The present work was conducted to e

The present work was conducted to evaluate AFLP (Amplified Fragment Length
Polymorphism) and SSR (Simple Sequence Repeat) marker systems for their ability to
detect genetic diversity within a set of 29 common bean accessions spanning both the
Andean and Mesoamerican gene pools and to compare the efficiency of these two marker
types in the classification of accessions according to the gene pools of origin. The ten
AFLP primer combinations produced 112 polymorphic bands, while 14 SSR primer pairs
generated 100 polymorphic bands. Almost two-fold higher value of expected heterozygosity
was calculated for SSR (0.63) than for AFLP (0.32). As the result of a higher multiplex ratio
component (11.20), higher marker index value was observed for AFLP (3.56) in
comparison to SSR (0.63). The higher level of polymorphism detected by SSR markers has
contributed to the lower genetic similarity estimates based on SSR markers (mean 0.25) as
compared to AFLP markers (mean 0.88). The dendrograms generated with hierarchical
UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic mean) cluster analysis of the
Jaccard’s similarity coefficient matrices revealed two major clusters, which were identified

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การทำงานปัจจุบันได้ดำเนินการประเมิน AFLP ขยายส่วนยาวโพลิมอร์ฟิซึม) และระบบเครื่องหมาย SSR (เรื่องลำดับซ้ำ) สำหรับความสามารถในการตรวจสอบความหลากหลายทางพันธุกรรมภายในชุดของ 29 ทั่วไปถั่ว accessions รัฐทั้งสองกลุ่มยีน Andean และในอเมริกากลางและ เพื่อเปรียบเทียบประสิทธิภาพของเครื่องหมายเหล่านี้สองชนิดในการจัดประเภทของ accessions ตามกลุ่มยีนของต้นกำเนิด สิบชุดรองพื้น AFLP ผลิต 112 วง polymorphic ในขณะที่คู่รองพื้น SSR 14สร้างวง polymorphic 100 ค่าสูงเกือบสองเท่าของคาด heterozygosityมีคำนวณสำหรับ SSR (0.63) กว่าสำหรับ AFLP ($ 0.32) เป็นผลลัพธ์ของอัตราส่วน multiplex สูงกว่าส่วนประกอบ (11.20), เครื่องหมายดัชนีค่าถูกตรวจสอบสำหรับ AFLP (3.56) ในเปรียบเทียบกับ SSR (0.63) ตรวจพบ โดยเครื่องหมาย SSR โพลิมอร์ฟิซึมในระดับสูงขึ้นได้ความคล้ายคลึงกันทางพันธุกรรมหรอกให้ต่ำลงประเมินตามเครื่องหมาย SSR (หมายถึง 0.25) เป็นเมื่อเทียบกับเครื่องหมาย AFLP ที่ (หมายถึง 0.88) Dendrograms ที่สร้างขึ้น ด้วยตามลำดับชั้นUPGMA (Unweighted คู่กลุ่มวิธีกับคณิต) คลัสเตอร์วิเคราะห์การเมทริกซ์สัมประสิทธิ์ความคล้ายของ Jaccard เปิดเผยคลัสเตอร์หลักสอง ซึ่งระบุ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การทำงานในปัจจุบันได้ดำเนินการในการประเมิน AFLP (ความยาวส่วนขยาย
Polymorphism) และ SSR (ลำดับที่เรียบง่ายซ้ำ)
ระบบเครื่องหมายความสามารถในการตรวจสอบความหลากหลายทางพันธุกรรมภายในชุดของ29
สายถั่วแขกทอดทั้งแอนเดียนและสระว่ายน้ำของยีนMesoamerican และเพื่อเปรียบเทียบ
ประสิทธิภาพของทั้งสองเครื่องหมายชนิดในการจำแนกประเภทของสายตามสระว่ายน้ำของยีนของแหล่งกำเนิด สิบ
AFLP ไพรเมอร์ที่ผลิตรวมกัน 112 วงดนตรีที่ polymorphic ในขณะที่ 14 SSR
คู่ไพรเมอร์ที่สร้าง100 วงดนตรีที่ polymorphic เกือบสองเท่าของมูลค่าที่สูงกว่าคาด heterozygosity
ที่คำนวณได้สำหรับ SSR (0.63) กว่า AFLP (0.32) อันเป็นผลมาจากอัตราที่สูงขึ้นหลายส่วนประกอบ (11.20) ค่าดัชนีที่สูงขึ้นเครื่องหมายเป็นที่สังเกตสำหรับ AFLP (3.56) ในการเปรียบเทียบกับSSR (0.63) ระดับที่สูงขึ้นของความแตกต่างที่ตรวจพบโดยเครื่องหมาย SSR มีส่วนร่วมในการที่ต่ำกว่าการประมาณการทางพันธุกรรมคล้ายคลึงกันขึ้นอยู่กับเครื่องหมาย SSR (ค่าเฉลี่ย 0.25) ขณะที่เมื่อเทียบกับเครื่องหมายAFLP (ค่าเฉลี่ย 0.88) dendrograms สร้างขึ้นด้วยลำดับชั้นUPGMA (ชั่งคู่กลุ่มกับวิธีเลขคณิตหมายความว่า) การวิเคราะห์กลุ่มของการฝึกอบรมค่าสัมประสิทธิ์ความคล้ายคลึงกันของJaccard เปิดเผยสองกลุ่มใหญ่ซึ่งถูกระบุว่า

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อประเมิน AFLP ( fragment length polymorphism ของ SSR (
) และทำซ้ำลำดับง่าย ) เครื่องหมายระบบความสามารถในการตรวจสอบความหลากหลายทางพันธุกรรมภายใน
ชุด 29 พบถั่วทอดทั้งแถบแอนเดียนและหอมกรุ่น
ยีนสระ และเพื่อเปรียบเทียบประสิทธิภาพของทั้งสองเครื่องหมาย
ประเภทในการจำแนกสายพันธุ์ตามที่ยีนพูลของที่มา สิบ
เทคนิคผสมรองพื้นผลิต 112 เกิดแถบดีเอ็นเอไพรเมอร์คู่ในขณะที่ 14 SSR
สร้างจำนวน 100 วง เกือบสองเท่าสูงกว่าค่าคาดการณ์เฉพาะที่
ถูกคำนวณสำหรับ SSR ( 0.63 ) กว่าเอเอฟ ( 0.32 ) ผลของอัตราส่วนที่สูง multiplex
ส่วนประกอบ ( 11.20 )เครื่องหมายสูงกว่าค่าดัชนีเป็นสังเกตสำหรับเทคนิค AFLP ( 3.56 )
เปรียบเทียบกับ SSR ( 0.63 ) ระดับที่สูงขึ้นของ polymorphism พบเครื่องหมาย SSR มี
ส่วนเพื่อลดประมาณการตามเครื่องหมาย SSR ความเหมือนทางพันธุกรรม ( 0.25 )
เมื่อเทียบกับเครื่องหมาย AFLP ( 0.88 ) ที่สร้างขึ้นด้วย
dendrograms ลำดับชั้น( วิธี UPGMA พบกลุ่มคู่กับค่าเฉลี่ยถ่วงน้ำหนัก ) การวิเคราะห์การเกาะกลุ่มของ
Jaccard ของเมทริกซ์สัมประสิทธิ์ความเหมือนพบสองกลุ่มหลักที่ระบุ