Abstract
In a prior study, we identified seven clinical isolates of an Aspergillus sp. that were slow to sporulate in multiple media and demonstrated decreased in vitro susceptibilities to multiple antifungals, including amphotericin B, itraconazole, voriconazole, and caspofungin. These isolates were initially considered to be variants of Aspergillus fumigatus because of differences in mitochondrial cytochrome b sequences and unique randomly amplified polymorphic DNA PCR patterns (S. A. Balajee, M. Weaver, A. Imhof, J. Gribskov, and K. A. Marr, Antimicrob. Agents Chemother. 48: 1197-1203, 2004). The present study was performed to clarify the taxonomic status of these organisms by phylogenetic analyses based on multilocus sequence typing of five genes (the beta-tubulin gene, the rodlet A gene, the salt-responsive gene, the mitochondrial cytochrome b gene, and the internal transcribed spacer regions). Results revealed that four of the seven variant isolates clustered together in a clade very distant from A. fumigatus and distinct from other members of the A. fumigatus group. This new clade, consisting of four members, was monophyletic with strong bootstrap support when the protein-encoding regions were analyzed, indicating a new species status under the phylogenetic species concept. Phenotype studies revealed that the variant isolate has smaller conidial heads with diminutive vesicles compared to A. fumigatus and is not able to survive at 48 degrees C. Our findings suggest the presence of a previously unrecognized, potentially drug-resistant Aspergillus species that we designate A. lentulus.
บทคัดย่อในการศึกษาก่อนหน้านี้ เราระบุเจ็ดทางคลินิกแยกของ sp.มี Aspergillus ที่ช้า sporulate ในหลายสื่อ และแสดง susceptibilities ในหลอดลดลงไปหลาย antifungals, amphotericin B, itraconazole, voriconazole และ caspofungin แยกเหล่านี้ได้เริ่มต้นถือเป็นตัวแปรของ Aspergillus fumigatus เนื่องจากความแตกต่างใน mitochondrial cytochrome b ลำดับและแบบสุ่มเอาต์ polymorphic DNA PCR ลวด (S. A. มายาดีลักซ์ ช่างทอผ้า M., A. Imhof, J. Gribskov และคุณ A. Marr, Antimicrob ตัวแทน Chemother 48:1197-1203, 2004) การศึกษาปัจจุบันได้ดำเนินการชี้แจงสถานะอนุกรมวิธานของสิ่งมีชีวิตเหล่านี้ โดยวิเคราะห์ phylogenetic ตามลำดับ multilocus พิมพ์ของ 5 ยีน (ยีนเบต้า tubulin ยีน rodlet A ยีนตอบสนองเกลือ ยีน b mitochondrial cytochrome และเป็นตัวเว้นวรรคทับภายในภูมิภาค) ผลการเปิดเผยที่ สี่วางแยกตัวแปรเจ็ดจับกลุ่มกันใน clade ที่ไกลมากจาก A. fumigatus และแตกต่างจากสมาชิกคนอื่น ๆ ของกลุ่ม A. fumigatus Clade นี้ใหม่ ประกอบด้วยสมาชิกสี่ ได้ monophyletic กับสนับสนุนการเริ่มต้นระบบที่แข็งแกร่งเมื่อภูมิภาคเข้ารหัสโปรตีนที่วิเคราะห์ แสดงสถานะสายพันธุ์ใหม่ภายใต้แนวคิดชนิด phylogenetic Phenotype ศึกษาเปิดเผยว่า แยกย่อยมีขนาดเล็ก conidial หัวอสุจิแคระเปรียบเทียบกับ A. fumigatus และไม่สามารถอยู่รอดใน 48 องศาเซลเซียส ผลการวิจัยของเราแนะนำอยู่ก่อนหน้านี้ไม่รู้จัก อาจยาทน Aspergillus พันธุ์ว่า เรากำหนด lentulus อ.
การแปล กรุณารอสักครู่..
บทคัดย่อ
ในการศึกษาก่อนที่เราระบุเจ็ดเชื้อทางคลินิกของ SP Aspergillus ที่มีความช้าในการสร้างสปอร์ในสื่อหลายรูปแบบและแสดงให้เห็นถึงการลดลงในหลอดทดลองที่จะมีอารมณ์ที่อ่อนไหว antifungals หลายรวมถึง B amphotericin, itraconazole, voriconazole และ caspofungin เชื้อเหล่านี้ได้รับการพิจารณาในขั้นต้นที่จะเป็นสายพันธุ์ของเชื้อรา Aspergillus fumigatus เพราะความแตกต่างในการ cytochrome ยลลำดับขและไม่ซ้ำกันขยายรูปแบบการสุ่ม PCR ดีเอ็นเอ polymorphic (SA Balajee เมตรประกอบ A. Imhof เจ Gribskov และ KA Marr, Antimicrob. ตัวแทน . Chemother 48: 1197-1203, 2004) การศึกษาครั้งนี้ได้รับการดำเนินการเพื่อชี้แจงสถานะการจัดหมวดหมู่ของสิ่งมีชีวิตเหล่านี้โดยการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการอยู่บนพื้นฐานของการพิมพ์ลำดับ Multilocus ห้ายีน (ยีนเบต้า tubulin, rodlet ยีนยีนเกลือตอบสนอง, cytochrome ขยีนยลและ ภูมิภาค spacer คัดลอกภายใน) ผลการศึกษาพบว่าสี่เจ็ดตัวแปรแยกคลัสเตอร์ร่วมกันใน clade มากห่างจาก A. fumigatus และแตกต่างจากสมาชิกคนอื่น ๆ ของกลุ่ม A. fumigatus นี้ clade ใหม่ประกอบด้วยสมาชิกสี่คนเป็นไฟย์เลติด้วยการสนับสนุนที่แข็งแกร่งเมื่อบูตภูมิภาคโปรตีนเข้ารหัสถูกนำมาวิเคราะห์แสดงให้เห็นสถานะของสปีชีส์ใหม่ภายใต้แนวคิดสายพันธุ์วิวัฒนาการ การศึกษาแสดงให้เห็นว่าฟีโนไทป์ที่แตกต่างแยกมีหัวเชื้อราขนาดเล็กที่มีถุงเล็กเมื่อเทียบกับ A. fumigatus และจะไม่สามารถอยู่รอดได้ 48 องศาเซลเซียสผลการวิจัยของเราแสดงให้เห็นการปรากฏตัวของไม่รู้จักก่อนหน้านี้อาจสายพันธุ์ดื้อยา Aspergillus ที่เรากำหนด . lentulus
การแปล กรุณารอสักครู่..
นามธรรม
ในการศึกษาทางคลินิกก่อน เราระบุเจ็ดสายพันธุ์ของเชื้อราที่ช้า sporulate ในหลายสื่อ และแสดงให้เห็นการลดลงในแบบที่ต้านเชื้อรา รวมทั้งต่อยา amphotericin B , , วอริโคนาโซล และ caspofungin .จำนวนเริ่มต้นถือว่าเป็นสายพันธุ์ของเชื้อรา Aspergillus fumigatus เนื่องจากความแตกต่างในการลำดับและแบบสุ่ม ไซ บี้ amplified polymorphic DNA PCR รูปแบบ ( A . s ได้ balajee เอ็ม. วีเวอร์ อ. imhof เจ gribskov , และ K . . . แต่ . . . antimicrob , . ตัวแทน chemother . 48 : 1197-1203 , 2004 )การศึกษาได้ดำเนินการเพื่อชี้แจงสถานะทางอนุกรมวิธานของสิ่งมีชีวิตเหล่านี้ โดยวิเคราะห์ตาม ซึ่ง multilocus พิมพ์ 5 ยีน ลำดับ ( เบต้าทูบูลิน rodlet ยีน , ยีน , เกลือตอบยีน ตัด - B ยีน และภายในภูมิภาคและ spacer )ผลการศึกษาพบว่าตัวแปรสี่ในเจ็ดสายพันธุ์การจัดกลุ่มเข้าด้วยกันใน clade ห่างไกลมากจาก . fumigatus และแตกต่างจากสมาชิกอื่น ๆของ A fumigatus กลุ่ม clade ใหม่นี้ ประกอบด้วยสมาชิก 4 คน คือ monophyletic ด้วยการสนับสนุนที่แข็งแกร่งเข้ารหัสภูมิภาคบูเมื่อโปรตีนวิเคราะห์แสดงสถานะสายพันธุ์ใหม่ชนิดต่างๆภายใต้แนวคิดการ ศึกษาพบว่าตัวแปรแยกได้จากหัวที่มีขนาดเล็กจิ๋วเล็กเมื่อเทียบกับ . fumigatus และไม่สามารถที่จะอยู่รอดที่ 48 องศาของเราแสดงให้เห็นว่าการแสดงของที่ไม่รู้จักก่อนหน้านี้ชนิด Aspergillus อาจดื้อยาที่เรากำหนด . เลนเทอเลิส .
การแปล กรุณารอสักครู่..