In Egypt, since 2006, descendants o

In Egypt, since 2006, descendants of the highly pathogenic avian influenza virus (HP AIV) H5N1 of clade
2.2 continue to cause sharp losses in poultry production and seriously threaten public health. Potentially
zoonotic H9N2 viruses established an endemic status in poultry in Egypt as well and co-circulate with HP
AIV H5N1 rising concerns of reassortments between H9N2 and H5N1 viruses along with an increase of
mixed infections of poultry.
Nucleotide sequences of whole genomes of 15 different isolates (H5N1: 7; H9N2: 8), and of the hemagglutinin
(HA) and neuraminidase (NA) encoding segments of nine further clinical samples (H5N1: 2;
H9N2: 7) from 2013 and 2014 were generated and analysed. The HA of H5N1 viruses clustered with clade
2.2.1 while the H9 HA formed three distinguishable subgroups within cluster B viruses. BEAST analysis
revealed that H9N2 viruses are likely present in Egypt since 2009. Several previously undescribed
substituting mutations putatively associated with host tropism and virulence modulation were detected
in different proteins of the analysed H9N2 and H5N1 viruses.
Reassortment between HP AIV H5N1 and H9N2 is anticipated in Egypt, and timely detection of such
events is of public health concern. As a rapid tool for detection of such reassortants discriminative
SYBR-Green reverse transcription real-time PCR assays (SG-RT-qPCR), targeting the internal genes of
the Egyptian H5N1 and H9N2 viruses were developed for the rapid screening of viral RNAs from both
virus isolates and clinical samples. However, in accordance to Sanger sequencing, no reassortants were
found by SG-RT-qPCR

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ในอียิปต์ ตั้งแต่ปี 2006 , ลูกหลานของสูง เชื้อโรค เชื้อไวรัสไข้หวัดนก ( HP aiv ) ไข้หวัดนกของ clade
2.2 ยังก่อให้เกิดความสูญเสียที่คมชัดในการผลิตสัตว์ปีก จริงจัง และคุกคามสาธารณสุข อาจ h9n2
จํานวนมากไวรัสก่อตั้งถิ่นสถานะในสัตว์ปีกในอียิปต์เป็นอย่างดีและ Co หมุนเวียนกับ HP
aiv ไข้หวัดนกเพิ่มขึ้นความกังวลของ reassortments ระหว่าง h9n2 ไข้หวัดนกและไวรัสพร้อมกับเพิ่ม

เบสผสมเชื้อจากสัตว์ปีก ลำดับของจีโนมของสายพันธุ์ที่แตกต่างกันทั้งหมด 15 ( ไข้หวัดนก : 7 ; h9n2 : 8 ) และของฮีแมกกูตินิน
( ฮา ) และนิวรามินิเดส ( na ) เข้ารหัสส่วนของเก้าคลินิกตัวอย่าง ( ไข้หวัดนกเพิ่มเติม : 2 ;
h9n2 : 7 ) จาก 2013 และ 2014 ถูกสร้างขึ้น และวิเคราะห์ของไวรัสไข้หวัดนก H5N1 ฮากระจายกับ clade
2.2.1 ในขณะที่ h9 ฮาขึ้น 3 แยกแยะกลุ่มย่อยภายในกลุ่ม บี ไวรัส
วิเคราะห์สัตว์ เปิดเผยว่า h9n2 ไวรัสมีแนวโน้มอยู่ในอียิปต์ตั้งแต่ 2009 ก่อนหน้านี้หลาย undescribed
แทนการกลายพันธุ์ putatively เกี่ยวข้องกับโฮสต์การกระหมวดความรุนแรงพบ
โปรตีนที่แตกต่างกันของไวรัสไข้หวัดนก H5N1 และวิเคราะห์ h9n2 .
reassortment ระหว่างเอชพีและ aiv ไข้หวัดนก h9n2 คาดการณ์ไว้ในอียิปต์ และการตรวจสอบของกิจกรรมดังกล่าว
ทันเวลาคือความกังวล สาธารณสุข เป็นเครื่องมือสำหรับการอย่างรวดเร็วเช่นค่า
reassortants SYBR สีเขียวย้อนกลับถอดความแบบเรียลไทม์ ( SG qpcr RT PCR พบยีน ) , เป้าหมายของ
ภายในอียิปต์และไวรัสไข้หวัดนก H5N1 h9n2 การพัฒนาอย่างรวดเร็วการคัดกรองไวรัส RNAs ทั้งจากไวรัสสายพันธุ์
และตัวอย่างทางคลินิก อย่างไรก็ตาม ตามลำดับแซงเจอร์ ไม่ reassortants ถูกพบโดย SG RT qpcr