไบต์ (EB)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ความก้าวหน้าในเทคโนโลยีลำดับรุ่นต่อไปมีผลในการสร้างระดับประวัติการณ์ของลำดับข้อมูล ดังนั้นชีววิทยาที่ทันสมัยในขณะนี้มีความท้าทายใหม่ ๆ ในแง่ของการจัดการข้อมูลและการวิเคราะห์แบบสอบถาม ดีเอ็นเอของมนุษย์ประกอบด้วยประมาณ 3 พันล้านฐานคู่กับบุคคลจีโนมคิดเป็นประมาณ100 กิกะไบต์ (GB) ของข้อมูลเทียบเท่า102,400 รูป ในตอนท้ายของปี 2011 ที่ทั่วโลกกำลังการผลิตลำดับประจำปีก็จะประมาณ13 quadrillion ฐานและนับข้อมูลเพียงพอที่จะเติมสแต็คของแผ่นดีวีดีสองไมล์สูง. กฎของมัวร์อธิบายถึงแนวโน้มการประกาศเกียรติคุณจาก Intel ร่วมก่อตั้งกอร์ดอนมัวร์ซึ่งระบุว่า ' 'จำนวนทรานซิสเตอร์ที่สามารถวางบนแผงวงจรรวมจะเพิ่มขึ้นชี้แจงด้วยเวลาสองเท่าประมาณ 18 เดือน' ' ใส่มากขึ้นเพียง: คอมพิวเตอร์เป็นสองเท่าในความเร็วและครึ่งหนึ่งในทุกขนาด 18 เดือน ปรากฏการณ์ที่คล้ายกันได้รับการบันทึกไว้สำหรับความจุของฮาร์ดดิสก์ (กฎหมาย Kryder) และแบนด์วิธเครือข่าย (กฎของนีลเซ่นและกฎหมายของเนย) แนวโน้มนี้ยังคงเป็นจริงสำหรับประมาณ 40 ปีจนกระทั่งเสร็จสิ้นการโครงการจีโนมมนุษย์ในปี 2003 ตั้งแต่นั้นมาน้ำท่วมของข้อมูลลำดับชีวภาพได้รับการสร้าง; ปรากฏการณ์ที่กระตุ้นส่วนใหญ่มาจากค่าใช้จ่ายที่ลดลงของการเรียงลำดับ ลำดับจีโนมของมนุษย์ลดลงของค่าใช้จ่ายจาก $ 1 ล้านบาทในปี 2007 ถึง 1000 $ ในปี 2012 ในฐานะที่เป็นหลักฐานเพิ่มเติมจากนี้โครงการ 1,000 จีโนม [8] ซึ่งเกี่ยวข้องกับการจัดลำดับและรายการการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมของมนุษย์ได้ฝากครั้งที่สองข้อมูลดิบมากยิ่งขึ้นใน GenBank NCBI ในช่วง 6 เดือนแรกกว่าทุกลำดับก่อนหน้านี้ไปฝากไว้ในช่วง 30 ปีที่ผ่านมาและ กับไดรฟ์หัวแม่มือลำดับมือถือบนขอบฟ้าก็แสดงให้เห็นสัญญาณของการชะลอตัวไม่มี กว่าปีที่ผ่านมาสถาบันมะเร็งแห่งชาติจะลำดับล้านจีโนมที่จะเข้าใจวิถีทางชีวภาพและการเปลี่ยนแปลงจีโนม ระบุว่าจีโนมทั้งหมดของเนื้องอกและตัวอย่างเนื้อเยื่อปกติการจับคู่กิน 1 TB การบีบอัดข้อมูล (ซึ่งอาจจะลดลงโดยปัจจัยที่ 10 ถ้าบีบอัด); หนึ่งล้านจีโนมจะต้อง 1000000 วัณโรคเทียบเท่ากับ 1,000 petabyte (PB) หรือ 1 Exabyte (EB)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ความก้าวหน้าในเทคโนโลยีการรุ่นถัดไปได้
ส่งผลให้เกิดการสร้างประวัติการณ์ระดับของลำดับข้อมูล

ดังนั้นชีววิทยายุคใหม่ในขณะนี้นำเสนอความท้าทายใหม่ใน
แง่ของการจัดการข้อมูลแบบสอบถามและการวิเคราะห์ ดีเอ็นเอมนุษย์
ประกอบด้วยประมาณ 3 พันล้านคู่เบส ด้วยส่วนตัว
( คิดเป็นประมาณ 100 กิกะไบต์ ( GB ) ของข้อมูล
เท่ากับ 102 ,400 รูป โดยจุดสิ้นสุดของ 2011 , โลก
ความจุลำดับประจำปีประมาณจะ 13 คว็อดรีล
ฐานและการนับข้อมูลพอที่จะเติมกองดีวีดีสองไมล์สูง
.
กฎของมัวร์ กล่าวถึงแนวโน้มการประกาศเกียรติคุณสำหรับผู้ร่วมก่อตั้งกอร์ดอนมัวร์ซึ่งระบุว่า " จำนวนของทรานซิสเตอร์ที่สามารถถูกวางไว้บนวงจร รวมบอร์ดเพิ่มขึ้นชี้แจง ,กับมากเวลาประมาณ 18 เดือน ' ' ใส่เพียง : คอมพิวเตอร์คู่ในความเร็วและครึ่งขนาดทุก 18 เดือน ปรากฏการณ์คล้ายคลึงกันได้รับการตั้งข้อสังเกตสำหรับความจุของฮาร์ดดิสก์ ( kryder ของกฎหมาย ) และแบนด์วิดธ์เครือข่ายบริการของกฎหมายและกฎหมายเนย ) แนวโน้มนี้ยังคงเป็นจริงสำหรับประมาณ 40 ปีจนเสร็จสิ้นโครงการจีโนมมนุษย์ในปี 2003 ตั้งแต่นั้นมาน้ําท่วมข้อมูลลำดับทางชีวภาพที่ถูกสร้างขึ้น ; ปรากฏการณ์ส่วนใหญ่ดันลงต้นทุนของ เป็นลำดับจีโนมมนุษย์ได้ลดลงในค่าใช้จ่ายจาก $ 1 ล้านใน 2007 ไปยัง $ 1 , 000 ใน 2012 ตามหลักฐานนี้ 1000 Genomes โครงการ [ 8 ] , ซึ่งเกี่ยวข้องกับการลงรายการและความผันแปรทางพันธุกรรมของมนุษย์ได้ฝากข้อมูลให้อีก 2 ครั้ง ในช่วงเดือนแรกของ ncbi ขนาดของมันกว่าก่อนหน้านี้ทั้งหมด 6 ลำดับฝากในช่วง 30 ปีและกับมือถือลำดับไดรฟ์หัวแม่มือบนขอบฟ้า มันแสดงให้เห็นสัญญาณของการชะลอตัว . มากกว่าปีที่ผ่านมา สถาบันมะเร็งแห่งชาติ จะลำดับจีโนมเข้าใจวิถีล้านทางชีวภาพและการเปลี่ยนแปลงจีโนม .ระบุว่าจีโนมทั้งหมดของเนื้องอกและการจับคู่ตัวอย่างเนื้อเยื่อปกติ ใช้ 1 TB ของข้อมูลที่ไม่มีการบีบอัด ( ซึ่งอาจจะลดลง โดยปัจจัยที่ 10 ถ้าอัด ) ; หนึ่งล้านจีโนมจะต้อง 1 ล้าน TB เท่ากับ 1000 เพตะไบต์ ( PB ) หรือ 1 โกกุลไฟว์ ( EB )