This study aimed to investigate the

This study aimed to investigate the diversity of the Butyrivibrio group bacteria in goat rumen and its response to garlic oil (GO) supplementation as revealed by molecular analysis of cloned 16S rRNA genes. Six wethers fitted with ruminal fistulas were assigned to two groups for a cross-over design with 28-d experimental period and 14-d interval. Goats were fed a basal diet without (control) or with GO ruminal infusion (0.8 g/d). Ruminal contents were used for DNA extraction collected before morning feeding on d 28. A total bacterial clone library was firstly constructed by nearly full-length 16S rRNA gene cloned sequences using universal primers. The resulting plasmids selected by Butyrivibrio-specific primers were used to construct a Butyrivibrio group-specific bacterial clone library. Butyrivibrio group represented 12.98% and 10.95% of total bacteria in control and GO group, respectively. In libraries, clones were classified to the genus Pseudobutyrivibrio, Butyrivibrio and others within the family Lachnospiraceae. Additionally, some specific clones were observed in GO group, being classified to the genus Ruminococcus and others within the family Ruminococcaceae. Based on the criterion that the similarity was 97% or greater with database sequences, there were 29.73% and 18.42% of clones identified as known isolates (i.e. B. proteoclasticus and Ps. ruminis) in control and GO groups, respectively. Further clones identified as B. fibrisolvens (5.41%) and R. flavefaciens (7.89%) were specifically found in control and GO groups, respectively. The majority of clones resembled Ps. ruminis (98% to 99% similarity), except for Lachnospiraceae bacteria (87% to 92% similarity) in the two libraries. The two clone libraries also appeared different in Shannon diversity index (control 2.47 and GO group 2.91). Our results indicated that the Butyrivibrio group bacteria had a complex community with considerable unknown species in the goat rumen.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การศึกษานี้มุ่งเน้นการตรวจสอบความหลากหลายของแบคทีเรียกลุ่ม Butyrivibrio ในแพะต่อและตอบสนองของกระเทียมแห้งเสริมน้ำมัน (GO) ที่เปิดเผย โดยวิเคราะห์ระดับโมเลกุลของยีนโคลน 16S rRNA Wethers หกมี ruminal fistulas ถูกกำหนดให้กับกลุ่มสองสำหรับการออกแบบมากกว่าระหว่างระยะเวลาทดลอง 28 d และ 14 d ช่วง แพะที่เลี้ยงอาหารโรค โดย (ควบคุม) หรือไป ruminal คอนกรีต (0.8 g/d) เนื้อหา ruminal ถูกใช้สำหรับการสกัดดีเอ็นเอที่เก็บก่อนเช้าอาหารบน d 28 รีโคลนแบคทีเรียรวมถูกสร้างขึ้นก่อน โดยปราศจากเกือบ 16S rRNA ยีนโคลนลำดับใช้ไพรเมอร์สากล Plasmids ผลลัพธ์ที่เลือก โดยเฉพาะ Butyrivibrio ไพรเมอร์ที่ใช้ในการสร้างรีโคลนแบคทีเรียเฉพาะกลุ่ม Butyrivibrio กลุ่ม Butyrivibrio แทนใช้ 12.98% และ 10.95% ของแบคทีเรียรวมในตัวควบคุม และไปกลุ่ม ตามลำดับ ในไลบรารี โคลนถูกจัดประเภทให้สกุล Pseudobutyrivibrio, Butyrivibrio และอื่น ๆ ภายในครอบครัว Lachnospiraceae นอกจากนี้ โคลนเฉพาะบางถูกสังเกตในกลุ่มไป การจำแนกพืชสกุล Ruminococcus และอื่น ๆ ภายในครอบครัว Ruminococcaceae ตามเงื่อนไขที่คล้ายคลึงได้ 97% หรือมากกว่า ด้วยลำดับฐานข้อมูล มี 29.73% และ 18.42% ของโคลนที่ระบุเป็นการรู้จักแยก (เช่นเกิด proteoclasticus และ Ps. ruminis) ในการควบคุมและกลุ่มไป ตามลำดับ เพิ่มเติมโคลนเป็นเกิด fibrisolvens (5.41%) และอาร์ flavefaciens (7.89%) พบเฉพาะในการควบคุม และไปกลุ่ม ตามลำดับ ส่วนใหญ่ clones คล้ายกับ Ps. ruminis (คล้าย 98% ถึง 99%), ยกเว้นแบคทีเรีย Lachnospiraceae (คล้าย 87% ถึง 92%) ในไลบรารีทั้งสอง ทั้งสองโคลนไลบรารีที่ยัง ปรากฏในดัชนีความหลากหลายแชนนอน (ควบคุม 2.47 และกลุ่มไป 2.91) ผลของเราระบุว่า แบคทีเรียกลุ่ม Butyrivibrio มีชุมชนซับซ้อนกับสายพันธุ์ที่รู้จักมากในต่อแพะ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การศึกษาครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาความหลากหลายของกลุ่ม Butyrivibrio แบคทีเรียในกระเพาะแพะและการตอบสนองของน้ำมันกระเทียม (GO) การเสริมเปิดเผยโดยการวิเคราะห์ระดับโมเลกุลของยีน 16S rRNA โคลน หก wethers พอดีกับ fistulas กระเพาะรูเมนได้รับมอบหมายให้ทั้งสองกลุ่มการออกแบบข้ามที่มีระยะเวลา 28 วันทดลองและ 14 d ช่วงเวลา แพะได้รับการเลี้ยงดูอาหารพื้นฐานโดยไม่ต้อง (ควบคุม) หรือแช่ไปในกระเพาะรูเมน (0.8 กรัม / วัน) เนื้อหาในกระเพาะรูเมนถูกนำมาใช้ในการสกัดดีเอ็นเอที่เก็บได้ก่อนที่จะให้อาหารในช่วงเช้าวันที่ 28 ห้องสมุดโคลนแบคทีเรียรวมถูกสร้างขึ้นครั้งแรกโดยเกือบเต็มความยาว 16S rRNA ยีนลำดับโคลนโดยใช้ไพรเมอร์สากล พลาสมิดที่เกิดการคัดเลือกจากไพรเมอร์ Butyrivibrio เฉพาะถูกนำมาใช้ในการสร้าง Butyrivibrio กลุ่มเฉพาะห้องสมุดโคลนแบคทีเรีย กลุ่มตัวแทน Butyrivibrio 12.98% และ 10.95% ของแบคทีเรียทั้งหมดในการควบคุมและกลุ่มไปตามลำดับ ในห้องสมุดโคลนจะถูกจัดประเภท Pseudobutyrivibrio, Butyrivibrio และคนอื่น ๆ ในครอบครัว Lachnospiraceae นอกจากนี้โคลนเฉพาะบางคนตั้งข้อสังเกตในกลุ่ม GO ถูกแบ่งออกเป็นประเภท Ruminococcus และคนอื่น ๆ ในครอบครัว Ruminococcaceae ตามเกณฑ์ที่คล้ายคลึงกันคือ 97% หรือมากกว่าวนเวียนอยู่กับฐานข้อมูลที่มีอยู่ 29.73% และ 18.42% ของโคลนระบุว่าเป็นสายพันธุ์ที่รู้จักกัน (เช่น proteoclasticus บีและ Ps. ruminis) ในการควบคุมและกลุ่มไปตามลำดับ โคลนเพิ่มเติมระบุว่าเป็น fibrisolvens บี (5.41%) และ flavefaciens อาร์ (7.89%) พบเฉพาะในการควบคุมและ GO กลุ่มตามลำดับ ส่วนใหญ่ของโคลนคล้าย Ps ruminis (98% ถึง 99% ความคล้ายคลึงกัน) ยกเว้นสำหรับแบคทีเรีย Lachnospiraceae (87% ความคล้ายคลึงกัน 92%) ในสองห้องสมุด ทั้งสองห้องสมุดโคลนก็ปรากฏตัวขึ้นแตกต่างกันในดัชนีความหลากหลายแชนนอน (ควบคุม 2.47 และ 2.91 GO กลุ่ม) ผลของเราแสดงให้เห็นว่ากลุ่ม Butyrivibrio แบคทีเรียที่มีชุมชนที่ซับซ้อนที่มีสายพันธุ์ที่ไม่รู้จักมากในกระเพาะแพะ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาความหลากหลายของกลุ่มแบคทีเรียในกระเพาะรูเมนของแพะ butyrivibrio และการตอบสนองของน้ำมันกระเทียม ( ไป ) ) พบว่าโดยการวิเคราะห์ระดับโมเลกุลของยีน 16S rRNA ยีน 6 wethers เข็มขัดและ fistulas แบ่งเป็นกลุ่ม 2 กลุ่ม สำหรับประชากรกลุ่มเดียวกันกับ 28-D ทดลองและระยะเวลาที่ 14-d ช่วงแพะที่ได้รับอาหารพื้นฐานโดยไม่ต้องควบคุม ) หรือไปแช่ในกระเพาะรูเมน ( 0.8 กรัม / วัน ) และเนื้อหาที่ใช้สำหรับการสกัดดีเอ็นเอเก็บก่อนเช้ากิน D 28 ห้องสมุดโคลนแบคทีเรียทั้งหมด เดิมทีสร้างโดยลำดับเบส 16S rRNA ยีนที่โคลนได้เกือบเต็ม ใช้วิธีสากลส่งผลให้เลือกโดยเฉพาะ butyrivibrio พลาสมิดดีเอ็นเอถูกใช้เพื่อสร้างกลุ่ม butyrivibrio เฉพาะแบคทีเรีย โคลนจากห้องสมุด butyrivibrio 12.98 ล้านบาท และกลุ่มตัวแทน 10.95 % ของจำนวนแบคทีเรียในการควบคุม และไปกลุ่มตามลำดับ ในห้องสมุด โคลนสามารถจำแนกสกุล pseudobutyrivibrio butyrivibrio lachnospiraceae , และคนอื่น ๆภายในครอบครัว นอกจากนี้เฉพาะบางพันธุ์ที่พบในไปกลุ่มถูกจัดในจีนัส ruminococcus ruminococcaceae และคนอื่น ๆภายในครอบครัว ขึ้นอยู่กับเกณฑ์ที่ความเหมือน 97 % หรือมากกว่า ด้วยลำดับฐานข้อมูลมี 29.73 ล้านบาท และ 18.42 % ของโคลนระบุว่ารู้จักเชื้อ ( เช่น บี proteoclasticus และ PS . ruminis ) ในการควบคุม และไปกลุ่มตามลำดับเพิ่มเติมโคลนระบุว่าพ. fibrisolvens ( 5.41 % ) และ อาร์ flavefaciens ( 7.89% ) โดยเฉพาะในกลุ่มควบคุม และพบไปตามลำดับ ส่วนใหญ่ของโคลนเหมือน PS ruminis ( 98% - 99% เหมือนกัน ) ยกเว้น lachnospiraceae แบคทีเรีย ( 87 92 % ความเหมือน ) สองห้องสมุด สองโคลนห้องสมุดยังปรากฏที่แตกต่างกันในการควบคุมดัชนีแชนนอนความหลากหลาย ( 247 ไปกลุ่ม 2.91 ) ผลของเราระบุว่า butyrivibrio กลุ่มแบคทีเรียมีชุมชนที่มีความซับซ้อนมากไม่ทราบชนิดในแพะกระเพาะ