Daphnia and arthropod phylogenyThe

Daphnia and arthropod phylogeny
The D. pulex genome also has the potential to contribute to resolving long-standing debates on arthropod phylogeny. Current views of arthropod phylogenetic relationships are based mainly on two types of datasets - molecular genetic data and morphological characters - and this has led to partly contradictory concepts of arthropod phylogeny. There is now almost universal agreement-that arthropods derive from a common ancestor, and that crustaceans and insects are sister groups [13]. However, some issues of arthropod relationships remain controversial, for example the question of whether insects, crustaceans and myriapods form a monophyletic-group. Crustaceans show the greatest diversity of body organization and development among arthropods [14] and therefore the phylogenetic relationships within the crustaceans are far from being resolved. Several morphological and molecular studies have questioned the monophyly of crustaceans, and either Branchiopoda (such as Daphnia) or Malacostraca (lobster, shrimps) has been hypothesized to be the sister group to insects [15]. Some recent molecular analyses suggest a sister group relationship of myriapods (millipedes) and chelicerates (spiders) [16]. Interestingly, this suggestion is supported by recent morphological and molecular studies on the development of the nervous system that reveal a surprising degree of similarity between myriapods and chelicerates [17,18]. The morphological support for an insect-crustacean sister-group relationship is mainly based on the comparative analysis of neural characters in higher crustaceans (malacostracans) and insects. For example, in both insects and malacostracans, stem-cell-like neuroblasts have been detected that divide asymmetrically to generate the cells that contribute to the nervous system [14]. But are these neural characters representative of all crustacean groups? Are homologous genes required for the development and the function of the nervous system? With the availability of a branchiopod genome and the development of genetic tools for Daphnia these questions can now be addressed.

Furthermore, using genome sequences of a wide range of organisms, the origin and evolution of neural signaling pathways can be traced, which will broaden our understanding of the evolution of nervous systems. The neurotrophin signaling pathway plays a role in neural development, regeneration and neural plasticity in mammals. Analyzing the Daphnia genome, Wilson [11] shows for the first time that a neurotrophin and both a tyrosine receptor kinase (Trk) and a p75-type neurotrophin-receptor (p75NTR) are present in a protostome, indicating that this pathway existed in the last common ancestor of protostomes and deuterostomes.

To conclude, the initial exploration of the D. pulex genome outlined above proves that with the availability of the genome sequence Daphnia research has entered a new era. New and long-standing questions in ecology and evolution can be addressed and it may finally be possible to link evolutionary and environmental adaptations to the underlying genetic processes.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Phylogeny daphnia และสัตว์ขาปล้องกลุ่ม D. pulex ยังมีศักยภาพในการนำไปสู่การแก้ไขดำเนินยาวนานบน phylogeny สัตว์ขาปล่อง มุมมองปัจจุบันของสัตว์ขาปล้อง phylogenetic ความสัมพันธ์ขึ้นอยู่กับสองชนิด datasets -ข้อมูลทางพันธุกรรมระดับโมเลกุลและอักขระของ - ส่วนใหญ่ และมีผลบางส่วนขัดแย้งกับแนวคิดของสัตว์ขาปล่อง phylogeny ขณะนี้มีข้อตกลงสากลเกือบ-ว่า arthropods ที่สืบทอดมาจากบรรพบุรุษร่วมกัน และที่พบ และแมลงมีน้องกลุ่ม [13] อย่างไรก็ตาม บางประเด็นของความสัมพันธ์ของสัตว์ขาปล่องยังคงแย้ง ตัวอย่างคำถามที่ว่าแมลง ครัสเตเชีย และ myriapods รูปแบบ monophyletic-กลุ่ม พบแสดงหลากหลายที่ตัวองค์กรและพัฒนาระหว่าง arthropods [14] และดังนั้น ความสัมพันธ์ของ phylogenetic พบมีจากการแก้ไข ศึกษาสัณฐาน และโมเลกุลหลายได้สอบสวน monophyly ของครัสเตเชีย และ Branchiopoda (เช่น Daphnia) หรือ Malacostraca (กุ้ง กุ้ง) ได้ถูกตั้งสมมติฐานว่าจะ เครือกลุ่มกับแมลง [15] วิเคราะห์ระดับโมเลกุลบางล่าสุดแนะนำพี่น้องกลุ่มสัมพันธ์ myriapods (millipedes) และ chelicerates (แมงมุม) [16] เป็นเรื่องน่าสนใจ แนะนำสนับสนุน โดยสัณฐาน และโมเลกุลการศึกษาล่าสุดในการพัฒนาของระบบประสาทที่เปิดเผยตัวประหลาดใจของความคล้ายคลึงกันระหว่าง myriapods และ chelicerates [17,18] การสนับสนุนของสำหรับความสัมพันธ์พี่น้องกลุ่มครัสเตเชียนแมลงส่วนใหญ่อยู่กับการวิเคราะห์เปรียบเทียบตัวประสาทสูงครัสเตเชีย (malacostracans) และแมลง ตัวอย่าง ทั้งแมลงและ malacostracans, neuroblasts เช่นสเต็มเซลล์ได้พบว่าแบ่ง asymmetrically ในการสร้างเซลล์ที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาท [14] แต่เป็นตัวแทนของกลุ่มครัสเตเชียนทั้งหมดอักขระเหล่านี้ประสาท มียีน homologous ที่จำเป็นสำหรับการพัฒนาและการทำงานของระบบประสาทหรือไม่ ด้วยความพร้อมของกลุ่ม branchiopod และการพัฒนาเครื่องมือทางพันธุกรรมสำหรับ Daphnia คำถามเหล่านี้สามารถมีอยู่ในขณะนี้นอกจากนี้ ใช้จีโนมลำดับของสิ่งมีชีวิตที่หลากหลาย การกำเนิดและวิวัฒนาการของมนต์ตามปกติประสาทสามารถติดตาม ซึ่งจะขยายความเข้าใจวิวัฒนาการของระบบประสาทของเรา Neurotrophin สัญญาณทางเดินเล่นบทบาทในการพัฒนาประสาท ฟื้นฟู และ plasticity ประสาทในการเลี้ยงลูกด้วยนม วิเคราะห์จีโนม Daphnia, Wilson [11] แสดงเป็นครั้งแรกว่า neurotrophin การและทั้ง kinase เป็นตัวรับ tyrosine (Trk) และ p75-ชนิด neurotrophin-ตัวรับ (p75NTR) ใน protostome แสดงว่า ทางเดินนี้อยู่ในบรรพบุรุษร่วมสุดท้าย protostomes และ deuterostomesเพื่อสรุป สำรวจเบื้องต้นของจีโนม D. pulex ที่อธิบายไว้ข้างต้นพิสูจน์ให้เห็นว่า มีความพร้อมของกลุ่มวิจัย Daphnia มีป้อนลำดับยุคใหม่ สามารถส่งคำถามใหม่ และยืนยาวในนิเวศวิทยาและวิวัฒนาการ และสุดท้ายอาจไปท้องวิวัฒนาการ และสิ่งแวดล้อมเชื่อมโยงกับกระบวนการทางพันธุกรรมต้นแบบ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

แดฟเนียและเชื้อชาติ arthropod
จีโนมพูเล็ก D. ยังมีศักยภาพที่จะนำไปสู่การแก้ปัญหาการอภิปรายยาวนานใน arthropod เชื้อชาติ มุมมองในปัจจุบันของความสัมพันธ์ phylogenetic arthropod จะขึ้นอยู่ส่วนใหญ่ในสองประเภทของชุดข้อมูล - ข้อมูลทางพันธุกรรมระดับโมเลกุลและลักษณะทางสัณฐานวิทยา - และนี่ได้นำไปสู่แนวความคิดที่ขัดแย้งกันบางส่วนของ arthropod เชื้อชาติ ขณะนี้มีข้อตกลงที่เป็นสากลเกือบรพได้รับมาจากบรรพบุรุษร่วมกันและที่กุ้งและแมลงเป็นกลุ่มน้องสาว [13] แต่บางประเด็นของความสัมพันธ์ arthropod ยังคงถกเถียงกันเช่นคำถามที่ว่าแมลงกุ้งและ myriapods รูปแบบไฟย์เลติกลุ่ม กุ้งแสดงความหลากหลายขององค์กรที่ยิ่งใหญ่ที่สุดของร่างกายและการพัฒนาในหมู่รพ [14] และดังนั้นจึงวิวัฒนาการภายในกุ้งอยู่ห่างไกลจากการได้รับการแก้ไข หลายการศึกษาลักษณะทางสัณฐานวิทยาและชีวโมเลกุลได้สอบถาม monophyly ของกุ้งและทั้ง Branchiopoda (เช่นไรน้ำ) หรือ Malacostraca (กุ้ง, กุ้ง) ได้รับการตั้งสมมติฐานว่าจะเป็นกลุ่มสาวแมลง [15] บางคนวิเคราะห์โมเลกุลล่าสุดแสดงให้เห็นความสัมพันธ์ของน้องสาวของกลุ่ม myriapods (กิ้งกือ) และ chelicerates (เดอร์) [16] ที่น่าสนใจข้อเสนอแนะนี้ได้รับการสนับสนุนจากการศึกษาลักษณะทางสัณฐานวิทยาและชีวโมเลกุลที่ผ่านมาเกี่ยวกับการพัฒนาของระบบประสาทที่แสดงให้เห็นในระดับที่น่าแปลกใจของความคล้ายคลึงกันระหว่าง myriapods และ chelicerates [17,18] การสนับสนุนทางสัณฐานวิทยาสำหรับแมลงกุ้งความสัมพันธ์ของน้องสาวของกลุ่มเป็นไปตามหลักในการวิเคราะห์เปรียบเทียบของตัวละครประสาทในกุ้งที่สูงขึ้น (malacostracans) และแมลง ยกตัวอย่างเช่นในทั้งแมลงและ malacostracans, neuroblasts เซลล์ต้นกำเนิดเหมือนได้รับการตรวจพบว่าแบ่งไม่สมดุลในการสร้างเซลล์ที่นำไปสู่ระบบประสาท [14] แต่เป็นตัวละครประสาทเหล่านี้เป็นตัวแทนของกลุ่มกุ้งทั้งหมดหรือไม่ จะคล้ายคลึงกันยีนที่จำเป็นสำหรับการพัฒนาและการทำงานของระบบประสาท? ด้วยความพร้อมของจีโนม branchiopod และการพัฒนาเครื่องมือทางพันธุกรรมสำหรับแดฟเนียคำถามเหล่านี้สามารถได้รับการแก้ไข. นอกจากนี้ยังใช้ลำดับจีโนมของความหลากหลายของสิ่งมีชีวิตกำเนิดและวิวัฒนาการของเส้นทางการส่งสัญญาณประสาทสามารถตรวจสอบซึ่งจะขยายของเรา ความเข้าใจในวิวัฒนาการของระบบประสาท เส้นทางการส่งสัญญาณ neurotrophin มีบทบาทในการพัฒนาระบบประสาทฟื้นฟูและปั้นประสาทในสัตว์เลี้ยงลูกด้วย การวิเคราะห์จีโนมแดฟเนีย, วิลสัน [11] แสดงให้เห็นเป็นครั้งแรกว่า neurotrophin และทั้งสองไคเนสรับซายน์ (Trk) และ p75 ประเภท neurotrophin-รับ (p75NTR) ที่มีอยู่ใน protostome แสดงให้เห็นว่าทางเดินนี้อยู่ใน บรรพบุรุษร่วมสุดท้ายของ protostomes และ deuterostomes. เพื่อสรุปการสำรวจครั้งแรกของจีโนมพูเล็ก D. ระบุไว้ข้างต้นพิสูจน์ให้เห็นว่ามีความพร้อมของลำดับจีโนมวิจัยไรน้ำได้เข้าสู่ยุคใหม่ ใหม่และคำถามที่ยาวนานในนิเวศวิทยาและวิวัฒนาการสามารถ addressed และในที่สุดมันก็อาจเป็นไปได้ที่จะเชื่อมโยงการดัดแปลงวิวัฒนาการและสิ่งแวดล้อมเพื่อกระบวนการทางพันธุกรรมพื้นฐาน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สั่นสะเทือนดินระบบเชื้อชาติและพันธุกรรม D .
pulex ก็มีศักยภาพที่จะสนับสนุนการอภิปรายยาวนานบนดินระบบเชื้อชาติ . มุมมองปัจจุบันของสัตว์ขาปล้องชนิดความสัมพันธ์ตามหลักสองประเภทของข้อมูล - ข้อมูลตัวละคร - พันธุศาสตร์ระดับโมเลกุลและสัณฐานวิทยา และนี่ทำให้บางส่วนขัดแย้งแนวคิดของดินระบบเชื้อชาติ .ขณะนี้มีข้อตกลงสากลเกือบแมลงที่สืบทอดมาจากบรรพบุรุษ และ สัตว์และแมลงเป็นน้องสาวของกลุ่ม [ 13 ] อย่างไรก็ตาม ปัญหาบางอย่างของความสัมพันธ์ที่ดินยังคงแย้งเช่นคำถามว่า แมลง และสัตว์ myriapods แบบฟอร์มกลุ่ม monophyletic .นแสดงความหลากหลายที่ยิ่งใหญ่ที่สุดของร่างกายและพัฒนาองค์กรของสัตว์ขาปล้อง [ 14 ] และความสัมพันธ์ภายในกลุ่ม ซึ่งอยู่ห่างไกลจากการแก้ไข การศึกษาลักษณะทางสัณฐานวิทยาและโมเลกุลต่าง ๆ ได้ถาม monophyly น และทั้งใน ( เช่นสั่นสะเทือน ) หรือ Malacostraca ( กุ้งกุ้ง ) ได้รับการตั้งสมมติฐานเป็นพี่กลุ่มแมลง [ 15 ] การวิเคราะห์ระดับโมเลกุลบางส่วนล่าสุดแนะนำน้องกลุ่มความสัมพันธ์ของ myriapods ( กิ้งกือ ) และ chelicerates ( แมงมุม ) [ 16 ] น่าสนใจข้อเสนอแนะนี้ได้รับการสนับสนุนโดยล่าสุดทางโมเลกุลและการศึกษาการพัฒนาของระบบประสาท ที่เผยให้เห็นถึงความเหมือนและน่าแปลกใจของ myriapods chelicerates [ 17,18 ]การสนับสนุนทางสัณฐานวิทยาเป็นน้องสาวกลุ่มครัสเตเชียนแมลงความสัมพันธ์ตามหลักในการวิเคราะห์เปรียบเทียบของตัวละครมากกว่า ( malacostracans ประสาทในสัตว์และแมลง ตัวอย่างทั้งแมลงและ malacostracans สเต็มเซลล์แบบ neuroblasts ได้รับการตรวจพบว่า แบ่ง asymmetrically สร้างเซลล์ที่สนับสนุนระบบประสาท [ 14 ]แต่พวกนี้ประสาท ตัวแทนของกลุ่มครัสเตเชียนตัวละครทั้งหมด เป็นโฮโมโลกัสยีนที่จำเป็นสำหรับการพัฒนาและการทำงานของระบบประสาท ? ด้วยความพร้อมของแบรนคิโอพอดจีโนมและการพัฒนาเครื่องมือทางพันธุกรรมสำหรับสั่นสะเทือนคำถามเหล่านี้สามารถ addressed .

นอกจากนี้การลำดับจีโนมของหลากหลายของสิ่งมีชีวิตที่มาและวิวัฒนาการของการส่งสัญญาณทางประสาท สามารถติดตาม ซึ่งจะขยายความเข้าใจของเราของวิวัฒนาการของระบบประสาท การส่งสัญญาณทาง neurotrophin มีบทบาทในการพัฒนาระบบประสาท ฟื้นฟูระบบประสาทและพลาสติกในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม การวิเคราะห์จีโนม สั่นสะเทือน ,วิลสัน [ 11 ] แสดงให้เห็นเป็นครั้งแรกว่า neurotrophin ทั้งซีนและตัวรับไคเนส ( trk ) และ p75 ประเภท neurotrophin รีเซพเตอร์ ( p75ntr ) มีอยู่ในโพรโตสโตม ระบุว่า เส้นทางนี้มีอยู่ในบรรพบุรุษสุดท้ายของโปรโตสโตเมีย และดิวเทอโร ตเมีย

สรุปการสำรวจเบื้องต้นของ Dpulex จีโนมที่ระบุไว้ข้างต้นพิสูจน์ให้เห็นว่ามีความพร้อมของจีโนมลำดับสั่นสะเทือนการวิจัยได้ป้อนยุคใหม่ ใหม่และคำถามในทางนิเวศวิทยาและวิวัฒนาการของสิ่งมีชีวิต สามารถระบุ และท้ายที่สุดอาจเป็นไปได้ที่จะเชื่อมโยงวิวัฒนาการและสิ่งแวดล้อมเพื่อต้นแบบกระบวนการดัดแปลงทางพันธุกรรม .