2. Prokaryotic organisms in desert environments
2.1. Hypolithic
Hypolithic bacterial communities have been studied less
extensively than the photosynthetic cyanobacterial ones, which
dominate this ecosystem. The abiotic factors that determine the
composition and activity of hypolithic bacterial communities are
available liquid water derived from rainfall and fog as well as
salinity (Azua-Bustos et al., 2011; Pointing et al., 2009; Warren-
Rhodes et al., 2006). Studies performed in the Atacama desert,
Chile, show that both soil and hypolithic heterotrophs are positively
correlated to soil moisture from rainfall and thus more
abundant in wetter sites along a 11,500 m2 precipitation gradient
(Navarro-González et al., 2003; Warren-Rhodes et al., 2006). Based
on 16S rRNA-sequence diversity analysis, hypolithic communities
unlike soil communities, were comprised primarily of Acidobacteria,
alpha, beta and gamma sub-classes of the Proteobacteria
and were co-extracted with cyanobacterial colonizers.
Stomeo et al. (2013) working with samples collected in the
Namib desert, spanning the Atlantic coasts of Angola, Namibia and
South Africa, showed that rainfall-moisture has a different effect on
both soil and hypolithic communities than fog-moisture. A higher
number of Operational Taxonomic Units (OTU) derived from terminal
restriction length polymorphisms (T-RFLP) of the 16S rRNA
gene were observed in hypolithic communities of rainfalldominated
sites than those from fog-dominated sites. In contrast,
soil communities were not influenced by the climate as they had a
similar number of OTUs in both regimes. Also, the genetic fingerprints
derived from soil communities revealed greater overall
variation than those derived from the hypolithic communities.
Makhalanyane et al. (2013) concluded that the noted variations
suggest soil and hypolithic communities do not develop in isolation
from one another but have cross recruitment.
2.2. Desert crusts
Obligate heterotrophic bacterial communities are important
components of the consortium of organisms that make up the
desert crusts. Their colonization on the crust is subsequent to the
pioneering cyanobacteria who are the dominant primary producers
contributing to nitrogen and carbon fixation. Investigation of the
spatial patterns of heterotrophic bacterial communities at the
micro-scale revealed a crust maturity-dependent distribution
(Evans and Johansen, 1999). In pioneering desert crusts in the
Colorado Plateau, communities were most abundant in the immediate
sub-surface (1e2 mm), whereas in the more welldeveloped
pigmented crusts the highest abundance was observed
on the surface (0e1 mm) (Garcia-Pichel et al., 2003). Other studies
performed at the centimeter to kilometer scale failed to observe
such vertical stratification of the heterotrophic communities, yet
the range of total viable counts are comparable and decline with
depth (3.1 102e3.6 107 CFU/g of soil) (Bolton et al., 1993; Kuske
et al., 2002; Skujins, 1984).
The soil texture of desert crusts is also a determining factor in
the total number of microorganisms they can support. The lowest
numbers are found in exposed or compacted crusts and un-crusted
soil followed by silt-surface crusts. Clay crusts support the highest
2. Prokaryotic organisms in desert environments2.1. HypolithicHypolithic bacterial communities have been studied lessextensively than the photosynthetic cyanobacterial ones, whichdominate this ecosystem. The abiotic factors that determine thecomposition and activity of hypolithic bacterial communities areavailable liquid water derived from rainfall and fog as well assalinity (Azua-Bustos et al., 2011; Pointing et al., 2009; Warren-Rhodes et al., 2006). Studies performed in the Atacama desert,Chile, show that both soil and hypolithic heterotrophs are positivelycorrelated to soil moisture from rainfall and thus moreabundant in wetter sites along a 11,500 m2 precipitation gradient(Navarro-González et al., 2003; Warren-Rhodes et al., 2006). Basedon 16S rRNA-sequence diversity analysis, hypolithic communitiesunlike soil communities, were comprised primarily of Acidobacteria,alpha, beta and gamma sub-classes of the Proteobacteriaand were co-extracted with cyanobacterial colonizers.Stomeo et al. (2013) working with samples collected in theNamib desert, spanning the Atlantic coasts of Angola, Namibia andSouth Africa, showed that rainfall-moisture has a different effect onboth soil and hypolithic communities than fog-moisture. A highernumber of Operational Taxonomic Units (OTU) derived from terminalrestriction length polymorphisms (T-RFLP) of the 16S rRNAgene were observed in hypolithic communities of rainfalldominatedsites than those from fog-dominated sites. In contrast,soil communities were not influenced by the climate as they had asimilar number of OTUs in both regimes. Also, the genetic fingerprintsderived from soil communities revealed greater overallvariation than those derived from the hypolithic communities.Makhalanyane et al. (2013) concluded that the noted variationssuggest soil and hypolithic communities do not develop in isolationfrom one another but have cross recruitment.2.2. Desert crustsObligate heterotrophic bacterial communities are importantcomponents of the consortium of organisms that make up thedesert crusts. Their colonization on the crust is subsequent to thepioneering cyanobacteria who are the dominant primary producerscontributing to nitrogen and carbon fixation. Investigation of thespatial patterns of heterotrophic bacterial communities at themicro-scale revealed a crust maturity-dependent distribution(Evans and Johansen, 1999). In pioneering desert crusts in theColorado Plateau, communities were most abundant in the immediatesub-surface (1e2 mm), whereas in the more welldevelopedpigmented crusts the highest abundance was observedon the surface (0e1 mm) (Garcia-Pichel et al., 2003). Other studiesperformed at the centimeter to kilometer scale failed to observesuch vertical stratification of the heterotrophic communities, yetthe range of total viable counts are comparable and decline withdepth (3.1 102e3.6 107 CFU/g of soil) (Bolton et al., 1993; Kuskeet al., 2002; Skujins, 1984).The soil texture of desert crusts is also a determining factor inthe total number of microorganisms they can support. The lowestnumbers are found in exposed or compacted crusts and un-crustedsoil followed by silt-surface crusts. Clay crusts support the highest
การแปล กรุณารอสักครู่..

2. Prokaryotic ชีวิตในสภาพแวดล้อมที่ทะเลทราย
2.1 Hypolithic
Hypolithic ชุมชนแบคทีเรียได้รับการศึกษาน้อยอย่างกว้างขวางกว่าคนไซยาโนแบคทีเรียสังเคราะห์แสงซึ่งครองระบบนิเวศนี้ ปัจจัยที่เป็นตัวกำหนด abiotic องค์ประกอบและกิจกรรมของชุมชนแบคทีเรีย hypolithic มีน้ำใช้ได้มาจากปริมาณน้ำฝนและหมอกเช่นเดียวกับความเค็ม(Azua-Bustos et al, 2011. ชี้ et al, 2009;. Warren-. โรดส์, et al, 2006) การศึกษาดำเนินการในทะเลทรายอาตากา, ชิลีแสดงให้เห็นว่าทั้งดินและ hypolithic heterotrophs จะบวกความสัมพันธ์กับความชื้นในดินจากปริมาณน้ำฝนและทำให้มากขึ้นมากมายในเว็บไซต์เปียกไปตามทางลาดเร่งรัด m2 11,500 (วาร์-González et al, 2003;. วอร์เรน-โรดส์ et al., 2006) จากใน 16S rRNA ลำดับวิเคราะห์ความหลากหลายของชุมชน hypolithic แตกต่างจากชุมชนดินถูกประกอบด้วยหลักของ Acidobacteria, อัลฟาและเบต้าแกมมาย่อยชั้นเรียนของ Proteobacteria และร่วมสกัดด้วย colonizers ไซยาโนแบคทีเรีย. Stomeo et al, (2013) การทำงานร่วมกับกลุ่มตัวอย่างที่เก็บรวบรวมได้ในทะเลทรายนามิบทอดชายฝั่งมหาสมุทรแอตแลนติกของแองโกลานามิเบียแอฟริกาใต้พบว่าปริมาณน้ำฝนความชื้นมีผลกระทบที่แตกต่างกันทั้งในดินและhypolithic ชุมชนกว่าหมอกความชื้น สูงขึ้นจำนวนหน่วยอนุกรมวิธานการดำเนินงาน (OTU) ที่มาจากสถานีหลากหลายระยะเวลาในการจำกัด (T-RFLP) ของ 16S rRNA ยีนถูกตั้งข้อสังเกตในชุมชนของ hypolithic rainfalldominated เว็บไซต์กว่าจากเว็บไซต์หมอกที่โดดเด่น ในทางตรงกันข้ามชุมชนดินที่ไม่ได้รับอิทธิพลจากสภาพภูมิอากาศที่พวกเขามีจำนวนใกล้เคียงกันของOtus ในระบอบการปกครองทั้งสอง นอกจากนี้ลายนิ้วมือทางพันธุกรรมที่ได้จากชุมชนดินเปิดเผยมากขึ้นโดยรวมรูปแบบกว่าผู้ที่มาจากชุมชนhypolithic. Makhalanyane et al, (2013) สรุปได้ว่ารูปแบบการตั้งข้อสังเกตแนะนำดินและhypolithic ชุมชนไม่พัฒนาในการแยกจากคนอื่นแต่มีการรับสมัครข้าม. 2.2 เปลือกทะเลทรายบังคับชุมชนแบคทีเรีย heterotrophic มีความสำคัญองค์ประกอบของสมาคมของสิ่งมีชีวิตที่ทำขึ้นเปลือกทะเลทราย การล่าอาณานิคมของพวกเขาในเปลือกโลกเป็นที่ตามมากับไซยาโนแบคทีเรียเป็นผู้บุกเบิกที่มีผู้ผลิตหลักที่โดดเด่นที่เอื้อต่อการตรึงไนโตรเจนและคาร์บอน การสืบสวนของรูปแบบการกระจายของชุมชนแบคทีเรีย heterotrophic ที่ระดับไมโครเผยให้เห็นการกระจายครบกําหนดขึ้นอยู่กับเปลือก(อีแวนส์และฮันเซน, 1999) ในเปลือกทะเลทรายเป็นผู้บุกเบิกในที่ราบสูงโคโลราโดชุมชนมีความอุดมสมบูรณ์มากที่สุดในทันทีผิวย่อย(1e2 มิลลิเมตร) ขณะที่ใน welldeveloped เพิ่มเติมเปลือกสีความอุดมสมบูรณ์มากที่สุดพบว่าบนพื้นผิว(0e1 มิลลิเมตร) (การ์เซีย Pichel et al, , 2003) การศึกษาอื่น ๆดำเนินการในเซนติเมตรขนาดกิโลเมตรล้มเหลวที่จะสังเกตเห็นการแบ่งชั้นดังกล่าวในแนวตั้งของชุมชน heterotrophic แต่ช่วงของการทำงานได้นับรวมที่มีการเทียบเคียงและการลดลงที่มีความลึก(3.1? 102e3.6? 107 โคโลนี / กรัมของดิน) (โบลเอ อัล, 1993. Kuske. et al, 2002;?. Skujin s, 1984) เนื้อดินเปลือกทะเลทรายยังเป็นปัจจัยในการกำหนดจำนวนของจุลินทรีย์ที่พวกเขาสามารถสนับสนุน ต่ำสุดจำนวนที่พบในเปลือกสัมผัสหรือการบดอัดและยกเลิกการเกรอะกรังดินตามด้วยเปลือกตะกอนพื้นผิว เปลือกดินสนับสนุนสูงสุด
การแปล กรุณารอสักครู่..

2 . โพรคาริโอติกสิ่งมีชีวิตในทะเลทรายสภาพแวดล้อม
2.1 . hypolithic
hypolithic แบคทีเรียชุมชนได้รับการศึกษาน้อย
อย่างกว้างขวางกว่าระบบยูสังเคราะห์แสงอยู่ ซึ่ง
ครองระบบนิเวศนี้ ในการทดลองปัจจัยที่กำหนดองค์ประกอบและกิจกรรมของชุมชน
ของแบคทีเรีย hypolithic เป็นของเหลวน้ำมาจากฝนและหมอกเช่นเดียวกับ
ความเค็ม ( อาซูอาบูโตส et al . , 2011 ; ชี้ et al . , 2009 ; วอร์เรน -
Rhodes et al . , 2006 ) การศึกษาดำเนินการในทะเลทราย Atacama
ชิลี แสดงให้เห็นว่าทั้งดินและ hypolithic heterotrophs บวก
มีความชื้นในดินจากน้ำฝน และดังมากขึ้น
มากมายใน Wetter เว็บไซต์ตาม , m2 ฝนลาด
( Navarro . kgm gonz lez et al . , 2003 ; วอร์เรน Rhodes et al . , 2006 )
จากในการวิเคราะห์ความหลากหลายของลำดับเบส 16S rRNA , ชุมชน
hypolithic แตกต่างจากชุมชน ดิน ถูก ประกอบด้วยหลักของ acidobacteria
, อัลฟ่า , เบต้า และ แกมมา ซับคลาสของโพรทีโอแบคทีเรีย
และ Co สกัดด้วยระบบยู colonizers .
stomeo et al . ( 1 ) ทำงานกับตัวอย่างที่เก็บในทะเลทราย
นามิบ รวมถึงชายฝั่งแอตแลนติกของแองโกลา , นามิเบียและ
แอฟริกาใต้พบว่า ความชื้น ปริมาณน้ำฝน มีลักษณะพิเศษที่แตกต่างกันในทั้งดินและชุมชนมากกว่า
hypolithic ความชื้นหมอก ตัวเลขที่สูงขึ้นของหน่วยปฏิบัติการ (
อนุกรมวิธาน otu ) ได้มาจากสถานี
จำกัด ( t-rflp ) ความยาวความหลากหลายของยีน 16S rRNA พบว่าใน hypolithic
เว็บไซต์ชุมชน rainfalldominated สูงกว่าหมอกครอบงำจากเว็บไซต์ ในทางตรงกันข้าม
การแปล กรุณารอสักครู่..
