Direct Hybridization AssayThe Direc

Direct Hybridization Assay
The Direct Hybridization Assay system uses a standard Eberwine protocol
assay, in which gene-specific probes are used to detect labeled cRNAs. Each
bead in the array contains a 50-mer, sequence-specific oligo probe
synthesized in-house using Illumina’s proprietary oligo manufacturing
technology. Probe design incorporates a number of selection criteria
including:
` Sequence context evaluation identifying regions of a transcript
compatible with probe design, based on items such as splice-isoformspecific
regions, sequence complexity, and uniqueness.
` Self-complementarity for hairpin structure prediction
` Melting temperature (Tm)
` Distance from the 3' end of the transcript
A series of controls is incorporated into the assay, accomplishing these
important tasks:
` Assessment of success of the major steps in the experiment
` Information on background and noise levels

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ตรงผสมพันธุ์ Assay
ระบบตรงผสมพันธุ์ Assay ใช้ Eberwine
โปรโตคอลมาตรฐานการทดสอบซึ่งในยานสำรวจยีนเฉพาะที่ใช้ในการตรวจสอบการติดป้ายCRNAs แต่ละลูกปัดในอาร์เรย์ที่มี 50-Mer สอบสวน Oligo ลำดับเฉพาะสังเคราะห์ในบ้านโดยใช้การผลิตที่เป็นกรรมสิทธิ์ของOligo Illumina เทคโนโลยี การออกแบบการสอบสวนรวมจำนวนของเกณฑ์การคัดเลือกได้แก่ : `ประเมินบริบทลำดับระบุภูมิภาคของหลักฐานที่เข้ากันได้กับการออกแบบการสอบสวนขึ้นอยู่กับรายการเช่นประกบ-isoformspecific ภูมิภาคซับซ้อนลำดับและเป็นเอกลักษณ์.` complementarity ด้วยตนเองสำหรับโครงสร้างการพยากรณ์กิ๊บ `จุดหลอมเหลว อุณหภูมิ (TM) `ระยะทางจากปลาย 3 'ของหลักฐานชุดควบคุมรวมอยู่ในการทดสอบที่ประสบความสำเร็จเหล่านี้งานที่สำคัญ:` การประเมินความสำเร็จของการทำตามขั้นตอนที่สำคัญในการทดลอง`ข้อมูลเกี่ยวกับพื้นหลังและระดับเสียง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การทดสอบระบบโดยตรง (
( ตรงใช้มาตรฐานโปรโตคอล eberwine
) ซึ่งในวัดเฉพาะยีนที่ใช้ในการตรวจสอบข้อความที่ crnas . แต่ละ
ลูกปัดในอาร์เรย์ประกอบด้วย 50 เมร์ หัวเล็กที่เฉพาะเจาะจงในการใช้ Illumina ลำดับ
สังเคราะห์เป็นกรรมสิทธิ์ของโอลิโกผลิต
เทคโนโลยี การออกแบบโพรบประกอบด้วยหมายเลขของเกณฑ์การเลือก

รวมถึง :` ลำดับการประเมินบริบท ระบุขอบเขตของหลักฐาน
เข้ากันได้กับการออกแบบเครื่อง ตามรายการ เช่น ประกบกัน isoformspecific
ภูมิภาค ความซับซ้อน ลำดับและเอกลักษณ์ .
` ตนเอง complementarity สำหรับกิ๊บโครงสร้างการพยากรณ์
` อุณหภูมิหลอมเหลว ( TM )
` ระยะห่างจากปลาย 3 ' สำเนา
ชุดของการควบคุมเป็นส่วนประกอบ เข้าไปตรวจสอบการบรรลุเหล่านี้
งานที่สำคัญ :
` การประเมินความสำเร็จของขั้นตอนที่สำคัญในการทดลอง
` ข้อมูลพื้นหลังและเสียงระดับ