AbstractAlteration of DNA methylati

Abstract
Alteration of DNA methylation in mammalian cells could be elicited by many factors, including viral infections [1]. HIV has shown the ability to interact with host cellular factors to change the methylation status of some genes [2], [3] and [4]. However, the change of the DNA methylation associated with HIV infection based on the whole genome has not been well illustrated. In this study, a unique pair of monozygotic twins was recruited: one of the twins was infected with HIV without further anti-retroviral therapy while the other one was healthy, which could be considered as a relatively ideal model for profiling the alterations of DNA methylation associated with HIV infection. Therefore, using methylated DNA immunoprecipitation–microarray method (MeDIP–microarray), we found the increased DNA methylation level in peripheral blood mononuclear cells from HIV infected twin compared to her normal sibling. Moreover, several distinguished differential methylation regions (DMRs) in HIV infected twin worth further study. The raw data has been deposited in Gene Expression Omnibus (GEO) datasets with reference number GSE68028.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

บทคัดย่อแก้ไขปรับเซลล์κอาจ elicited ได้ โดยปัจจัยหลายประการ รวมทั้งการติดเชื้อไวรัส [1] เอชไอวีได้แสดงความสามารถในการโต้ตอบกับโฮสต์เซลล์ปัจจัยการปรับสถานะของยีนบางอย่าง [2], [3] และ [4] อย่างไรก็ตาม การเปลี่ยนแปลงที่เกี่ยวข้องกับเชื้อเอชไอวีตามพันธุทั้งปรับไม่ดีล้วน รับเฉพาะคู่แฝดไข่ใบในการศึกษานี้ : ฝาแฝดอย่างใดอย่างหนึ่งถูกติดเชื้อ HIV โดยยาต้านเพิ่มเติมในขณะที่อีกคนหนึ่งเพื่อสุขภาพ ซึ่งอาจถือเป็นรูปแบบค่อนข้างเหมาะสำหรับการสร้างโพรไฟล์ที่การเปลี่ยนแปลงของปรับเกี่ยวข้องกับเชื้อเอชไอวีได้ ดังนั้น เราจึงใช้ DNA methylated immunoprecipitation จึง – microarray วิธี (MeDIP – microarray), พบปรับระดับเพิ่มขึ้นของดีเอ็นเอในเซลล์โลหิตโมโนนิวเคลียร์เลือดจากเอชไอวีติดทวิเมื่อเปรียบเทียบกับพี่น้องของเธอปกติ นอกจากนี้ ปรับแตกต่างแตกต่างภูมิภาคต่าง ๆ (DMRs) เอชไอวีติดแฝดน่าศึกษา ข้อมูลดิบได้รับฝากไว้ในชุดข้อมูลของรถโดยสารนิพจน์ยีน (GEO) กับหมายเลขอ้างอิง GSE68028

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บทคัดย่อ
การเปลี่ยนแปลงของดีเอ็นเอ methylation ในเซลล์สัตว์ที่อาจจะเกิดจากหลายปัจจัยรวมถึงการติดเชื้อไวรัส [1] เอชไอวีได้แสดงให้เห็นความสามารถในการโต้ตอบกับปัจจัยมือถือเจ้าภาพในการเปลี่ยนสถานะ methylation ของยีนบาง [2], [3] [4] อย่างไรก็ตามการเปลี่ยนแปลงของดีเอ็นเอ methylation ที่เกี่ยวข้องกับการติดเชื้อเอชไอวีอยู่บนพื้นฐานของทั้งจีโนมยังไม่ได้แสดงให้เห็นเป็นอย่างดี ในการศึกษานี้เป็นคู่ที่ไม่ซ้ำกันของฝาแฝด monozygotic ได้รับคัดเลือก: หนึ่งในฝาแฝดติดเชื้อเอชไอวีได้โดยไม่ต้องต่อการรักษาด้วยยาต้านไวรัสในขณะที่คนอื่น ๆ มีสุขภาพดีซึ่งอาจถือได้ว่าเป็นรูปแบบที่ค่อนข้างเหมาะสำหรับโปรไฟล์การเปลี่ยนแปลงของ methylation ดีเอ็นเอ ที่เกี่ยวข้องกับการติดเชื้อเอชไอวี ดังนั้นการใช้สารดีเอ็นเอวิธี immunoprecipitation-microarray (MeDIP-microarray) เราพบว่าในระดับดีเอ็นเอ methylation เพิ่มขึ้นในเซลล์โลหิตโมโนนิวเคลียร์จากแฝดที่ติดเชื้อเอชไอวีเมื่อเทียบกับพี่น้องปกติของเธอ นอกจากนี้ยังโดดเด่นหลายภูมิภาคค่า methylation (DMRs) ในเอชไอวีที่ติดเชื้อแฝดศึกษาต่อมูลค่า ข้อมูลดิบที่ได้รับเงินในการแสดงออกของยีน Omnibus (GEO) ชุดข้อมูลที่มีจำนวนการอ้างอิง GSE68028