Dehydration response element bindin

Dehydration response element binding factors (DREBs) are one of the principal plant transcription factor subfamilies that regulate
the expression of many abiotic stress-inducible genes. This sub-family belongs to AP2 transcription factor family and plays a
considerable role in improving abiotic stresses tolerance in plants. Therefore, it is of interest to identify critical cis-acting elements
involved in abiotic stress responses. In this study, we survey promoter cis-elements for ATDREBs genes (Arabidopsis thaliana
DREBs). Regulatory networks based on ATDREB candidate genes were also generated to find other genes that are functionally
similar to DREBs. The study was conducted on all 20 Arabidopsis thaliana non redundant DREB genes stored in RefSeq database.
Promoter analysis and regulatory network prediction was accomplished by use of Plant CARE program and GeneMANIA web
tool, respectively. The results indicated that among all genes, DREB1A, DREB1C, DREB2C, DREB2G and DEAR3 have the most
type of diverse motifs involved in abiotic stress responses. It is implied that co-operation of abscisic acid, ethylene, salicylic acid
and methyl jasmonate signaling is crucial for the regulation of the expression of drought and cold responses through DREB
transcription factors. Gene network analysis showed different co-expressed but functionally similar genes that had physical and
functional interactions with candidate DREB genes.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

คายน้ำตอบองค์ประกอบรวมปัจจัย (DREBs) เป็นหนึ่งใน subfamilies ปัจจัย transcription โรงงานหลักที่ควบคุมนิพจน์ของยีนความเครียด inducible abiotic มาก ครอบครัวนี้ย่อยเป็นของ AP2 transcription ปัจจัยครอบครัว และเล่นเป็นบทบาทสำคัญในการปรับปรุงค่าเผื่อความเครียด abiotic ในพืช จึง มันเป็นที่น่าสนใจในการระบุองค์ประกอบสำคัญทำหน้าที่ cisเกี่ยวข้องในการตอบสนองความเครียด abiotic ในการศึกษานี้ เราสำรวจ ATDREBs ยีน (Arabidopsis thaliana โปรโมเตอร์ cis-องค์ประกอบDREBs) เครือข่ายกำกับดูแลตามยีน ATDREB ผู้สมัครยังได้สร้างขึ้นเพื่อค้นหายีนอื่น ๆ ที่มีฟังก์ชันคล้ายกับ DREBs การวิจัยในทั้งหมด 20 Arabidopsis thaliana ซ้ำซ้อนไม่ DREB ยีนเก็บในฐานข้อมูล RefSeqเครือข่ายกำกับดูแลและวิเคราะห์โปรโมเตอร์ทำนายได้สำเร็จ โดยใช้โปรแกรมการดูแลพืชและเว็บ GeneMANIAเครื่องมือ ตามลำดับ ผลระบุว่า ระหว่างยีนทั้งหมด DREB1A, DREB1C, DREB2C, DREB2G และ DEAR3 มีมากที่สุดชนิดของความหลากหลายที่เกี่ยวข้องในการตอบสนองความเครียด abiotic มันเป็นนัยว่าความร่วมมือของกรดแอบไซซิก เอทิลีน กรดซาลิไซลิและ methyl jasmonate ตามปกติจะใช้ในการควบคุมของนิพจน์ของการตอบสนองภัยแล้งและเย็นผ่าน DREBปัจจัย transcription พบยีนการวิเคราะห์เครือข่ายต่าง ๆ ร่วมแสดงแต่ยีนมีฟังก์ชันคล้ายกันที่มีจริง และโต้ตอบที่ใช้งานได้กับยีน DREB ผู้สมัคร

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การคายน้ำองค์ประกอบการตอบสนองต่อปัจจัยที่มีผลผูกพัน (DREBs) เป็นส่วนหนึ่งของการถอดความพืชหลักครอบครัวปัจจัยที่ควบคุม
การแสดงออกของยีนความเครียดกระตุ้น abiotic จำนวนมาก ย่อยครอบครัวนี้เป็นของครอบครัวถอดความปัจจัย AP2 และเล่น
บทบาทสำคัญในการปรับปรุง abiotic เน้นความอดทนในพืช ดังนั้นจึงเป็นที่น่าสนใจในการระบุองค์ประกอบที่ถูกต้องทำหน้าที่ที่สำคัญ
มีส่วนร่วมในการตอบสนองต่อความเครียด abiotic ในการศึกษานี้เราสำรวจองค์ประกอบถูกต้อง-ก่อการยีน ATDREBs (Arabidopsis thaliana
DREBs) เครือข่ายการกำกับดูแลขึ้นอยู่กับ ATDREB ยีนยังถูกสร้างขึ้นเพื่อหายีนอื่น ๆ ที่มีหน้าที่
คล้ายกับ DREBs ศึกษาได้ดำเนินการในทุก 20 Arabidopsis thaliana ไม่ใช่ยีน DREB ซ้ำซ้อนเก็บในฐานข้อมูล RefSeq.
โปรโมเตอร์วิเคราะห์และคาดการณ์เครือข่ายการกำกับดูแลก็ประสบความสำเร็จจากการใช้โปรแกรมการดูแลพืชและ GeneMANIA เว็บ
เครื่องมือตามลำดับ ผลการศึกษาพบว่าในหมู่ยีนทั้งหมด DREB1A, DREB1C, DREB2C, DREB2G DEAR3 และมีมากที่สุด
ชนิดของลวดลายที่มีความหลากหลายมีส่วนร่วมในการตอบสนองต่อความเครียด abiotic มันส่อให้เห็นว่าความร่วมมือของกรดแอบไซซิก, เอทิลีน, กรดซาลิไซลิ
และการส่งสัญญาณ methyl jasmonate เป็นสิ่งสำคัญสำหรับการควบคุมการแสดงออกของภัยแล้งและการตอบสนองเย็นผ่าน DREB
ถอดความปัจจัย ยีนแสดงให้เห็นว่าการวิเคราะห์เครือข่ายร่วมแสดงความแตกต่างกัน แต่ยีนที่คล้ายกันที่มีหน้าที่ทางกายภาพและ
การโต้ตอบการทำงานที่มียีน DREB

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การขาดองค์ประกอบรวมปัจจัย ( drebs ) เป็นหนึ่งในพืชหลักถอดความปัจจัยวงศ์ย่อยที่ควบคุมการแสดงออกของสิ่งมีชีวิต
เครียดมาก inducible ยีน นี้ย่อยครอบครัวเป็นของ ap2 ถอดความปัจจัยด้านครอบครัว และการเล่นบทบาทเป็นอย่างมากในการปรับปรุง ไร่ เน้นความอดทนในพืช ดังนั้น จึงเป็นที่สนใจของระบุวิกฤตแสดงองค์ประกอบ
CISมีส่วนร่วมในการตอบสนองความเครียด ไร่ . ในการศึกษาครั้งนี้ได้สำรวจการ CIS องค์ประกอบ atdrebs ยีน ( Arabidopsis thaliana
drebs ) ข้อบังคับเครือข่ายตาม atdreb ผู้สมัครยีนก็สร้างขึ้นเพื่อค้นหายีนที่ร่ำลือ
คล้ายกับ drebs . มีจำนวนทั้งหมด 20 Arabidopsis thaliana ไม่ซ้ำซ้อน dreb ยีนที่เก็บไว้ในฐานข้อมูล refseq .
วิเคราะห์และทำนายการควบคุมเครือข่ายได้ โดยการใช้พืชดูแลโปรแกรมและเว็บเครื่องมือ genemania
ตามลำดับ ผลการศึกษาพบว่า ในบรรดายีน dreb1a dreb1c dreb2c , , , และ dreb2g dear3 มีชนิดมากที่สุดของลวดลายที่หลากหลายที่เกี่ยวข้องกับ
การตอบสนองความเครียด ไร่ . มันเป็นนัยว่า ความร่วมมือของ abscisic acid , เอทิลีน , กรด Salicylic
และ เมทิลจั มเนตส่งสัญญาณเป็นสําคัญสําหรับการควบคุมของการแสดงออกของการตอบสนองผ่านแล้งและเย็นปัจจัยการถอดความ dreb

การวิเคราะห์เครือข่ายยีนมีความแตกต่างแต่หน้าที่คล้ายกัน Co แสดงยีนที่มีการโต้ตอบการทำงานทางกายภาพและ
กับผู้สมัคร dreb ยีน