The Sclerotinia sclerotiorum sequen

The Sclerotinia sclerotiorum sequencing project was funded by the National Research Initiative, which is within the U.S. Department of Agriculture's (USDA's) Cooperative State Research Education and Extension Service, and reviewed through the USDA/NSF Microbial Genome Sequencing Project. Our strategy involves Whole Genome Shotgun (WGS) sequencing, in which sequence from the entire genome is generated using paired end reads from plasmids and Fosmids and assembled using Arachne (Batzoglou et al. 2002, Jaffe et al. 2003). The rapid availability of this sequence in an annotated form will immediately promote discovery of genes and potential anti-fungal targets, permit reconstruction of pathways, provide sequence-anchored clone paths for use in genetic and functional studies, and enable comparative genomic approaches to analysis.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

โครงการจัดลำดับ sclerotiorum Sclerotinia ได้รับการสนับสนุนนวัตกรรมวิจัยแห่งชาติ ซึ่งอยู่ภายในแผนกเกษตรสหรัฐฯ ของสหกรณ์รัฐวิจัยศึกษา (จากของ) และส่วนขยายของบริการ และตรวจสอบผ่าน จาก/NSF จุลินทรีย์กลุ่มจัดลำดับโครงการ กลยุทธ์ของเราเกี่ยวข้องกับการจัดลำดับทั้งจีโนมปืน (WGS) ในลำดับใดจากกลุ่มทั้งหมดจะถูกสร้างขึ้น โดยใช้ปลายจัดเป็นคู่อ่าน plasmids และ Fosmids และประกอบใช้อาราคเน่ (Batzoglou et al. 2002, Jaffe et al. 2003) พร้อมใช้งานอย่างรวดเร็วของลำดับนี้ในแบบฟอร์มประกอบจะทันทีส่งเสริมการค้นพบยีนและเป้าหมายต้านเชื้อรา อนุญาตให้ฟื้นฟูหลัก ให้โคลนยึดลำดับเส้นทางสำหรับใช้ในการศึกษาพันธุกรรม และการทำงาน และเปิดใช้งานวิเคราะห์เปรียบเทียบแนว genomic

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

โครงการลำดับ Sclerotinia sclerotiorum ได้รับการสนับสนุนโดยการริเริ่มวิจัยแห่งชาติซึ่งอยู่ในสหรัฐอเมริกากรมวิชาการเกษตรของสหรัฐ (USDA) ที่สหกรณ์รัฐการศึกษาวิจัยและการขยายบริการและการตรวจสอบผ่าน USDA / NSF จุลินทรีย์โครงการจีโนมลำดับ กลยุทธ์ของเราเกี่ยวข้องกับจีโนมทั้งปืนลูกซอง (WGS) ลำดับที่ลำดับจากจีโนมทั้งหมดจะถูกสร้างขึ้นโดยใช้ปลายคู่อ่านจากพลาสมิดและ Fosmids และประกอบโดยใช้อารัคนี (Batzoglou et al. 2002 Jaffe et al. 2003) ความพร้อมใช้งานอย่างรวดเร็วของลำดับนี้ในรูปแบบข้อเขียนทันทีจะส่งเสริมการค้นพบยีนที่มีศักยภาพและเป้าหมายป้องกันเชื้อราอนุญาตให้มีการฟื้นฟูของทางเดินให้ลำดับทอดสมอเส้นทางโคลนสำหรับการใช้งานในการศึกษาทางพันธุกรรมและการทำงานและเปิดใช้งานวิธีการเปรียบเทียบจีโนมการวิเคราะห์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การ sclerotinia sclerotiorum จัดลำดับโครงการได้รับการสนับสนุนโดยโครงการวิจัยแห่งชาติ ซึ่งภายในกรมวิชาการเกษตรของสหรัฐอเมริกา ( USDA ) สหกรณ์แห่งชาติวิจัยการศึกษาและส่งเสริมการให้บริการและตรวจสอบผ่าน USDA / NSF จุลินทรีย์ลำดับจีโนมโครงการ กลยุทธ์ของเราเกี่ยวข้องกับทั้งจีโนมปืนลูกซอง ( wgs ) จัดลำดับซึ่งในลำดับจากจีโนมทั้งหมดจะถูกสร้างขึ้นโดยใช้ข้อมูลและสิ้นสุดอ่านจากพลาสมิด fosmids และประกอบโดยใช้อาราคเน่ ( batzoglou et al . 2002 เจฟฟ์ et al . 2003 ) จากความพร้อมของลำดับนี้ในบันทึกย่อแบบทันทีจะส่งเสริมการค้นพบยีนและศักยภาพ anti fungal เป้าหมายที่อนุญาตให้สร้างทางเดินให้ลำดับยึดโคลนเส้นทางเพื่อใช้ในการศึกษาทางพันธุกรรม และใช้งาน และให้แนวทางการวิเคราะห์จีโนมเปรียบเทียบ .