Infections by multiple parasite spe

Infections by multiple parasite species are common in nature and have important consequences for between-species interactions and coevolutionary dynamics with the host populations. For example, ecological and evolutionary factors underlying the structure of parasite communities determine the range of hosts a parasite can infect and set the basis for both evolution of host defences and parasite virulence, as well as management of diseases. Studies investigating these factors have been facilitated in the recent past by genetic methods, which surmount difficulties of traditional morphological taxonomy in identifying individual parasite species. Here we take a step further and present a novel methodological approach to analyze parasite communities as a whole. We determined the relative frequencies of interspecific SNP alleles by pyrosequencing naturally pooled samples of closely related Diplostomum spp. trematodes infecting eye lenses of freshwater fish. Pyrosequencing allowed us to use naturally pooled community samples (lenses) to increase the sample size and statistical power, without sequencing single parasite specimens. In a case study, we applied this method to analyze the community structure of the eye flukes across fish host species of a freshwater system in Finland. We found that the fish species harboured significantly different parasite communities and that multiple species infections were common. Our study provides an example of how quantitative pyrosequencing can be used to answer evolutionary and ecological questions in natural communities of parasites.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ติดเชื้อจากปรสิตหลายชนิดทั่วไปในธรรมชาติ และมีผลกระทบสำคัญการโต้ตอบระหว่างพันธุ์ coevolutionary ไหวที่ประชาชน ตัวอย่าง นิเวศวิทยา และวิวัฒนาการปัจจัยโครงสร้างของปรสิตชุมชนต้นแบบกำหนดช่วงของโฮสต์ปรสิตสามารถติดเชื้อ และการตั้งค่าพื้นฐานของวิวัฒนาการทั้ง defences โฮสต์ และปรสิต virulence ตลอดจนการจัดการโรค ศึกษาตรวจสอบปัจจัยเหล่านี้มีการบริการในอดีตผ่านมา โดยวิธีทางพันธุกรรม การ surmount ปัญหาของระบบภาษีของดั้งเดิมในระบุปรสิตแต่ละชนิด ที่นี่เราใช้ขั้นตอนเพิ่มเติม และนำเสนอวิธีการ methodological นวนิยายการวิเคราะห์ชุมชนปรสิตทั้งหมด เราสามารถกำหนดความถี่สัมพัทธ์ของ interspecific SNP alleles โดยธรรมชาติทางถูกพู pyrosequencing trematodes โอ Diplostomum ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดติดเลนส์ตาของปลาตัวอย่าง Pyrosequencing ให้เราใช้ธรรมชาติรวมชุมชนตัวอย่าง (เลนส์) เพื่อเพิ่มขนาดตัวอย่างและสถิติพลังงาน ไม่ มีลำดับเบสเดียวปรสิตไว้เป็นตัวอย่าง ในกรณีศึกษา เราใช้วิธีนี้ในการวิเคราะห์โครงสร้างชุมชนของ flukes ตาข้ามปลาโฮสต์พันธุ์ระบบน้ำจืดในประเทศฟินแลนด์ เราพบว่า พันธุ์ปลา harboured ชุมชนปรสิตที่แตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญ และที่ติดเชื้อหลายชนิดได้ทั่วไป การศึกษาของเราให้สามารถใช้ตัวอย่างของ pyrosequencing วิธีเชิงปริมาณเพื่อตอบวิวัฒนาการ และนิเวศวิทยาถามในชุมชนธรรมชาติกับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การติดเชื้อปรสิตชนิดหลายอยู่ทั่วไปในธรรมชาติและมีผลกระทบที่สำคัญสำหรับการมีปฏิสัมพันธ์ระหว่างสายพันธุ์และการเปลี่ยนแปลง coevolutionary กับประชากรโฮสต์ ตัวอย่างเช่นปัจจัยทางนิเวศวิทยาและวิวัฒนาการโครงสร้างพื้นฐานของชุมชนปรสิตกำหนดช่วงของโฮสต์ปรสิตสามารถติดเชื้อและการตั้งค่าพื้นฐานสำหรับการวิวัฒนาการของการป้องกันความรุนแรงโฮสต์และปรสิตทั้งสองเช่นเดียวกับการจัดการของโรค การศึกษาการตรวจสอบปัจจัยเหล่านี้ได้รับการอำนวยความสะดวกในอดีตที่ผ่านมาโดยวิธีทางพันธุกรรมซึ่งฟันฝ่าความยากลำบากของอนุกรมวิธานก้านแบบดั้งเดิมในการระบุสายพันธุ์ปรสิตบุคคล ที่นี่เราจะใช้ขั้นตอนต่อไปและนำเสนอวิธีการวิธีการใหม่ในการวิเคราะห์ชุมชนปรสิตรวม เรากำหนดความถี่ญาติของอัลลีล SNP interspecific โดย pyrosequencing ตัวอย่าง pooled ธรรมชาติของที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด spp Diplostomum trematodes ติดไวรัสเลนส์ตาของปลาน้ำจืด pyrosequencing ได้รับอนุญาตให้เราใช้ pooled ธรรมชาติตัวอย่างชุมชน (เลนส์) เพื่อเพิ่มขนาดของกลุ่มตัวอย่างและอำนาจทางสถิติโดยไม่ต้องลำดับตัวอย่างปรสิตเดียว ในกรณีศึกษาที่เรานำมาใช้วิธีการนี​​้ในการวิเคราะห์โครงสร้างของชุมชน flukes ตาข้ามสายพันธุ์ปลาโฮสต์ของระบบน้ำจืดในฟินแลนด์ เราพบว่าปลาชนิดเก็บงำอย่างมีนัยสำคัญชุมชนปรสิตที่แตกต่างกันและการติดเชื้อหลายชนิดที่เป็นเรื่องปกติ การศึกษาของเราแสดงให้เห็นตัวอย่างของวิธีการเชิงปริมาณ pyrosequencing สามารถใช้ในการตอบคำถามและวิวัฒนาการของระบบนิเวศในชุมชนตามธรรมชาติของปรสิต

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เชื้อจากสายพันธุ์ปรสิตหลายอยู่ทั่วไปในธรรมชาติ และที่สำคัญสำหรับปฏิสัมพันธ์ระหว่างชนิด coevolutionary กับโฮสต์และพลวัตประชากร ตัวอย่างเช่นนิเวศวิทยาและวิวัฒนาการปัจจัยพื้นฐานโครงสร้างของสังคมพยาธิกําหนดช่วงของโยธา ปรสิตสามารถติดเชื้อและการตั้งค่าพื้นฐานสำหรับทั้งวิวัฒนาการของการป้องกันโฮสต์ และโรคพยาธิ ตลอดจนการจัดการของโรค การศึกษาการตรวจสอบปัจจัยเหล่านี้ได้รับความสะดวกในอดีตที่ผ่านมา โดยวิธีการทางพันธุกรรมซึ่งผ่านพ้นความยากลำบากของอนุกรมวิธานสัณฐานวิทยาแบบดั้งเดิมในการระบุปรสิตชนิดบุคคล ที่นี่เราใช้ขั้นตอนเพิ่มเติม และเสนอแนวทางในนวนิยายวิเคราะห์ชุมชนปรสิตที่เป็นทั้ง เรากำหนดความถี่ของอัลลีล interspecific SNP โดยไพโรซีเควนซิงตามธรรมชาติรวมตัวอย่างที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด diplostomum spp .ใบไม้ติดเลนส์ตาของน้ำจืดปลา ไพโรซีเควนซิงให้เราสามารถใช้ธรรมชาติรวมชุมชนตัวอย่าง ( เลนส์ ) เพิ่มขนาดตัวอย่างและอำนาจทางสถิติ โดยตัวอย่างปรสิตเดียวของ ในกรณีศึกษา เราใช้วิธีนี้เพื่อวิเคราะห์โครงสร้างชุมชนของตาฟลุคข้ามปลาชนิดของโฮสต์ระบบน้ำจืดในฟินแลนด์เราพบว่า ปลาแต่ละชนิดและเก็บงำชุมชนแตกต่างกัน ที่หลาย ๆ ชนิดเชื้อเป็นทั่วไป การศึกษาของเรามีตัวอย่างของวิธีไพโรซีเควนซิงเชิงปริมาณสามารถใช้ตอบคําถามทางนิเวศวิทยาและวิวัฒนาการในชุมชนธรรมชาติของปรสิต