Four protocols viz., the trichloroa

Four protocols viz., the trichloroacetic acid-acetone (TCA), phenol-ammonium acetate (PAA), phenol/SDS-ammonium acetate (PSA) and trisbase-acetone (TBA) were evaluated with modifications for protein extraction from banana (Grand Naine) roots, considered as recalcitrant tissues for proteomic analysis. The two-dimensional electrophoresis (2-DE) separated proteins were compared based on protein yield, number of resolved proteins, sum of spot quantity, average spot intensity and proteins resolved in 4-7 pI range. The PAA protocol yielded more proteins (0.89 mg/g of tissues) and protein spots (584) in 2-DE gel than TCA and other protocols. Also, the PAA protocol was superior in terms of sum of total spot quantity and average spot intensity than TCA and other protocols, suggesting phenol as extractant and ammonium acetate as precipitant of proteins were the most suitable for banana rooteomics analysis by 2-DE. In addition, 1:3 ratios of root tissue to extraction buffer and overnight protein precipitation were most efficient to obtain maximum protein yield

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สี่โพรโทคอ viz., กรด trichloroacetic-อะซีโตน (TCA), แอมโมเนียวาง acetate (PAA), วาง SDS-แอมโมเนีย acetate (PSA) และ trisbase-อะซีโตน (TBA) ถูกประเมิน ด้วยการสกัดโปรตีนจากกล้วย (Grand Naine) ราก ถือว่าเป็นเนื้อเยื่อ recalcitrant สำหรับการวิ proteomic การปรับเปลี่ยน โปรตีนสอง electrophoresis (2-DE) แยกได้เทียบตามผลผลิตโปรตีน โปรตีนแก้ไขจำนวน ผลรวมของปริมาณจุด เฉลี่ยความเข้มของจุด และโปรตีนที่ได้รับการแก้ไขในช่วง 4-7 ปี โพรโทคอล PAA หาโปรตีน (0.89 มิลลิกรัม/กรัมของเนื้อเยื่อ) และโปรตีนจุด (584) ในเจ 2 เด TCA และโปรโตคอลอื่น ๆ เพิ่มเติม ยัง โพรโทคอล PAA เหนือกว่าในแง่ของผลรวมของปริมาณจุดรวมและค่าเฉลี่ยความเข้มของจุดมากกว่า TCA และโปรโตคอลอื่น ๆ แนะนำการวางเป็นแอมโมเนียและ extractant acetate เป็น precipitant ของโปรตีนได้มากที่สุดเหมาะสำหรับการวิเคราะห์ rooteomics กล้วยโดยเดอ 2 นอกจากนี้ อัตราส่วน 1:3 ของเนื้อเยื่อรากแยกบัฟเฟอร์และค้างคืนฝนโปรตีนมีประสิทธิภาพสูงสุดเพื่อให้ได้ผลผลิตโปรตีนสูงสุด

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สี่โปรโตคอล ได้แก่ . ที่กรดอะซีโตนไตรคลอโร (TCA), อะซิเตตฟีนอลแอมโมเนียม (PAA) ฟีนอล / อะซิเตท SDS-แอมโมเนียม (PSA) และ trisbase-อะซิโตน (TBA) ได้รับการประเมินมีการปรับเปลี่ยนในการสกัดโปรตีนจากกล้วย (แกรนด์ Naine ) รากถือว่าเป็นเนื้อเยื่อบิดพลิ้วสำหรับการวิเคราะห์โปรตีน อิสองมิติ (2-DE) แยกโปรตีนที่ถูกเมื่อเทียบกับอัตราผลตอบแทนขึ้นอยู่กับโปรตีนจำนวนโปรตีนแก้ไขผลรวมของปริมาณจุดเข้มจุดเฉลี่ยและโปรตีนการแก้ไขในช่วง 4-7 pI โปรโตคอล PAA ยอมแพ้โปรตีนมากขึ้น (0.89 มิลลิกรัม / กรัมของเนื้อเยื่อ) และจุดโปรตีน (584) ในเจล 2 DE กว่า TCA และโปรโตคอลอื่น ๆ นอกจากนี้โปรโตคอล PAA ดีกว่าในแง่ของผลรวมของปริมาณจุดรวมและความเข้มจุดเฉลี่ยกว่า TCA และโปรโตคอลอื่น ๆ บอกฟีนอลเป็นสารสกัดอะซิเตทและแอมโมเนียมเป็นตกตะกอนของโปรตีนเป็นที่เหมาะสมที่สุดสำหรับการวิเคราะห์ rooteomics กล้วย 2-DE นอกจากนี้ 1: 3 อัตราส่วนของเนื้อเยื่อรากบัฟเฟอร์การสกัดและการตกตะกอนโปรตีนในชั่วข้ามคืนก็มีประสิทธิภาพมากที่สุดที่จะได้รับผลตอบแทนสูงสุดโปรตีน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

4 ระบบ ได้แก่ , อะซิโตน trichloroacetic acid ( TCA ) , ฟีนอลแอมโมเนียมอะซิเตท ( ป้า ) , ฟีนอล / SDS แอมโมเนียมอะซิเตท ( PSA ) และ trisbase อะซิโตน ( TBA ) ได้แก่ มีการปรับเปลี่ยนในการสกัดโปรตีนจากกล้วยหอมแกรนด์เนน ) ราก ถือว่าเป็นเนื้อเยื่อนอกครูการวิเคราะห์โปรตีน .วิธีที่ 2 ( แผ่น ) แยกโปรตีนเปรียบเทียบผลผลิตโปรตีน จำนวนการแก้ไข โปรตีน ผลรวมของปริมาณความเข้มของจุด และแก้ไขในจุดที่มีโปรตีน 4-7 และช่วง ส่วนป้าโปรโตคอล ) โปรตีน ( 0.89 มก. / กรัมของโปรตีนและเนื้อเยื่อ ) ปอ ( 584 ) ในแผ่นเจลกว่า TCA และโปรโตคอลอื่น ๆ นอกจากนี้ส่วนป้าโพรโทคอลคือเหนือกว่าในแง่ของจำนวนจุดทั้งหมดและปริมาณเฉลี่ยจุดเข้มกว่า TCA และโปรโตคอลอื่น ๆแนะนำ ฟีนอลเป็นสารสกัดและแอมโมเนียมอะซิเตทเป็นสารตกตะกอนโปรตีนได้เหมาะสมมากที่สุด สำหรับการวิเคราะห์ rooteomics กล้วยโดย 2-de. นอกจากนี้ 13 . อัตราส่วนของรากการบัฟเฟอร์และการสกัดโปรตีนตกตะกอนเป็นแรมที่มีประสิทธิภาพมากที่สุดเพื่อให้ได้ผลผลิตสูงสุด

โปรตีน