RNA molecules tend to form stable,

RNA molecules tend to form stable, non-functional secondary structures, and whose proper function requires RNA chaperones. RNA helicases are prominent candidates as RNA chaperones because the energy derived from ATP hydrolysis can be used to promote the formation of optimal RNA structures via local RNA unwinding, or by mediating RNA–protein association/dissociation (Jankowsky et al., 2001). It is known that RNA–protein interactions and the secondary structure of RNA molecules to be important for RNA metabolism. RNA helicases are involved in ribosome biogenesis, transcription, pre-mRNA splicing, mRNA export, RNA degradation, translation initiation, and organelle gene expression. Helicases include six superfamilies (SF1 to SF6). The majority of known RNA helicases belong to the SF2 superfamily, which can be subdivided into several families including DEAD, DEAH and DExH/D (Tanner and Linder, 2001). DEAD-box proteins comprise the largest and most extensively characterized family of RNA helicases. These proteins are characterized by a core of 350 to 400 amino acids containing seven to nine conserved amino acid motifs. In the DEAD-box proteins, motif II includes the sequence D-E-A-D, from which the name was derived. The Q-motif (Tanner et al., 2003) and motifs I and II (Walker motifs A and B) are involved in ATP binding and hydrolysis (Walker et al., 1982). Motif III is speculated to couple ATP hydrolysis with helicase activity by linking conformational changes of the protein with ATP hydrolysis, which ultimately leads to RNA unwinding or RNA–protein dissociation (Velankar et al., 1999). Motif VI is believed to be involved in binding the ATP phosphates, and mutations in this motif impair ATP hydrolysis in some DEAD-box proteins (Pause et al., 1993). The solved crystal structures of a substrate-bound helicase (Kim et al., 1998) indicate that the remaining motifs (Ia, Ib, IV and V) are probably involved in RNA binding and in stimulation of ATP hydrolysis by RNA binding, which are consistent with biochemical studies (Shen et al., 2007). In addition to the helicase core, DEAD-box helicases contain N-terminal and/or C-terminal extensions, which differ among proteins and, in some cases, target the proteins to specific sites of action via protein–protein or protein–RNA interactions.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เอ็นเอมักจะแบบฟอร์มมีเสถียรภาพ ไม่ทำงานโครงสร้างรอง และที่มีฟังก์ชั่นที่เหมาะสมต้อง RNA chaperones RNA helicases มีผู้สมัครที่โดดเด่นเป็น RNA chaperones เพราะสามารถใช้พลังงานจาก ATP ย่อยเพื่อส่งเสริมการก่อตัวของโครงสร้าง RNA ที่เหมาะสม ผ่านท้องถิ่น RNA คลาย หรือ RNA – โปรตีน สมาคม/dissociation (Jankowsky et al. 2001) การเป็นสื่อกลาง เป็นที่ทราบกันว่าโต้ RNA – โปรตีนและโครงสร้างรองของเอ็นจะเป็นสิ่งสำคัญสำหรับการเผาผลาญ RNA RNA helicases เกี่ยวข้องในไรโบโซม biogenesis ถอด mRNA ก่อนประกบ ส่ง mRNA, RNA ลด เริ่มต้นแปล และออร์แกเนลล์ยีน Helicases รวมหก superfamilies (SF1 การ SF6) ส่วนใหญ่รู้จัก helicases RNA อยู่ใน superfamily SF2 ซึ่งสามารถแยกออกเป็นหลายครอบครัวตาย DEAH และ DExH/D (แทนเนอร์และลิ 2001) กล่องตายโปรตีนประกอบใหญ่ที่สุด และมากสุดลักษณะของ RNA helicases โปรตีนเหล่านี้มีลักษณะ โดยหลักของกรดอะมิโน 350-400 ที่ประกอบด้วยลวดลายที่นำกรดอะมิโน 7-9 ขวบ ในโปรตีนกล่องตาย รูปที่สองมีลำดับ D-E-A-D ที่มาชื่อ Q-ลาย (แทนเนอร์ et al. 2003) และลวดลายที่ I และ II (Walker ลาย A และ B) เกี่ยวข้องใน ATP รวมและสลาย (Walker et al. 1982) ลาย III ถูกคาดการย่อยสลาย ATP คู่กับ helicase กิจกรรม โดยการเชื่อมโยงเปลี่ยนแปลง conformational โปรตีนกับสลาย ATP ซึ่งในท้ายที่สุด นำไปสู่การคลาย RNA หรือ RNA – โปรตีน dissociation (Velankar et al. 1999) ลาย VI เชื่อว่าการมีส่วนร่วมในการผูกฟอสเฟต ATP และในรูปนี้ทำสลาย ATP ในโปรตีนบางตายกล่อง (หยุด et al. 1993) โครงสร้างผลึกที่แก้ไขของ helicase ขอบพื้นผิว (Kim et al. 1998) ระบุว่า ลวดลายที่เหลือ (Ia, Ib, IV และ V) อาจจะเกี่ยวข้อง ใน RNA รวม และกระตุ้นสลาย ATP โดย RNA รวม ซึ่งมีความสอดคล้องกับการศึกษาทางชีวเคมี (Shen et al. 2007) นอกจากหลัก helicase, helicases กล่องตายประกอบด้วย N-เทอร์มินัล หรือส่วนขยายอาคารผู้โดยสาร C ซึ่งแตกต่าง จากโปรตีน และ ในบางกรณี เป้าหมายโปรตีนให้ไซต์ที่เฉพาะเจาะจงของการดำเนินการผ่านการโต้ตอบโปรตีน – โปรตีนหรือโปรตีน – RNA

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

โมเลกุล RNA มักจะสร้างเสถียรภาพที่ไม่ใช่หน้าที่โครงสร้างรองและมีฟังก์ชั่นที่เหมาะสมต้องมีครูใหญ่อาร์เอ็นเอ helicases RNA มีผู้สมัครที่โดดเด่นเป็นครูใหญ่ RNA เพราะพลังงานที่ได้จากการย่อยสลาย ATP สามารถนำมาใช้เพื่อส่งเสริมการก่อตัวของโครงสร้าง RNA ที่ดีที่สุดผ่านทางอาร์เอ็นเอท้องถิ่นคลี่คลายหรือโดยการไกล่เกลี่ย RNA โปรตีนสมาคม / แยกออกจากกัน (Jankowsky et al., 2001) เป็นที่ทราบกันว่าการโต้ตอบ RNA โปรตีนและโครงสร้างทุติยภูมิของโมเลกุล RNA จะมีความสำคัญสำหรับการเผาผลาญอาร์เอ็นเอ helicases RNA มีส่วนร่วมใน biogenesis ไรโบโซมถอดความก่อน mRNA ประกบส่งออก mRNA ย่อยสลาย RNA ริเริ่มแปลภาษาและการแสดงออกของยีนเนลล์ Helicases รวมหก superfamilies (SF1 เพื่อ SF6) ส่วนใหญ่ที่รู้จักกัน helicases RNA อยู่ใน superfamily SF2 ซึ่งสามารถแบ่งออกเป็นหลายครอบครัวรวมทั้งคนตายและ DEAH DExH / D (แทนเนอร์และลินเดอ, 2001) โปรตีนตายกล่องประกอบด้วยครอบครัวที่ใหญ่ที่สุดและโดดเด่นอย่างกว้างขวางที่สุดของ helicases อาร์เอ็นเอ โปรตีนเหล่านี้มีลักษณะหลักของ 350-400 กรดอะมิโนที่มี 7-9 อนุรักษ์ลวดลายกรดอะมิโน ในโปรตีนตายกล่องแม่ลาย II รวมถึงความตายลำดับซึ่งเป็นชื่อที่ได้รับมา Q-บรรทัดฐาน (แทนเนอร์ et al., 2003) และลวดลาย I และ II (วอล์คเกอร์ลวดลาย A และ B) มีส่วนร่วมในเอทีพีมีผลผูกพันและการย่อยสลาย (วอล์คเกอร์ et al., 1982) Motif III สันนิษฐานคู่ไฮโดรไลซิเอทีพีที่มีกิจกรรม helicase โดยการเชื่อมโยงการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างของโปรตีนไฮโดรไลซิเอทีพีซึ่งในที่สุดนำไปสู่​​การคลี่คลายหรืออาร์เอ็นเออาร์เอ็นเอโปรตีนแยกออกจากกัน (Velankar et al., 1999) Motif VI เชื่อว่าจะมีส่วนร่วมในการผูกฟอสเฟตเอทีพีและการกลายพันธุ์ในบรรทัดฐานนี้ทำให้เสียเอทีพีจองจำในบางโปรตีนตายกล่อง (หยุด et al., 1993) แก้ไขโครงสร้างผลึกของ helicase พื้นผิวที่ถูกผูกไว้ (Kim et al., 1998) แสดงให้เห็นว่าลวดลายที่เหลือ (IA, Ib, IV และ V) อาจจะมีส่วนร่วมใน RNA ผูกพันและในการกระตุ้นของเอทีพีจองจำโดย RNA ผูกพันซึ่งเป็น สอดคล้องกับการศึกษาทางชีวเคมี (Shen et al., 2007) นอกเหนือไปจากหลัก helicase ที่ helicases ตายกล่องประกอบด้วย N-Terminal และ / หรือ C ขั้วส่วนขยายที่แตกต่างกันระหว่างโปรตีนและในบางกรณี, โปรตีนเป้าหมายไปยังเว็บไซต์ที่เฉพาะเจาะจงของการดำเนินการผ่านทางโปรตีนหรือโปรตีน-RNA .

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

โมเลกุล RNA มักจะฟอร์มที่มีเสถียรภาพ ไม่ใช่การทำงานโครงสร้างทุติยภูมิที่มีหน้าที่ต้องเหมาะสมและ RNA ผู้ดูแล . อาร์เอ็นเอ helicases เป็นผู้สมัครที่โดดเด่นเป็นอาร์เอ็นเอ คนติดตาม เพราะพลังงานที่ได้รับจาก ATP hydrolysis สามารถใช้เพื่อส่งเสริมการก่อตัวของโครงสร้าง RNA ที่เหมาะสมผ่านทางท้องถิ่น RNA เพื่อไกล่เกลี่ย RNA หรือโปรตีน–สมาคม / หวิว ( jankowsky et al . , 2001 ) มันเป็นที่รู้จักกันว่า RNA และโปรตีนปฏิสัมพันธ์และโครงสร้างของโมเลกุล RNA มีความสำคัญสำหรับการเผาผลาญ RNA helicases เกี่ยวข้องกับ RNA ไรโบโซมเครื่องกรองอากาศการคัดลอก , pre mRNA ของยีน Splicing ส่งออก , การสลายตัว , การเริ่มต้นการแปล และการแสดงออกของยีนออร์แกเนลล์ . helicases รวมหก superfamilies ( SFI กับ SF6 ) ส่วนใหญ่รู้จัก RNA helicases เป็นของ sf2 ซูเปอร์แฟมิลี ซึ่งสามารถแบ่งออกได้เป็นหลายครอบครัวรวมทั้งตาย และ deah dexh / D ( แทนเนอร์ และ ลิน , 2001 ) กล่องประกอบด้วยโปรตีนตายที่ใหญ่ที่สุด และลักษณะครอบครัวของ RNA helicases อย่างกว้างขวางมากที่สุด . โปรตีนเหล่านี้มีลักษณะโดยหลักของ 350 ถึง 400 กรดอะมิโนที่มีเจ็ดถึงเก้าปี กรดอะมิโน ลวดลาย ในกล่องประกอบด้วยโปรตีนที่ตายแล้ว , แม่ลาย 2 ลำดับ d-e-a-d ซึ่งชื่อที่ได้มา การ q-motif ( เทนเนอร์ et al . , 2003 ) และลวดลายที่ I และ II ( Walker ลาย A และ B ) มีส่วนร่วมในเอทีพี และย่อยสลาย ( วอล์คเกอร์ et al . , 1982 ) แม่ลาย III คือสันนิษฐานคู่เอทีพีโมเลกุล โดยการเชื่อมโยงกับกิจกรรม การเปลี่ยนแปลงโครงสร้างของโปรตีนกับ ATP การย่อย ซึ่งในที่สุดจะนำไปสู่การคลี่คลายหรือ RNA ( RNA โปรตีน ( velankar et al . , 1999 ) แม่ลาย VI เชื่อว่ามีส่วนร่วมในการจับเอทีพีฟอสเฟต และการกลายพันธุ์ในกลุ่มนี้บั่นทอนประสิทธิภาพการย่อยโปรตีนเอทีพีในกล่องแล้ว ( หยุด et al . , 1993 ) การแก้ไขโครงสร้างของโมเลกุลผลึกฐานรองไว้ ( Kim et al . , 1998 ) ระบุว่าลวดลายที่เหลือ ( IA , IB , IV และ V ) อาจจะเกี่ยวข้องกับการกระตุ้นของ RNA ใน ATP การย่อยโดย RNA ผูก ซึ่งสอดคล้องกับชีวเคมี ( Shen et al . , 2007 ) นอกจากนี้โมเลกุลประกอบด้วยกรดอะมิโนหลัก helicases กล่องตายและ / หรือส่วนขยายซึ่งซึ่งแตกต่างกันระหว่างโปรตีนและในบางกรณีโปรตีนเป้าหมายเฉพาะเว็บไซต์ของการกระทำผ่านทางโปรตีนและโปรตีนหรือโปรตีนและ RNA การโต้ตอบ