Fig. 4. SM-22 structure analysis. A

Fig. 4. SM-22 structure analysis. A) Multialignment of LTPs and epitopes. Sequences refer to tomato LTP rSM-22, apple (EBI accession number Q9M5X7), peach (Pastorello et al.,
1999), plum (Pastorello et al., 2001), apricot (Pastorello et al., 2001). Multialignment was obtained by Clustal Omega (Sievers et al., 2011). Sequences with a light gray background
correspond to linear epitopes detected by using 15 amino acid long synthetic peptides (Borges et al., 2008). Underlined sequences correspond to linear epitopes detected by using 10
amino acid long synthetic peptides (Garcia-Casado et al., 2003). Vertical arrows indicate amino acids which have been identified as strictly required for allergenicity in peach fruits
(Garcia-Casado et al., 2003). Boxes indicate regions corresponding to possible conformational epitopes (Pacios et al., 2008). Tomato sequences with a dark gray background
correspond to conserved epitope regions. B) Localization of possible epitopes in the deduced structure of rLTP SM-22. The three-dimensional structure of rLTP SM-22, as deduced by
modeling using the peach LTP structure (PDB: 2ALG, chain A) as reference, is shown. The figures in the two panels are interconvertible by 180
rotation around a horizontal axis
passing through the center of the structure. In green, amino acids 17e24 (see Fig. 4A); in cyan, amino acids 37e51; in yellow, amino acids 64e69; in orange, amino acids 76e91. The
three amino acids identified as necessary for allergenicity in peach LTP are in red and indicated. (For interpretation of the references to colour in this figure legend, the reader is
referred to the web version of this article.)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

รูป 4. การวิเคราะห์โครงสร้าง SM-22 A) Multialignment ของ LTPS และ epitopes ลำดับหมายถึงมะเขือเทศ LTP RSM-22, แอปเปิ้ล (EBI เข้าจำนวน Q9M5X7), ลูกพีช (Pastorello et al.,
1999), พลัม (Pastorello et al., 2001), แอปริคอท (Pastorello et al., 2001) Multialignment ได้มาจาก Clustal โอเมก้า (Sievers et al., 2011) ลำดับที่มีพื้นหลังสีเทาอ่อนสอดคล้องกับ epitopes เชิงเส้นที่ตรวจพบโดยใช้กรดอะมิโนเปปไทด์สังเคราะห์ 15 ยาว (Borges et al., 2008)
ลำดับที่ขีดเส้นใต้ตรงกับ epitopes เชิงเส้นที่ตรวจพบโดยใช้ 10
กรดอะมิโนเปปไทด์สังเคราะห์ยาว (การ์เซีย Casado et al., 2003) ลูกศรแนวตั้งแสดงให้เห็นกรดอะมิโนที่ได้รับการระบุว่าเป็นที่ต้องการอย่างเคร่งครัดสำหรับภูมิแพ้ในผลไม้ลูกพีช
(การ์เซีย Casado et al., 2003) กล่องบ่งชี้ที่สอดคล้องกับภูมิภาค epitopes โครงสร้างที่เป็นไปได้ (Pacios et al., 2008) ลำดับมะเขือเทศที่มีพื้นหลังสีเทาเข้มสอดคล้องกับการอนุรักษ์ภูมิภาค epitope
B) รองรับหลายภาษาของ epitopes ที่เป็นไปได้ในโครงสร้างอนุมานของ rLTP SM-22 โครงสร้างสามมิติของ rLTP SM-22
เป็นอนุมานได้โดยการสร้างแบบจำลองโดยใช้โครงสร้างLTP พีช (PDB: 2ALG โซ่ A) เป็นข้อมูลอ้างอิงจะปรากฏ ตัวเลขในสองแผงมี interconvertible 180? การหมุนรอบแกนแนวนอนผ่านศูนย์ของโครงสร้าง
สีเขียว, กรดอะมิโน 17e24 (ดูรูป 4A.); ในฟ้ากรดอะมิโน 37e51; สีเหลือง, กรดอะมิโน 64e69; สีส้ม, กรดอะมิโน 76e91
สามกรดอะมิโนระบุว่าเป็นสิ่งที่จำเป็นสำหรับภูมิแพ้ในพีช LTP อยู่ในสีแดงและชี้ให้เห็น (สำหรับความหมายของการอ้างอิงสีในตำนานรูปนี้ผู้อ่านจะเรียกว่าเว็บรุ่นของบทความนี้.)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

รูปที่ 4 การวิเคราะห์โครงสร้าง sm-22 . ) และ multialignment ของ ltps จาก . ลำดับดูมะเขือเทศ LTP rsm-22 , แอปเปิ้ล ( Ebi เข้าเบอร์ q9m5x7 ) พีช ( pastorello et al . ,
1999 ) , พลัม ( pastorello et al . , 2001 ) , apricot ( pastorello et al . , 2001 ) multialignment ได้โดย clustal โอเมก้า ( ซีเวิร์ส et al . , 2011 ) ลำดับกับ
พื้นหลังสีเทาอ่อนสอดคล้องกับผู้ป่วยที่ตรวจพบโดยการใช้เส้น ยาว 15 กรดอะมิโนสารสังเคราะห์ ( Borges et al . , 2008 ) ขีดเส้นใต้เส้นลำดับสอดคล้องกับผู้ป่วยที่ตรวจพบโดยการใช้สารสังเคราะห์กรดอะมิโนยาว 10
( การ์เซีย คาซาโด้ et al . , 2003 ) ลูกศรแนวตั้งระบุว่า กรดอะมิโน ซึ่งมีการระบุเป็นอย่างเคร่งครัดจำเป็นสำหรับ allergenicity ในลูกพีชผลไม้
( การ์เซีย คาซาโด้ et al . , 2003 )กล่องแสดงในภูมิภาคสอดคล้องกับผู้ป่วยเป็นไปได้ ( pacios et al . , 2008 ) มะเขือเทศลำดับกับ
พื้นหลังสีเทาเข้มที่สอดคล้องกับการอนุรักษ์ epitope mapping ในภูมิภาค ข ) จำกัดที่สุดได้จากโครงสร้างของ rltp sm-22 . โครงสร้างสามมิติของ rltp sm-22 เป็น deduced โดย
แบบใช้พีช LTP โครงสร้าง ( PDB : 2alg โซ่ ) เป็นการอ้างอิงภาพที่แสดง ตัวเลขในแผ่นสองเป็น interconvertible 180
การหมุนรอบแกนนอน
ผ่านศูนย์กลางของโครงสร้าง สีเขียว , กรดอะมิโน 17e24 ( ดูรูปที่ 4 ) ; ในสีฟ้า , กรดอะมิโน 37e51 ; สีเหลือง กรดอะมิโน 64e69 ; สีส้ม , กรดอะมิโน 76e91 .
สามกรดอะมิโนที่จําเป็นสําหรับ allergenicity ระบุใน LTP พีชจะเป็นสีแดง และพบว่า( สำหรับความหมายของการอ้างอิงถึงสีในรูปตำนาน ผู้อ่าน
เรียกว่าเว็บรุ่นของบทความนี้