1) หมู่เกาะซุนดาใหญ่ ประกอบด้วย เกาะชวา สุมาตรา กะลิมันตัน
และสุลาเวสี
2) หมู่เกาะซุนดาน้อย ประกอบด้วยเกาะเล็กๆ ทางตะวันออกของ
เกาะชวา มีเกาะบาหลี ล็อมบอก ซุมบาวา ฟอลเรส และติมอร์
3) หมู่เกาะโมลุกกะ หรือหมู่เกาะเครื่องเทศ อยู่ระหว่างสุลาเวสีกับ
เกาะปาปัว
4) ปาปัว (Papua) อยู่บนเกาะนิวกินีทางตะวันตกของประเทศ
ปาปัวนิวกินี ในบรรดาหมู่เกาะทั้งหมด มีเกาะขนาดใหญ่ 5 เกาะ ครอบคลุม
พื้นที่ประมาณร้อยละ 90 ของประเทศ คือ
1) กะลิมันตัน มีพื้นที่คิดเป็นร้อยละ 28 ของพื้นที่ทั้งหมด และ
ครอบคลุมพื้นที่ 2 ใน 3 ของเกาะบอร์เนียว
2) สุมาตรา มีพื้นที่คิดเป็นร้อยละ 24 ของพื้นที่ทั้งหมด
3) ปาปวั มีพื้นที่คิดเปน็ รอ้ ยละ 22 ของพื้นที่ทั้งหมด และครอบคลุม
พื้นที่ครึ่งหนึ่งด้านตะวันตกของเกาะนิวกินี
4) สุลาเวสี มีพื้นที่คิดเป็นร้อยละ 10 ของพื้นที่ทั้งหมด
5) ชวา และมาดูรา ครอบคลุมพื้นที่เพียงร้อยละ 7 ของพื้นที่
ทั้งหมด แต่มีประชากรอาศัยอยู่ถึงร้อยละ 64 ของทั้งประเทศ