We examined multiple plastid genes

We examined multiple plastid genes from a diversity of gymnosperm lineages to explore the consistency of signal among different
outgroups for rooting fl owering plant phylogeny. For maximum parsimony (MP), most outgroups attach on a branch of the
underlying ingroup tree that leads to Amborella . Maximum likelihood (ML) analyses either root angiosperms on a nearby branch
or fi nd split support for these neighboring root placements, depending on the outgroup. The inclusion of two species of Hydatellaceae,
recently recognized as an ancient line of angiosperms, does not aid in inference of the root. Cost profi les for placing the
root in suboptimal locations are highly correlated across most outgroup comparisons, even comparing MP and ML profi les. Those
for Gnetales are the most deviant of all those considered. This divergent outgroup either attaches on a long eudicot branch with
moderate bootstrap support in MP analyses or supports no particular root location in ML analysis. Removing the most rapidly
evolving sites in rate classifi cations based on two divergent angiosperm root placements with Gnetales yields strongly confl icting
root placements in MP analysis, despite substantial overlap in the estimated sets of conservative sites. However, the generally high
consistency in rooting signal among distantly related gymnosperm clades suggests that the long branch connecting angiosperms
to their extant relatives may not interfere substantially with inference of the angiosperm root.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เราตรวจสอบยีนพลาสติดหลายจากหลากหลายเชื้อชาติ gymnosperm สำรวจความสอดคล้องของสัญญาณระหว่างแตกต่างกันoutgroups สำหรับ rooting phylogeny พืช owering fl สำหรับสูงสุด parsimony (MP), outgroups สุด แนบในสาขาของการต้นทรี ingroup ให้ Amborella วิเคราะห์ความเป็นไปได้สูงสุด (มล) ทั้งราก angiosperms ในสาขาใกล้เคียงหรือ nd ไร้สายแบ่งสนับสนุนและรากเหล่านี้ใกล้เคียง ตาม outgroup รวมสองพันธุ์ Hydatellaceaeเพิ่ง รู้จักเป็นบรรทัดโบราณของ angiosperms ไม่ช่วยในข้อราก ต้นทุนรับเลสสำหรับวางรากในสภาพสูง correlated ข้ามส่วนใหญ่ outgroup เปรียบเทียบ การเปรียบเทียบ MP และ ML เลสรับแม้ ผู้Gnetales จะ deviant มากที่สุดของผู้ถือ ขันติธรรมนี้ outgroup ใดแนบในสาขา eudicot ยาวด้วยสนับสนุนการเริ่มต้นระบบปานกลางใน MP วิเคราะห์ หรือสนับสนุนไม่ตำแหน่งรากเฉพาะในการวิเคราะห์ ML เอาออกอย่างรวดเร็วที่สุดการพัฒนาในอัตรา classifi เป็นของหายากตามสอง angiosperm ขันติธรรมและรากกับ Gnetales ทำให้ขอ confl ictingหลักการปฏิบัติในการวิเคราะห์ MP แม้มีการทับซ้อนที่พบในชุดประเมินของอเมริกาหัวเก่า อย่างไรก็ตาม สูงทั่วไปความสอดคล้องในสัญญาณ rooting ระหว่าง clades gymnosperm ที่เกี่ยวข้อง distantly แนะนำที่สาขาลองเชื่อมต่อ angiospermsเพื่อญาติพี่น้องยังไม่อาจรบกวนมากข้อ angiosperm ราก

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เราตรวจสอบยีน plastid หลายรายการจากหลากหลายของ lineages gymnosperm ในการสำรวจความสอดคล้องของสัญญาณที่แตกต่างกันในหมู่
outgroups สำหรับการขจัดชั้นเชื้อชาติพืช owering สำหรับความประหยัดสูงสุด (MP) outgroups
ส่วนใหญ่ติดอยู่ที่สาขาของที่ต้นไม้ingroup พื้นฐานที่นำไปสู่การ Amborella ความน่าจะเป็นสูงสุด (ML) การวิเคราะห์ทั้ง Angiosperms
รากในสาขาที่ใกล้เคียงหรือสายสนับสนุนครั้งที่แยกสำหรับตำแหน่งรากเพื่อนบ้านเหล่านี้ขึ้นอยู่กับoutgroup รวมของทั้งสองสายพันธุ์ของ Hydatellaceae,
ได้รับการยอมรับเมื่อเร็ว ๆ นี้สายโบราณของ Angiosperms ไม่ได้ช่วยในการอนุมานของราก ค่าใช้จ่ายกำา les
สำหรับการวางรากในสถานที่ที่ก่อให้เกิดผลลัพธ์มีความสัมพันธ์อย่างมากทั่วประเทศส่วนใหญ่เปรียบเทียบoutgroup แม้เปรียบเทียบ MP และ ML ​​Profi les ผู้ที่สำหรับ Gnetales เป็นปกติมากที่สุดของทุกคนพิจารณา
outgroup นี้แตกต่างกันอย่างใดอย่างหนึ่งยึดติดในสาขา eudicot
ยาวกับการสนับสนุนเงินทุนในระดับปานกลางในการวิเคราะห์MP หรือสนับสนุนสถานที่ไม่มีรากโดยเฉพาะอย่างยิ่งในการวิเคราะห์ ML การถอดอย่างรวดเร็วที่สุดเว็บไซต์การพัฒนาในไพเพอร์ classifi อัตราขึ้นอยู่กับสองตำแหน่งรากพืชชั้นสูงที่แตกต่างกันที่มีอัตราผลตอบแทน Gnetales ขอ confl icting ตำแหน่งรากในการวิเคราะห์ MP แม้จะมีการทับซ้อนกันมากในชุดประมาณของเว็บไซต์พรรค อย่างไรก็ตามโดยทั่วไปสูงสม่ำเสมอในการขจัดสัญญาณในหมู่ gymnosperm เกี่ยวข้องลิ่ว clades แสดงให้เห็นว่าสาขายาวเชื่อมต่อ Angiosperms กับญาติที่ยังหลงเหลืออยู่ของพวกเขาอาจจะไม่รบกวนการทำงานอย่างมีนัยสำคัญกับการอนุมานของรากพืชชั้นสูง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เราตรวจสอบหลายพลาสติดยีนจากความหลากหลายของพืชเมล็ดเปลือยเมื่อศึกษาความสอดคล้องของสัญญาณที่แตกต่างกันของ outgroups
เพื่อขจัด FL owering ระบบเชื้อชาติพืช สำหรับความตระหนี่สูงสุด ( MP ) , outgroups ที่สุดแนบอยู่บนกิ่งของต้นไม้ที่นำไปสู่
) กลุ่ม amborella . ความน่าจะเป็นสูงสุด ( ML ) และให้รากของพืชดอกใน
สาขาใกล้เคียงหรือ FI ND แยกสนับสนุนเหล่านี้ใกล้เคียงรากตำแหน่ง ขึ้นอยู่กับกลุ่ม รวมสองชนิดของ hydatellaceae
เมื่อเร็ว ๆนี้ได้รับการยอมรับว่าเป็น , สายโบราณของพืชดอก ไม่ได้ช่วยในการอนุมานของราก ค่าใช้จ่าย Pro เลสสำหรับวาง
รากในสถานที่ suboptimal มีความสัมพันธ์ในกลุ่มเปรียบเทียบส่วนใหญ่แม้เปรียบเทียบและ MP ml Profi เลส เหล่านั้น
สำหรับ gnetales เป็นปกติมากที่สุดของทั้งหมดนั้น ถือว่า กลุ่มโรงเรียนนี้เหมือนกันให้บนนาน eudicot กิ่ง
สนับสนุนบูปานกลางในการวิเคราะห์ MP หรือสนับสนุนไม่เฉพาะรากที่ตั้งในการวิเคราะห์เซลล์ การลบอย่างรวดเร็วมากที่สุดในการพัฒนาเว็บไซต์ที่มีอัตรา classifi
ขึ้นอยู่กับสองอย่างวกรากตำแหน่งกับ gnetales ผลผลิตขอ confl icting
รากทำหน้าที่ในการวิเคราะห์ MP , แม้จะมีจำนวนมากทับซ้อนกันในประมาณชุดอนุลักษณ์เว็บไซต์ อย่างไรก็ตามโดยทั่วไปสูง
ความสอดคล้องในรากของพืชเมล็ดเปลือยห่างเหินเกี่ยวข้องกับสัญญาณ clades เห็นว่าสาขายาวเชื่อมต่อพืชดอก
ให้ญาติของพวกเขายังไม่อาจแทรกแซง อย่างเต็มที่ ด้วยการอนุมานของพืชดอกราก