Staphylococcus argenteus is a genet

Staphylococcus argenteus is a genetically divergent lineage of Staphylococcus aureus that received formal taxonomic classification in 2014 [1]. S. argenteus is mis-identified as S. aureus in clinical diagnostic laboratories using standard identification tests [2], [3], [4]. Multilocus sequence typing (MLST) makes a clear distinction between the two species, but the original PCR primers for S. aureus failed to amplify two of the seven loci in S. argenteus [2], [5], [6] and such isolates were often excluded by default. Although several of the earliest descriptions of S. argenteus were associated with remote communities [2], [3], [4], cumulative publications have since suggested that S. argenteus is globally distributed. This includes its isolation from humans or animals in Thailand, Cambodia, Indonesia, Fiji, New Zealand, Mayotte, Trinidad and Tobago, with additional evidence from the MLST database of its presence in Europe and Africa [2], [3], [4], [5], [6], [7], [8], [9], [10], [11], [12].

Discovering the existence of this new pathogenic species results in the need to determine whether S. argenteus and S. aureus should be distinguished apart in routine practice. This might be necessary if S. argenteus infection is associated with different clinical manifestations, severity or outcome, and/or requires different antimicrobial regimens. Data on clinical features of human S. argenteus infection are limited, but a study that defined the frequency of S. argenteus in three different clinical collections in northern Australia reported that this was predominantly associated with skin and soft-tissue infections, but rarely with bacteraemia [13]. S. argenteus has been reported to be more susceptible to oxidative stress and neutrophil killing in vitro, and less virulent in murine sepsis and skin infection models compared with S. aureus [13]. This raises the possibility that human S. argenteus infection may be associated with a milder course. Comparison between ten patients with invasive S. argenteus infection and 236 patients with invasive S. aureus infection reported that morbidity and death were comparable [6], but this study was underpowered. The presence of virulence genes in S. argenteus has not been subjected to detailed investigation. Several studies have reported that S. argenteus is negative for genes encoding Panton–Valentine leukocidin (PVL) [3], [4], [7], [8], [14], [15], although a recent case report of two patients with PVL-positive S. argenteus infection [11] indicates that this species may acquire virulence factors. One study also detected the gene encoding staphylococcal enterotoxin B in all S. argenteus isolates cultured from villagers in the Amazonian forest [4].

Here, we describe a prospective, multicentre study of invasive staphylococcal infection that was initially reported by diagnostic laboratories to be due to S. aureus, in which around one-fifth of isolates were re-identified as S. argenteus. This allowed a comparison of patient characteristics and demography, features of infection and outcome, antimicrobial resistance profiles, and the presence of selected putative virulence determinants.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Staphylococcus argenteus เป็นเชื้อสายแตกต่างทางพันธุกรรมของหมอเทศข้างลาย Staphylococcus ที่ได้รับการจำแนกอนุกรมวิธานอย่างเป็นทางการในปี 2557 [1] S. argenteus จะระบุอย่างไม่ถูกต้องเป็นหมอเทศข้างลาย S. ในห้องปฏิบัติการวินิจฉัยทางคลินิกโดยใช้การทดสอบมาตรฐานรหัส [2], [3], [4] Multilocus ลำดับพิมพ์ (MLST) ทำให้แตกต่างชัดเจนระหว่างสองสปีชีส์ แต่ไพรเมอร์ PCR ดั้งเดิมสำหรับหมอเทศข้างลาย S. ล้มเหลวในการขยายของตำแหน่งอ่อนแอเจ็ดใน S. argenteus [2], [5], [6] และแยกดังกล่าวก็มักจะแยกออก โดยค่าเริ่มต้น แม้ว่าจะหลายคำอธิบายแรกสุดของ S. argenteus เกี่ยวข้องกับระยะไกลชุมชน [2], [3], [4], สิ่งพิมพ์ที่สะสมได้ตั้งแต่แนะนำว่า S. argenteus ทั่วโลกกระจาย ซึ่งรวมถึงการแยกจากมนุษย์หรือสัตว์ในไทย กัมพูชา อินโดนีเซีย นิวซีแลนด์ ฟิจิ มายอ ตรินิแดดและ โตเบโก มีหลักฐานเพิ่มเติมจากฐานข้อมูล MLST ของตนในยุโรปและแอฟริกา [2], [3], [4], [5], [6], [7], [8], [9], [10], [11], [12]การดำรงอยู่ของสายพันธุ์นี้ทำให้เกิดโรคใหม่ที่ค้นพบผลลัพธ์ในต้องตรวจสอบว่า S. argenteus และ S. หมอเทศข้างลายควรจะต่างกันในการปฏิบัติกิจวัตรประจำวัน นี้อาจจำเป็นถ้าติดเชื้อ S. argenteus สัมพันธ์กับอาการทางคลินิกที่แตกต่างกัน ความรุนแรง หรือผล และ หรือต้องใช้ยาต้านจุลชีพที่แตกต่างกัน ข้อมูลเกี่ยวกับลักษณะทางคลินิกของการติดเชื้อ argenteus S. มนุษย์มีจำกัด แต่การศึกษาที่กำหนดความถี่ของ S. argenteus ในคอลเลกชันทางคลินิกแตกต่างกันสามในออสเตรเลียเหนือ รายงานว่า นี้ไม่เกี่ยวข้องกับผิวหนังและเนื้อเยื่ออ่อนติดเชื้อ แต่ไม่ค่อย bacteraemia [13] ส่วนใหญ่ รับรายงาน S. argenteus ว่าความเครียดออกซิเดชันต่อและฆ่าในหลอดทดลอง และน้อย neutrophil virulent murine sepsis และผิวติดเชื้อรุ่นที่เทียบกับหมอเทศข้างลาย S. [13] นี้เพิ่มความเป็นไปได้ว่า มนุษย์ S. argenteus ติดเชื้ออาจเกี่ยวข้องกับหลักสูตรจ้า เปรียบเทียบระหว่างผู้ป่วยสิบรุกราน S. argenteus ติดเชื้อและผู้ป่วยติดเชื้อหมอเทศข้างลาย S. รุกราน 236 รายงานว่า เจ็บป่วยและการตายเปรียบเทียบ [6], แต่การศึกษานี้คือนให้่ การปรากฏตัวของยีนความรุนแรงใน S. argenteus มีไม่ได้อยู่ภายใต้การสอบสวนโดยละเอียด หลายการศึกษาได้รายงานว่า S. argenteus เป็นค่าลบสำหรับเข้ารหัส Panton – วาเลนไทน์ leukocidin (PVL) [3], [4], [7], [8], [14], [15], ยีนแม้กรณีรายงานล่าสุดของผู้ป่วยที่ติดเชื้อ S. PVL บวก argenteus [11] สองบ่งชี้ว่า สายพันธุ์นี้อาจได้รับปัจจัยความรุนแรง หนึ่งการศึกษายังพบยีนเข้ารหัส staphylococcal enterotoxin B ในทั้งหมด S. argenteus แยกล้างจากชาวบ้านในป่า Amazonian [4]ที่นี่ เราอธิบายการศึกษาอนาคต multicentre ของการติดเชื้อ staphylococcal รุกรานที่รายงาน โดยห้องปฏิบัติการวินิจฉัยในเบื้องต้นเกิดจาก S. หมอเทศข้างลาย ซึ่งรอบ หนึ่งในห้าของที่แยกได้ใหม่ว่าเป็น S. argenteus นี้อนุญาตให้มีการเปรียบเทียบลักษณะของผู้ป่วยและประชากร คุณสมบัติของการติดเชื้อและผล ส่วนกำหนดค่าความต้านทานต่อยาต้านจุลชีพ และจากตัวเลือกความรุนแรง putative ดีเทอร์มิแนนต์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Staphylococcus argenteus เป็นเชื้อสายแตกต่างทางพันธุกรรมของเชื้อที่ได้รับการจัดหมวดหมู่การจัดหมวดหมู่อย่างเป็นทางการในปี 2014 [1] เอส argenteus จะผิดพลาดระบุว่าเป็นเชื้อ S. aureus ในห้องปฏิบัติการวินิจฉัยทางคลินิกโดยใช้บัตรประจำตัวทดสอบมาตรฐาน [2], [3] [4] Multilocus ลำดับพิมพ์ดีด (MLST) ทำให้ความแตกต่างที่ชัดเจนระหว่างสองเผ่าพันธุ์ แต่ไพรเมอร์ PCR ต้นฉบับสำหรับเชื้อ S. aureus ล้มเหลวในการขยายสองในเจ็ดตำแหน่งในเอส argenteus [2] [5] [6] และสายพันธุ์ดังกล่าว มักจะได้รับการยกเว้นตามค่าเริ่มต้น แม้ว่าหลายคำอธิบายที่เก่าแก่ที่สุดของเอส argenteus มีความสัมพันธ์กับชุมชนที่ห่างไกล [2], [3] [4] สิ่งพิมพ์สะสมได้ตั้งแต่บอกว่าเอส argenteus มีการกระจายไปทั่วโลก ซึ่งรวมถึงการแยกจากมนุษย์หรือสัตว์ในประเทศไทย, กัมพูชา, อินโดนีเซีย, ฟิจิ, นิวซีแลนด์, มายอต, ตรินิแดดและโตเบโก, มีหลักฐานเพิ่มเติมจากฐานข้อมูล MLST ของการแสดงตนในยุโรปและแอฟริกา [2], [3] [4 ] [5] [6] [7] [8] [9] [10] [11] [12].

ค้นพบการดำรงอยู่ของชนิดนี้ทำให้เกิดโรคใหม่ในความต้องการที่จะตรวจสอบว่า S . argenteus และ S. aureus ควรจะแตกต่างออกจากกันในการปฏิบัติกิจวัตรประจำวัน นี้อาจจะเป็นสิ่งที่จำเป็นถ้าเอส argenteus การติดเชื้อมีความเกี่ยวข้องกับอาการทางคลินิกที่แตกต่างกัน, ความรุนแรงหรือผลและ / หรือจำเป็นต้องใช้ยาต้านจุลชีพที่แตกต่างกัน ข้อมูลเกี่ยวกับลักษณะทางคลินิกของมนุษย์เอส argenteus การติดเชื้อจะถูก จำกัด แต่การศึกษาที่กำหนดความถี่ของเอส argenteus ในคอลเลกชันสามทางคลินิกที่แตกต่างกันในภาคเหนือของออสเตรเลียรายงานว่านี้เป็นคนที่เกี่ยวข้องส่วนใหญ่กับผิวหนังและเนื้อเยื่ออ่อนติดเชื้อ แต่ไม่ค่อยมี bacteraemia [13] เอส argenteus ได้รับรายงานว่าเป็นที่อ่อนแอมากขึ้นเพื่อความเครียดออกซิเดชันและการฆ่า neutrophil ในหลอดทดลองและน้อยความรุนแรงในการติดเชื้อและการติดเชื้อที่ผิวหนังหมารุ่นเมื่อเทียบกับเชื้อ S. aureus [13] นี้ทำให้เกิดความเป็นไปได้ที่มนุษย์ติดเชื้อ argenteus เอสอาจจะเกี่ยวข้องกับหลักสูตรจ้า เปรียบเทียบระหว่างผู้ป่วยที่มีการติดเชื้อสิบรุกรานเอส argenteus และผู้ป่วย 236 ที่มีการติดเชื้อที่แพร่กระจายเชื้อ S. aureus รายงานว่าการเจ็บป่วยและการตายถูกเปรียบเทียบ [6] แต่การศึกษานี้คือ underpowered การปรากฏตัวของยีนรุนแรงในเอส argenteus ยังไม่ได้รับภายใต้การตรวจสอบรายละเอียด มีงานวิจัยหลายรายงานว่าเอส argenteus เป็นลบสำหรับยีน Panton วาเลนไทน์ leukocidin (PVL) [3] [4] [7] [8] [14] [15] แม้ว่ารายงานกรณีล่าสุดของ สองผู้ป่วยที่มี PVL บวกติดเชื้อเอส argenteus [11] แสดงให้เห็นว่าสายพันธุ์นี้อาจได้รับปัจจัยความเป็นพิเศษ หนึ่งการศึกษานอกจากนี้ยังตรวจพบยีนเข้ารหัส staphylococcal enterotoxin บีเอสในทุก argenteus แยกเชื้อจากชาวบ้านในป่าอเมซอน [4].

ที่นี่เราจะอธิบายในอนาคตการศึกษา multicentre ของการติดเชื้อเชื้อรุกรานที่มีรายงานครั้งแรกโดยห้องปฏิบัติการวินิจฉัยว่าเป็นเพราะ เพื่อเชื้อ S. aureus ซึ่งในรอบหนึ่งในห้าของเชื้ออีกครั้งระบุว่าเป็นเอส argenteus นี้ได้รับอนุญาตการเปรียบเทียบลักษณะของผู้ป่วยและประชากรศาสตร์คุณสมบัติของการติดเชื้อและผลโปรไฟล์ดื้อยาและการปรากฏตัวของความรุนแรงที่เลือกปัจจัยสมมุติ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

Staphylococcus argenteus เป็นเชื้อสายทางพันธุกรรมที่แตกต่างกันของเชื้อ Staphylococcus aureus ที่ได้รับการจำแนกทางอนุกรมวิธานอย่างเป็นทางการในปี 2014 [ 1 ] เอส argenteus เป็น MIS ระบุเป็น S . aureus ในห้องปฏิบัติการวินิจฉัยทางคลินิกโดยใช้มาตรฐานการทดสอบ [ 2 ] , [ 3 ] [ 4 ] multilocus ลำดับการพิมพ์ ( mlst ) ทำให้ความแตกต่างที่ชัดเจนระหว่างสองชนิด แต่ต้นฉบับ PCR ไพรเมอร์สำหรับ S . aureus ล้มเหลวในการขยายสองในเจ็ดของอเมริกาใน argenteus [ 2 ] , [ 5 ] [ 6 ] และเช่นเชื้อมักจะไม่รวมโดยค่าเริ่มต้น แม้ว่าหลายของรายละเอียดแรกของสหรัฐฯ มีความสัมพันธ์กับชุมชน argenteus ระยะไกล [ 2 ] , [ 3 ] , [ 4 ] , สิ่งพิมพ์สะสมได้ตั้งแต่พบว่า S . argenteus กระจายทั่วโลก นี้รวมถึงการแยกจากมนุษย์หรือสัตว์ในไทย , กัมพูชา , อินโดนีเซีย , ฟิจิ , นิวซีแลนด์ , บาตร , ตรินิแดดและโตเบโก กับหลักฐานเพิ่มเติมจากฐานข้อมูล mlst ของการแสดงตนในยุโรปและแอฟริกา [ 2 ] , [ 3 ] , [ 4 ] , [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] , [ 9 ] , [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ]การค้นพบการดำรงอยู่ของเชื้อโรคสายพันธุ์ใหม่ ผลลัพธ์ที่ต้องตรวจสอบว่า เอส argenteus และ S . aureus ควรแยกแยะออกจากกันในการปฏิบัติงาน นี้อาจจำเป็นถ้าเอส argenteus การติดเชื้อที่เกี่ยวข้องกับอาการทางคลินิกที่แตกต่างกัน ความรุนแรงหรือผล และ / หรือต้องใช้ยาต้านจุลชีพที่แตกต่างกัน ข้อมูลเกี่ยวกับลักษณะทางคลินิกของมนุษย์ . argenteus การติดเชื้อมีจำกัด แต่การศึกษาที่กำหนดความถี่ของ S . argenteus ในคลินิกคอลเลกชันที่แตกต่างกันสามทางตอนเหนือของออสเตรเลีย รายงานว่า นี่คือส่วนใหญ่ที่เกี่ยวข้องกับผิวหนัง และเชื้อ soft-tissue แต่ไม่ค่อยมี bacteraemia [ 13 ] เอส argenteus ได้เสี่ยงต่อภาวะเครียดออกซิเดชันและนิวโทรฟิลฆ่าในหลอดทดลอง และรุนแรงน้อยกว่าในการติดเชื้อ ~ และรูปแบบการติดเชื้อผิวหนังเมื่อเทียบกับ S . aureus [ 13 ] นี้พูดถึงความเป็นไปได้ของมนุษย์ . argenteus การติดเชื้ออาจเกี่ยวข้องกับหลักสูตรที่เบาลง การเปรียบเทียบระหว่างผู้ป่วยกับสิบรุกราน . argenteus การติดเชื้อและแพร่กระจายเชื้อ S . aureus 236 ) รายงานว่า อัตราการเจ็บป่วยและการตายโดยเปรียบเทียบ [ 6 ] , แต่การศึกษานี้ underpowered . การปรากฏตัวของโรคยีนใน S . argenteus ยังไม่ได้รับการตรวจสอบรายละเอียด การศึกษาหลายแห่งได้รายงานว่า เอส argenteus เป็นลบสำหรับยีนที่เข้ารหัส Panton –วันวาเลนไทน์ leukocidin ( pvl ) [ 3 ] [ 4 ] [ 7 ] , [ 8 ] , [ 14 ] , [ 15 ] แม้ว่าจะเป็นกรณีล่าสุดรายงานผู้ป่วย 2 pvl บวก . argenteus การติดเชื้อ [ 11 ] บ่งชี้ว่า ชนิดนี้ อาจได้รับปัจจัยความรุนแรง . การศึกษาหนึ่งที่ยังตรวจพบยีน staphylococcal ปน B ทั้งหมด argenteus แยกเลี้ยงจากชาวบ้านในป่า Amazonian [ 4 ]ที่นี่ เราอธิบายอนาคตการศึกษา multicentre ถูก staphylococcal การติดเชื้อที่ถูกรายงานครั้งแรกโดยห้องปฏิบัติการตรวจวินิจฉัยได้เนื่องจาก S . aureus ซึ่งในรอบห้าของไอโซเลทเป็นระบุว่าเป็นเอส argenteus . นี้ได้รับอนุญาตการเปรียบเทียบลักษณะของผู้ป่วยและประชากร ลักษณะของการติดเชื้อ และผลโปรไฟล์สามารถต้านจุลชีพและการปรากฏตัวของโรคปัจจัยเฉพาะหน้าที่เลือก .