SSRs identified coding regions were

SSRs identified coding regions were defined by mapping reference genes of Melon to KM and SW3 assemblies with BLAT (The BLAST-Like Alignment Tool) [24]. To
remove mapping false positives, the genic regions in the assemblies were defined by 80 % of the gene mapping coverage. To design primer sets for targeted SSRs, we used the primer3_core software with options as follows: optimum length of primers = 20; optimum melting temperature = 60 C; and PCR product size = 200–500. The primers designed for SSR loci were named CMMS (C.melo makuwa SSR). The overall pipeline was controlled with scripts developed inhouse in Python (ver. 2.7) using the BioPython modules (ver. 1.59)

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ภูมิภาครหัส identified SSRs ถูก defined โดยการแม็ปยีนอ้างอิงของแตงโมกับ KM และ SW3 ประกอบด้วย BLAT (The BLAST-Like ตำแหน่งมือ) [24] ถึงเอาแมปทำงานผิดพลาดปลอม ภูมิภาค genic ในแอสเซมบลีถูก defined โดย 80% ของความครอบคลุมการแม็ปยีน การออกแบบชุดรองพื้นสำหรับ SSRs เป้าหมาย เราใช้ซอฟต์แวร์ primer3_core มีตัวเลือกดังนี้: ความยาวสูงสุดของไพรเมอร์ = 20 เหมาะสมละลายอุณหภูมิ 60 C = และขนาดผลิตภัณฑ์ PCR = 200 – 500 ไพรเมอร์ที่ออกแบบมาสำหรับ SSR loci ถูกชื่อ CMMS (C.melo makuwa SSR) ขั้นตอนทั้งหมดถูกควบคุม ด้วยสคริปต์ที่พัฒนาห้องในงูเหลือม (ไม่ 2.7) โดยใช้โมดูล BioPython (ไม่ 1.59)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

SSRs การระบุเอ็ด Fi ภูมิภาคเข้ารหัสเป็นนิยามโดยยีนอ้างอิงการทำแผนที่ของแตงโมที่จะ KM และประกอบกับ SW3 BLAT (ระเบิดเช่นเดียวกับการจัดเครื่องมือ) [24] ในการ
ลบการทำแผนที่บวกเท็จในภูมิภาค Genic ประกอบถูกนิยามโดย 80% ของความคุ้มครองการทำแผนที่ยีน การออกแบบชุดไพรเมอร์สำหรับ SSRs กำหนดเป้าหมายที่เราใช้ซอฟแวร์ primer3_core ที่มีตัวเลือกดังนี้ระยะเวลาที่เหมาะสมของไพรเมอร์ = 20; อุณหภูมิที่เหมาะสมในการละลาย = 60? C; และขนาดของผลิตภัณฑ์ PCR = 200-500 ไพรเมอร์ที่ออกแบบมาสำหรับ loci SSR ถูกตั้งชื่อ CMMS (C.melo makuwa SSR) ท่อโดยรวมได้รับการควบคุมด้วยสคริปต์พัฒนาชมในห้องพักในหลาม (ver. 2.7) โดยใช้โมดูล BioPython (ver. 1.59)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ssrs identi จึงเอ็ดรหัสภูมิภาคอยู่เดอเน็ดโดยการทำแผนที่ยีนจึงอ้างอิงของแตงโมกับ km และ sw3 ประกอบกับ blat ( ระเบิดเหมือนกับเครื่องมือจัด ) [ 24 ]

เอาแผนที่บวกเท็จ , ภูมิภาคทำให้เป็นในประกอบเป็น de จึงเน็ด โดย 80% ของการทำแผนที่ยีนครอบคลุม การออกแบบชุดไพรเมอร์สำหรับ ssrs เป้าหมาย เราใช้ primer3_core ซอฟต์แวร์มีตัวเลือกดังนี้ความยาวที่เหมาะสมของไพรเมอร์ = 20 ; สูงสุดละลายอุณหภูมิ = 60  C ; และผลิตภัณฑ์ PCR ขนาด = 200 – 500 ไพรเมอร์ที่ออกแบบมาสำหรับติดสถานะเป็นชื่อเพลง ( c.melo makuwa SSR ) ท่อทั้งหมดถูกควบคุมด้วยสคริปต์พัฒนาสัมมนางูหลาม ( Ver . 2.7 ) ใช้ไบโอไพธันโมดูล ( Ver . 4 )