In the present work, we proposed to

In the present work, we proposed to use a new protein–protein
docking approach to construct the human CFTR’s NBD1–NBD2
heterodimeric complex based on the crystal structure of human
CFTR’s NBD1 and a modeled structure of human CFTR’s NBD2 built
by using NBD1 as a mold. The method requires no a priori
knowledge of any dimeric structure of homologous proteins. It also
overcomes the potential severe backbone clashing problem in the
conventional overlying method. The constructed NBD1–NBD2
model was consistent with the experimentally observed NBD
dimers of ABC transporters (see [16] for review). To further validate
our model, we docked ATP molecules to the CFTR’s NBD1–NBD2
dimer, and reproduced the observed ATP binding mode in the
NBD1 monomer. Lastly, we used the modeled NBD heterodimer to
investigate the interaction between genistein and human CFTR’s
NBD dimer by molecular docking. Genistein is an isoflavonoid
found in soybeans and soy products that has a prominent effect in
potentiating CFTR channel activity [17–24]. It is regarded as the
gold standard for drug screening programs spearheaded by the
Cystic Fibrosis Foundation. However, the molecular mechanism of
genistein’s activation remains unclear. Based on our computational
results, the putative binding sites of genistein on CFTR were
identified, showing consistency with experimental findings.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เราเสนอการใช้โปรตีน – โปรตีนตัวใหม่ในงานนำเสนอ
เทียบวิธีสร้างของ CFTR มนุษย์ NBD1 – NBD2
heterodimeric ซับซ้อนตามโครงสร้างผลึกของ
CFTR ของ NBD1 และสร้างแบบจำลองโครงสร้างของมนุษย์ CFTR NBD2 สร้าง
โดย NBD1 เป็นแม่พิมพ์ วิธีการต้องไม่เป็น priori
ความรู้ใด ๆ โครงสร้าง dimeric ของ homologous โปรตีน มันยัง
overcomes แกนหลักอย่างรุนแรงอาจเกิดขึ้น clashing ปัญหา
ทั่วไปวิธีการเหล่านั้น NBD1 – NBD2 สร้าง
แบบจำลองไม่สอดคล้องกับ NBD experimentally สังเกต
dimers ABC ผู้ (ดู [16] สำหรับทบทวน) การตรวจสอบเพิ่มเติม
รุ่นของเรา เราย้ายโมเลกุล ATP กับของ CFTR NBD1 – NBD2
ผลิตของ dimer และสังเกต ATP รวมโหมดในการทำซ้ำ
NBD1 น้ำยา สุดท้าย เราใช้ heterodimer NBD สร้างแบบจำลองการ
ตรวจสอบการโต้ตอบระหว่าง genistein และมนุษย์ CFTR
NBD ผลิตของ dimer โดยเทียบระดับโมเลกุล Genistein เป็นการ isoflavonoid
พบในถั่วเหลืองและผลิตภัณฑ์ถั่วเหลืองที่มีลักษณะพิเศษโดดเด่น
potentiating CFTR ช่องกิจกรรม [17-24] ถือเป็นการ
มาตรฐานสำหรับยาที่ตรวจโปรแกรม spearheaded โดย
รซิมูลนิธิ อย่างไรก็ตาม กลไกระดับโมเลกุลของ
เปิดของ genistein ยังคงไม่ชัดเจน ตามการคำนวณของเรา
ผลลัพธ์ การผูก putative ของ genistein ใน CFTR ถูก
identified แสดงความสอดคล้องกับ findings ทดลอง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ในการทำงานในปัจจุบันที่เราเสนอให้ใช้โปรตีนใหม่
วิธีการเชื่อมต่อที่จะสร้าง CFTR มนุษย์ NBD1-NBD2
ซับซ้อน heterodimeric ขึ้นอยู่กับโครงสร้างผลึกของมนุษย์
CFTR ของ NBD1 และโครงสร้างจำลองของมนุษย์ CFTR ของ NBD2 สร้างขึ้น
โดยใช้ NBD1 เป็นแม่พิมพ์ . วิธีการที่ไม่จำเป็นต้องมีการนิรนัย
ความรู้เกี่ยวกับโครงสร้าง dimeric ใด ๆ ของโปรตีนที่คล้ายคลึงกัน นอกจากนี้ยัง
ครอบงำรุนแรงกระดูกสันหลังปัญหาปะทะกันที่อาจเกิดขึ้นใน
วิธีการวางธรรมดา NBD1-NBD2 สร้าง
รูปแบบที่สอดคล้องกับการสังเกตการทดลอง NBD
dimers ขนส่งของเอบีซี (ดู [16] เพื่อการตรวจสอบ) เพื่อตรวจสอบ
รูปแบบของเราเราเทียบโมเลกุลเอทีพี CFTR ของ NBD1-NBD2
dimer และทำซ้ำโหมดเอทีพีผูกพันสังเกตใน
โมโนเมอร์ NBD1 สุดท้ายเราใช้ heterodimer NBD รูปแบบการ
ตรวจสอบการมีปฏิสัมพันธ์ระหว่าง genistein และ CFTR มนุษย์
NBD dimer โดยโมเลกุลเทียบท่า genistein เป็น isoflavonoid
พบในถั่วเหลืองและผลิตภัณฑ์จากถั่วเหลืองที่มีผลต่อการประสบความสำเร็จใน
การออกฤทธิ์กิจกรรมช่อง CFTR [17-24] มันจะถือเป็น
มาตรฐานทองคำสำหรับโปรแกรมการตรวจคัดกรองยาเสพติดทันสมัยโดย
มูลนิธิโรคปอดเรื้อรัง แต่กลไกระดับโมเลกุลของ
การเปิดใช้ genistein ยังคงไม่มีความชัดเจน ขึ้นอยู่กับการคำนวณของเรา
ผลเว็บไซต์ที่มีผลผูกพันตามคำเล่าลือของ genistein CFTR ที่ถูก
ระบุแสดงให้เห็นความสอดคล้องกับผลการวิจัยทดลอง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ในงานปัจจุบัน เราเสนอให้ใช้โปรตีนใหม่–โปรตีน
docking วิธีการสร้างมนุษย์ cftr เป็น nbd1 – nbd2
heterodimeric ซับซ้อนขึ้นอยู่กับโครงสร้างผลึกของมนุษย์
cftr เป็น nbd1 และแบบจำลองโครงสร้างของมนุษย์ cftr เป็น nbd2 สร้าง
โดยใช้ nbd1 เป็นแม่พิมพ์ วิธีที่ไม่ต้องใช้ความรู้ใด ๆระหว่าง
ท้องเฟ้อโครงสร้างของฟังก์ชันโปรตีน
มันยังเอาชนะหัวใจรุนแรงอาจอึกทึกปัญหาใน
ปกติวางวิธีการ การสร้าง nbd1 – nbd2
รูปแบบสอดคล้องกับการทดลองพบว่าไม่สำคัญ
ิของ ABC transporters ( ดู [ 16 ] เพื่อทบทวน ) เพื่อเพิ่มเติมตรวจสอบ
นางแบบของเรา เราจอด ATP โมเลกุลของ cftr nbd1 – nbd2
ไดเมอร์และทำซ้ำจากเอทีพี ผูกพันในโหมด
nbd1 โมโนเมอร์ ท้ายนี้เราใช้แบบ heterodimer ไม่สำคัญ

ศึกษาปฏิสัมพันธ์ระหว่างมนุษย์และ cftr เจนิของ
ไม่สำคัญเมอร์โมเลกุลด้วย Docking . เจนนิสเป็น ISO fl avonoid
ที่พบในถั่วเหลือง และผลิตภัณฑ์ถั่วเหลือง ที่มีลักษณะพิเศษที่โดดเด่นในกิจกรรม cftr
Professor ช่อง 17 – [ 24 ] มันถือเป็นมาตรฐานทองสำหรับโปรแกรมฉายยา

spearheaded โดยมูลนิธิ Cystic Fibrosis . อย่างไรก็ตามกลไกระดับโมเลกุลของของการกระตุ้น
เจนิยังไม่ชัดเจน จากผลการคำนวณ
ของเรา นอกจากนี้ เว็บไซต์ของเจนิ cftr ถูกผูกบน
identi จึงเอ็ด แสดงความสอดคล้องกับ ndings

จึงทดลอง