3.1. PhylogenyThe phylogenetic tree

3.1. Phylogeny
The phylogenetic tree featured three major clades, Cry1, Cry2 and
Cry4 (Fig. 2). Cry4 genes are phylogenetically related to (6–4) PHR and
evolutionary older than Cry1 and Cry2. The Cry1 clade includes three
subfamilies, 1A, 1B and 1C. The homologs from the 1A and 1B subfamilies
are phylogenetically related to cryptochromes of tetrapods. Several
fish species (e.g., Gasterosteus aculeatus, Oryzias latipes, and Xiphophorus
maculatus) possess representatives of all three Cry1 subfamilies. An evolutionarily
ancient lamprey (P. marinus) has only one homolog of Cry,
and coelacanth (L. chalumnae) has three, while evolutionarily younger
teleosts possess multiple (three or more) copies of cryptochromes.
Closely related species may possess different members of Cry paralogs.
For example, among the Tetraodontidae, T. nigroviridis has two copies
of Cry2 and two of Cry1, while T. rubripes possess only one copy of
Cry2 but three homologs of Cry1.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.1. phylogenyต้นไม้ผลที่โดดเด่นสามหลัก clades, Cry1, Cry2 และCry4 (2 รูป) Cry4 ยีน phylogenetically เกี่ยวข้องกับ PHR (6 – 4) และวิวัฒนาการมากกว่า Cry1 และ Cry2 Cry1 เคลดสามวงศ์ย่อย 1A, 1B และ 1 c Homologs จากวงศ์ย่อยที่ 1A และ 1Bphylogenetically เกี่ยวข้องกับ cryptochromes สะท้อน หลายปลา (เช่น และ Gasterosteus, latipes ฐานด้านบน และปลาสอดหางดาบmaculatus) มีตัวแทนของทั้งหมด 3 วงศ์ย่อย Cry1 การ evolutionarilyปลาแลมป์เพรย์โบราณ (มารินุสที่ P.) มี homolog เดียวของร้องไห้ปลาซีลาแคนท์ (L. chalumnae) มีสาม ในขณะที่อายุน้อยกว่า evolutionarilyteleosts มีหลาย (สาม หรือมากกว่า) สำเนา cryptochromesสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดอาจมีสมาชิกอื่นของร้องไห้ paralogsเช่น ในหมู่ Tetraodontidae, T. จุดดำมี 2 ชุดCry2 และสอง Cry1 ขณะที rubripes มีสำเนาเดียวเท่านั้นCry2 แต่ homologs สามของ Cry1

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3.1 เชื้อชาติ
phylogenetic ต้นไม้สำคัญสาม clades ที่สำคัญในกลุ่ม cry1, Cry2 และ
Cry4 (รูปที่. 2) ยีน Cry4 ที่เกี่ยวข้อง phylogenetically ไป (6-4) PHR และ
วิวัฒนาการเก่ากว่ากลุ่ม cry1 และ Cry2 กลุ่ม cry1 clade รวมถึงสาม
ครอบครัว, 1A, 1B และ 1C homologs จาก 1A และ 1B ครอบครัว
ที่เกี่ยวข้อง phylogenetically เพื่อ cryptochromes ของ tetrapods หลาย
สายพันธุ์ปลา (เช่น Gasterosteus aculeatus, latipes Oryzias และ Xiphophorus
maculatus) มีตัวแทนของทั้งสามครอบครัวในกลุ่ม cry1 วิวัฒนาการ
ปลาทูนาโบราณ ( P. Marinus) มีเพียงหนึ่ง homolog ของร้องไห้
และ Coelacanth ( L. chalumnae) มีสามในขณะที่วิวัฒนาการที่อายุน้อยกว่า
teleosts มีหลาย (สามหรือมากกว่า) สำเนาของ cryptochromes.
สายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดอาจมีความแตกต่างกันของสมาชิกร้องไห้ paralogs.
ยกตัวอย่างเช่นในหมู่วงศ์ปลาปักเป้าฟันสี่ซี่ตัน nigroviridis มีสองชุด
ของ Cry2 และสองของกลุ่ม cry1 ขณะ rubripes ตันมีเพียงหนึ่งสำเนาของ
Cry2 แต่สาม homologs ของกลุ่ม cry1

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3.1 . ระบบเชื้อชาติต้นไม้ชนิดที่โดดเด่นสามหลัก clades cry1 cry2 , , และcry4 ( รูปที่ 2 ) cry4 ยีน phylogenetically เกี่ยวข้องกับ ( 6 ) 4 ) , และอายุมากกว่า cry1 cry2 และวิวัฒนาการ การ cry1 clade รวมถึงสามและวงศ์ย่อย 1A , 1B , 1C . โฮโมลอกส์จาก 1A และ 1B วงศ์ย่อยเป็น phylogenetically เกี่ยวข้องกับ cryptochromes ของสัตว์สี่ขา . หลาย ๆปลา ( เช่น gasterosteus aculeatus กรมอุทกศาสตร์ และ xiphophorus latipes , ,บินคอแดง ) มีผู้แทนทั้ง 3 วงศ์ย่อย cry1 . การ evolutionarilyอซาโมอาห์ กียาน โบราณ ( หน้ามารินุส ) มีเพียงหนึ่ง homolog ของร้องปลาซีลาแคนท์ ( L . chalumnae ) และสาม ในขณะที่ evolutionarily น้องteleosts มีหลายสามหรือมากกว่า ) สำเนา cryptochromes .ชนิดที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด อาจมีสมาชิกที่แตกต่างกันของร้องไห้ paralogs .ตัวอย่างเช่นในวงศ์ปลาปักเป้าฟันสี่ซี่ ต. nigroviridis มี 2 ฉบับของ cry2 และสอง cry1 ในขณะที่ ต. rubripes มีเพียงหนึ่งสำเนาของcry2 แต่สามโฮโมลอกส์ของ cry1 .