unique sequences were annotated usi

unique sequences were annotated using BLAST based on sequence
similarity searches against public databases, including the NCBI Nt,
Nr, Uniprot/SwissProt, KEGG, and TAIR databases. A total of 25,473
(69.97%) unique sequences presented at least one significant match
in the above-mentioned sequence databases. An overview of the
numbers and percentages of the annotated unique sequences is
presented in Supplementary Table 2.
To functionally categorize the information in this EST pool, all
unigenes were characterized using GO analysis provided by the
TAIR database. A total of 21,023 unigenes were classified into 3
large categories and 45 subcategories based on sequence similarity
to known proteins in the TAIR GO database (Berardini et al., 2004).
In the cellular component group (19,860 unique sequences), unique
sequences related to the nucleus (16.7%), chloroplast (7.7%), plasma
membrane (7.4%), and cytosol (6.2%) were the well-represented categories
(Fig. 2A). A large number of hydrolases (9.0%), transferases
(8.7%), kinases (3.9%), and transporters (3.8%) were annotated to
the subgroups of the molecular function category (18,738 unique sequences),
which suggests that our study may allow the identification
of novel genes involved in secondary metabolite synthesis pathways
(Fig. 2B). Sequences related to several biological processes (19,449
unique sequences) such as protein metabolism(8.0%), developmental
processes (6.9%), and response to stress (6.3%) (Fig. 2C) were identified.
These GO annotations provide comprehensive information on
the functions of the identified transcripts of D. officinale.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ลำดับที่ไม่ซ้ำกันมีคำอธิบายประกอบโดยใช้ระเบิดตามลำดับค้นหาความคล้ายคลึงกับฐานข้อมูลสาธารณะ รวมทั้ง NCBI Ntฐานข้อมูลยางพารา Uniprot/SwissProt, KEGG และแท ทั้งหมด 25,473แสดงลำดับเฉพาะ (69.97%) สำคัญตรงในฐานข้อมูลดังกล่าวข้างลำดับ ภาพรวมของการจำนวนและเปอร์เซ็นต์ของลำดับเฉพาะใส่คำอธิบายประกอบแสดงในตารางที่ 2 ส่งเสริมการขายการจัดประเภทข้อมูลในสระนี้ EST หน้าที่ทั้งหมดunigenes มีลักษณะการใช้ไปวิเคราะห์โดยการฐานข้อมูลแท ทั้งหมด 21,023 unigenes ถูกแบ่งออกเป็น 3ใหญ่ประเภทและประเภทย่อย 45 ตามลำดับคล้ายกับโปรตีนที่รู้จักกันในฐานข้อมูลไปที่แท (Berardini et al. 2004)ในกลุ่มมือถือคอมโพเนนต์ (ลำดับเฉพาะ 19,860), เฉพาะลำดับที่เกี่ยวข้องกับนิวเคลียส (16.7%), คลอโรพลาสต์ (7.7%) พลาสม่าเมมเบรน (7.4%), และไซโตซอล (6.2%) ถูกประเภทเป็นตัวแทนห้อง(รูป 2A) จำนวนมากของ hydrolases (9.0%), transferases(8.7%), kinases (3.9%), และขน (3.8%) มีคำอธิบายประกอบเพื่อกลุ่มย่อยของประเภทฟังก์ชันโมเลกุล (18,738 เฉพาะลำดับ),ซึ่งแสดงให้เห็นว่า การศึกษาของเราอาจทำให้รหัสของยีนที่เกี่ยวข้องในทางสังเคราะห์รอง metabolite นวนิยาย(รูปที่ 2B) ลำดับที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการทางชีวภาพต่าง ๆ (19,449ลำดับที่ไม่ซ้ำกัน) เช่นโปรตีน metabolism(8.0%) พัฒนาการกระบวนการ (6.9%), และการตอบสนองต่อความเครียด (6.3%) (รูปที่ 2C) ระบุเหล่านี้ไปอธิบายประกอบให้ครอบคลุมข้อมูลการทำงานของหลักฐานระบุของ D. officinale

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ลำดับที่ไม่ซ้ำกันถูกอธิบายโดยใช้ระเบิดขึ้นอยู่กับลำดับ
การค้นหาความคล้ายคลึงกันกับฐานข้อมูลสาธารณะรวมทั้ง NCBI NT,
Nr, Uniprot / SwissProt, KEGG และฐานข้อมูล TAIR รวมเป็น 25,473
(69.97%) ลำดับที่ไม่ซ้ำกันนำเสนออย่างน้อยหนึ่งในการแข่งขันอย่างมีนัยสำคัญ
ในฐานข้อมูลลำดับดังกล่าวข้างต้น ภาพรวมของ
ตัวเลขและร้อยละของลำดับไม่ซ้ำกันข้อเขียนจะ
แสดงในตารางที่เสริม 2.
การจัดหมวดหมู่ข้อมูลหน้าที่ในสระว่ายน้ำ EST นี้ทั้งหมด
unigenes มีลักษณะโดยใช้การวิเคราะห์ไปให้โดย
ฐานข้อมูล TAIR รวม 21,023 unigenes ถูกแบ่งออกเป็น 3
ประเภทใหญ่และ 45 หมวดหมู่ย่อยขึ้นอยู่กับลำดับความคล้ายคลึงกัน
กับโปรตีนที่รู้จักกันในฐานข้อมูล TAIR GO (Berardini et al., 2004).
ในกลุ่มส่วนประกอบโทรศัพท์มือถือ (19,860 ลำดับไม่ซ้ำกัน) ที่ไม่ซ้ำกัน
ลำดับที่เกี่ยวข้องกับ นิวเคลียส (16.7%) chloroplast (7.7%), พลาสม่า
เมมเบรน (7.4%) และเซลล์ (6.2%) เป็นประเภทเดียวกับตัวแทน
(รูป. 2A) จำนวนมากของไฮโดร (9.0%) ราน
(8.7%), ไคเนสส์ (3.9%) และขนส่ง (3.8%) เป็นข้อเขียนเพื่อ
กลุ่มย่อยของหมวดหมู่ฟังก์ชั่นในระดับโมเลกุล (18,738 ลำดับไม่ซ้ำกัน)
ซึ่งแสดงให้เห็นว่าการศึกษาของเราอาจ อนุญาตให้ประชาชน
ของยีนนวนิยายที่เกี่ยวข้องในการเตรียมความพร้อมระดับการสังเคราะห์สารรอง
(รูป. 2B) ลำดับที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการทางชีวภาพหลายคน (19,449
ลำดับที่ไม่ซ้ำกัน) เช่นการเผาผลาญโปรตีน (8.0%) การพัฒนา
กระบวนการ (6.9%) และตอบสนองต่อความเครียด (6.3%) (รูป. 2C) ถูกระบุ.
เหล่านี้ไปคำอธิบายประกอบให้ข้อมูลที่ครอบคลุมเกี่ยวกับ
การทำงานของยีนที่ระบุของง officinale

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ลำดับไม่ซ้ำ แสดงการใช้ระเบิดตามลำดับความคล้ายคลึงกับฐานข้อมูลการค้นหาสาธารณะรวมทั้ง ncbi NT ,ยาง , uniprot / swissprot KEGG เป็นต้น , และฐานข้อมูลแต . รวม 25473( XX.XX% ) เฉพาะลำดับนำเสนออย่างน้อยหนึ่งที่สำคัญตรงในฐานข้อมูลลำดับดังกล่าวข้างต้น ภาพรวมของจำนวนและร้อยละของบันทึกย่อเฉพาะดังนี้คือนำเสนอในโต๊ะเสริม 2การจัดหมวดหมู่ข้อมูลตามหน้าที่ในสระว่ายน้ำและนี้unigenes มีลักษณะโดยใช้การวิเคราะห์ไปโดยฐานข้อมูลแต . รวม 21023 unigenes แบ่งออกเป็น 3ขนาดใหญ่ประเภท 45 หมวดหมู่ย่อยตามลำดับ คล้ายคลึงกันรู้จักโปรตีนในแตไปฐานข้อมูล ( berardini et al . , 2004 )ในกลุ่มชิ้นส่วนของเซลล์ ( 19860 ลำดับเฉพาะ ) เฉพาะยีนที่เกี่ยวข้องกับนิวเคลียส ( 16.7% ) คลอ ( 7.7% ) , พลาสมาเมมเบรน ( 7.4% ) และเข็มทิศ ( 6.2% ) คือ แสดงดี หมวดหมู่( รูปที่ 2A ) ตัวเลขขนาดใหญ่ของไฮโดรเลส ( 9.0% ) , ทราน เฟอร์เรส( 8.7% ) , ยา ( 3.9% ) และขนส่ง ( 3.8% ) แสดงถึงในกลุ่มย่อยของประเภทฟังก์ชันโมเลกุล ( 18738 ลำดับเฉพาะ )ซึ่งแสดงให้เห็นว่าการศึกษาของเราอาจอนุญาตให้ระบุของยีนที่เกี่ยวข้องในการสังเคราะห์เซลล์ไลท์ใหม่มัธยมศึกษา( รูปที่ 2B ) ลําดับที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการทางชีวภาพหลาย ( 19449ลำดับเฉพาะ ) เช่นการเผาผลาญโปรตีน ( 8.0% ) พัฒนาการกระบวนการ ( 6.9% ) , และการตอบสนองต่อความเครียด ( 6.3% ) ( รูปที่ 2 ) มีการระบุ .บันทึกย่อเหล่านี้ไปให้ข้อมูลอย่างละเอียดการทำงานของการระบุหลักฐานของ D . พะเยา .