We report the use of chemical deriv

We report the use of chemical derivatization with MALDI-MS/MS analysis for de novo sequence
analysis. Using three frequently used homology-based search algorithms, we were able to identify
more than 40 proteins from banana, a nonmodel plant with unsequenced genome. Furthermore, this
approach allowed the identification of different isoforms. We also observed that the identification score
obtained varied according to the position of the peptide sequences in the query using the MS-Blast
algorithm.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เรารายงานการใช้ derivatization เคมีกับวิเคราะห์ MALDI-MS/MS สำหรับลำดับ de novoวิเคราะห์ ใช้สามมักใช้อัลกอริทึมค้นหา homology เราไม่สามารถระบุโปรตีนมากกว่า 40 จากกล้วย พืช nonmodel กับกลุ่ม unsequenced นอกจากนี้ นี้วิธีอนุญาตให้ใช้รหัสของ isoforms แตกต่างกัน เรายังสังเกตว่า รหัสคะแนนได้รับแตกต่างกันตามตำแหน่งเพปไทด์ลำดับในแบบสอบถามที่ใช้ MS-ระเบิดอัลกอริทึมการ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เรารายงานการใช้สารเคมีที่มีการวิเคราะห์อนุพันธ์ MALDI-MS / MS สำหรับโนโวลำดับ
การวิเคราะห์ ใช้สามที่ใช้บ่อยอัลกอริทึมการค้นหาตามที่คล้ายคลึงกันเราก็สามารถที่จะระบุ
กว่า 40 โปรตีนจากกล้วยพืช nonmodel กับจีโนม unsequenced นอกจากนี้
วิธีการอนุญาตให้ใช้บัตรประจำตัวของไอโซฟอร์มที่แตกต่างกัน นอกจากนี้เรายังตั้งข้อสังเกตว่าคะแนนประชาชน
ที่ได้รับแตกต่างกันไปตามตำแหน่งของลำดับเปปไทด์ในแบบสอบถามโดยใช้ MS-ระเบิด
อัลกอริทึม

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เรารายงานใช้กับเคมีกับการวิเคราะห์ maldi-ms / MS สำหรับการวิเคราะห์โดยลำดับ
เดอ . ใช้สามตัวที่ใช้บ่อยใช้ขั้นตอนวิธีการค้นหา เราสามารถระบุ
40 กว่าโปรตีนจากกล้วย , พืช nonmodel กับ unsequenced จีโนม . นอกจากนี้ วิธีการนี้
อนุญาตตัวของไอโซฟอร์มที่แตกต่างกัน เรายังพบว่า การกำหนดคะแนน
ได้เปลี่ยนแปลงไปตามตำแหน่งของเปปไทด์ ลำดับในการใช้ MS ระเบิด
ขั้นตอนวิธี