The objective of this study was to assess the
impact of the use of different REVs in a multi-trait
index on predicted financial and trait gains from
selection of sires of cows and on the choice of leading
Holstein bulls available in the UK.
Methodology
The selection index program MTIndex, used by
Cottle (2011) to study the sensitivity of genetic gains
to variations in genetic parameters, was modified to
also allow trait REV (ai) variance. The breeding
objective traits studied were milk yield, fat yield,
protein yield, lifespan, mastitis, non-return rate,
calving interval and lameness. Mammary composite
score and SCC were included as selection index traits
for mastitis, and the feet and leg composite score
was the selection index trait for lameness. These are
standard traits used by the national genetic evaluation
system for dairy cattle in the UK. The sires of
dams (SD) pathway was modelled assuming there
were 75 progeny records for each bull for the eight
selection index traits. The SD pathway is the most
important pathway for commercial dairy producers.
Genetic standard deviations and correlations
(Tables 1 and 2) were obtained from an analysis of
the predicted transmitting abilities (PTAs) of 712 (as
of June 2010) available Holstein bulls in the UK.
Heritability and phenotypic parameters were derived
from the literature (Stott et al. 2005; Wall et al.
2005), the Interbull website (http://www-interbull.
slu.se/national_ges_info2/framesida-ges.htm)
and unpublished dairy data analyses. The ‘true’ ai
values were derived from the bio-economic modelling
approach described by Santarossa et al. (2004).
These values are used in the computation of the UK
national index Profitable Lifetime Index (£PLI).
The ai of each trait was varied trait by trait by
small equal increments within the range )ai to 3*ai
so that percentage (or relative) REV inaccuracy
(PEVI) varied from )200 to +200% when the program
was run separately for each trait. When the ai
values were all varied together, their standard errors
were set at ai ⁄ 2 and these were multiplied by a Box
& Muller (1958) transformation, ()2logeU1)1 ⁄ 2.
sin2pU2, where U1 and U2 are independent random
variables from a density function on the interval
(0,1). This produced normally distributed REVs for
each trait. Responses to index selection (SDIndex)
were then calculated using the generated ai values
using 100 iterations for each trait in turn or 1000
iterations when all aj values were allowed to vary
together. The ai values resulting in the index with
the largest TEM gain from the 1000 random iterations
(opt ai) were used to focus in on the combination
of ai’s that resulted in the highest TEM. The
program calculated indexes with REVs stepping
through the range (opt ai + ai) ⁄ 2 up to 2*opt
ai ) (opt ai + ai) in five equal increments so that all
combinations of ai values were used (>37 000 iterations)
within these ranges. The ai values that
resulted from the ‘true’ REVs, and from the largest
SDIndex value from the random sampling and from
the best three indexes from the structured iterations
were then used to create ‘new’ index values for the
712 Holstein sires from their PTA values for all traits,
except mastitis and lameness which were not available.
The five new calculated index values for each
bull were compared with their existing £PLI value
by estimating the correlations between index values
and determining the top 10 bulls on each of the six
indexes. The high value indexes had ‘incorrect’
REVs, but they were within the normal distribution
of possible ai values.
Table 1
วัตถุประสงค์ของการศึกษานี้เป็นการ ประเมิน
ผลกระทบของการใช้ REVs แตกต่างกันในหลายติด
ดัชนีบนเส้นทางการเงิน และกำไรติดจาก
เลือกพ่อพันธุ์โค ของวัว และที่นำ
โฮลชไตน์โกบูลส์ใน UK
วิธี
เลือกดัชนีโปรแกรม MTIndex ใช้
Cottle (2011) เพื่อศึกษาความไวของกำไรพันธุ
ไปในพารามิเตอร์ทางพันธุกรรม, ล่าสุดไป
ยัง อนุญาตให้ติดเรฟ (ไอ) ต่างกัน การผสมพันธุ์
นมผลตอบแทน ผลตอบแทนไขมัน มีลักษณะวัตถุประสงค์ศึกษา
ผลผลิตโปรตีน อายุ mastitis อัตราผลตอบแทนไม่ใช่,
calving ช่วงและความอ่อนแอ คอมโพสิตทางหน้าอก
คะแนนและ SCC ถูกรวมเป็นลักษณะเลือกดัชนี
mastitis เท้า และขาคะแนนรวม
ถูกติดดัชนีของตัวเลือกสำหรับความอ่อนแอ เหล่านี้
ลักษณะมาตรฐานที่ใช้ โดยการประเมินพันธุกรรมแห่งชาติ
ระบบสำหรับนมสหราชอาณาจักร พ่อพันธุ์โคของ
ทางเดินสาย (SD) เป็น modelled สมมุติว่ามี
ได้ 75 ลูกหลานระเบียนสำหรับแต่ละวัวสำหรับแปด
เลือกดัชนีลักษณะ ทางเดิน SD เป็นที่สุด
ทางเดินสำคัญสำหรับธุรกิจโคนมผลิต
ส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐานทางพันธุกรรมและความสัมพันธ์
(ตารางที่ 1 และ 2) ได้รับจากการวิเคราะห์ของ
ความคาดการณ์ส่งสามารถ (PTAs) ของ 712 (เป็น
มิถุนายน 2553) มีโฮลชไตน์โกบูลส์ใน UK
มา Heritability และพารามิเตอร์ไทป์
จากวรรณคดี (Stott et al. 2005 ผนัง et al.
2005), เว็บไซต์ Interbull ยกเลิกการ (http://www-interbull.
slu.se/national_ges_info2/framesida-ges.htm)
and ประกาศวิเคราะห์ข้อมูลโคนม ไอ 'จริง'
ได้มาจากแบบจำลองเศรษฐกิจชีวภาพ
วิธีที่อธิบายไว้โดย Santarossa et al. (2004) .
ค่าเหล่านี้จะใช้ในการคำนวณของ UK
ชาติดัชนีกำไรชีวิตดัชนี (£PLI) .
ไอติดแต่ละแตกต่างกันโดยติดโดยติด
ทีเท่าภายในช่วง) อายไป 3 * ไอ
ให้เปอร์เซ็นต์ (หรือญาติ) REV inaccuracy
(PEVI) ที่แตกต่างกันจาก) 200 200% เมื่อโปรแกรม
รันแยกต่างหากสำหรับแต่ละติด เมื่อผสมผสาน
ค่ามีทั้งหมดร่วมกัน หลากหลายของข้อผิดพลาดมาตรฐาน
ถูกตั้งค่าที่ไอ⁄ 2 และเหล่านี้ได้ด้วยเครื่อง
&แปลงมูลเลอร์ (1958) 2logeU1 ()) 1 ⁄ 2.
sin2pU2, U1 และ U2 อิสระสุ่ม
แปรจากฟังก์ชันความหนาแน่นในการ interval
(0,1) นี้ผลิต REVs กระจายปกติสำหรับ
ติดละกัน ตอบเลือกดัชนี (SDIndex)
ถูกคำนวณโดยใช้ค่าอายสร้าง
ใช้ครบ 100 ครั้งติดแต่ละใน หรือ 1000
ซ้ำเมื่อค่า aj ทั้งหมดได้รับอนุญาตให้เปลี่ยนแปลง
กัน ไอค่าดัชนีกับผล
กำไรยการที่ใหญ่ที่สุดจากแผนสุ่ม 1000
(เลือกอาย) ก็จะมาในชุด
ของไอของที่ทำให้เกิดยการสูงสุด ที่
โปรแกรมคำนวณดัชนี REVs ก้าว
ช่วง (เลือกไอไอ) ⁄ 2 ถึง 2 * เลือก
ไอ) (เลือกไอไอ) ในห้าเท่าเพิ่มขึ้นเพื่อให้ทั้งหมด
ใช้ชุดของค่าไอ (> ซ้ำ 37 000)
ในช่วงนี้ ไอค่าที่
ผล จาก REVs 'จริง' และใหญ่ที่สุด
ค่า SDIndex จากการสุ่มตัวอย่างแบบสุ่ม และ
ดัชนีสามสุดจากแผนโครงสร้าง
แล้วใช้เพื่อสร้าง 'ใหม่' ค่าดัชนีสำหรับการ
พ่อพันธุ์โคโฮลชไตน์ 712 จากค่า PTA ในลักษณะทั้งหมด,
ยกเว้น mastitis และความอ่อนแอที่ไม่ว่าง
ห้าใหม่คำนวณค่าดัชนีสำหรับแต่ละ
วัวถูกเปรียบเทียบกับค่าของ PLI £อยู่
โดยการประเมินความสัมพันธ์ระหว่างค่าดัชนี
และกำหนดวัว 10 อันดับในแต่ละ 6
ดัชนี ดัชนีมูลค่าสูงได้ 'ถูกต้อง'
REVs แต่พวกเขาได้ภายในการแจกแจงปกติ
ของไอได้ค่า
1 ตาราง
การแปล กรุณารอสักครู่..