Rumen microbiome represents rich so

Rumen microbiome represents rich source of enzymes degrading complex plant polysaccharides.

We describe here analysis of Carbohydrate Active Enzymes (CAZymes) from 3.5 gigabase sequences of metagenomic data from rumen samples of Mehsani buffaloes fed on different proportions of green or dry roughages to concentrate ration.

A total of 2597 contigs encoding putative CAZymes were identified by CAZyme Analysis Toolkit (CAT).

the phylogenetic analysis of these contigs by MG-RAST revealed predominance of Bacteroidetes, followed by Firmicutes, Proteobacteria, and Actinobacteria phyla.

a higher abundance of oligosaccharide degrading and debranching enzymes in buffalo rumen metagenome and that of cellulases and hemicellulases in termite hindgut was observed when we compared glycoside hydrolase (GH) profile of buffalo rumen metagenome with cow rumen, termite hindgut and chicken caecum metagenome

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ต่อ microbiome แสดงถึงแหล่งอุดมไปด้วยเอนไซม์ที่ลด polysaccharides พืชที่ซับซ้อนเราถึงวิเคราะห์คาร์โบไฮเดรตใช้เอนไซม์ (CAZymes) จากลำดับ gigabase 3.5 metagenomic ข้อมูลจากตัวอย่างควาย Mehsani เลี้ยงในสัดส่วนที่แตกต่างกันของเขียว หรือแห้ง roughages สมาธิอาหารต่อจำนวน 2597 contigs รหัส putative CAZymes ถูกกำหนดโดยชุดเครื่องมือการวิเคราะห์ CAZyme (แมว)วิเคราะห์ phylogenetic contigs เหล่านี้โดย MG RAST เปิดเผยเด่นของ Bacteroidetes ตาม phyla Firmicutes, Proteobacteria และ Actinobacteriaความสูงของ oligosaccharide ลด และ debranching เอนไซม์ในบัฟฟาโลต่อ metagenome และที่ cellulases และ hemicellulases ในปลวก hindgut ถูกสังเกตเมื่อเราเปรียบเทียบ glycoside hydrolase (GH) โปรไฟล์ของ metagenome ต่อควายกับวัวต่อ ปลวก hindgut และไก่ metagenome caecum

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Rumen microbiome แสดงถึงแหล่งอุดมไปด้วยเอนไซม์ย่อยสลาย polysaccharides พืชที่ซับซ้อน. เราอธิบายที่นี่การวิเคราะห์ของเอนไซม์ที่ใช้งานคาร์โบไฮเดรต (CAZymes) จาก 3.5 ลำดับ gigabase ข้อมูล Metagenomic จากตัวอย่างกระเพาะของกระบือ Mehsani กินสัดส่วนที่แตกต่างกันของอาหารหยาบสีเขียวหรือแห้งจะมีสมาธิปันส่วน. รวมของ 2597 contigs เข้ารหัส CAZymes สมมุติถูกระบุ CAZyme วิเคราะห์ Toolkit (กสท.). การวิเคราะห์สายวิวัฒนาการของ contigs เหล่านี้โดย MG-RAST เปิดเผยเด่นของ Bacteroidetes ตาม Firmicutes, Proteobacteria และ actinobacteria phyla. ความอุดมสมบูรณ์สูงขึ้นของการย่อยสลาย oligosaccharide และ debranching เอนไซม์ในกระเพาะรูเมนกระบือ metagenome และของเซลลูและเฮมิใน hindgut ปลวกพบว่าเมื่อเราเทียบ glycoside hydrolase (GH) รายละเอียดของ metagenome กระเพาะควายกับกระเพาะวัว hindgut ปลวกและไก่ caecum metagenome

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

กระบวนการไมโครไบโ หมายถึง แหล่งที่อุดมไปด้วยเอนไซม์ย่อยสลายพืช complex polysaccharides

เราอธิบายที่นี่การวิเคราะห์คาร์โบไฮเดรตเอนไซม์ที่มีฤทธิ์ ( cazymes ) จาก 3.5 gigabase ลําดับของข้อมูลเมตาจีโนมิคจากกระเพาะรูเมนของกระบือที่เลี้ยง mehsani ตัวอย่างในสัดส่วนที่แตกต่างกันของสีเขียวหรือบริการอาหารหยาบจดจ่อ

ปันส่วนรวม 2597 สูงซึ่งมีการเข้ารหัส cazymes ระบุเครื่องมือการวิเคราะห์ cazyme ( แมว )

การวิเคราะห์วิวัฒนาการของสูงเหล่านี้ โดย mg-rast เปิดเผยความเด่นของ bacteroidetes ตาม Firmicutes โพรทีโอแบคทีเรีย , และแอคติโนมัยสีททั้งหมด

ความอุดมสมบูรณ์ของโอลิโกแซคคาไรด์สูงขึ้นทำให้เอนไซม์ในกระเพาะรูเมน และ debranching ควาย metagenome ที่ได้ hemicellulases ใน hindgut ปลวกและพบว่าเมื่อเราเทียบไกลโคไซด์ไฮโดรเลส ( GH ) โปรไฟล์ของกระเพาะควาย metagenome กับกระเพาะวัว hindgut ปลวกและ metagenome ในไก่