Phylogenetic relationships of dung

Phylogenetic relationships of dung beetles in the tribe Onthophagini, including the species-rich, cosmopolitan
genus Onthophagus, were inferred using whole mitochondrial genomes. Data were generated by shotgun sequencing of mixed genomic DNA from >100 individuals on 50% of an Illumina MiSeq flow cell.

Genome assembly of the mixed reads produced contigs of 74 (nearly) complete mitogenomes. The final dataset included representatives of Onthophagus from all biogeographic regions, closely related genera of Onthophagini, and the related tribes Onitini and Oniticellini.

The analysis defined four major clades of Onthophagini, which was paraphyletic for Oniticellini, with Onitini as sister group to all others. Several (sub)genera considered as members of Onthophagus in the older literature formed separate deep lineages.

All New World species of Onthophagus formed a monophyletic group, and the Australian taxa are confined to a single or two closely related clades, one of which forms the sister group of the New World species.

Dating the tree by constraining the basal splits with existing calibrations of Scarabaeoidea suggests an origin of Onthophagini sensu lato in the Eocene and a rapid spread from an African ancestral stock into the Oriental region, and secondarily to Australia and the Americas at about 20–24 Mya.

The successful assembly of mitogenomes and the well-supported tree obtained from these sequences demonstrates
the power of shotgun sequencing from total genomic DNA of species pools as an efficient tool in genus-level phylogenetics.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ความสัมพันธ์ของผลของด้วงมูลในเผ่า Onthophagini รวมทั้งสายพันธุ์รวย เชื้อชาติสกุล Onthophagus ถูกสรุปใช้ genomes ยลทั้งหมด ข้อมูลที่สร้างขึ้น โดยลำดับปืนลูกซองของผสมดีเอ็นเอออกจาก > 100 คน 50% ของการ Illumina MiSeq ไหลเซลล์ กลุ่มชุมนุมของอ่านผสมผลิต contigs ของ mitogenomes (เกือบ) ทั้งหมด 74 ชุดข้อมูลขั้นสุดท้ายรวมตัวแทนของ Onthophagus จากทุกภูมิภาค biogeographic สกุลที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดของ Onthophagini และชนเผ่าที่เกี่ยว Onitini และ Oniticellini การวิเคราะห์กำหนด clades หลักสี่ของ Onthophagini, paraphyletic สำหรับ Oniticellini กับ Onitini เป็นน้องสาวซึ่ง กลุ่มคนอื่น ๆ ทั้งหมด หลายสกุล (ย่อย) ที่ถือเป็นสมาชิกของ Onthophagus ในวรรณคดีเก่าเกิดเชื้อชาติลึกแยกต่างหากทุกสายพันธุ์ของโลกใหม่ของ Onthophagus เกิดกลุ่ม monophyletic เหลืองออสเตรเลียถูกคุมขังที่เดียว หรือสองชิด clades หนึ่งซึ่งรูปแบบน้องสาวกลุ่มพันธุ์โลกใหม่ หาคู่ต้นไม้ โดย constraining แยกฐาน ด้วยการสอบเทียบที่อยู่ของ Scarabaeoidea แสดงให้เห็นจุดเริ่มต้นของลาแอ Onthophagini Eocene ที่และรวดเร็วที่แพร่กระจายจากสต็อกของบรรพบุรุษแอฟริกา เป็นภูมิภาคตะวันออก และเชื่อม สู่ออสเตรเลียและอเมริกาที่เกี่ยวกับเมียะ 20 – 24 อธิบายการประกอบ mitogenomes และต้นไม้ได้รับการสนับสนุนอย่างดีจากลำดับเหล่านี้ประสบความสำเร็จพลังของลำดับปืนลูกซองจากดีเอ็นเอออกรวมชนิดน้ำเป็นเครื่องมือที่มีประสิทธิภาพในระดับสกุลวงศ์วานวิวัฒนาการ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการของด้วงมูลสัตว์ในเผ่า Onthophagini รวมทั้งชนิดที่อุดมไปด้วยความเป็นสากล
สกุล Onthophagus, ถูกอ้างถึงโดยใช้จีโนมทั้งหมดยล ข้อมูลที่ถูกสร้างขึ้นโดยปืนลูกซองลำดับของดีเอ็นเอการชื่นชมจาก> 100 คนใน 50% ของเซลล์ไหล Illumina MiSeq.

ประกอบจีโนมของผสมที่ผลิตอ่าน contigs 74 (เกือบ) สมบูรณ์ mitogenomes ชุดข้อมูลสุดท้ายรวมถึงตัวแทนของ Onthophagus จากทุกภูมิภาคชีวภูมิศาสตร์จำพวกเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดของ Onthophagini และชนเผ่าที่เกี่ยวข้อง Onitini และ Oniticellini.

การวิเคราะห์กำหนดสี่ clades สำคัญของ Onthophagini ซึ่งเป็น paraphyletic สำหรับ Oniticellini กับ Onitini เป็นกลุ่มน้องสาวคนอื่น ๆ ทั้งหมด หลายคน (ย่อย) จำพวกถือว่าเป็นสมาชิกของ Onthophagus ในวรรณคดีเก่ารูป lineages ลึกแยกต่างหาก.

ทุกสายพันธุ์ใหม่ของโลก Onthophagus กลายเป็นกลุ่มไฟย์เลติและแท็กซ่าออสเตรเลียถูกกักบริเวณให้อยู่คนเดียวหรือสอง clades เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดซึ่งหนึ่งในรูปแบบ กลุ่มสาวของสายพันธุ์ใหม่ของโลก.

ออกเดทต้นไม้โดย constraining แยกฐานที่มีการสอบเทียบที่มีอยู่ของ Scarabaeoidea แสดงให้เห็นที่มาของ Onthophagini วงศ์ใน Eocene และแพร่กระจายอย่างรวดเร็วจากสต็อกของบรรพบุรุษแอฟริกันเข้ามาในภูมิภาคเอเชียตะวันออกและครั้งที่สองไปยังประเทศออสเตรเลียและ อเมริกาอยู่ที่ประมาณ 20-24 ม.

การชุมนุมประสบความสำเร็จของ mitogenomes และต้นไม้ที่ดีได้รับการสนับสนุนที่ได้รับจากลำดับเหล่านี้แสดงให้เห็นถึง
พลังของปืนลูกซองจากลำดับดีเอ็นเอทั้งหมดของสระว่ายน้ำสปีชีส์ในฐานะที่เป็นเครื่องมือที่มีประสิทธิภาพใน phylogenetics ประเภทระดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ซึ่งความสัมพันธ์ของด้วงมูลสัตว์ในเผ่า onthophagini รวมทั้งชนิดรวย สากลสกุล onthophagus , ที่ได้ใช้ทั้งยลจีโนม . ข้อมูลที่ถูกสร้างขึ้นโดยการหาลำดับเบสของดีเอ็นเอผสมจากปืนลูกซอง > 100 บุคคลใน 50% ของ Illumina miseq ไหลเซลล์ยีโนมประกอบผสมอ่านผลิตสูง 74 ( เกือบ ) mitogenomes สมบูรณ์ ข้อมูล รวม onthophagus สุดท้ายตัวแทนจากภูมิภาค biogeographic ทั้งหมดที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด onthophagini สกุลและที่เกี่ยวข้องและชนเผ่า onitini oniticellini .การวิเคราะห์กำหนดสี่ clades หลักของ onthophagini ซึ่ง paraphyletic สำหรับ oniticellini กับ onitini เป็นพี่สาวกลุ่มอื่นๆทั้งหมด หลาย ( ย่อย ) สกุลถือเป็นสมาชิกของ onthophagus ในเก่าวรรณกรรมรูปแบบแยกลึกพันธุ์ .ใหม่ของโลกชนิด onthophagus ก่อตั้งกลุ่ม monophyletic และซ่าออสเตรเลียคับเดียวหรือสองที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด clades ซึ่งหนึ่งในรูปแบบน้องกลุ่มของสายพันธุ์ใหม่ของโลก .เดทกับต้นไม้ โดยจำกัดแยกพื้นฐานที่มีอยู่ของ scarabaeoidea สอบเทียบให้กำเนิด onthophagini เซ็นสุ lato ในอีโอซีนและแพร่กระจายอย่างรวดเร็วจากบรรพบุรุษชาวหุ้นในภูมิภาคตะวันออก และครั้งที่สองออสเตรเลียและอเมริกาประมาณ 20 – 24 เมียะ .ความสำเร็จของ mitogenomes ประกอบและการสนับสนุนอย่างดี ต้นไม้ที่ได้จากลำดับเหล่านี้ แสดงพลังของการใช้ปืนลูกซองรวมดีเอ็นเอชนิดต่างๆ เป็นเครื่องมือที่มีประสิทธิภาพในไฟโลเจเนติกระดับสกุล