—Sequencecomparison of ITS region e

—Sequence
comparison of ITS region encompassing ITS-
1, 5.8 S rRNA gene and ITS-2 of M. phaseolina and
other related fungal species revealed three regions
that were conserved among the M. phaseolina isolates.
We divided the complete sequence into five regions
from ITS-1 to ITS-2 (FIG. 2). The region 4 that
showed variability among the aligned sequences of M.
phaseolina isolates was not considered for further analysis. We also excluded 5.8 S RNA gene sequence
from the analysis. After editing and rearrangement of
aligned sequences and comparison with the sequences
of closely related genera of fungi, region 1
and 5 were selected for the development of speciesspecific
primers for M. phaseolina. Two primers
MpKFI and MpKRI were designed from the specific
nucleotide areas and one oligonucleotide probe
MpKH1 (19 mer) was designed from the conserved
region, adjacent to 5.8 S gene showed in the region 3
(FIG. 2). The designed primers yielded single amplified
product of 350 bp with all the M. phaseolina
isolates tested. The specificity of the primers was
tested on representative species of common soilborne
microbes (TABLE II). The primer pair was
found to be specific for M. phaseolina as none of
the other soil microbes tested could yield any
amplification product under identical conditions of
amplification (FIG. 3).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

โดยลำดับเปรียบเทียบภูมิภาคความบริบูรณ์ของ-1, 5.8 S ของ-2 ของม. phaseolina และยีนใน rRNA และอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องกับเชื้อราพันธุ์เปิดเผยขอบเขตสามที่มีอยู่ระหว่างแยก phaseolina เมตรเราแบ่งลำดับสมบูรณ์ 5 ภูมิภาคของ 1 ของ 2 (FIG. 2) ภาค 4 ที่แสดงให้เห็นว่าความแปรผันระหว่างลำดับการจัดตำแหน่งของ Mphaseolina แยกไม่มีพิจารณาสำหรับการวิเคราะห์เพิ่มเติม เรายังรวม 5.8 S อาร์เอ็นเอยีนลำดับจากการวิเคราะห์ หลังจากแก้ไขและ rearrangement ของวางลำดับและเปรียบเทียบกับลำดับที่ของสกุลที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดของเชื้อรา ภาค 1และ 5 เลือกพัฒนาการ speciesspecificไพรเมอร์สำหรับ phaseolina เมตร ไพรเมอร์ 2MpKFI และ MpKRI ถูกออกแบบจากการบริเวณนิวคลีโอไทด์และโพรบ oligonucleotide หนึ่งMpKH1 (แมร์ 19) ถูกออกแบบมาจากการนำภูมิภาค ติดกับยีน S 5.8 ที่พบในภูมิภาค 3(FIG. 2) ไพรเมอร์ที่ออกแบบให้ผลเดียวที่ขยายผลิตภัณฑ์ของ 350 bp กับ phaseolina ม.ทั้งหมดแยกทดสอบ มี specificity ของไพรเมอร์ที่ทดสอบพันธุ์ soilborne ทั่วไปพนักงานจุลินทรีย์ (ตาราง II) คู่รองพื้นได้ต้องมีเฉพาะสำหรับ phaseolina เมตรเป็นไม่มีอื่น ๆ ดินจุลินทรีย์ทดสอบได้ผลตอบแทนใด ๆขยายผลิตภัณฑ์ภายใต้เงื่อนไขเหมือนกันขยาย (FIG. 3)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

-Sequence
เปรียบเทียบภูมิภาคครอบคลุม ITS-
1, 5.8 S rRNA ของยีนและ ITS-2 ของเอ็ม phaseolina
และอื่นๆ
ที่เกี่ยวข้องกับสายพันธุ์ของเชื้อราเปิดเผยสามภูมิภาคที่ได้รับการอนุรักษ์ในหมู่เมตรแยกphaseolina.
เราได้แบ่งลำดับสมบูรณ์ในห้าภูมิภาคจาก
ITS-1 ถึง ITS-2 (มะเดื่อ. 2) ภูมิภาคที่ 4
แสดงให้เห็นความแปรปรวนในหมู่ลำดับสอดคล้องของเอ็มไอโซเลท phaseolina ไม่ได้รับการพิจารณาสำหรับการวิเคราะห์ต่อไป
นอกจากนี้เรายังได้รับการยกเว้น 5.8 S RNA
ลำดับยีนจากการวิเคราะห์ หลังจากการแก้ไขและการปรับปรุงใหม่ของลำดับสอดคล้องและการเปรียบเทียบกับลำดับของจำพวกเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดของเชื้อราภาค1 และ 5 ได้รับการคัดเลือกในการพัฒนา speciesspecific ไพรเมอร์สำหรับ M. phaseolina ไพรเมอร์สองMpKFI MpKRI และได้รับการออกแบบจากเฉพาะพื้นที่เบื่อหน่ายและสอบสวนoligonucleotide หนึ่งMpKH1 (19 แมร์) ได้รับการออกแบบจากป่าสงวนพื้นที่ที่อยู่ติดกับยีนS 5.8 แสดงให้เห็นว่าในภูมิภาคที่ 3 (มะเดื่อ. 2) ไพรเมอร์ได้รับการออกแบบให้ผลขยายเดียวสินค้า 350 bp กับทุก M. phaseolina แยกการทดสอบ ความจำเพาะของไพรเมอร์ที่ได้รับการทดสอบในสายพันธุ์ที่เป็นตัวแทนของ soilborne ที่พบจุลินทรีย์(ตารางที่สอง) ไพรเมอร์ทั้งคู่ถูกพบว่ามีความเฉพาะเจาะจงสำหรับ M. phaseolina ที่ไม่มีจุลินทรีย์ดินที่ผ่านการทดสอบได้ผลใดๆผลิตภัณฑ์ขยายภายใต้เงื่อนไขที่เหมือนกันของเครื่องขยายเสียง (มะเดื่อ. 3)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

- การเปรียบเทียบลำดับของเขตครอบคลุมของ
-
1 s rRNA ยีน its-2 5.8 และชีวภาพของเมตรและชนิดของเชื้อราอื่น ๆที่เกี่ยวข้องเปิดเผย

สามภูมิภาคที่ศึกษาในม. ชีวภาพของเชื้อ
เราแบ่งลำดับเบสที่สมบูรณ์ในห้าภูมิภาค
จาก its-1 เพื่อ its-2 ( รูปที่ 2 ) ภาค 4 ที่พบความแปรปรวนระหว่างชิด

5 Mชีวภาพแยกไม่ได้พิจารณาสำหรับการวิเคราะห์ต่อไป เรายังไม่รวม 5.8 เป็นอาร์เอ็นเอยีน ลำดับ
จากการวิเคราะห์ หลังจากการแก้ไขและการปรับปรุงของ
ชิดลำดับและการเปรียบเทียบกับลำดับของความสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดของเชื้อราสกุล
1
5 ได้ถูกเลือกสำหรับการพัฒนาไพรเมอร์ speciesspecific
M . ชีวภาพ . สองชนิด และ mpkri
mpkfi ออกแบบจากเฉพาะ
พื้นที่หนึ่ง ซึ่งลำดับเบสด้วย
mpkh1 ( 19 แมร์ ) ถูกออกแบบจากป่าสงวน
เขตติดกับ 5.8 ของยีน พบในเขต 3
( รูปที่ 2 ) ออกแบบไพรเมอร์จำนวนเดียวขยาย
ผลิตภัณฑ์ 350 คู่เบสไอโซชีวภาพ
ทุกเมตร ทดสอบ ความจำเพาะของไพรเมอร์ถูก
ทดสอบตัวแทนชนิดของจุลินทรีย์ทางดิน
ทั่วไป ( ตารางที่ 2 ) ไพรเมอร์คู่ถูก
พบว่ามีเฉพาะม. ชีวภาพเป็นไม่มีอื่น ๆดินจุลินทรีย์ทดสอบ

( จะได้ผลผลิตใด ๆภายใต้เงื่อนไขที่เหมือนกันของ
( ( รูปที่ 3 )