Culture supernatant of the new isolate showed distinct antimicrobial activity against L. innocua, but no activity against E. coli K-12; therefore, the former was used as an indicator during purification of the antimicrobial agent. After separation through HPLC, four fractions exhibited antimicrobial activity against L. innocua ( Fig. 2). Fraction 1 showed strong antagonistic activity whereas other three fractions exhibited weak activity. All four fractions were subjected to mass spectrometry analyses. Fraction 1, with retention time of 23.06 min, gave a protonated ion at m/z 3401.414 ( Fig. 3a), which matched the molecular weight of subtilosin ( Stein, Dusterhus, Stroh, & Entian, 2004). The intact and tryptic-digested compounds were then analysed by tandem MS. However, both of these analyses failed to elucidate the structural information, suggesting that the compound probably contained inter-residual linkage. Polymerase chain reaction was subsequently conducted to confirm the presence of subtilosin gene in OSY-7LA genomic DNA. A fragment of 1.2 kb, stretching 512 bp upstream and 578 bp downstream of subtilosin gene ( Zheng et al., 1999), was successfully amplified and sequenced. Translated amino acid sequence was identical to subtilosin which verifies that the compound in HPLC fraction 1 was subtilosin.
วัฒนธรรม supernatant ของใหม่แยกแสดงกิจกรรมจุลินทรีย์แตกต่างกับ L. innocua แต่ไม่มีกิจกรรมกับ E. coli K-12 ดังนั้น เดิมใช้เป็นตัวบ่งชี้ระหว่างฟอกของจุลินทรีย์ หลังจากแยกผ่าน HPLC สี่ส่วนจัดแสดงกิจกรรมจุลินทรีย์กับ L. innocua (Fig. 2) เศษ 1 แสดงให้เห็นว่ากิจกรรมการต่อต้านที่แข็งแกร่งในขณะที่อื่น ๆ ส่วนที่สามจัดแสดงกิจกรรมที่อ่อนแอ สี่เศษทั้งหมดถูกต้องวิเคราะห์รเมท เศษ 1 รักษาเวลา 23.06 นาที ให้ไอออน protonated ที่ m/z 3401.414 (Fig. 3a), ซึ่งตรงกับน้ำหนักโมเลกุลของ subtilosin (สไตน์ Dusterhus, Stroh, & Entian, 2004) สารเชื่อม และ เจ่า tryptic ได้แล้ว analysed โดยตัวตามกันไป MS อย่างไรก็ตาม วิเคราะห์เหล่านี้ทั้งสองไม่สามารถ elucidate โครงสร้างข้อมูล แนะนำที่ บริเวณอาจประกอบด้วยความเชื่อมโยงระหว่างส่วนที่เหลือ ปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรสได้ดำเนินการต่อเพื่อยืนยันสถานะของยีน subtilosin ใน OSY 7LA genomic DNA ส่วนของ 1.2 kb ยืด 512 bp ขั้นต้นน้ำ และ 578 bp น้ำของยีน subtilosin (เจิ้ง et al., 1999), ถูกขยายเสร็จเรียบร้อยแล้ว และเรียงลำดับ ลำดับกรดอะมิโนแปลได้เหมือนกับ subtilosin ที่ตรวจสอบว่า สารประกอบใน HPLC เศษ 1 คือ subtilosin
การแปล กรุณารอสักครู่..
