Molecular taxonomy of the isolatesT

Molecular taxonomy of the isolates
To identify ITS sequences similar to those obtained from fungi
isolates, the FASTA algorithms were used to screen the EMBL/Genbank database of fungal nucleotide sequences. To visualize the
diverse fungal taxa identified by means of molecular characters,
a sequence similarity dendrogram was developed with the ITS1-
5.8S rRNA-ITS2 nucleotide sequences of the isolates. Isolates
sequences were aligned using the program ClustalX 2.1 with the
default settings, and the dendrogram produced with MEGA 6.06
software using the neighbor-joining method with Kimura 2-
parameter distances. Groups of sequences at close proximity
within the same branch of the dendrogram were individually
aligned with ClustalX to determine their percentage of similarity.
Sequences with similarity greater than 99% were considered

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ระบบโมเลกุลของการแยกการระบุของลำดับที่คล้ายกับที่ได้จากเชื้อราแยก อัลกอริทึม FASTA ใช้หน้าจอฐานข้อมูล EMBL/Genbank ลำดับนิวคลีโอไทด์เชื้อรา เห็นภาพแท็กซ่าหลากหลายที่ระบุ โดยตัวโมเลกุล เชื้อราเป็นลำดับคล้าย dendrogram ถูกพัฒนา ด้วย ITS1-5.8S ลำดับนิวคลีโอไทด์ rRNA ITS2 แยก แยกลำดับถูกจัดการโดยใช้โปรแกรม ClustalX 2.1 ด้วยการค่าเริ่มต้น และ dendrogram ผลิต 6.06 ล้านซอฟต์แวร์ที่ใช้วิธีเข้าร่วมบ้านกับคิมุระ 2-ระยะทางพารามิเตอร์ กลุ่มลำดับที่ภายในสาขาเดียวกันของ dendrogram มีเอกลักษณ์สอดคล้องกับ ClustalX เพื่อกำหนดเปอร์เซ็นต์ของความคล้ายคลึงกันพิจารณาว่าลำดับ มีความคล้ายคลึงมากกว่า 99%

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

อนุกรมวิธานระดับโมเลกุลของเชื้อ
เพื่อระบุลำดับที่คล้ายกับผู้ที่ได้รับจากเชื้อรา
ไอโซเลทอัลกอริทึม FASTA ถูกนำมาใช้ในการคัดกรองฐานข้อมูล EMBL / Genbank ลำดับเบสของเชื้อรา เห็นภาพการ
แท็กซ่าเชื้อราที่มีความหลากหลายระบุความหมายของตัวอักษรโมเลกุล
dendrogram ลำดับความคล้ายคลึงกันได้รับการพัฒนาด้วย ITS1-
5.8S rRNA-ITS2 ลำดับเบสของเชื้อ แยก
ลำดับถูกจัดชิดโดยใช้โปรแกรม ClustalX 2.1 ที่มีการ
ตั้งค่าเริ่มต้นและ dendrogram ที่ผลิตด้วย MEGA 6.06
ซอฟต์แวร์โดยใช้วิธีเพื่อนบ้านเข้ากับคิมูระ 2-
ระยะทางพารามิเตอร์ กลุ่มของลำดับที่ใกล้ชิด
ภายในสาขาเดียวกันของ dendrogram ได้เป็นรายบุคคล
สอดคล้องกับ ClustalX ในการกำหนดอัตราร้อยละของพวกเขามีความคล้ายคลึงกัน.
ลำดับที่มีความคล้ายคลึงกันมากขึ้นกว่า 99% ได้รับการพิจารณา