Squid is used to generalize seafood

Squid is used to generalize seafood products manufactured from species belonging to the families Loliginidae and Ommastrephidae. The genus Loligo is one of the most representative and widely distributed groups of myopsid squids. In this study, a DNA barcoding approach was used to clarify phylogenetic relationship among 8 members of Loliginidae family. Muscle tissue samples of each species (Loligo bleekeri, L. forbesii, L. gahi, L. opalescens, L. pealei, L. plei, L. subulata and L. vulgaris) were taken from each specimen and stored at −20°C until DNA extraction. Mitochondrial COI gene was amplified using polymerase chain reaction with specific primers designed for Loligo genus. Amplified DNA's were purified and DNA sequencing reactions were conducted. Alignment of sequences and phylogenetic analyses were conducted using MEGA 5. Tamura-Nei model was used in computing pair-wise distances. Maximum likelihood method was used in construction of phylogenetic tree. Including all species studied, 67.98% of amplified region was found to be conserved among species. Rate of transitional pairs over transversional pairs (R) was calculated as 1.30. Average distance of evolutionary divergence between sequences was 0.178. In conclusion, DNA barcoding approach was successful in determining the phylogenetic relationship among members of genus Loligo at species level.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

หมึกใช้ทั่วไปผลิตภัณฑ์อาหารทะเลผลิตจากสายพันธุ์ของครอบครัว Loliginidae และ Ommastrephidae Loligo ตระกูลนี้เป็นหนึ่งในกลุ่มผู้แทนมากที่สุด และกระจายอย่างกว้างขวางของปลาหมึก myopsid ในการศึกษานี้ วิธีการซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอถูกใช้เพื่อชี้แจงความสัมพันธ์ phylogenetic 8 สมาชิกของครอบครัว Loliginidae ตัวอย่างเนื้อเยื่อกล้ามเนื้อแต่ละชนิด (Loligo bleekeri, L. forbesii, L. gahi, L. opalescens, L. pealei, L. plei, L. subulata และ L. vulgaris) ถูกนำมาจากแต่ละสิ่งส่งตรวจ และเก็บไว้ที่ −20 ° C จนสกัดดีเอ็นเอ ยีน COI mitochondrial ถูกขยายด้วยปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรสเฉพาะไพรเมอร์ที่ออกแบบมาสำหรับ Loligo สกุล ของดีเอ็นเอเอาต์ได้บริสุทธิ์ และปฏิกิริยาลำดับดีเอ็นเอได้ดำเนินการ จัดลำดับและวิเคราะห์ phylogenetic ได้ดำเนินการโดยใช้ 5 เมกกะพิกเซล รุ่น Tamura Nei ถูกใช้ในการคำนวณระยะทาง pair-wise วิธีความเป็นไปได้สูงสุดที่ใช้ในการก่อสร้างของ phylogenetic tree ทุกชนิดรวมทั้งศึกษา 67.98% ภาคเอาต์พบจะอยู่ในสปีชีส์ มีคำนวณอัตราของอีกรายการคู่ผ่านคู่ transversional (R) เป็น 1.30 ระยะทางเฉลี่ยของ divergence วิวัฒนาการระหว่างลำดับถูก 0.178 เบียดเบียน วิธีโค้ดีเอ็นเอได้สำเร็จในการกำหนดความสัมพันธ์ระหว่างสมาชิกของสกุล Loligo ระดับพันธุ์ phylogenetic

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ปลาหมึกจะใช้ในการพูดคุยผลิตภัณฑ์อาหารทะเลที่ผลิตจากสายพันธุ์ที่อยู่ในครอบครัวและ Ommastrephidae Loliginidae ประเภท Loligo เป็นหนึ่งในกลุ่มตัวแทนมากที่สุดและการกระจายอย่างกว้างขวางของ myopsid ปลาหมึก ในการศึกษานี้วิธีดีเอ็นเอบาร์โค้ดถูกใช้ในการอธิบายความสัมพันธ์ phylogenetic หมู่ 8 สมาชิกในครอบครัว Loliginidae ตัวอย่างเนื้อเยื่อของกล้ามเนื้อแต่ละชนิด (Loligo bleekeri, forbesii ลิตรลิตร gahi, opalescens ลิตร pealei ลิตรลิตร plei, subulata ลิตรลิตรและขิง) ถูกนำมาจากแต่ละชิ้นงานและเก็บไว้ที่ -20 ° C จนกว่าการสกัดดีเอ็นเอ ยีน COI ยลถูกขยายโดยใช้วิธี polymerase chain reaction กับไพรเมอร์เฉพาะที่ออกแบบมาสำหรับสกุล Loligo ดีเอ็นเอขยายกำลังบริสุทธิ์และปฏิกิริยาลำดับดีเอ็นเอได้ดำเนินการ การจัดลำดับและการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการได้ดำเนินการโดยใช้ MEGA 5. รูปแบบการทามูระ-Nei ถูกนำมาใช้ในการคำนวณระยะทางคู่ที่ชาญฉลาด วิธีโอกาสสูงสุดใช้ในการก่อสร้างของต้นไม้สายวิวัฒนาการ รวมทั้งทุกชนิดศึกษา 67.98% ของภูมิภาคขยายพบว่าได้รับการอนุรักษ์สายพันธุ์ในหมู่ อัตราการเปลี่ยนผ่านของคู่มากกว่าคู่ transversional (R) ที่คำนวณเป็น 1.30 ระยะทางเฉลี่ยของความแตกต่างระหว่างลำดับวิวัฒนาการเป็น 0.178 สรุปได้ว่าวิธีการดีเอ็นเอบาร์โค้ดก็ประสบความสำเร็จในการกำหนดความสัมพันธ์ระหว่างสมาชิกในสายวิวัฒนาการของพืชและสัตว์ Loligo ในระดับสปีชีส์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ปลาหมึกถูกใช้เพื่อหาผลิตภัณฑ์อาหารทะเลที่ผลิตจากสายพันธุ์ที่เป็นของครอบครัวโลลิจินิดี และ ommastrephidae . สกุล loligo เป็นหนึ่งในตัวแทนมากที่สุดและกระจายอย่างกว้างขวางของกลุ่ม myopsid ปลาหมึก การศึกษาดีเอ็นเอ barcoding วิธีการถูกใช้เพื่ออธิบายความสัมพันธ์ระหว่างสมาชิกในครอบครัว ซึ่ง 8 โลลิจินิดี .ตัวอย่างเนื้อเยื่อของกล้ามเนื้อแต่ละชนิด ( loligo บลีกเกอร์ ย forbesii gahi L L L L L opalescens pealei , ไพล , L และ L . subulata vulgaris ) ถ่ายจากแต่ละตัวอย่างที่เก็บรักษาที่อุณหภูมิ 20 ° C −ไปจนถึงการสกัดดีเอ็นเอ การขยายยีนผมโดยใช้วิธีพีซีอาร์ด้วยไพรเมอร์ที่ออกแบบมาเฉพาะสำหรับ loligo สกุลแถบดีเอ็นเอ มีการจัดลำดับดีเอ็นเอบริสุทธิ์และปฏิกิริยาการ การเรียงตัวของลำดับการใช้และการวิเคราะห์ phylogenetic ร็อค 5 ทามูระเนยแบบคู่ปัญญาที่ใช้ในการคำนวณระยะทาง วิธีความควรจะเป็นสูงสุดที่ใช้ในการสร้าง phylogenetic ต้นไม้ . รวมทุกสายพันธุ์ที่ศึกษา 67.98 % ของขยายเขตพบว่ามีการอนุรักษ์ของชนิดพันธุ์คะแนนของคู่เดียวจบ transversional คู่ ( R ) คือคำนวณเป็น 1.30 . เฉลี่ยระยะทางของความแตกต่างระหว่างลำดับวิวัฒนาการเป็น 0.178 . สรุป ดีเอ็นเอ barcoding วิธีการประสบความสำเร็จในการกำหนดความสัมพันธ์ต่างๆระหว่างสมาชิกประเภท loligo ที่ชนิดระดับ