environment than previously thought.
Other methods of gene transfer include capsduction,
or gene transfer by a small phage-like structure (Joset and
Guepsin-Michel, 1993), protoplast fusion (Matsushima and
Baltz, 1986) and transposition.
Transformation
The potential for gene transfer by transformation in the
environment was first demonstrated by Graham and Istock
(1978) using chromosomal loci of Bacillus subtilis in sterile
soil. Since these early studies, many reports have
described transformation in sand/seawater microcosms,
although most often with sterile sand and B. subtilis as
recipient (Aardema et al., 1983; Lorenz and Wackernagel,
1987; Lorenz and Wackernagel, 1994). These studies have
indicated that DNA binds to sand, becoming protected from
DNase, but still capable of causing transformation.
Copious amounts of high MW dissolved DNA in the
marine environment (DeFlaun et al., 1987; Paul et al., 1987)
suggested that transformation could be a viable mechanism
of gene transfer. Gene transfer to a High Frequency of
Transformation Vibrio was demonstrated using plasmid
multimers and seawater microcosms (Paul et al., 1991)
The presence of the ambient microbial community in water
column simulations either had no effect on the rate of
transfer or inhibited transfer. Nutrients stimulated the
transfer rate. These results suggested that nutrients
facilitated transfer, probably by stimulating recipient growth,
and by providing a preferred carbon source (over the
transforming DNA) from the indigenous community. At low
nutrient conditions, we hypothesized that the DNA was
used as a C/N/P source by the indigenous flora, and was
not available to transform the recipients. In sediments, the
presence of the indigenous flora inhibited gene transfer,
whereby sterile sediments enabled transfer to occur (Paul
et al., 1991). In soil, Acinetobacter calcoaceticus could only
be transformed in nonsterile microcosms when excess
nutrients were present (Nielsen et al., 1997). Thus, it sees
that studies with sterile sediments or soil do not yield
relevant information concerning transfer in the marine
environment.
The facilitation of natural transformation by cell contact
which was DNase sensitive was demonstrated by Stewart
et al. (1983) in Pseudomonas stutzeri. The intergeneric
transfer of a small, non- conjugative plasmid from E. coli
to Vibrio JT-1 (later identified as a Pseudomonas species)
occurred and was shown to be DNase-sensitive (Paul et
al., 1992). Heat -killed donor cells were as efficient as living
cells, and interestingly transfer in liquid yielded a 10-fold
higher frequency of transfer than filter matings.
Environmental conditions in microcosms may reveal
gene transfer properties of bacterial strains not revealed
by culture studies using rich media. For example, E. coli
has been known for some time not to be naturally
competent, only being transformable by chemical
treatment, osmotic shock, and electroporation. Using river
water, spring water and mineral water, E. coli was shown
to be naturally competent for the uptake of pUC18 DNA
(Baur et al., 1996). Competence seemed to be internally
regulated, being greatest in exponential phase and least
in stationary phase. This work argues for the potential for
E.coli (and perhaps other coliform bacteria) to be
transformed in natural environments
สภาพแวดล้อมมากกว่าคิดว่า ก่อนหน้านี้วิธีการอื่น ๆ ของการถ่ายโอนยีนรวม capsductionหรือยีนโดยโครงสร้างเล็ก ๆ เหมือน phage (Joset และMichel Guepsin, 1993) ฟิวชั่น protoplast (มัตสึชิมะ และBaltz, 1986) และ transpositionการเปลี่ยนแปลงเป็นยีนที่ถ่ายโอน โดยการเปลี่ยนแปลงในการก่อนได้แสดงให้เห็นว่าสภาพแวดล้อม โดยเกรแฮมและ Istock(1978) ใช้ loci ของโครโมโซมของคัด subtilis ในกอซดิน ตั้งแต่ช่วงการศึกษานี้ มีรายงานหลายฉบับการเปลี่ยนแปลงที่อธิบายไว้ในทะเล ทราย/microcosmsถึงแม้ว่าส่วนใหญ่มักจะ มี subtilis ใส่ทราย และเกิดเป็นผู้รับ (Aardema และ al., 1983 ชายลอเรนซ์และ Wackernagel1987 ชายลอเรนซ์ก Wackernagel, 1994) การศึกษาเหล่านี้ได้ระบุว่า ดีเอ็นเอ binds กับทราย เป็นป้องกันจากDNase แต่ยังคงสามารถก่อให้เกิดการเปลี่ยนแปลงจำนวน copious MW สูงส่วนยุบดีเอ็นเอในการสภาพแวดล้อมทางทะเล (DeFlaun et al., 1987 Paul et al., 1987)แนะนำว่า การแปลงอาจจะมีกลไกการทำงานได้ถ่ายโอนยีน ส่งความถี่สูงของยีนมีแสดงผลการแปลงใช้ plasmidmicrocosms multimers และทะเล (Paul et al., 1991)ของชุมชนแวดล้อมที่จุลินทรีย์ในน้ำจำลองคอลัมน์อย่างใดอย่างหนึ่งก็ไม่มีผลต่ออัตราการโอนหรือห้ามโอน สารอาหารถูกกระตุ้นอัตราการถ่ายโอน ผลลัพธ์เหล่านี้แนะนำที่สารอาหารอาศัยโอน กระตุ้นผู้เจริญเติบโต คงและให้เป็นแหล่งคาร์บอนที่ต้องการ (ผ่านการเปลี่ยนดีเอ็นเอ) จากชุมชนพื้นเมือง ที่ต่ำเงื่อนไขธาตุอาหาร เราตั้งสมมติฐานว่าดีเอ็นเอถูกใช้เป็นแหล่ง C/N/P โดยพืชพื้นเมือง และเป็นไม่มีการแปลงผู้รับด้วย ในตะกอน การของพืชพื้นเมืองห้ามโอนย้ายยีนโดยตะกอนกอซเปิดโอนย้ายเกิดขึ้น (Paulร้อยเอ็ด al., 1991) ในดิน Acinetobacter calcoaceticus สามารถเท่านั้นแตกต่างใน microcosms nonsterile เมื่อเกินสารอาหารถูกนำเสนอ (นีลและ al., 1997) ดังนั้น เห็นที่ศึกษากับใส่ตะกอนดินได้ผลผลิตไม่ข้อมูลที่เกี่ยวข้องเกี่ยวกับการโอนในทางทะเลสภาพแวดล้อมการอำนวยความสะดวกของการเปลี่ยนแปลงธรรมชาติโดยติดต่อเซลล์ซึ่งสำคัญ DNase ถูกแสดง โดยสจ๊วตal. ร้อยเอ็ด (1983) ใน Pseudomonas stutzeri Intergeneric ที่โอนย้ายของขนาดเล็ก ใช่ conjugative plasmid จาก E. coliการต่อ JT-1 (ในภายหลังระบุเป็นชนิด Pseudomonas)เกิดขึ้น และถูกแสดงเป็น สำคัญ DNase (Paul etal., 1992) ความร้อน - ผู้บริจาคฆ่าเซลล์มีประสิทธิภาพที่อยู่เซลล์ และเรื่องน่าสนใจโอนย้ายในของเหลวเต็ม 10-foldความถี่สูงของการโอนย้ายมากกว่ากรอง matingsสภาพแวดล้อมใน microcosms อาจเปิดเผยคุณสมบัติการถ่ายโอนยีนของแบคทีเรียสายพันธุ์ที่ไม่เปิดเผยโดยใช้สื่อศึกษาวัฒนธรรม ตัวอย่าง E. coliเป็นที่รู้จักในเวลาที่มีตามธรรมชาติเชี่ยวชาญ แต่ transformable โดยเคมีรักษา ออสโมติกช็อก ก electroporation ใช้แม่น้ำน้ำ บ่อน้ำ และน้ำแร่ E. coli ถูกแสดงคุณวุฒิตามธรรมชาติในการดูดซับของ pUC18 ดีเอ็นเอ(เบาร์เอาลา et al., 1996) ความสามารถที่ดูเหมือน จะเป็นการภายในควบคุม สุดในระยะเนนและน้อยที่สุดในระยะเครื่องเขียน งานนี้จนสำหรับศักยภาพในการระบบ (และอาจจะอื่น ๆ โคลิฟอร์มแบคทีเรีย)แปลงในสภาพแวดล้อมธรรมชาติ
การแปล กรุณารอสักครู่..
สภาพแวดล้อมกว่าที่เคยคิด.
วิธีการอื่น ๆ ของการถ่ายโอนยีนรวม capsduction,
หรือการถ่ายโอนยีนโดยโครงสร้างทำลายจุลินทรีย์เหมือนขนาดเล็ก (Joset และ
Guepsin-Michel 1993), ฟิวชั่นโปรโตพลา (Matsushima และ
Baltz, 1986) และการขนย้าย.
แปลง
ที่มีศักยภาพสำหรับการแสดงออกของยีน โอนโดยการเปลี่ยนแปลงใน
สภาพแวดล้อมที่ได้แสดงให้เห็นเป็นครั้งแรกโดยเกรแฮมและ Istock
(1978) โดยใช้สถานะของโครโมโซมของเชื้อ Bacillus subtilis ในการฆ่าเชื้อ
ดิน ตั้งแต่ช่วงต้นการศึกษาเหล่านี้รายงานจำนวนมากได้
อธิบายการเปลี่ยนแปลงในระบบนิเวศน์จำลองทราย / น้ำทะเล
ถึงแม้ว่าส่วนใหญ่มักจะมีทรายเป็นหมันและ B. subtilis เป็น
ผู้รับ (Aardema et al, 1983;. ลอเรนและ Wackernagel,
1987; อเรนซ์และ Wackernagel, 1994) การศึกษาเหล่านี้ได้
แสดงให้เห็นว่าดีเอ็นเอผูกกับทรายกลายเป็นป้องกันจาก
DNase แต่ยังคงความสามารถในการก่อให้เกิดการเปลี่ยนแปลง.
ปริมาณมากเมกะวัตต์สูงละลายดีเอ็นเอใน
สภาพแวดล้อมทางทะเล (DeFlaun et al, 1987;. พอลและคณะ, 1987.)
ชี้ให้เห็นว่า การเปลี่ยนแปลงอาจจะเป็นกลไกการทำงาน
ของการถ่ายโอนยีน การถ่ายโอนยีนเพื่อความถี่สูงของ
การเปลี่ยนแปลง Vibrio ได้แสดงให้เห็นการใช้พลาสมิด
multimers และจุลภาคน้ำทะเล (พอล et al., 1991)
การปรากฏตัวของชุมชนโดยรอบของจุลินทรีย์ในน้ำ
จำลองคอลัมน์ทั้งไม่มีผลกระทบต่ออัตรา
การถ่ายโอนหรือยับยั้งการถ่ายโอน สารอาหารที่กระตุ้น
อัตราการถ่ายโอน ผลการศึกษานี้ชี้ให้เห็นว่าสารอาหารที่
อำนวยความสะดวกในการถ่ายโอนอาจจะโดยการกระตุ้นการเจริญเติบโตของผู้รับ
และโดยการให้แหล่งคาร์บอนที่ต้องการ (กว่า
ดีเอ็นเอเปลี่ยน) จากชุมชนพื้นเมือง ที่ต่ำ
สภาพสารอาหารที่เราตั้งสมมติฐานว่าดีเอ็นเอที่ถูก
นำมาใช้เป็น C / N / P แหล่งที่มาจากพืชพื้นเมืองและเป็น
ไม่สามารถที่จะเปลี่ยนผู้รับ ในตะกอน,
การปรากฏตัวของพืชพื้นเมืองถ่ายโอนยีนยับยั้ง
โดยตะกอนหมันเปิดใช้งานการถ่ายโอนจะเกิดขึ้น (พอล
et al., 1991) ในดิน Acinetobacter calcoaceticus เท่านั้นที่จะ
ถูกเปลี่ยนในระบบนิเวศน์จำลอง nonsterile เมื่อเกิน
สารอาหารที่อยู่ในปัจจุบัน (นีลเซ่น et al., 1997) ดังนั้นจึงเห็น
ว่าการศึกษาที่มีการฆ่าเชื้อตะกอนหรือดินไม่ได้ผลผลิต
ข้อมูลที่เกี่ยวข้องเกี่ยวกับการโอนในทะเล
สภาพแวดล้อม.
การอำนวยความสะดวกของการเปลี่ยนแปลงทางธรรมชาติโดยการสัมผัสมือถือ
ซึ่งเป็น DNase ที่มีความสำคัญคือการแสดงให้เห็นถึงสจ๊วต
และคณะ (1983) ใน Pseudomonas stutzeri สกุล
การโอนขนาดเล็กที่ไม่พลาสมิด conjugative จากเชื้อ E. coli
ต่อเชื้อ Vibrio JT-1 (ต่อมาระบุว่าเป็นสายพันธุ์ Pseudomonas)
ที่เกิดขึ้นและได้รับการแสดงที่จะมีความไวต่อการ DNase (พอลและ
al., 1992) ความร้อน -killed บริจาคเซลล์พบว่ามีประสิทธิภาพเป็นที่อาศัย
เซลล์และที่น่าสนใจในการถ่ายโอนในของเหลว yielded 10 เท่า
ความถี่สูงของการถ่ายโอนกว่ากรองถอนราก.
สภาพสิ่งแวดล้อมในระบบนิเวศน์จำลองอาจเปิดเผย
คุณสมบัติการถ่ายโอนยีนของแบคทีเรียไม่เปิดเผย
โดยการศึกษาวัฒนธรรมการใช้สื่อที่อุดมไปด้วย . ตัวอย่างเช่นเชื้อ E. coli
ได้รับการรู้จักกันบางครั้งไม่เป็นตามธรรมชาติ
มีอำนาจเพียงอย่างเดียว transformable โดยใช้สารเคมี
รักษาช็อกออสโมติกและ Electroporation ใช้แม่น้ำ
น้ำฤดูใบไม้ผลิและน้ำแร่เชื้อ E. coli ถูกนำมาแสดง
จะมีอำนาจธรรมชาติสำหรับการดูดซึมของ pUC18 ดีเอ็นเอ
(Baur et al., 1996) ความสามารถดูเหมือนจะอยู่ภายใน
การควบคุมเป็นที่ยิ่งใหญ่ที่สุดในขั้นตอนการชี้แจงและอย่างน้อย
ในเฟส งานนี้ระบุว่าสำหรับที่มีศักยภาพสำหรับ
E.coli (และอื่น ๆ อาจจะโคลิฟอร์มแบคทีเรีย) ที่จะ
เปลี่ยนในสภาพแวดล้อมทางธรรมชาติ
การแปล กรุณารอสักครู่..
สิ่งแวดล้อมมากกว่าที่คิดไว้ก่อนหน้านี้
วิธีการอื่น ๆของการถ่ายโอนยีนรวมถึง capsduction
, หรือการถ่ายโอนยีนโดยฟาจขนาดเล็กเช่นโครงสร้าง ( โยเซฟและ
guepsin มิเชล , 1993 ) โปรโตพลาสต์ฟิวชัน ( Matsushima และ
แบลต์ส , 1986 ) และ การขนย้าย การเปลี่ยนแปลง
ที่มีศักยภาพสำหรับการถ่ายโอนยีนโดยการเปลี่ยนแปลงในสภาพแวดล้อมที่เป็นครั้งแรกที่แสดงให้เห็นถึง
โดย เกรแฮม และซึ่ง
( 1978 ) โดยใช้รูปแบบของโครโมโซมใน Bacillus subtilis ในดินปลอดเชื้อ
ตั้งแต่ก่อนการศึกษานี้รายงานหลายคน
อธิบายการเปลี่ยนแปลงใน microcosms ทราย / น้ำทะเล
ถึงแม้ว่าส่วนใหญ่มักจะด้วยทรายปลอดเชื้อและ B . subtilis เป็นผู้รับ (
aardema et al . , 1983 ; ลอเรนซ์ และ wackernagel
, 1987 ; และลอเรนซ์ wackernagel , 1994 ) การศึกษานี้พบว่า ดีเอ็นเอก็ให้
เป็นป้องกันจากทรายตรวจหา ADNase แต่ยังสามารถก่อให้เกิดการเปลี่ยนแปลง .
ปริมาณมากของ MW สูงละลาย DNA ใน
สิ่งแวดล้อมทางทะเล ( deflaun et al . , 1987 ; Paul et al . , 1987 )
แนะนำว่า แปลงเป็นกลไกปฏิบัติการถ่ายโอนยีน . การถ่ายโอนยีนในความถี่สูงของการใช้พลาสมิดพบ Vibrio
multimers และน้ำทะเล microcosms ( Paul et al . , 1991 )
การแสดงตนของชุมชนจุลินทรีย์ที่มีในน้ำ
คอลัมน์จำลองให้ไม่มีผลต่ออัตรา
โอนหรือยับยั้งการถ่ายโอน สารอาหารกระตุ้น
โอนอัตรา ผลลัพธ์เหล่านี้ชี้ให้เห็นว่าสารอาหาร
สะดวกโอน อาจจะโดยการกระตุ้นการเจริญเติบโตและผู้รับ
โดยมีแหล่งคาร์บอนที่ต้องการ ( มากกว่า
เปลี่ยน DNA ) จากชุมชนท้องถิ่น
ที่ต่ำสภาวะธาตุอาหาร เราตั้งสมมุติฐานว่าดีเอ็นเอ
ใช้เป็น C / N / P ที่มาจากพืชพื้นเมืองและ
ไม่สามารถเปลี่ยนผู้รับ ในดินตะกอน , การแสดงตนของพืชพื้นเมือง
การถ่ายโอนยีน โดยปราศจากการใช้ตะกอนเกิดขึ้น ( พอล
et al . , 1991 ) ในดิน Accipitriformes เท่านั้น
จะเปลี่ยนใน nonsterile microcosms เมื่อสารอาหารส่วนเกิน
อยู่ในปัจจุบัน ( Nielsen et al . , 1997 ) ดังนั้น จึงเห็นว่า การศึกษาด้วย
หรือดินตะกอนที่เป็นหมันไม่ให้ผลผลิต
ข้อมูลที่เกี่ยวข้องเกี่ยวกับการถ่ายโอนในสภาพแวดล้อมทางทะเล
.
การอํานวยความสะดวกของการเปลี่ยนแปลงตามธรรมชาติโดยเซลล์ติดต่อ
ซึ่งตรวจหา ADNase ละเอียดอ่อนที่แสดงโดยสจ๊วต
et al . ( 1983 ) ในส่วนของ stutzeri .จาก intergeneric
โอนขนาดเล็กไม่ conjugative พลาสมิดจาก E . coli
ต่อ Vibrio jt-1 ( รู้ทีหลังว่าเป็น Pseudomonas species )
ที่เกิดขึ้น และได้แสดงให้ตรวจหา ADNase อ่อนไหว ( Paul et
al . , 1992 ) ความร้อน - ฆ่าเซลล์มีประสิทธิภาพเท่าที่ชีวิต
เซลล์และน่าสนใจโอนในของเหลวจาก 10 เท่า
ความถี่สูงของการ matings
มากกว่าตัวกรองสภาพแวดล้อมใน microcosms อาจเปิดเผย
ถ่ายยีนคุณสมบัติของสายพันธุ์แบคทีเรียไม่เปิดเผย
โดยวัฒนธรรมการศึกษาการใช้สื่อที่อุดมไปด้วย ตัวอย่างเช่น , E . coli
ได้รับรู้มานานแล้วว่าไม่มีความสามารถโดยธรรมชาติ
แค่หม้อแปลงโดยเคมี
รักษาการช็อกและ electroporation . การใช้น้ำในแม่น้ำ
, น้ำแร่และน้ำแร่ , E . coli พบ
มีความสามารถตามธรรมชาติสำหรับการรับของ
ดีเอ็นเอเบส ( บอร์ et al . , 1996 ) ความสามารถดูเหมือนจะภายใน
ถูกระเบียบ ถูกที่สุดในระยะ exponential และอย่างน้อย
ในเฟสอยู่กับที่ งานนี้เถียงเพื่อศักยภาพ
E.coli ( และบางทีโคลิฟอร์มแบคทีเรียอื่น ๆ ) ที่จะ
เปลี่ยนในสภาพแวดล้อมธรรมชาติ
การแปล กรุณารอสักครู่..