We used common primers for FLA as described earlier which could identify the four Acanthamoeba isolates which were also further confirmed by using specific JDP primers. However, the common primers could not identify the remaining ten FLA which may be due to lack of such sequence in these FLA as water harbours a plethora of organisms which may have some different sequences.[9] Some other target in 18S rRNA itself may help in resolving this issue. Bagheri et al., reported presence of Acanthamoeba in 48% of tap water samples collected from different wards of hospitals in 13 cities of Iran.[12] Carlesso et al., demonstrated FLA in 35% of swab samples from dust and biofilms of which 34% were Acanthamoeba species.[18] In another study by Carlesso et al., 23% of similar samples showed presence of Acanthamoeba species of T3 and T4 genotypes in dust and T5 genotype in biofilms.[15] A study from France by Ovrutsky has shown isolation of FLA including Acanthamoeba of T3 and T4 genotype in 14.8% samples of water and biofilms formed in shower drains and sink drains.[7] The four Acanthamoeba isolates in our study also belonged to both T3 and T4 genotypes (two each). The pathogenic Acanthamoebae earlier have been observed to be of T3 and T4 genotype, thereby suggesting these isolates obtained from critical units may pose danger to immunocompromised patients.[19] Another study from France by Lasheras et al. showed a high presence of 68.9% of FLA in hot water faucets, showers, hot water tanks and cooling towers of 10 hospitals.[20] A study from Switzerland by Thomas et al. have shown isolation of FLA predominantly Hartmanella vermiformis in 7.5% in tap water, swabs from tap and showerhead of ICU, surgery ward, medicine and other wards in a hospital.
We used common primers for FLA as described earlier which could identify the four Acanthamoeba isolates which were also further confirmed by using specific JDP primers. However, the common primers could not identify the remaining ten FLA which may be due to lack of such sequence in these FLA as water harbours a plethora of organisms which may have some different sequences.[9] Some other target in 18S rRNA itself may help in resolving this issue. Bagheri et al., reported presence of Acanthamoeba in 48% of tap water samples collected from different wards of hospitals in 13 cities of Iran.[12] Carlesso et al., demonstrated FLA in 35% of swab samples from dust and biofilms of which 34% were Acanthamoeba species.[18] In another study by Carlesso et al., 23% of similar samples showed presence of Acanthamoeba species of T3 and T4 genotypes in dust and T5 genotype in biofilms.[15] A study from France by Ovrutsky has shown isolation of FLA including Acanthamoeba of T3 and T4 genotype in 14.8% samples of water and biofilms formed in shower drains and sink drains.[7] The four Acanthamoeba isolates in our study also belonged to both T3 and T4 genotypes (two each). The pathogenic Acanthamoebae earlier have been observed to be of T3 and T4 genotype, thereby suggesting these isolates obtained from critical units may pose danger to immunocompromised patients.[19] Another study from France by Lasheras et al. showed a high presence of 68.9% of FLA in hot water faucets, showers, hot water tanks and cooling towers of 10 hospitals.[20] A study from Switzerland by Thomas et al. have shown isolation of FLA predominantly Hartmanella vermiformis in 7.5% in tap water, swabs from tap and showerhead of ICU, surgery ward, medicine and other wards in a hospital.
การแปล กรุณารอสักครู่..
เราใช้ไพรเมอร์ทั่วไปสำหรับ FLA ตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ซึ่งอาจระบุสี่แยก Acanthamoeba ซึ่งได้รับการยืนยันต่อไปโดยใช้ไพรเมอร์ JDP ที่เฉพาะเจาะจง อย่างไรก็ตามไพรเมอร์ร่วมกันไม่สามารถระบุส่วนที่เหลืออีกสิบ FLA ซึ่งอาจจะเกิดจากการขาดลำดับดังกล่าวใน FLA เหล่านี้เป็นน้ำที่ท่าเรือมากมายเหลือเฟือของสิ่งมีชีวิตซึ่งอาจมีบางลำดับที่แตกต่างกัน. [9] บางเป้าหมายอื่น ๆ ใน 18S rRNA ตัวเองอาจช่วยให้ ในการแก้ไขปัญหานี้ Bagheri et al., รายงานการปรากฏตัวของ Acanthamoeba ใน 48% ของกลุ่มตัวอย่างน้ำประปาที่เก็บได้จากหอผู้ป่วยที่แตกต่างกันของโรงพยาบาลใน 13 เมืองของประเทศอิหร่าน. [12] Carlesso et al., แสดงให้เห็นถึง FLA ใน 35% ของกลุ่มตัวอย่างไม้กวาดจากฝุ่นและไบโอฟิล์มที่ 34% เป็นชนิด Acanthamoeba. [18] ในการศึกษาโดย Carlesso อื่น et al., 23% ของกลุ่มตัวอย่างที่คล้ายกันแสดงให้เห็นว่าการปรากฏตัวของสายพันธุ์ Acanthamoeba ของ T3 และยีน T4 ในฝุ่นละอองและจีโนไทป์ T5 ในไบโอฟิล์ม. [15] การศึกษาจากประเทศฝรั่งเศสโดย Ovrutsky ได้แสดงให้เห็นการแยก FLA รวมทั้ง Acanthamoeba ของ T3 และ T4 จีโนไทป์ใน 14.8% ตัวอย่างของน้ำและไบโอฟิล์มที่เกิดขึ้นในท่อระบายน้ำห้องอาบน้ำฝักบัวและอ่างล้างจานท่อระบายน้ำ. [7] สี่ Acanthamoeba แยกในการศึกษาของเรายังเป็นทั้ง T3 และ T4 จีโนไทป์ (สองแต่ละคน) . ที่ทำให้เกิดโรค Acanthamoebae ก่อนหน้านี้ได้รับการปฏิบัติที่จะเป็นของ T3 และ T4 genotype จึงบอกสายพันธุ์เหล่านี้ที่ได้รับจากหน่วยงานที่สำคัญอาจก่อให้เกิดอันตรายกับผู้ป่วยที่มีภาวะภูมิคุ้มกันบกพร่อง. [19] การศึกษาจากประเทศฝรั่งเศสโดยอีก Lasheras et al, แสดงให้เห็นสถานะที่สูงของ 68.9% ของ FLA ในก๊อกน้ำร้อนอาบน้ำ, ถังเก็บน้ำร้อนและอาคารระบายความร้อนจาก 10 โรงพยาบาล. [20] การศึกษาจากประเทศสวิสเซอร์แลนด์โดยโทมัสอัลเอต ได้แสดงให้เห็นการแยก FLA เด่น Hartmanella vermiformis 7.5% ในน้ำประปา, swabs จากก๊อกฝักบัวและห้องไอซียูของผู้ป่วยผ่าตัดแพทย์และคนไข้อื่น ๆ ในโรงพยาบาล
การแปล กรุณารอสักครู่..