Bacteriophage λ has long served as

Bacteriophage λ has long served as a model system for studies of regulated site-specific recombination. In conditions favorable for bacterial growth, the phage genome is inserted into the Escherichia coli genome by an ‘integrative’ recombination reaction, which takes place between DNA attachment sites called attP and attB in the phage and bacterial genomes, respectively. As a result, the integrated λ DNA is bounded by hybrid attachment sites, termed attL and attR. In response to the physiological state of the bacterial host or to DNA damage, λ phage DNA excises itself from the host chromosome. This excision reaction recombines attL with attR to precisely restore the attP and attB sites on the circular λ and E. coli DNAs.
The phage-encoded λ integrase protein (Int), a tyrosine recombinase, splices together bacterial and phage attachment sites. Int is required for both integration and excision of the λ prophage.
λ recombination has a strong directional bias in response to environmental conditions. Accessory factors, whose expression levels change in response to host physiology, control the action of Int and determine whether the phage genome will remain integrated or be excised. Int has two DNA-binding domains: a C-terminal domain, consisting of a catalytic domain and a core-binding (CB) domain, that interacts with the core recombining sites and an N-terminal domain (N-domain) that recognizes the regulatory arm DNA sites.
The heterobivalent Int molecules bridge distant core and arm sites with the help of accessory proteins, such as integration host factor (IHF), which bend the DNA at intervening sites, and appose arm and core sequences for interaction with the Int recombinase. Five arm DNA sites in the regions flanking the core of attP are differentially occupied during integration and excision reactions. The integration products attL and attR cannot revert back to attP and attB without assistance from the phage-encoded factor Xis, which bends DNA on its own or in combination with the host-encoded factor Fis [6, 7, 8, 9, 10, 11]. Xis also inhibits integration, and prevents the attP and attB products of excision from reverting to attL and attR [7, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23]. Because the cellular levels of IHF and Fis proteins respond to growth conditions, these host-encoded factors have been proposed as the master signals for integration and excision [9, 11, 22, 23, 24, 25].The phage (attP) and bacterial (attB) att sites are designated POP’ and BOB’, respectively, and the prophage att sites are designated BOP’ (attL) and POB’ (attR).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แบคทีλได้จึงทำหน้าที่เป็นระบบแบบจำลองสำหรับการศึกษาของ recombination ควบคุมเฉพาะ สภาพดีสำหรับการเจริญเติบโตของแบคทีเรีย จีโนม phage จะแทรก Escherichia coli จีโนม โดยปฏิกิริยาการ recombination "แบบบูรณาการ" ซึ่งเกิดขึ้นระหว่างไซต์แนบดีเอ็นเอที่เรียกว่า attP และ attB phage และแบคทีเรีย genomes ตามลำดับ เป็นผล ดีเอ็นเอรวมλจะล้อมรอบ ด้วยไฮบริดแนบไซต์ เรียกว่า attL และ attR ตอบรัฐเจ้าแบคทีเรียสรีรวิทยา หรือความเสียหายของดีเอ็นเอ λ phage DNA excises เองจากโครโมโซมโฮสต์ ปฏิกิริยานี้ตอนการผ่าตัด recombines attL ด้วย attR การคืนค่าไซต์ attP และ attB บนวงกลมλและ E. coli DNAs อย่างแม่นยำ
Phage เข้าλ integrase โปรตีน (Int), recombinase เป็น tyrosine, splices กันแบคทีเรียและ phage ไซต์ที่แนบมา Int จะต้องรวมและตอนการผ่าตัดของλ prophage
λ recombination มีความโน้มเอียงทิศทางแข็งแกร่งตอบสนองต่อสภาพแวดล้อม ปัจจัยเสริม ระดับนิพจน์เปลี่ยนโฮสต์สรีรวิทยา ควบคุมการกระทำของ Int และกำหนดว่า จีโนม phage ยังคงรวม หรือถูก excised Int มีดีเอ็นเอรวมสองโดเมน: โดเมนเทอร์มินอล C ประกอบด้วยโดเมนเป็นตัวเร่งปฏิกิริยา และหลักผูก (CB) โด เมน สถานพยาบาลหลักที่ recombining เว็บไซต์ และโดนัล N (N-โดเมน) ที่รู้จักอเมริกา DNA แขนบังคับ
โมเลกุล Int heterobivalent สะพานไกลหลักและแขนอเมริกาช่วยเสริมโปรตีน เช่นรวมโฮสต์ปัจจัย (IHF), ที่งอดีเอ็นเอที่อยู่ระหว่างกลางอเมริกา และ appose แขนและหลักลำดับการโต้ตอบกับ Int recombinase ไซต์ 5 แขนดีเอ็นเอในภูมิภาคหลักของ attP flanking differentially ครอบครองระหว่างปฏิกิริยารวมและตอนการผ่าตัด รวมผลิตภัณฑ์ attL และ attR ไม่สามารถกลับไปสู่ attP และ attB โดยความช่วยเหลือจาก Xis phage เข้าปัจจัย ฟันดีเอ็นเอในตัวเอง หรือร่วมกับการโฮสต์เข้ารหัสปัจจัย Fis [6, 7, 8, 9, 10, 11] Xis ยังยับยั้งรวม และป้องกันผลิตภัณฑ์ attP และ attB ของตอนการผ่าตัดจากการเปลี่ยนกลับเป็น attL และ attR [7, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23] เนื่องจากในระดับเซลของโปรตีน IHF และ Fis ตอบสนองเงื่อนไขการเจริญเติบโต ปัจจัยเหล่านี้เข้าโฮสต์ได้รับการเสนอชื่อเป็นสัญญาณหลักรวมและตอนการผ่าตัด [9, 11, 22, 23, 24, 25]Phage (attP) และแบคทีเรีย (attB) อเมริกา att กำหนด POP 'และ BOB' ตาม ลำดับ และกำหนดไซต์ att prophage bop ที่มีระดับ ' (attL) และ POB' (attR) .

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

bacteriophage λได้ทำหน้าที่ตราบใดที่ระบบแบบจำลองสำหรับการศึกษาการควบคุมการรวมตัวเว็บไซต์เฉพาะ ในเงื่อนไขที่ดีสำหรับการเจริญเติบโตของแบคทีเรียจีโนมฟาจจะถูกแทรกเข้าไปในจีโนม coli Escherichia โดย 'บูรณาปฏิกิริยารวมตัวกันอีกซึ่งจะมีขึ้นระหว่างเว็บไซต์สิ่งที่แนบมาที่เรียกว่าดีเอ็นเอ attP และ attB ในทำลายจุลินทรีย์และแบคทีเรียจีโนมตามลำดับ เป็นผลให้ดีเอ็นเอλแบบบูรณาการมีขอบเขตโดยเว็บไซต์ที่แนบมาไฮบริดที่เรียกว่า attL และ attr ในการตอบสนองต่อสภาพทางสรีรวิทยาของโฮสต์แบคทีเรียหรือความเสียหายดีเอ็นเอλ excises ดีเอ็นเอทำลายจุลินทรีย์ตัวเองจากโครโมโซมเจ้าภาพ ปฏิกิริยาตัดตอนนี้ recombines attL กับ attr ได้อย่างแม่นยำเรียกคืน attP และ attB เว็บไซต์บนวงกลมλและ E. coli DNAs
ทำลายจุลินทรีย์เข้ารหัสλ integrase โปรตีน (Int) recombinase ซายน์, splices ร่วมกันแบคทีเรียและทำลายจุลินทรีย์เว็บไซต์สิ่งที่แนบมา int เป็นสิ่งจำเป็นสำหรับทั้งการรวมและการตัดออกจากλ prophage
รวมตัวกันอีกλมีอคติทิศทางที่แข็งแกร่งในการตอบสนองต่อสภาพแวดล้อม ปัจจัยเสริมที่มีระดับการแสดงออกในการตอบสนองการเปลี่ยนแปลงในการเป็นเจ้าภาพสรีรวิทยาการควบคุมการกระทำของ Int และตรวจสอบว่าจีโนมฟาจจะยังคงแบบบูรณาการหรือไม่ก็ถูกตัดทิ้ง int มีสองดีเอ็นเอผูกพันโดเมน: โดเมน C-ขั้วประกอบด้วยโดเมนและการเร่งปฏิกิริยา (CB) โดเมนหลักที่มีผลผูกพันที่มีการโต้ตอบกับเว็บไซต์ recombining หลักและ N-terminal domain (N-โดเมน) ที่ตระหนักถึง เว็บไซต์การกำกับดูแลดีเอ็นเอแขน
heterobivalent Int โมเลกุลสะพานหลักและแขนเว็บไซต์ที่ห่างไกลด้วยความช่วยเหลือของโปรตีนเสริมเช่นปัจจัยเป็นเจ้าภาพบูรณาการ (IHF) ซึ่งโค้งดีเอ็นเอที่แทรกแซงเว็บไซต์และ appose แขนและแกนลำดับสำหรับการมีปฏิสัมพันธ์กับ Int recombinase ห้าเว็บไซต์ดีเอ็นเอแขนในภูมิภาคที่ขนาบหลักของ attP มีการครอบครองที่แตกต่างกันในระหว่างการรวมและการตัดออกอาการ attL ผลิตภัณฑ์รวมและ attr ไม่สามารถเปลี่ยนกลับไปใช้ attP และ attB โดยไม่มีความช่วยเหลือจากปัจจัยที่ทำลายจุลินทรีย์เข้ารหัส Xis ซึ่งโค้งดีเอ็นเอของตัวเองหรือใช้ร่วมกับปัจจัยที่เป็นเจ้าภาพการเข้ารหัส Fis [6, 7, 8, 9, 10, 11] xis ยังยับยั้งบูรณาการและป้องกันไม่ให้ attP และ attB ผลิตภัณฑ์ของการตัดออกจากการกลับไป attL และ attr [7, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, ​​19, 20, 21, 22, 23] เพราะในระดับเซลล์ของ IHF และ Fis โปรตีนตอบสนองต่อสภาวะการเจริญเติบโตปัจจัยเป็นเจ้าภาพการเข้ารหัสเหล่านี้ได้รับการเสนอให้เป็นสัญญาณหลักสำหรับการรวมและการตัดออก [9, 11, 22, 23, 24, 25] ทำลายจุลินทรีย์ได้โดยง่าย (attP) และ แบคทีเรีย (attB) เว็บไซต์อัฐกำหนด POP และบ๊อบ 'ตามลำดับและ prophage เว็บไซต์อัฐกำหนด BOP (attL) และ POB (attr)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ถึงอย่างไรก็ตามλได้ทำหน้าที่เป็นรูปแบบเฉพาะของระบบการศึกษาที่มีการ . ในเงื่อนไขที่ดีสำหรับการเจริญเติบโตของแบคทีเรียว่าพันธุกรรมจะถูกแทรกลงใน Escherichia coli ) โดยปฏิกิริยาของการบูรณาการ ซึ่งเกิดขึ้นระหว่างดีเอ็นเอแนบเว็บไซต์และเรียก attp attb ในเฟจแบคทีเรีย จีโนม ตามลำดับ ผลรวมλดีเอ็นเอถูกล้อมรอบ โดยเว็บไซต์ที่แนบมาผสม เรียกว่า attl และ attr . ในการตอบสนองต่อสภาพทางสรีรวิทยาของเจ้าบ้านแบคทีเรียหรือความเสียหายดีเอ็นเอ ดีเอ็นเอλฟา excises ตัวเองจากโฮสต์โครโมโซม นี้ที่ recombines attl ปฏิกิริยากับ attr แม่นยำและเรียกคืน attp attb เว็บไซต์ในλวงกลมและ E . coli จำเพาะ .
λอินทีเกรสฟาเข้ารหัสโปรตีน ( int )เป็นซีน recombinase ดามกันแบคทีเรีย , ว่าเว็บไซต์ที่แนบมา 1 ต้องมีทั้งการตัดของλ prophage .
λ recombination มีอคติทิศทางที่แข็งแกร่งในการตอบสนองต่อสภาพแวดล้อม ปัจจัยเสริมที่มีระดับการแสดงออกเปลี่ยนแปลงในการตอบสนองไปยังโฮสต์สรีรวิทยาควบคุมการกระทำของ INT และตรวจสอบว่าว่าจีโนมจะยังคงรวม หรือจะเอาออก int ได้สองดีเอ็นเอมัดโดเมน : โดเมนซึ่งประกอบด้วยโดเมนเร่งปฏิกิริยาและหลักมัด ( CB ) โดเมน ที่โต้ตอบกับเว็บไซต์และโดเมนหลัก recombining ของกรดอะมิโน ( n-domain ) รู้จักกฎระเบียบแขนดีเอ็นเอเว็บไซต์
การ heterobivalent INT โมเลกุลสะพานไกลหลักและแขนเว็บไซต์ด้วยความช่วยเหลือของโปรตีนเสริม เช่น การเป็นเจ้าภาพปัจจัย ( IHF ) ซึ่งงอดีเอ็นเอที่แทรกเว็บไซต์ และวางชิดกับแขนและหลักลำดับสำหรับการปฏิสัมพันธ์กับ int recombinase . แขนดีเอ็นเอห้าเว็บไซต์ในภูมิภาคหลักของ attp จจะต่างกันอยู่ในปฏิกิริยาและบูรณาการข้อมูล .ผลิตภัณฑ์และการ attl attr ไม่สามารถกลับไปและ attp attb โดยไม่มีความช่วยเหลือจากฟาซิส ที่ปัจจัยซึ่งโค้ง ดีเอ็นเอ ของตนเอง หรือในการรวมกันกับโฮสต์เชื่อมต่อปัจจัย 6 [ 6 , 7 , 8 , 9 , 10 , 11 ] เอกซ์ ไอ เอส ยังยับยั้งการรวมกลุ่ม และป้องกัน attp attb และผลิตภัณฑ์ที่จากและ ย้อนไป attl attr [ 7 , 12 , 13 , 14 , 15 , 16 , 17 , 18 , 19 , 20 , 21 , 22 , 23 )เพราะระดับเซลของ IHF และ Fis โปรตีนตอบสนองเงื่อนไขการเจริญเติบโต ปัจจัยเหล่านี้โฮสต์ที่ได้รับการเสนอเป็นหลักสำหรับการตัดสัญญาณ [ 9 , 11 , 22 , 23 , 24 , 25 ) ว่า ( attp ) และแบคทีเรีย ( attb ) ATT เว็บไซต์เขตป๊อป ' บ๊อบ ' ตามลำดับ และ prophage ATT เว็บไซต์เขตป็อบ ' ( attl ) และภพ ' (
attr )