คาเฟอีนมีฤทธิ์กระตุ้นระบบประสาท คาเฟอีนจะไปแทรกแซงการนอนหลับ ทำให้หลับยาก
เนื่องจากหลังการดื่มกาแฟจะทำให้ย้ำย่อยในกระเพาะอาหารออกมามากขึ้น ทำให้มีแผลในกระเพาะมากขึ้น
ผู้ที่มีความดันโลหิตสูง หากได้รับคาเฟอีน จะทำให้ความดันโลหิตสูงขึ้นนานถึง ชั่วโมง
คาเฟอีนทำให้ปัสสาวะบ่อยขึ้น จะทำให้สูญเสียแคลเซียมไปกับปัสสาวะมากจนเกิดภาวะกระดูกพรุ่น