Culture-dependent and culture-indep

Culture-dependent and culture-independent methods were combined for the investigation of acetic acid bacteria
(AAB) populations in traditionally produced vinegars and mother of vinegar samples obtained from apple and
grape. The culture-independent denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) analysis, which targeted the
V7–V8 regions of the 16S rRNA gene, showed that Komagataeibacter hansenii and Komagataeibacter europaeus/
Komagataeibacter xylinus were the most dominant species in almost all of the samples analyzed directly. The
culture-independent GTG 5 -rep PCR fingerprinting was used in the preliminary characterization of AAB isolates
and species-level identification was carried out by sequencing of the 16S rRNA gene, 16S–23S rDNA internally
transcribedto thespacer(ITS)region and tufgene. Acetobacter okinawensis was frequently isolated from samples
obtained from apple while K. europaeus was identified as the dominant species, followed by Acetobacter
indonesiensis in the samples originating from grape. In addition to common molecular techniques, real-time
PCR intercalating dye assays, including DNA melting temperature (Tm) and high resolution melting analysis
(HRM),were applied to acetic acid bacterial isolates for the first time.The target sequence of ITS region generated
species-specific HRM profiles and Tm values allowed discrimination at species level.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วิธีการขึ้นอยู่ กับวัฒนธรรม และวัฒนธรรมอิสระถูกรวมในการตรวจสอบแบคทีเรียกรดน้ำส้มประชากร (aab โดย) ซึ่งผลิต vinegars และแม่ตัวอย่างน้ำส้มสายชูที่ได้จากแอปเปิ้ล และองุ่น วัฒนธรรมอิสระ denaturing เจลไล่ระดับ electrophoresis (DGGE) วิเคราะห์ ซึ่งเป็นเป้าหมายแคว้น 16S rRNA ยีน V7-V8 พบที่ hansenii Komagataeibacter Komagataeibacter europaeus และ /Komagataeibacter xylinus สปีชีส์หลักมากที่สุดในตัวอย่างวิเคราะห์โดยตรงเกือบทั้งหมดได้ ที่วัฒนธรรมอิสระ GTG 5-ตัวแทน PCR ลายพิมพ์ใช้ในคุณสมบัติเบื้องต้นของ aab โดยแยกและพันธุ์ระดับรหัสถูกดำเนินการ โดยลำดับของยีน 16S rRNA, 16S – 23S rDNA ภายในภูมิภาค thespacer (ของ) transcribedto และ tufgene Acetobacter okinawensis มักแยกต่างหากจากตัวอย่างได้รับจากแอปเปิ้ลในขณะที่คุณ europaeus ระบุเป็นสายพันธุ์หลัก ตาม Acetobacterindonesiensis ในตัวอย่างที่มาจากองุ่น นอกจากนี้ทั่วไปถึงระดับโมเลกุลเทคนิค เรียลไทม์Intercalating ย้อม assays รวมละลายอุณหภูมิ (Tm) และความละเอียดสูงละลายวิเคราะห์ DNA PCR(HRM), ถูกกับกรดอะซิติกแบคทีเรียที่แยกได้ในครั้งแรก ลำดับเป้าหมายเป็นภาคที่สร้างขึ้นค่า Tm และโพรไฟล์ HRM species-specific ได้แบ่งแยกระดับพันธุ์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

วิธีการขึ้นอยู่กับวัฒนธรรมและวัฒนธรรมที่เป็นอิสระร่วมกันสำหรับการตรวจสอบของแบคทีเรียกรดอะซิติก
(AAB) ประชากรใน vinegars
ผลิตแบบดั้งเดิมและแม่ของกลุ่มตัวอย่างที่ได้จากน้ำส้มสายชูแอปเปิ้ลและองุ่น denaturing วัฒนธรรมอิสระลาดข่าวคราว (DGGE)
การวิเคราะห์ซึ่งเป้าหมายภูมิภาคV7-V8 ของยีน 16S rRNA แสดงให้เห็นว่า hansenii Komagataeibacter และ Komagataeibacter ยูโร /
Komagataeibacter xylinus ถูกสายพันธุ์ที่โดดเด่นที่สุดในเกือบทุกกลุ่มตัวอย่างวิเคราะห์โดยตรง
GTG วัฒนธรรมอิสระ 5 -rep PCR พิมพ์ลายนิ้วมือถูกใช้ในลักษณะเบื้องต้นของ AAB
แยกและบัตรประจำตัวสายพันธุ์ระดับได้ดำเนินการโดยลำดับของยีน16S rRNA, 16S-23S rDNA ภายใน
transcribedto thespacer (ITS) และภูมิภาค tufgene Acetobacter okinawensis
ที่แยกได้บ่อยจากตัวอย่างที่ได้จากแอปเปิ้ลในขณะที่เคยูโรถูกระบุว่าเป็นสายพันธุ์ที่โดดเด่นตามด้วยAcetobacter
indonesiensis ในกลุ่มตัวอย่างที่มาจากองุ่น นอกจากเทคนิคโมเลกุลทั่วไปแบบ real-time
PCR intercalating ตรวจย้อมรวมทั้งอุณหภูมิหลอมเหลวดีเอ็นเอ (TM) และการวิเคราะห์ละลายความละเอียดสูง
(HRM) ถูกนำไปใช้กับแบคทีเรียกรดอะซิติกที่แยกสำหรับเป้าหมายลำดับแรกของฝ่ายภูมิภาค ITS สร้าง
สายพันธุ์เฉพาะรูปแบบการบริหารทรัพยากรมนุษย์และค่า Tm ได้รับอนุญาตการเลือกปฏิบัติในระดับสปีชีส์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ตัวแปรอิสระ คือ วิธีการวัฒนธรรมและวัฒนธรรมรวม สำหรับการสอบสวนของแบคทีเรียกรดอะซิติก
( AAB ) ประชากรในผ้าที่ผลิตน้ำส้มสายชูและแม่ของตัวอย่างที่ได้จากแอปเปิ้ลและส้ม
องุ่น วัฒนธรรมไที่ลาด gel electrophoresis ( การทดลอง ) วิเคราะห์ ซึ่งเป้าหมาย
v7 V8 และภูมิภาคของเบส 16S rRNA ยีนและพบว่า komagataeibacter hansenii komagataeibacter europaeus /
komagataeibacter xylinus เป็นชนิดเด่นที่สุดในเกือบทั้งหมดของตัวอย่างวิเคราะห์โดยตรง
วัฒนธรรมอิสระ GTG 5 - ตัวแทนตรวจลายนิ้วมือถูกใช้ในลักษณะเบื้องต้นของ AAB ไอโซ
และชนิดระบุระดับกระทำโดยการจัดลำดับของยีน 16S rRNA ,( - 23s rDNA ภายใน
transcribedto thespacer ( ของมัน ) ภูมิภาค และ tufgene . Acetobacter okinawensis มักแยกจากตัวอย่างที่ได้จากแอปเปิ้ลในขณะที่ K .
europaeus ถูกระบุเป็นชนิดเด่น รองลงมาคือ Acetobacter
indonesiensis ในกลุ่มตัวอย่างที่มาจากองุ่น นอกจากเทคนิคโมเลกุลทั่วไป เวลาจริง
intercalating ย้อมตรวจ PCR ,รวมถึงดีเอ็นเออุณหภูมิหลอมเหลว ( TM ) และความละเอียดสูงจุดหลอมเหลวการวิเคราะห์
( HRM ) เพื่อใช้ กรดแบคทีเรียไอโซเลทเป็นครั้งแรก เป้าหมายลำดับของภูมิภาคสร้างโปรไฟล์และ TM .
เผ่าพันธุ์ - เฉพาะค่าอนุญาตในการแบ่งแยกชนิด
)