Identification of the amylase enzym

Identification of the amylase enzyme-secreting organism

The isolated strain IND4 with highest activity was identified on the basis of the biochemical properties, the phenotypical characteristics, and the 16S rRNA gene sequencing. The genomic DNA was extracted from the cells of an 18-h cultured IND4 strain by using a QIAGEN DNA purification kit (Germany) according to the manufacturer’s instructions. The 16S rRNA gene of the isolate was amplified by polymerase chain reaction (PCR) using the upstream primer P1: 5′-AGAGTTTGATCMTGGCTAG-3′ and the downstream primer P2: 5′-ACGGGCGG TGTGTRC-3′ (Sigma–Aldrich). Amplification of DNA was carried out using the research gradient Peltier Thermal cycler machine PTC-225 and a DNA polymerase (Sigma) under the following conditions: denaturation at 95 °C for 3 min followed by 30 cycles at 95 °C for 1 min, 55 °C for 30 s, and 72 °C for 1 min and 50 s. The amplified product was sequenced at Scigenome Laboratories, India. Sequence comparison with databases was performed using BLAST through the NCBI server. The isolate IND4 was identified as B. cereus IND4. The sequence was submitted to the GenBank database, and an accession number was assigned. The GenBank accession number of the sequence reported in this article is KF250420.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ระบุมีชีวิต secreting เอนไซม์ amylaseแยกพันธุ์ IND4 มีกิจกรรมสูงสุดที่ระบุ โดยคุณสมบัติทางชีวเคมี ลักษณะ phenotypical และ 16S rRNA ยีนลำดับ ดีเอ็นเอ genomic ถูกสกัดจากเซลล์ของตัว 18 h อ่าง IND4 ต้องใช้ โดยใช้ชุดฟอก QIAGEN DNA (เยอรมนี) ตามคำแนะนำของผู้ผลิต มีขยายยีน rRNA 16S ของการแยก โดยพอลิเมอเรสปฏิกิริยาลูกโซ่ (PCR) ใช้รองพื้นขั้นต้นน้ำ P1: 5′-AGAGTTTGATCMTGGCTAG-3′ และรองพื้นปลายน้ำ p 2: 5′ ACGGGCGG TGTGTRC-3′ (ซิก-Aldrich) ขยายของดีเอ็นเอได้รับการดำเนินการใช้วิจัยไล่โทนสีร้อน Peltier cycler เครื่อง PTC 225 และมีดีเอ็นเอพอลิเมอเรส (ซิกมา) ภายใต้เงื่อนไขต่อไปนี้: denaturation ที่ 95 ° C สำหรับ 3 นาทีตาม ด้วยรอบ 30 ที่ 95 องศาเซลเซียสใน 1 นาที 55 ° C สำหรับ 30 s และ 72 องศาเซลเซียสใน 1 นาที และ 50 s ผลิตภัณฑ์เอาต์ถูกเรียงลำดับในห้องปฏิบัติการ Scigenome อินเดีย ลำดับการเปรียบเทียบกับฐานข้อมูลที่ดำเนินการโดยใช้ระเบิดผ่านเซิร์ฟเวอร์ NCBI มีระบุ IND4 แยกเป็น cereus เกิด IND4 ลำดับที่ส่งไปยังฐานข้อมูลของ GenBank และกำหนดหมายเลขทะเบียน หมายเลขทะเบียน GenBank ลำดับที่รายงานในบทความนี้คือ KF250420

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บัตรประจำตัวของสิ่งมีชีวิตเอนไซม์อะไมเลสหลั่งIND4 สายพันธุ์ที่แยกกับกิจกรรมสูงสุดที่ถูกระบุบนพื้นฐานของคุณสมบัติทางชีวเคมีลักษณะ phenotypical และ 16S rRNA ลำดับยีน ดีเอ็นเอจีโนมถูกสกัดจากเซลล์ของสายพันธุ์ที่เพาะเลี้ยง IND4 18 ชั่วโมงโดยใช้ชุดฟอกดีเอ็นเอ QIAGEN (เยอรมนี) ตามคำแนะนำของผู้ผลิต 16S rRNA ยีนของเชื้อที่ถูกขยายโดยวิธี Polymerase chain reaction (PCR) โดยใช้ไพรเมอร์ต้นน้ำ P1: 5'-AGAGTTTGATCMTGGCTAG-3 และไพรเมอร์ปลายน้ำ P2: 5'-ACGGGCGG TGTGTRC-3 (Sigma-Aldrich) การขยายของดีเอ็นเอได้ดำเนินการโดยใช้การไล่ระดับสีวิจัยเครื่อง Cycler Peltier ร้อน PTC-225 และดีเอ็นเอโพลิเมอร์ (ซิกม่า) ภายใต้เงื่อนไขดังต่อไปนี้: denaturation ที่ 95 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 3 นาทีตามด้วย 30 รอบที่ 95 ° C เป็นเวลา 1 นาที 55 ° C เป็นเวลา 30 วินาทีและ 72 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 1 นาทีและ 50 วินาที ผลิตภัณฑ์ที่ได้รับการขยายลำดับที่ Scigenome ห้องปฏิบัติการอินเดีย ลำดับเปรียบเทียบกับฐานข้อมูลที่ได้รับการดำเนินการโดยใช้ระเบิดผ่านเซิร์ฟเวอร์ NCBI แยก IND4 ถูกระบุว่าเป็น B. cereus IND4 ลำดับที่ถูกส่งไปยังฐานข้อมูลของ GenBank และจำนวนการเข้าถูกที่ได้รับมอบหมาย จำนวนภาคยานุวัติ GenBank ของลำดับที่มีการรายงานในบทความนี้คือ KF250420

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

รหัสของเอนไซม์อะไมเลส ปล่อยชีวิต

แยกสายพันธุ์ ind4 กับกิจกรรมสูงสุดถูกระบุบนพื้นฐานของคุณสมบัติทางชีวเคมี , ลักษณะ phenotypical และเบส 16S rRNA ยีนของดีเอ็นเอจีโนมถูกสกัดจากเซลล์เพาะเลี้ยงของ 18-h ind4 สายพันธุ์โดยใช้เพิ่มดีเอ็นเอบริสุทธิ์ Kit ( เยอรมนี ) ตามคำแนะนำของผู้ผลิต ส่วนเบส 16S rRNA ยีนของเชื้อกำลังขยายโดยวิธีพีซีอาร์ ( PCR ) โดยใช้ไพรเมอร์ upstream 5 P1 และ P2 ’ - ’ agagtttgatcmtggctag-3 รองพื้นต่อเนื่อง : 5 ’ - ’ ( Sigma ) acgggcgg tgtgtrc-3 ดิช )การเพิ่มปริมาณของดีเอ็นเอ โดยใช้การไล่ระดับสีและวงจรความร้อน Peltier เครื่อง ptc-225 และ DNA polymerase ( Sigma ) ภายใต้เงื่อนไขดังต่อไปนี้ : ( 95 องศา C เป็นเวลา 3 นาที ตามด้วย 30 รอบ 95 องศา C เป็นเวลา 1 นาที 55 ° C เป็นเวลา 30 วินาที กับ 72 ° C เป็นเวลา 1 นาทีและ 50 วินาที การขยายผลิตภัณฑ์นี้ที่ห้องปฏิบัติการ , scigenome อินเดียลำดับการเปรียบเทียบกับฐานข้อมูลการใช้ระเบิดผ่าน ncbi เซิร์ฟเวอร์ แยก ind4 ถูกระบุว่าเป็น ind4 B . cereus . ลําดับที่ถูกส่งไปยังฐานข้อมูลของขนาดและภาคยานุวัติจำนวนที่ได้รับมอบหมาย ขนาดตัวเลขของลำดับการรายงานในบทความนี้ kf250420 .