DNA Isolation from Strawberries Dev

DNA Isolation from Strawberries Developed by Diane Sweeney http://www.caseciw.org/first_light_case/horn/strawberries/strawbdnaproc.html
Teacher Background This is a simple, effective protocol for spooling DNA. Ripe strawberries are an excellent source for extracting DNA because they are easy to pulverize and contain enzymes called pectinases and cellulases that help to break down cell walls. And most important, strawberries have eight copies of each chromosome (they are octoploid), so there is a lot of DNA to isolate.
The purpose of each ingredient in the procedure is as follows:
Shampoo or dishwasher soap helps to dissolve the cell membrane, which is a lipid bilayer. Sodium chloride helps to remove proteins that are bound to the DNA. It also helps to keep the proteins dissolved in the aqueous layer so they don’t precipitate in the alcohol along with the DNA. Ethanol or isopropyl alcohol causes the DNA to precipitate. When DNA comes out of solution it tends to clump together, which makes it visible. The long strands of DNA will wrap around the stirrer or transfer pipet when it is swirled at the interface between the two layers.
Notes on Materials and Recipes • Use Ziploc TM freezer bags rather than sandwich bags, as they are thicker. • Fresh or frozen strawberries can be used. Be sure to thaw the frozen berries at room temperature. Bananas or kiwi fruit can also be used but yield less DNA. • Use non-iodized table salt or laboratory-grade sodium chloride. • 95% ethanol or 91 or 100% isopropyl alcohol can be used to precipitate the DNA. Isopropyl alcohol can be purchased from a pharmacy. Whichever you use, make sure it is ice cold by placing in an ice-water bath or in the freezer.
DNA Extraction Buffer • 100 ml (3/8 cup) shampoo (without conditioner) or 50 ml dishwasher detergent • 15 grams sodium chloride (2 teaspoons) • water to 1 liter
The GENETICS Project Department of Genome Sciences University of Washington http://chroma.mbt.washington.edu/outreach/genetics 2
DNA Isolation from Strawberries Student Directions
Materials per student group • 1-3 strawberries (about the volume of a golf ball). Frozen strawberries should be thawed at room temperature. • 10 ml DNA Extraction Buffer (soapy salty water) • about 20 ml ice cold 91% or 100% isopropyl alcohol • 1 Ziploc TM bag • 1 clear test tube • 1 funnel lined with a moistened paper towel • 1 coffee stirrer or transfer pipet
Directions 1. Remove the green sepals from the strawberries. 2. Place strawberries into a Ziploc TM bag and seal shut. 3. Squish for a few minutes to completely squash the fruit. 4. Add 10 ml DNA Extraction Buffer (soapy salty water) and squish for a few more minutes. Try not to make a lot of soap bubbles. 5. Filter through a moistened paper towel set in a funnel, and collect the liquid in a clear tube. Do not squeeze the paper towel. Collect about 3 ml liquid. 6. Add 2 volumes ice cold isopropyl alcohol to the strawberry liquid in the tube. Pour the isopropyl alcohol carefully down the side of the tube so that it forms a separate layer on top of the strawberry liquid. 7. Watch for about a minute. What do you see? You should see a white fluffy cloud at the interface between the two liquids. That’s DNA! 8. Spin and stir the coffee stirrer or transfer pipet in the tangle of DNA, wrapping the DNA around the stirrer. 9. Pull out the stirrer and transfer the DNA to a piece of saran wrap or clean tube. The fibers are thousands and millions of DNA strands. 10. To view in a microscope, put the glob on a clean slide and gently tease/stretch apart using 2 toothpicks or dissecting pins. The fibers will be easier to see in the teased-apart area. 11. Rinse your funnel. Put the Ziploc TM bag and paper towel in the garbage. ง

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แยกดีเอ็นเอจากสตรอเบอร์รี่พัฒนาโดยไดแอนนีย์ http://www.caseciw.org/first_light_case/horn/strawberries/strawbdnaproc.html พื้นหลังครูนี้เป็นโพรโทคอง่าย มีประสิทธิภาพสำหรับการจัดคิวดีเอ็นเอ ชิมสตรอเบอร์รี่เป็นแหล่งดีสำหรับการแยกดีเอ็นเอเนื่องจากง่ายต่อการขยี้ และประกอบด้วยเอนไซม์ที่เรียกว่า pectinases และ cellulases ที่ช่วยในการสลายผนังเซลล์ และสำคัญที่สุด สตรอเบอร์รี่มีสำเนาที่แปดของแต่ละโครโมโซม (พวกเขาเป็น octoploid), ให้ดีเอ็นเอจะแยกเป็นจำนวนมาก วัตถุประสงค์ของส่วนผสมแต่ละขั้นตอนมีดังต่อไปนี้: สบู่แชมพูหรือเครื่องล้างจานช่วยในการละลายเซลล์เมมเบรน ซึ่งเป็น bilayer มีไขมัน โซเดียมคลอไรด์ช่วยขจัดโปรตีนที่ถูกผูกไว้กับดีเอ็นเอ นอกจากนี้มันยังช่วยให้โปรตีนที่ละลายในชั้นน้ำดังนั้นพวกเขาไม่ตกตะกอนในแอลกอฮอล์พร้อมกับดีเอ็นเอ เอทานอลหรือแอลกอฮอล์ isopropyl ทำให้ตกตะกอนดีเอ็นเอ เมื่อดีเอ็นเอมาจากโซลูชันจะก้อน ๆ ซึ่งทำให้มองเห็น เส้นยาวของดีเอ็นเอจะพันรอบช้อนคนหรือโอนปิเมื่อมันเป็นตแม่ที่รอยต่อระหว่างสองชั้น หมายเหตุบนวัสดุและสูตรถุงแช่แข็ง• TM Ziploc ใช้แทนถุงแซนด์วิช พวกเขาจะหนา •สตรอเบอร์รี่สด หรือแช่แข็งใช้ ตรวจสอบให้แน่ใจว่าละลายผลเบอร์รี่แช่แข็งที่อุณหภูมิห้อง กล้วยหรือผลไม้กีวียังสามารถใช้ แต่ผลผลิตดีเอ็นเอน้อยกว่า •ใช้ไอโอดีนเกลือหรือโซเดียมคลอไรด์ระดับห้องปฏิบัติการ • 95% เอทานอล หรือ 91 หรือ 100% isopropyl แอลกอฮอล์ใช้ตกตะกอนดีเอ็นเอ เครื่องดื่มแอลกอฮอล์ isopropyl สามารถซื้อได้จากร้านขายยา ตามจำนวนที่คุณใช้ ทำให้แน่ใจว่าน้ำแข็งเย็น โดยวาง ในอ่างน้ำแข็ง หรือแช่เย็น บัฟเฟอร์การสกัดดีเอ็นเอ• 100 มล. (3/8 ถ้วย) แชมพู (ไม่ปรับ) หรือ 50 ml ล้างจานผงซักฟอก• 15 กรัมโซเดียมคลอไรด์ (2 ช้อนชา) •น้ำ 1 ลิตร แผนกโครงการพันธุศาสตร์ของมหาวิทยาลัยวอชิงตันวิทยาศาสตร์จีโนมที่ http://chroma.mbt.washington.edu/outreach/genetics 2 แยกดีเอ็นเอจากสตรอเบอร์รี่ทิศทางนักเรียน กลุ่มวัสดุต่อนักเรียน•สตรอเบอร์รี่ 1-3 (เกี่ยวกับระดับเสียงของลูกกอล์ฟ) ควรจะเตรียมสตรอเบอร์รี่แช่แข็งที่อุณหภูมิห้อง • 10 มล.•บัฟเฟอร์สกัดดีเอ็นเอ (สบู่น้ำเค็ม) ประมาณ 20 มล.น้ำแข็งเย็น 91% หรือ 100% isopropyl แอลกอฮอล์• 1 Ziploc TM ถุง• 1 หลอดทดลองชัดเจน• 1 ช่องทางเรียงรายไป ด้วยเป็นกระดาษชุบผ้า• 1 กาแฟช้อนคนหรือโอนปิ เส้นทางที่ 1 เอากลีบเลี้ยงสีเขียวจากสตรอเบอร์รี่ 2. วางสตรอเบอรี่ลงในถุง Ziploc TM และปิดผนึก 3. squish กี่นาทีในการสมบูรณ์สควอชผลไม้ 4. เพิ่ม 10 มล.บัฟเฟอร์สกัดดีเอ็นเอ (สบู่น้ำเค็ม) และ squish สำหรับกี่นาที พยายามที่ไม่ทำให้ฟองสบู่จำนวนมาก 5. กรองผ่านชุดผ้าขนหนูกระดาษชุบในปล่อง และรวบรวมของเหลวในหลอดใส บีบผ้ากระดาษ รวบรวมประมาณ 3 มล.ของเหลว 6. เพิ่ม 2 ปริมาณน้ำแข็งเย็น isopropyl แอลกอฮอล์เหลวสตรอเบอร์รี่ในหลอด เทแอลกอฮอล์ isopropyl อย่างระมัดระวังลงด้านของท่อเพื่อให้รูปแยกชั้นอยู่ด้านบนของเหลวสตรอเบอร์รี่ 7. นาฬิกาสำหรับประมาณหนึ่งนาที คุณเห็นอะไร คุณควรเห็นปุยเมฆขาวที่รอยต่อระหว่างของเหลวสอง นั่นคือดีเอ็นเอ 8. หมุน และกวนกาแฟช้อนคนหรือโอนปิในพันของดีเอ็นเอ การตัดดีเอ็นเอช้อนคนให้ทั่ว 9. ช้อนคนที่ดึง และถ่ายโอนดีเอ็นเอชิ้นของ saran wrap หรือทำความสะอาดหลอด เส้นใยพัน และปอยล้านของดีเอ็นเอ 10. เพื่อดูในกล้องจุลทรรศน์ ใส่ glob การบนภาพนิ่งสะอาด และค่อย ๆ แซว/ยืดออกจากกันโดยใช้ไม้จิ้มฟัน 2 หรือพดี ๆ พิน เส้นใยจะง่ายต่อการดูในพื้นที่กันล้อ 11. ล้างช่องทางของคุณ ใส่ผ้ากระดาษและถุง Ziploc TM ในถังขยะ ง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การแยกดีเอ็นเอจากสตรอเบอร์รี่ที่พัฒนาโดยไดแอนสวีนีย์ http://www.caseciw.org/first_light_case/horn/strawberries/strawbdnaproc.html
ครูพื้นหลังนี้เป็นง่ายโปรโตคอลที่มีประสิทธิภาพสำหรับ spooling ดีเอ็นเอ สตรอเบอร์รี่สุกเป็นแหล่งที่ดีสำหรับการสกัดดีเอ็นเอเพราะพวกเขาเป็นเรื่องง่ายที่จะกลายเป็นผงและมีเอนไซม์ที่เรียกว่าเพคติเนสและเซลลูที่ช่วยในการทำลายลงผนังเซลล์ และที่สำคัญที่สุด, สตรอเบอร์รี่มีแปดสำเนาของแต่ละโครโมโซม (พวกเขาจะ octoploid) ดังนั้นมีเป็นจำนวนมากของดีเอ็นเอที่จะแยก.
วัตถุประสงค์ของส่วนผสมในแต่ละขั้นตอนมีดังนี้:
แชมพูหรือสบู่ล้างจานช่วยในการละลายเยื่อหุ้มเซลล์ ซึ่งเป็นไขมัน bilayer โซเดียมคลอไรด์ช่วยขจัดโปรตีนที่ถูกผูกไว้กับดีเอ็นเอ นอกจากนี้ยังจะช่วยให้โปรตีนที่ละลายในชั้นน้ำเพื่อไม่ให้เกิดการตกตะกอนในเครื่องดื่มแอลกอฮอล์พร้อมกับดีเอ็นเอ เอทานอลหรือแอลกอฮอล์ isopropyl เป็นสาเหตุของดีเอ็นเอที่จะเกิดการตกตะกอน เมื่อดีเอ็นเอออกมาของการแก้ปัญหามีแนวโน้มที่จะรวมกันเป็นกอซึ่งทำให้มันสามารถมองเห็นได้ เส้นยาวของดีเอ็นเอจะตัดรอบกวนหรือโอนปิเปตเมื่อมีการหมุนวนที่เชื่อมต่อระหว่างสองชั้น.
หมายเหตุเกี่ยวกับวัสดุและสูตร•ใช้ Ziploc TM ถุงแช่แข็งมากกว่าถุงแซนวิชขณะที่พวกเขาจะหนา •สตรอเบอร์รี่สดหรือแช่แข็งสามารถนำมาใช้ ให้แน่ใจว่าจะละลายเบอร์รี่แช่แข็งที่อุณหภูมิห้อง กล้วยหรือผลไม้กีวียังสามารถนำมาใช้ แต่ผลผลิตดีเอ็นเอน้อย •การใช้ที่ไม่ใช่เกลือเสริมไอโอดีนตารางหรือห้องปฏิบัติการระดับโซเดียมคลอไรด์ •เอทานอล 95% หรือ 91 หรือ 100% เครื่องดื่มแอลกอฮอล์ isopropyl สามารถใช้ในการตกตะกอนดีเอ็นเอ เครื่องดื่มแอลกอฮอล์ Isopropyl สามารถซื้อได้จากร้านขายยา ไม่ว่าคุณจะใช้ให้แน่ใจว่ามันจะหนาวเย็นน้ำแข็งโดยการวางในห้องอาบน้ำน้ำแข็งน้ำหรือในช่องแช่แข็ง.
สกัดดีเอ็นเอบัฟเฟอร์• 100 มล. (3/8 ถ้วย) แชมพู (ไม่ปรับอากาศ) หรือ 50 มล. เครื่องล้างจานผงซักฟอก• 15 กรัมโซเดียมคลอไรด์ (2 ช้อนชา) •น้ำ 1 ลิตร
พันธุศาสตร์ฝ่ายโครงการจีโนมของวิทยาศาสตร์มหาวิทยาลัยวอชิงตัน http://chroma.mbt.washington.edu/outreach/genetics 2
ดีเอ็นเอแยกจากสตรอเบอร์รี่นักศึกษาทิศทาง
วัสดุต่อกลุ่มนักเรียน• 1-3 สตรอเบอร์รี่ (เกี่ยวกับปริมาณของลูกกอล์ฟ) สตรอเบอร์รี่แช่แข็งควรจะละลายที่อุณหภูมิห้อง • 10 มล. สกัดดีเอ็นเอบัฟเฟอร์ (สบู่น้ำเค็ม) •ประมาณ 20 มล. เย็น 91% หรือ 100% isopropyl แอลกอฮอล์• 1 Ziploc TM ถุง• 1 ที่ชัดเจนหลอดทดลอง• 1 ช่องทางเรียงรายไปด้วยกระดาษชุบผ้าขนหนู•กวน 1 กาแฟหรือโอนปิเปต
เส้นทาง 1. ถอดกลีบเลี้ยงสีเขียวจากสตรอเบอร์รี่ 2. สตรอเบอร์รี่เพลสลงในถุง Ziploc และประทับตรา TM ปิด 3. Squish ไม่กี่นาทีที่จะสมบูรณ์ผลไม้สควอช 4. เพิ่ม 10 มล. สกัดดีเอ็นเอบัฟเฟอร์ (สบู่น้ำเค็ม) และ squish นาทีมากขึ้นไม่กี่ พยายามที่จะไม่ทำให้จำนวนมากของฟองสบู่ 5. กรองผ่านผ้ากระดาษชุบตั้งอยู่ในช่องทางและเก็บของเหลวในหลอดที่ชัดเจน อย่าบีบกระดาษเช็ด เก็บประมาณ 3 มล. ของเหลว 6. เพิ่ม 2 ปริมาณน้ำแข็งเครื่องดื่มแอลกอฮอล์ isopropyl เย็นกับของเหลวสตรอเบอร์รี่ในหลอด เท isopropyl แอลกอฮอล์อย่างระมัดระวังลงด้านข้างของท่อเพื่อให้มันเป็นชั้นแยกต่างหากที่ด้านบนของของเหลวสตรอเบอร์รี่ 7. นาฬิกาประมาณนาที คุณเห็นอะไร? คุณจะเห็นปุยเมฆสีขาวที่เชื่อมต่อระหว่างสองของเหลว นั่นคือดีเอ็นเอ! 8. สปินและกวนกวนกาแฟหรือโอนปิเปตในยุ่งเหยิงของดีเอ็นเอดีเอ็นเอห่อรอบตัวกวน 9. ดึงกวนและโอนดีเอ็นเอชิ้นส่วนของสราญห่อหรือหลอดสะอาด เส้นใยหลายพันล้านของดีเอ็นเอ 10. หากต้องการดูในกล้องจุลทรรศน์ใส่ glob บนสไลด์ที่สะอาดและเบา ๆ หยอกล้อ / ยืดออกจากกันโดยใช้ไม้จิ้มฟัน 2 หรือตัดขา เส้นใยจะง่ายต่อการดูในพื้นที่แกล้ง-ออกจากกัน 11. ล้างช่องทางของคุณ ใส่ถุงกระดาษและผ้าขนหนู Ziploc TM ในถังขยะ ง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การสกัดดีเอ็นเอจากสตรอเบอร์รี่ที่พัฒนาโดยไดแอน http://www.caseciw.org/first_light_case/horn/strawberries/strawbdnaproc.html สวีนีย์ครูหลังนี้เป็นง่ายโปรโตคอลที่มีประสิทธิภาพ , ดีเอ็นเอ สตรอเบอร์รี่สุกเป็นแหล่งที่ดีสำหรับการแยกดีเอ็นเอ เพราะพวกเขาจะง่ายต่อการยิงและมีเอนไซม์เพคติเนส และเรียกได้ว่าช่วยทำลายลงผนังเซลล์ และที่สำคัญที่สุด , สตรอเบอร์รี่ , สำเนาของแต่ละโครโมโซม ( พวกเขาจะ octoploid ) ดังนั้นมีจำนวนมากของดีเอ็นเอที่แยก .วัตถุประสงค์ของแต่ละส่วนผสมในขั้นตอน ดังนี้แชมพูหรือสบู่เครื่องล้างจานจะช่วยละลายเซลล์เมมเบรน ซึ่งเป็นไขมัน bilayer . โซเดียม คลอไรด์ ช่วยกำจัดโปรตีนที่ถูกผูกไว้กับ DNA มันยังช่วยให้โปรตีนที่ละลายในชั้นน้ำ ดังนั้นพวกเขาไม่ตกตะกอนในแอลกอฮอล์พร้อมกับดีเอ็นเอ เอทานอลหรือ isopropyl แอลกอฮอล์เป็นสาเหตุทำให้ดีเอ็นเอในตะกอน เมื่อ DNA ออกมาจากโซลูชั่นมันมีแนวโน้มที่จะรวมตัวกัน ซึ่งทำให้มันสามารถมองเห็นได้ ถักยาวของดีเอ็นเอจะห่อรอบหมุน หรือ ปิเปตโอนเมื่อมัน swirled ที่รอยต่อระหว่างสองชั้นบันทึกในวัสดุและเค้ก - ตู้แช่ Ziploc TM ใช้ถุงมากกว่าถุงแซนวิช ตามที่พวกเขาจะหนาขึ้น - สดหรือแช่แข็งสตรอเบอร์รี่สามารถใช้ ให้แน่ใจว่าผลเบอร์รี่แช่แข็งละลายที่อุณหภูมิห้อง กล้วยหรือผลไม้กีวียังสามารถใช้แต่ผลผลิตดีเอ็นเอน้อยกว่า - ไม่ใช้เกลือป่นหรือโซเดียมคลอไรด์เกรดห้องปฏิบัติการ - 95 หรือ 91 เอทานอล 100% หรือ isopropyl แอลกอฮอล์สามารถใช้ตกตะกอน DNA ไอโซโพรพิลแอลกอฮอล์สามารถซื้อได้จากร้านขายยา ใดที่คุณใช้ ให้แน่ใจว่ามันเย็น โดยวางในน้ำแข็ง น้ำอาบ หรือในช่องแช่แข็งการสกัดดีเอ็นเอบัฟเฟอร์ - 100 มิลลิลิตร ( 1 / 8 ถ้วย ) แชมพู ( ไม่มีแอร์ ) หรือ 50 ml เครื่องล้างจานผงซักฟอก - 15 กรัม โซเดียม คลอไรด์ ( 2 ช้อนชา ) - น้ำ 1 ลิตรโครงการจีโนมมนุษย์พันธุศาสตร์ภาควิชาวิทยาศาสตร์มหาวิทยาลัยวอชิงตัน http://chroma.mbt.washington.edu/outreach/genetics 2การสกัดดีเอ็นเอจากสตรอเบอร์รี่เส้นทางนักเรียนวัสดุ / กลุ่มนักศึกษา - 1-3 สตรอเบอร์รี่ ( เกี่ยวกับปริมาณของลูกกอล์ฟ ) สตรอเบอรี่แช่แข็ง ควรละลายในอุณหภูมิห้อง - 10 มิลลิลิตรการสกัดดีเอ็นเอบัฟเฟอร์ ( โซปเค็มน้ำ ) - 20 ml เย็น 91 % หรือ 100 % แอลกอฮอล์ isopropyl - 1 ถุง Ziploc TM - 1 หลอดทดสอบที่ชัดเจน - 1 ช่องทางเรียงรายไปด้วยผ้าขนหนูกระดาษชุบ - 1 กาแฟหมุนหรือโอนไปเปตเส้นทางที่ 1 เอากลีบเลี้ยงสีเขียวจากสตรอเบอร์รี่ 2 . วางสตรอเบอรี่ลงในถุง Ziploc TM และ ซีลปิด 3 . คนไม่กี่นาทีที่จะสมบูรณ์สควอชผลไม้ 4 . เพิ่ม 10 มิลลิลิตรการสกัดดีเอ็นเอบัฟเฟอร์ ( โซป เค็ม น้ำ ) และ squish สำหรับไม่กี่นาที พยายามที่จะไม่ทำสบู่ฟอง 5 . กรองผ่านชุบผ้าขนหนูกระดาษ ตั้งกรวย และเก็บรวบรวมของเหลวในหลอดใส ไม่บีบผ้าขนหนูกระดาษ เก็บประมาณ 3 มล. ของของเหลว 6 . เพิ่ม 2 ปริมาณน้ำแข็งเย็น isopropyl แอลกอฮอล์กับสตรอเบอรี่ ของเหลวในท่อ เท isopropyl แอลกอฮอล์อย่างระมัดระวังลงด้านข้างของท่อเพื่อให้รูปแบบการแยกชั้นด้านบนของสตรอเบอรี่ ของเหลว 7 . ดูประมาณ 1 นาที คุณเห็นอะไรบ้าง ? คุณควรจะเห็นสีขาวปุยเมฆที่รอยต่อระหว่างสองทัพ ที่ DNA ! 8 . ปั่นและปั่นกาแฟหมุนหรือปิเปตโอนในการพันกันของดีเอ็นเอ การตัดดีเอ็นเอรอบหมุน . 9 . ดึงหมุนออกและถ่ายโอนดีเอ็นเอชิ้นห่อ saran หรือท่อทำความสะอาด เส้นใยเป็นหลักพันและหลักล้านของเส้นดีเอ็นเอ 10 . ดูในกล้องจุลทรรศน์ ใส่ Glob ในสะอาด สไลด์ และค่อย ๆแหย่ / ยืด นอกจากการใช้ 2 ชิ้น หรือผ่าขา เส้นใยจะง่ายต่อการดูล้อกันในพื้นที่ 11 . ล้างช่องทางของคุณ ใส่ถุง Ziploc TM และผ้าขนหนูกระดาษในกองขยะ ง