In this section, we show how our so

In this section, we show how our software infrastructure can be
used to implement two data-intensive applications—the K-mer Matching Interface (KMI)
4
and Breadth First Search (BFS), and compare
their performance to the respective MPI implementations. KMI is a
distributed, domain-specific library for hashing, designed for genome
assembly and mapping analysis applications. BFS is a fundamental
kernel in graph analytics, that is widely employed in many graph algorithms, including connected components, betweenness centrality,
and heuristic search algorithms [27,30].

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ในส่วนนี้ เราแสดงโครงสร้างพื้นฐานซอฟต์แวร์ของเราจะอยู่อย่างไรใช้ในการดำเนินงานเน้นข้อมูลสอง — K mer ตรงอินเตอร์เฟซ (KMI)4และกว้างแรกค้นหา (BFS), และเปรียบเทียบผลการใช้งาน MPI ที่เกี่ยวข้อง KMI เป็นการไลบรารีสำหรับ hashing กระจาย โดเมนเฉพาะที่ออกแบบมาสำหรับกลุ่มประกอบและการวิเคราะห์โปรแกรมการแมป BFS เป็นพื้นฐานเคอร์เนลในกราฟวิเคราะห์ ที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในหลายกราฟอัลกอริทึม รวมทั้งคอมโพเนนต์การเชื่อมต่อ แห่ง betweennessและอัลกอริทึมค้นหาพฤติกรรม [27,30]

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ในส่วนนี้เราแสดงให้เห็นว่าโครงสร้างพื้นฐานของซอฟแวร์ของเราสามารถ
ใช้ในการดำเนินสองข้อมูลจำนวนมากใช้งาน K-Mer จับคู่ Interface (KMI)
4
และความกว้างแรกค้นหา (BFS) และเปรียบเทียบ
ประสิทธิภาพการทำงานของพวกเขาเพื่อการใช้งานที่ MPI ที่เกี่ยวข้อง KMI เป็น
กระจายห้องสมุดโดเมนที่เฉพาะเจาะจงสำหรับคร่ำเครียดที่ออกแบบมาสำหรับจีโนม
การชุมนุมและการทำแผนที่การใช้งานการวิเคราะห์ BFS เป็นพื้นฐาน
เคอร์เนลในด้านการวิเคราะห์กราฟที่มีการจ้างงานกันอย่างแพร่หลายในขั้นตอนวิธีกราฟจำนวนมากรวมทั้งชิ้นส่วนเชื่อมต่อ betweenness ศูนย์กลาง,
และขั้นตอนวิธีการแก้ปัญหาการค้นหา [27,30]

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ในส่วนนี้เราจะแสดงวิธีการที่ซอฟต์แวร์โครงสร้างพื้นฐานของเราสามารถเคยใช้ข้อมูล 2 เข้มข้น แอปพลิเคชั่นที่ k-mer ตรงกับอินเตอร์เฟซ ( kmi )4 .และความกว้างแรกค้นหา ( BFS ) และเปรียบเทียบประสิทธิภาพของพวกเขาที่จะใช้สำหรับแต่ละ kmi คือแจก , โดเมนที่เฉพาะเจาะจงสำหรับบริการห้องสมุดที่ออกแบบมาสำหรับจีโนมการประกอบและการประยุกต์ใช้การวิเคราะห์แผนที่ BFS เป็นพื้นฐานโปรแกรมในการวิเคราะห์กราฟ ที่เป็นกันอย่างแพร่หลายใช้ในขั้นตอนวิธีกราฟหลาย รวมทั้งเชื่อมต่อศูนย์กลาง betweenness , ส่วนประกอบของแต่ละขั้นตอนวิธีการค้นหา [ 27,30 ]