Gene Expression Omnibus: NCBI gene

Gene Expression Omnibus: NCBI gene expression and hybridization array data repository
Ron Edgar, Michael Domrachev and Alex E. Lash*
+ Author Affiliations

National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, National Institutes of Health, Lister Hill Center, 8600 Rockville Pike, Bethesda, MD 20894, USA
Abstract

The Gene Expression Omnibus (GEO) project was initiated in response to the growing demand for a public repository for high-throughput gene expression data. GEO provides a flexible and open design that facilitates submission, storage and retrieval of heterogeneous data sets from high-throughput gene expression and genomic hybridization experiments. GEO is not intended to replace in house gene expression databases that benefit from coherent data sets, and which are constructed to facilitate a particular analytic method, but rather complement these by acting as a tertiary, central data distribution hub. The three central data entities of GEO are platforms, samples and series, and were designed with gene expression and genomic hybridization experiments in mind. A platform is, essentially, a list of probes that define what set of molecules may be detected. A sample describes the set of molecules that are being probed and references a single platform used to generate its molecular abundance data. A series organizes samples into the meaningful data sets which make up an experiment. The GEO repository is publicly accessible through the World Wide Web at http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ยีนนิพจน์ Omnibus: NCBI ยีนนิพจน์และ hybridization เรย์ข้อมูลเก็บRon Edgar, Michael Domrachev และ Alex E. ขนตา *+ เข้าสังกัดผู้เขียนศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพ ห้องสมุดแพทย์แห่งชาติ สถาบันแห่งชาติสุขภาพ ศูนย์เขาลิสเตอร์ 8600 ร็อควิลล์ จน เบเทสดา MD 20894 สหรัฐอเมริกาบทคัดย่อโครงการ Omnibus นิพจน์ยีน (แก้ว) เป็นจุดเริ่มต้นในการตอบสนองความต้องการเติบโตเก็บสาธารณะสำหรับข้อมูลนิพจน์ยีนอัตราความเร็วสูง แก้วแสดงออกแบบเปิด และยืดหยุ่นที่อำนวยความสะดวกส่ง จัดเก็บ และเรียกชุดข้อมูลที่แตกต่างกันจากอัตราความเร็วสูงยีนและ genomic hybridization ทดลอง แก้วไม่ได้มีวัตถุประสงค์เพื่อแทนที่ในฐานข้อมูลนิพจน์ยีนเฮาส์ที่รับประโยชน์จากชุดข้อมูล coherent และที่สร้างด้วยวิธีระบบการอำนวยความสะดวก แต่แทนที่จะ เติมเต็มโดยทำหน้าที่เป็นศูนย์กลางการกระจายข้อมูลระดับมหาวิทยาลัย เซ็นทรัล เอนทิตีข้อมูลกลางสามของแก้ว ใจแพลตฟอร์ม ตัวอย่างชุด และถูกออกแบบ ด้วยยีนและทดลอง genomic hybridization ในจิตใจ แพลตฟอร์มคือ เป็น รายการคลิปปากตะเข้ที่กำหนดชุดใดของโมเลกุลอาจพบ ตัวอย่างอธิบายชุดของโมเลกุลที่มีการพิสูจน์ และอ้างอิงเป็นเวทีเดียวที่ใช้ในการสร้างข้อมูลความอุดมสมบูรณ์ระดับโมเลกุล ชุดจัดตัวอย่างลงในชุดข้อมูลมีความหมายซึ่งทำให้ค่าการทดลอง เก็บทางภูมิศาสตร์เป็นสาธารณะสามารถเข้าถึงได้ผ่านทางเวิลด์ไวด์เว็บที่ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การแสดงออกของยีนโดยสาร: NCBI การแสดงออกของยีนและอาเรย์ไฮบริเก็บข้อมูล
รอนเอ็ดการ์, ไมเคิล Domrachev และอเล็กซ์อีหวด *
+ เขียน บริษัท ในเครือแห่งชาติศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพ, ห้องสมุดแห่งชาติของแพทย์สถาบันสุขภาพแห่งชาติ, ศูนย์ Lister ฮิลล์ 8600 Rockville หอก Bethesda, MD 20894, USA บทคัดย่อการแสดงออกของยีนรถโดยสาร (GEO) โครงการที่ริเริ่มในการตอบสนองความต้องการที่เพิ่มขึ้นสำหรับพื้นที่เก็บข้อมูลสาธารณะสูง throughput ข้อมูลการแสดงออกของยีน GEO มีการออกแบบที่มีความยืดหยุ่นและเปิดที่อำนวยความสะดวกในการส่งการเก็บรักษาและการดึงของชุดข้อมูลที่แตกต่างจากการแสดงออกของยีนสูง throughput และการทดลองผสมข้ามพันธุ์จีโนม GEO ไม่ได้มีวัตถุประสงค์เพื่อแทนที่ในฐานข้อมูลของยีนบ้านนิพจน์ที่ได้รับประโยชน์จากชุดข้อมูลที่สอดคล้องกันและที่ถูกสร้างขึ้นเพื่ออำนวยความสะดวกวิธีการวิเคราะห์โดยเฉพาะอย่างยิ่ง แต่เสริมเหล่านี้โดยทำหน้าที่เป็นตติยข้อมูลกลางศูนย์กลางการกระจาย สามหน่วยงานข้อมูลกลางของ GEO เป็นแพลตฟอร์มตัวอย่างและชุดและได้รับการออกแบบที่มีการแสดงออกของยีนและการทดลองผสมข้ามพันธุ์จีโนมในใจ แพลตฟอร์มที่เป็นหลักรายชื่อของยานสำรวจที่กำหนดสิ่งที่ตั้งของโมเลกุลอาจถูกตรวจพบ ตัวอย่างอธิบายชุดของโมเลกุลที่มีการการตรวจสอบและอ้างอิงแพลตฟอร์มเดียวที่ใช้ในการสร้างข้อมูลความอุดมสมบูรณ์โมเลกุล ชุดจัดตัวอย่างเป็นชุดข้อมูลที่มีความหมายที่ทำให้ค่าการทดสอบ พื้นที่เก็บข้อมูล GEO เป็นสาธารณชนสามารถเข้าถึงได้ผ่านทางเวิลด์ไวด์เว็บที่ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การแสดงออกของยีนแบบ : ncbi และเก็บข้อมูลชนิดอาร์เรย์
รอนเอ็ดการ์ไมเคิล domrachev และ Alex E *
เขียนขนตาเข้า

แห่งชาติศูนย์สารสนเทศ , ห้องสมุดการแพทย์แห่งชาติ สถาบันสุขภาพแห่งชาติ ศูนย์ ลิสเตอร์ ฮิลล์ , 8600 ร็อกวิลล์หอก , Bethesda , MD 20894 อเมริกา

บทคัดย่อการแสดงออกของยีนแบบ ( กอ ) โครงการได้ริเริ่มขึ้นเพื่อตอบสนองความต้องการเพิ่มขึ้นสำหรับข้อมูลสาธารณะเพื่อช่วยข้อมูลการแสดงออกของยีน . กอให้ยืดหยุ่น และเปิดโครงการที่ช่วยในการส่ง , จัดเก็บและค้นคืนข้อมูลชุดข้อมูลจากการแสดงออกของยีนและสารสกัดช่วยทดลอง .กอไม่ได้มีวัตถุประสงค์เพื่อแทนที่บ้านยีน ฐานข้อมูลที่ได้ประโยชน์จากชุดข้อมูลเชื่อมโยงกัน ซึ่งสร้างขึ้นเพื่อความสะดวก โดยเฉพาะ วิเคราะห์วิธีการ แต่เสริมเหล่านี้ โดยทำหน้าที่เป็นระบบศูนย์กลางข้อมูลกลาง ามกลางข้อมูลหน่วยงานของ GEO เป็นแพลตฟอร์ม , ตัวอย่างและชุดและการออกแบบด้วยการแสดงออกของยีน และการทดลองทำจีโนมในจิตใจ เป็นแพลตฟอร์มที่เป็นหลัก , รายชื่อวัดที่กำหนดสิ่งที่ชุดของโมเลกุลอาจจะตรวจพบ ตัวอย่างที่อธิบายถึงชุดของโมเลกุลที่ถูกตรวจสอบและอ้างอิงแพลตฟอร์มเดียวที่ใช้ในการสร้างโมเลกุลของความอุดมสมบูรณ์ของข้อมูลชุดจัดตัวอย่างลงในชุดข้อมูลที่มีความหมายซึ่งสร้างการทดลอง กอ กรุ เป็นเรื่องที่สาธารณชนสามารถเข้าถึงได้ผ่านทางเวิลด์ไวด์เว็บที่ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo .