Third the sequencing output is dire

Third the sequencing output is directly detected without the need for electrophoresis; base interrogation is performed cyclically and in parallel. The enormous numbers of reads generated by NGS enabled the sequencing of entire genomes at an unprecedented speed. However, a drawback of NGS technologies was their relatively short reads. This made genome assembly more difficult and required the development of novel alignment algorithms (see below). The first NGS technology to be released in 2005 was the pyrosequencing method by 454 Life Sciences (now Roche) [5]. The 454 Genome Sequencer generated about 200 000 reads (20 Mb) of 110 base-pairs (bp). One year later, the Solexa/Illumina sequencing platform was commercialized (Illumina acquired Solexa in 2007). The third technology to be released was Sequencing by Oligo Ligation Detection (SOLiD) by Applied Biosystems (now Life Technologies) in 2007 [6]. The Illumina and SOLiD sequencers generated much larger numbers of reads than 454 (30 and 100 million reads, respectively) but the reads produced were only 35 bp long. In 2010, Ion Torrent (now Life Technologies) released the Peronal Genome Machine (PGM). This system was developed by Jonathan Rothberg, the founder of 454, and resembles the 454 system. An important difference is that the PGM uses semiconductor technology and does not rely on the optical detection of incorporated nucleotides using fluorescence and camera scanning. This resulted in higher speed, lower cost, and smaller instrument size. The first PGM generated up to 270 Mb of sequence with up to 100 nt reads; slightly shorter than those produced by 454. For a detailed description of these major NGS technologies, see [7,8]; a quick overview is presented in Box 1.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สาม ลำดับผลลัพธ์โดยตรงตรวจพบโดยไม่ต้อง electrophoresis ทำการสอบปากคำฐาน cyclically และพร้อมกัน จำนวนผู้อ่านที่สร้างขึ้น โดย NGS มหาศาลใช้ลำดับของ genomes ทั้งที่ความเร็วเป็นประวัติการณ์ อย่างไรก็ตาม คืนเงินเทคโนโลยี NGS ได้อ่านของพวกเขาค่อนข้างสั้น นี้ทำแอสเซมบลีจีโนมยากขึ้น และต้องการพัฒนาอัลกอริทึมจัดนวนิยาย (ดูด้านล่าง) เทคโนโลยี NGS แรกจะออกในปี 2005 ถูกวิธี pyrosequencing โดย 454 วิทยาศาสตร์สุขภาพ (ขณะนี้โรช) [5] Sequencer จีโนม 454 สร้างประมาณ 200 000 อ่าน (20 Mb) 110 ฐานคู่ (bp) หนึ่งปีต่อมา แพลตฟอร์ม Solexa/Illumina ลำดับมี commercialized (Illumina มา Solexa ในปี 2007) เทคโนโลยีที่สามที่จะออกมีลำดับเบส ด้วย Oligo ไข่ตรวจ (ของแข็ง) โดย Biosystems ใช้ (ตอนนี้ชีวิตเทคโนโลยี) ในปี 2007 [6] Sequencers Illumina และทึบสร้างมากใหญ่จำนวนอ่านกว่า 454 (30 และ 100 ล้านอ่าน ตามลำดับ) แต่อ่านที่ผลิต เพียง 35 ยาว bp ในปี 2553, Torrent ไอออน (ตอนนี้ชีวิตเทคโนโลยี) ออกเครื่องกลุ่ม Peronal (PGM) ระบบนี้ถูกพัฒนา โดย Jonathan Rothberg, 454 ผู้ก่อตั้ง และมีลักษณะระบบ 454 ความแตกต่างคือ PGM การใช้เทคโนโลยีสารกึ่งตัวนำ และไม่ต้องอาศัยการตรวจพบแสง fluorescence และกล้องสแกนนิวคลีโอไทด์ที่เรท ส่งผลให้ความเร็วสูง ต้นทุนต่ำ และเครื่องมือขนาดเล็ก PGM แรกสร้างขึ้นสูงสุด 100 nt อ่าน ถึง 270 Mb เล็กน้อยสั้นกว่าผลิต โดย 454 สำหรับคำอธิบายโดยละเอียดของเทคโนโลยีเหล่านี้ NGS สำคัญ ดู [7,8]; การนำเสนอใน 1 กล่อง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ประการที่สามการส่งออกลำดับที่ตรวจพบได้โดยตรงโดยไม่ต้องใช้อิเล็ก; การสอบสวนจะดำเนินการฐานวนและในแบบคู่ขนาน ตัวเลขมหาศาลของคนอ่านที่เกิดจากการใช้งาน NGS ลำดับของจีโนมทั้งหมดที่ความเร็วเป็นประวัติการณ์ แต่ข้อเสียเปรียบของเทคโนโลยี NGS ค่อนข้างสั้นของพวกเขาอ่าน นี่เองที่ทำให้การชุมนุมจีโนมที่ยากลำบากมากขึ้นและจำเป็นต้องมีการพัฒนาอัลกอริทึมการจัดตำแหน่งนวนิยาย (ดูด้านล่าง) เทคโนโลยี NGS แรกที่จะได้รับการปล่อยตัวในปี 2005 เป็นวิธีการ pyrosequencing โดย 454 วิทยาศาสตร์สิ่งมีชีวิต (ตอนนี้โรช) [5] 454 จีโนมซีเควนสร้างประมาณ 200 000 อ่าน (20 MB) 110 คู่ฐาน (bp) หนึ่งปีต่อมา Solexa / Illumina แพลตฟอร์มลำดับถูกในเชิงพาณิชย์ (Illumina Solexa ได้มาในปี 2007) เทคโนโลยีสามที่จะได้รับการปล่อยตัวเป็นลำดับโดย Oligo Ligation ตรวจจับ (ของแข็ง) โดย Applied Biosystems (ตอนนี้ไลฟ์เทคโนโลยีส์) ในปี 2007 [6] Illumina และ sequencers ที่มั่นคงสร้างตัวเลขที่มีขนาดใหญ่ของการอ่านกว่า 454 (30 และ 100 ล้านอ่านตามลำดับ) แต่อ่านที่ผลิตได้เพียง 35 bp ยาว ในปี 2010, Ion Torrent (ตอนนี้ไลฟ์เทคโนโลยีส์) ออก Peronal เครื่องจีโนม (PGM) ระบบนี้ได้รับการพัฒนาโดยโจนาธาน Rothberg ผู้ก่อตั้ง 454 และคล้ายกับระบบ 454 ความแตกต่างที่สำคัญคือ PGM ใช้เทคโนโลยีเซมิคอนดักเตอร์และไม่พึ่งพาการตรวจจับแสงของนิวคลีโอนิติบุคคลที่จัดตั้งขึ้นโดยใช้การเรืองแสงและกล้องสแกน นี้ส่งผลให้ความเร็วสูงกว่าค่าใช้จ่ายที่ต่ำกว่าและขนาดเครื่องมือที่มีขนาดเล็ก แรก PGM สร้างถึง 270 Mb ของลำดับที่มีถึง 100 NT อ่าน; สั้นกว่าเล็กน้อยที่ผลิตโดย 454. สำหรับรายละเอียดของเทคโนโลยีเหล่านี้ NGS ใหญ่เห็น [7,8]; ภาพรวมอย่างรวดเร็วจะนำเสนอในกรอบที่ 1

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ประการที่สาม การตรวจพบผลผลิตโดยตรงโดยไม่ต้องสอบสวน ฐานปฏิบัติ cyclically เรส ; และในแบบคู่ขนาน ตัวเลขมหาศาลของคนอ่านที่สร้างขึ้นโดยใช้ลำดับจีโนมทั้งหมดของแทนด้วยความเร็วเป็นประวัติการณ์ อย่างไรก็ตามเทคโนโลยีข้อเสียเปรียบของเทค คือค่อนข้างสั้นและอ่านนี้ทำให้การประกอบจีโนมที่ยากกว่า และต้องพัฒนาขั้นตอนวิธีการใหม่ ( ดูด้านล่าง ) เทคเทคโนโลยีแรกที่จะออกในปี 2005 เป็นไพโรซีเควนซิงวิธีชีวิต 454 วิทยาศาสตร์ ( ตอนนี้ โรช ) [ 5 ] 454 ลำดับจีโนมสร้างขึ้นประมาณ 200 000 อ่าน ( 20 MB ) 110 คู่เบส ( BP ) หนึ่งปีต่อมาการ solexa / Illumina ลำดับแพลตฟอร์มที่เป็นเชิงพาณิชย์ ( Illumina ได้รับ solexa ในปี 2007 ) เทคโนโลยีที่สามที่จะออกมาเป็นลำดับ โดยโอลิโก Ligation ตรวจจับ ( แข็ง ) โดยประยุกต์ Biosystems ( ตอนนี้ชีวิตเทคโนโลยี ) ในปี 2007 [ 6 ] ที่สร้างขึ้นมีขนาดใหญ่มาก และซีเควนเซอร์ Illumina แข็งจำนวนคนอ่านกว่า 454 ( 30 และ 100 ล้านอ่านว่าตามลำดับ ) แต่อ่านผลิตได้เพียง 35 BP นาน ใน 2010 , Ion Torrent ( ตอนนี้ชีวิต Technologies ) เปิดตัวเครื่อง peronal จีโนม ( PGM ) ระบบนี้ถูกพัฒนาโดยโจนาธาน รอธเบิร์ก ผู้ก่อตั้ง และคล้ายกับ 454 454 , ระบบแตกต่างที่สำคัญคือว่า PGM ใช้เทคโนโลยีสารกึ่งตัวนำและไม่พึ่งพาตรวจจับแสงของนิวคลีโอไทด์โดยใช้การรวมและการสแกนของกล้อง ส่งผลให้ความเร็วสูงกว่าต้นทุนที่ต่ำและขนาดเล็ก เครื่องมือขนาด และ PGM ก่อนสร้างถึง 270 MB ของลำดับถึง 100 NT อ่าน สั้นกว่าเล็กน้อยกว่าที่ผลิตโดย 454 .สำหรับรายละเอียดของเหล่านี้สาขาเทคเทคโนโลยี เห็น [ 7 , 8 ] ; ภาพรวมอย่างรวดเร็วจะแสดงในกล่อง 1 .